RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000619438.4

SGMS1-210, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene SGMS1, Length 1,680 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-210ENST00000619438 CLEC14AQ86T13 490 aa21.5■■□□□ 1.03
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SGMS1-210ENST00000619438 RGL4Q8IZJ4 473 aa21.5■■□□□ 1.03
SGMS1-210ENST00000619438 FOXJ1Q92949 421 aa21.5■■□□□ 1.03
SGMS1-210ENST00000619438 AGAP2Q99490 1192 aa21.5■■□□□ 1.03
SGMS1-210ENST00000619438 SLC25A51Q9H1U9 297 aa21.5■■□□□ 1.03
SGMS1-210ENST00000619438 ARNT2Q9HBZ2 717 aa21.5■■□□□ 1.03
SGMS1-210ENST00000619438 SCML1Q9UN30 329 aa21.5■■□□□ 1.03
SGMS1-210ENST00000619438 TRIM33Q9UPN9 1127 aa21.5■■□□□ 1.03
SGMS1-210ENST00000619438 HS3ST2Q9Y278 367 aa21.5■■□□□ 1.03
SGMS1-210ENST00000619438 CEP250Q9BV73 2442 aa21.5■■□□□ 1.03
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SGMS1-210ENST00000619438 ELAVL3Q14576 367 aaKnown RBP21.49■■□□□ 1.03
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SGMS1-210ENST00000619438 HSPA12BQ96MM6 686 aa21.49■■□□□ 1.03
SGMS1-210ENST00000619438 FAM129BQ96TA1 746 aa21.49■■□□□ 1.03
SGMS1-210ENST00000619438 OMDQ99983 421 aa21.49■■□□□ 1.03
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SGMS1-210ENST00000619438 PLXND1Q9Y4D7 1925 aa21.49■■□□□ 1.03
SGMS1-210ENST00000619438 CEP192Q8TEP8 1941 aa21.48■■□□□ 1.03
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SGMS1-210ENST00000619438 ITPKAP23677 461 aa21.48■■□□□ 1.03
SGMS1-210ENST00000619438 SLC8A1P32418 973 aa21.48■■□□□ 1.03
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SGMS1-210ENST00000619438 FICDQ9BVA6 458 aa21.48■■□□□ 1.03
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SGMS1-210ENST00000619438 WWP1Q9H0M0 922 aa21.48■■□□□ 1.03
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SGMS1-210ENST00000619438 K7ERQ8 282 aa21.47■■□□□ 1.03
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SGMS1-210ENST00000619438 SYT12Q8IV01 421 aa21.47■■□□□ 1.03
SGMS1-210ENST00000619438 TEX26Q8N6G2 289 aa21.47■■□□□ 1.03
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SGMS1-210ENST00000619438 MRGPRX2Q96LB1 330 aa21.47■■□□□ 1.03
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SGMS1-210ENST00000619438 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
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SGMS1-210ENST00000619438 KDELC1Q6UW63 502 aa21.47■■□□□ 1.03
SGMS1-210ENST00000619438 CADM4Q8NFZ8 388 aa21.47■■□□□ 1.03
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SGMS1-210ENST00000619438 IMP4Q96G21 291 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
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SGMS1-210ENST00000619438 NOD2Q9HC29 1040 aa21.47■■□□□ 1.03
SGMS1-210ENST00000619438 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa21.47■■□□□ 1.03
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SGMS1-210ENST00000619438 MEI4A8MW99 385 aa21.46■■□□□ 1.03
SGMS1-210ENST00000619438 PRR5-ARHGAP8B1AHC4 643 aa21.46■■□□□ 1.03
SGMS1-210ENST00000619438 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
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SGMS1-210ENST00000619438 CBX6O95503 412 aa21.46■■□□□ 1.03
SGMS1-210ENST00000619438 ADH1BP00325 375 aa21.46■■□□□ 1.03
SGMS1-210ENST00000619438 ACSL1P33121 698 aa21.46■■□□□ 1.03
SGMS1-210ENST00000619438 ARCN1P48444 511 aaKnown RBP21.46■■□□□ 1.03
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SGMS1-210ENST00000619438 WDR45BQ5MNZ6 344 aa21.46■■□□□ 1.03
SGMS1-210ENST00000619438 FAM46CQ5VWP2 391 aa21.46■■□□□ 1.03
SGMS1-210ENST00000619438 CMC1Q7Z7K0 106 aa21.46■■□□□ 1.03
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