RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000187120.1

Topbp1-ps1-201, mousemouse

BASIC

Gene Topbp1-ps1, Length 184 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Cldn34b4Q3V0X2 211 aa2.22□□□□□ -2.05
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Afg1lQ3V384 480 aa2.22□□□□□ -2.05
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 SynaQ5G5D5 617 aa2.22□□□□□ -2.05
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Mtcp1Q60945 107 aa2.22□□□□□ -2.05
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Prtn3Q61096 254 aa2.22□□□□□ -2.05
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 SypQ62277 314 aa2.22□□□□□ -2.05
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Maml1Q6T264 1020 aa2.22□□□□□ -2.05
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Fam102aQ78T81 392 aa2.22□□□□□ -2.05
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Actn1Q7TPR4 892 aaKnown RBP2.22□□□□□ -2.05
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Vgll4Q80V24 287 aa2.22□□□□□ -2.05
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Acad11Q80XL6 779 aa2.22□□□□□ -2.05
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Hist3h2aQ8BFU2 130 aaKnown RBP2.22□□□□□ -2.05
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Lrfn3Q8BLY3 626 aa2.22□□□□□ -2.05
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 PcgF3Q8BTQ0 241 aa2.22□□□□□ -2.05
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Fem1abQ8C0T1 654 aa2.22□□□□□ -2.05
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Zfp449Q8CB76 518 aa2.22□□□□□ -2.05
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Wdr37Q8CBE3 496 aa2.22□□□□□ -2.05
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Prpf31Q8CCF0 499 aaKnown RBP2.22□□□□□ -2.05
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Fbxo43Q8CDI2 640 aa2.22□□□□□ -2.05
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Pars2Q8CFI5 475 aa2.22□□□□□ -2.05
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Hist1h2afQ8CGP5 130 aa2.22□□□□□ -2.05
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Hist1h2akQ8CGP7 130 aa2.22□□□□□ -2.05
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Slc37a1Q8R070 531 aa2.22□□□□□ -2.05
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Olfr1033Q8VFK5 310 aa2.22□□□□□ -2.05
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Olfr1262Q8VGN2 304 aa2.22□□□□□ -2.05
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 MlphQ91V27 590 aa2.22□□□□□ -2.05
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Mrgpra1Q91WW5 304 aa2.22□□□□□ -2.05
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 AspnQ99MQ4 373 aa2.22□□□□□ -2.05
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Slc5a5Q99PN0 618 aa2.22□□□□□ -2.05
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 CenpmQ9CQA0 180 aa2.22□□□□□ -2.05
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Mrpl11Q9CQF0 192 aaKnown RBP2.22□□□□□ -2.05
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Pdzk1ip1Q9CQH0 114 aa2.22□□□□□ -2.05
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Nkiras2Q9CR56 191 aa2.22□□□□□ -2.05
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Q9CRW3 126 aa2.22□□□□□ -2.05
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Gm9817Q9D2M0 144 aa2.22□□□□□ -2.05
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Senp8Q9D2Z4 221 aa2.22□□□□□ -2.05
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Q9D4A5 307 aa2.22□□□□□ -2.05
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Dcbld1Q9D4J3 503 aa2.22□□□□□ -2.05
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Wdr20Q9D5R2 567 aa2.22□□□□□ -2.05
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 CutcQ9D8X1 272 aa2.22□□□□□ -2.05
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Ndufs3Q9DCT2 263 aaKnown RBP2.22□□□□□ -2.05
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Lime1Q9EQR5 269 aa2.22□□□□□ -2.05
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Zcchc17Q9ESX4 241 aaKnown RBP2.22□□□□□ -2.05
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Rnf114Q9ET26 229 aa2.22□□□□□ -2.05
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 FibpQ9JI19 357 aa2.22□□□□□ -2.05
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Slc29a1Q9JIM1 460 aa2.22□□□□□ -2.05
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Slc5a3Q9JKZ2 718 aa2.22□□□□□ -2.05
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Pmm2Q9Z2M7 242 aa2.22□□□□□ -2.05
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Sik3Q6P4S6 1311 aa2.21□□□□□ -2.06
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Igkv1-132A0A0B4J1H9 120 aa2.21□□□□□ -2.06
