RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636071.2

SCN2A-209, Transcript of sodium voltage-gated channel alpha subunit 2, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 5 BASIC

Gene SCN2A, Length 8,881 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2A-209ENST00000636071 IRGQQ8WZA9 623 aa6.34□□□□□ -1.39
SCN2A-209ENST00000636071 EPYCQ99645 322 aa6.34□□□□□ -1.39
SCN2A-209ENST00000636071 B3GAT2Q9NPZ5 323 aa6.34□□□□□ -1.39
SCN2A-209ENST00000636071 HACL1Q9UJ83 578 aa6.34□□□□□ -1.39
SCN2A-209ENST00000636071 EIF1AYO14602 144 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
SCN2A-209ENST00000636071 DFNA5O60443 496 aa6.34□□□□□ -1.39
SCN2A-209ENST00000636071 MAP3K6O95382 1288 aa6.34□□□□□ -1.39
SCN2A-209ENST00000636071 PRAMEF1O95521 474 aa6.34□□□□□ -1.39
SCN2A-209ENST00000636071 MMP10P09238 476 aa6.34□□□□□ -1.39
SCN2A-209ENST00000636071 KCNA5P22460 613 aa6.34□□□□□ -1.39
SCN2A-209ENST00000636071 IGFBP5P24593 272 aa6.34□□□□□ -1.39
SCN2A-209ENST00000636071 EIF1AXP47813 144 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
SCN2A-209ENST00000636071 MAB21L1Q13394 359 aa6.34□□□□□ -1.39
SCN2A-209ENST00000636071 DGCR6Q14129 220 aa6.34□□□□□ -1.39
SCN2A-209ENST00000636071 SMTNL2Q2TAL5 461 aa6.34□□□□□ -1.39
SCN2A-209ENST00000636071 ASTE1Q2TB18 679 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
SCN2A-209ENST00000636071 TCEAL4Q96EI5 215 aa6.34□□□□□ -1.39
SCN2A-209ENST00000636071 ORAI2Q96SN7 254 aa6.34□□□□□ -1.39
SCN2A-209ENST00000636071 ETNK2Q9NVF9 386 aa6.34□□□□□ -1.39
SCN2A-209ENST00000636071 ACTR3BQ9P1U1 418 aa6.34□□□□□ -1.39
SCN2A-209ENST00000636071 SCP2D1Q9UJQ7 156 aa6.34□□□□□ -1.39
SCN2A-209ENST00000636071 TMEM5Q9Y2B1 443 aa6.34□□□□□ -1.39
SCN2A-209ENST00000636071 C5orf60A6NFR6 353 aa6.34□□□□□ -1.39
SCN2A-209ENST00000636071 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
SCN2A-209ENST00000636071 DNTTP04053 509 aa6.34□□□□□ -1.39
SCN2A-209ENST00000636071 DBTP11182 482 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
SCN2A-209ENST00000636071 GJA1P17302 382 aa6.34□□□□□ -1.39
SCN2A-209ENST00000636071 BLMHQ13867 455 aa6.34□□□□□ -1.39
SCN2A-209ENST00000636071 ZBED5Q49AG3 693 aa6.34□□□□□ -1.39
SCN2A-209ENST00000636071 DCST1Q5T197 706 aa6.34□□□□□ -1.39
SCN2A-209ENST00000636071 SUSD4Q5VX71 490 aa6.34□□□□□ -1.39
SCN2A-209ENST00000636071 FBXL19Q6PCT2 694 aa6.34□□□□□ -1.39
SCN2A-209ENST00000636071 ATG9AQ7Z3C6 839 aa6.34□□□□□ -1.39
SCN2A-209ENST00000636071 C17orf64Q86WR6 236 aa6.34□□□□□ -1.39
SCN2A-209ENST00000636071 CXorf40BQ96DE9 158 aa6.34□□□□□ -1.39
SCN2A-209ENST00000636071 KLHL5Q96PQ7 755 aa6.34□□□□□ -1.39
SCN2A-209ENST00000636071 GPER1Q99527 375 aa6.34□□□□□ -1.39
SCN2A-209ENST00000636071 TRMT13Q9NUP7 481 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
SCN2A-209ENST00000636071 GGT7Q9UJ14 662 aa6.34□□□□□ -1.39
SCN2A-209ENST00000636071 ST14Q9Y5Y6 855 aa6.34□□□□□ -1.39
SCN2A-209ENST00000636071 COL1A2P08123 1366 aa6.34□□□□□ -1.39
SCN2A-209ENST00000636071 TMEM94Q12767 1356 aa6.34□□□□□ -1.39
SCN2A-209ENST00000636071 ALOX15BO15296 676 aa6.34□□□□□ -1.39
SCN2A-209ENST00000636071 GRID2O43424 1007 aa6.34□□□□□ -1.39
SCN2A-209ENST00000636071 ALDH2P05091 517 aa6.34□□□□□ -1.39
SCN2A-209ENST00000636071 SLC35G4P0C7Q5 338 aa6.34□□□□□ -1.39
SCN2A-209ENST00000636071 NAGLUP54802 743 aa6.34□□□□□ -1.39
SCN2A-209ENST00000636071 MTMR2Q13614 643 aa6.34□□□□□ -1.39
SCN2A-209ENST00000636071 ARMCX6Q7L4S7 300 aa6.34□□□□□ -1.39
