RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617172.4

TARDBP-218, Transcript of TAR DNA binding protein, humanhuman

TSL 5

Gene TARDBP, Length 980 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARDBP-218ENST00000617172 SARM1Q6SZW1 724 aa9.6□□□□□ -0.87
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TARDBP-218ENST00000617172 USP53Q70EK8 1073 aa9.6□□□□□ -0.87
TARDBP-218ENST00000617172 MARK2Q7KZI7 788 aaKnown RBP9.6□□□□□ -0.87
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TARDBP-218ENST00000617172 CCDC170Q8IYT3 715 aa9.6□□□□□ -0.87
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TARDBP-218ENST00000617172 SBDSQ9Y3A5 250 aaKnown RBP eCLIP9.6□□□□□ -0.87
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TARDBP-218ENST00000617172 PMS2P1A4D2B8 440 aa9.59□□□□□ -0.87
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TARDBP-218ENST00000617172 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa9.59□□□□□ -0.87
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TARDBP-218ENST00000617172 KIR2DS3K7RE56 304 aa9.58□□□□□ -0.88
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TARDBP-218ENST00000617172 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
TARDBP-218ENST00000617172 PCSK7Q16549 785 aa9.58□□□□□ -0.88
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