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Trbv13-1A0A0B4J1P8 112 aa2.21□□□□□ -2.06
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Ptpn3A2ALK8 913 aa2.21□□□□□ -2.06
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Fam83cA2ARK0 776 aa2.21□□□□□ -2.06
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Arhgap36B1AUC7 590 aa2.21□□□□□ -2.06
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Trappc11B2RXC1 1133 aa2.21□□□□□ -2.06
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Vmn1r137D3YTY1 307 aa2.21□□□□□ -2.06
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Vmn1r143E9PUW9 307 aa2.21□□□□□ -2.06
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Vmn2r16E9Q025 850 aa2.21□□□□□ -2.06
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Maml2F6U238 1170 aa2.21□□□□□ -2.06
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Tmem132bF7BAB2 1078 aa2.21□□□□□ -2.06
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 E230025N22RikG5E8S3 482 aa2.21□□□□□ -2.06
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 A630023A22RikJ3QP60 199 aa2.21□□□□□ -2.06
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Vmn2r32K7N686 852 aa2.21□□□□□ -2.06
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Gm10436L7N1Y3 520 aa2.21□□□□□ -2.06
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Vmn1r125L7N227 307 aa2.21□□□□□ -2.06
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Vmn1r116L7N2A6 307 aa2.21□□□□□ -2.06
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 MttpO08601 894 aa2.21□□□□□ -2.06
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Ebf3O08791 596 aa2.21□□□□□ -2.06
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Ikzf3O08900 507 aa2.21□□□□□ -2.06
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Vmn2r42O35192 852 aa2.21□□□□□ -2.06
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Nr1i2O54915 431 aa2.21□□□□□ -2.06
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Tcn2O88968 430 aa2.21□□□□□ -2.06
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Hoxc9P09633 260 aa2.21□□□□□ -2.06
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 EporP14753 507 aa2.21□□□□□ -2.06
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Cyp2a5P20852 494 aa2.21□□□□□ -2.06
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Capza2P47754 286 aa2.21□□□□□ -2.06
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Efna2P52801 209 aa2.21□□□□□ -2.06
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Acod1P54987 488 aa2.21□□□□□ -2.06
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Eef2P58252 858 aaKnown RBP2.21□□□□□ -2.06
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Isl1P61372 349 aa2.21□□□□□ -2.06
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Hoxb13P70321 286 aa2.21□□□□□ -2.06
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Hnrnph2P70333 449 aaKnown RBP2.21□□□□□ -2.06
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Slc9a3r1P70441 355 aa2.21□□□□□ -2.06
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Cdh8P97291 799 aa2.21□□□□□ -2.06
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Anp32eP97822 260 aaKnown RBP2.21□□□□□ -2.06
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Q0VG49 157 aa2.21□□□□□ -2.06
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Mmp7Q10738 264 aa2.21□□□□□ -2.06
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Spatc1Q148B6 480 aa2.21□□□□□ -2.06
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Chrna5Q2MKA5 467 aa2.21□□□□□ -2.06
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Tcfl5Q32NY8 489 aa2.21□□□□□ -2.06
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Ppp1r21Q3TDD9 780 aa2.21□□□□□ -2.06
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Ckap2Q3V1H1 664 aa2.21□□□□□ -2.06
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Mup20Q5FW60 181 aa2.21□□□□□ -2.06
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Atg16l2Q6KAU8 623 aa2.21□□□□□ -2.06
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Camk2dQ6PHZ2 499 aa2.21□□□□□ -2.06
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Rfx4Q7TNK1 735 aa2.21□□□□□ -2.06
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Olfr1225Q7TR01 311 aa2.21□□□□□ -2.06
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Ddhd2Q80Y98 699 aa2.21□□□□□ -2.06
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Kbtbd3Q8BHI4 607 aa2.21□□□□□ -2.06
Topbp1-ps1-201ENSMUST00000187120 Glt28d2Q8BML3 165 aa2.21□□□□□ -2.06
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 28.8 ms