SCN2A-209ENST00000636071 SYNE4Q8N205 404 aa6.34□□□□□ -1.39
SCN2A-209ENST00000636071 LRRC52Q8N7C0 313 aa6.34□□□□□ -1.39
SCN2A-209ENST00000636071 OR8H1Q8NGG4 311 aa6.34□□□□□ -1.39
SCN2A-209ENST00000636071 NODALQ96S42 347 aa6.34□□□□□ -1.39
SCN2A-209ENST00000636071 IFT27Q9BW83 186 aa6.34□□□□□ -1.39
SCN2A-209ENST00000636071 EVA1AQ9H8M9 152 aa6.34□□□□□ -1.39
SCN2A-209ENST00000636071 SNTG2Q9NY99 539 aa6.34□□□□□ -1.39
SCN2A-209ENST00000636071 AP1M2Q9Y6Q5 423 aa6.34□□□□□ -1.39
SCN2A-209ENST00000636071 CBX4O00257 560 aa6.34□□□□□ -1.39
SCN2A-209ENST00000636071 LAMP2P13473 410 aa6.34□□□□□ -1.39
SCN2A-209ENST00000636071 MATKP42679 507 aa6.34□□□□□ -1.39
SCN2A-209ENST00000636071 YAP1P46937 504 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
SCN2A-209ENST00000636071 TLE3Q04726 772 aa6.34□□□□□ -1.39
SCN2A-209ENST00000636071 NFE2L1Q14494 772 aa6.34□□□□□ -1.39
SCN2A-209ENST00000636071 INAVAQ3KP66 663 aa6.34□□□□□ -1.39
SCN2A-209ENST00000636071 ALG10BQ5I7T1 473 aa6.34□□□□□ -1.39
SCN2A-209ENST00000636071 PDSS1Q5T2R2 415 aa6.34□□□□□ -1.39
SCN2A-209ENST00000636071 FAM83AQ86UY5 434 aa6.34□□□□□ -1.39
SCN2A-209ENST00000636071 ERI1Q8IV48 349 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
SCN2A-209ENST00000636071 STOML3Q8TAV4 291 aa6.34□□□□□ -1.39
SCN2A-209ENST00000636071 HCAR2Q8TDS4 363 aa6.34□□□□□ -1.39
SCN2A-209ENST00000636071 SEC14L1Q92503 715 aa6.34□□□□□ -1.39
SCN2A-209ENST00000636071 C8orf48Q96LL4 319 aa6.34□□□□□ -1.39
SCN2A-209ENST00000636071 TBC1D10AQ9BXI6 508 aa6.34□□□□□ -1.39
SCN2A-209ENST00000636071 ZYG11BQ9C0D3 744 aa6.34□□□□□ -1.39
SCN2A-209ENST00000636071 TBC1D24Q9ULP9 559 aa6.34□□□□□ -1.39
SCN2A-209ENST00000636071 TRAPPC13A5PLN9 417 aa6.34□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 NPHS1O60500 1241 aa6.34□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 SLC19A2O60779 497 aa6.34□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 IFNA10P01566 189 aa6.34□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 GLRBP48167 497 aa6.34□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 STXBP1P61764 594 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 SLC13A2Q13183 592 aa6.34□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 NUP54Q7Z3B4 507 aa6.34□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 UBE2Q1Q7Z7E8 422 aa6.34□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 GALNT6Q8NCL4 622 aa6.34□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 S100A14Q9HCY8 104 aa6.34□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 TMEM260Q9NX78 707 aa6.34□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 MIOSQ9NXC5 875 aa6.34□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 SEC14L3Q9UDX4 400 aa6.34□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 DNMT3LQ9UJW3 386 aa6.34□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 MYPNQ86TC9 1320 aa6.33□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 TRAV19A0A0A6YYK7 116 aa6.33□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 CXCL11O14625 94 aa6.33□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 PTPN9P43378 593 aa6.33□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 TUBP50607 506 aa6.33□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 CAV3P56539 151 aa6.33□□□□□ -1.4
SCN2A-209ENST00000636071 EFEMP1Q12805 493 aa6.33□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.1 ms