RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616768.4

MLH1-223, Transcript of mutL homolog 1, human

TSL 2

Gene MLH1, Length 721 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MLH1-223	ENST00000616768	CRYGN	Q8WXF5	182 aa		5.04	□□□□□ -1.6
MLH1-223	ENST00000616768	VOPP1	Q96AW1	172 aa		5.04	□□□□□ -1.6
MLH1-223	ENST00000616768	C19orf60	Q96EN9	201 aa		5.04	□□□□□ -1.6
MLH1-223	ENST00000616768	TMX3	Q96JJ7	454 aa		5.04	□□□□□ -1.6
MLH1-223	ENST00000616768	SERAC1	Q96JX3	654 aa		5.04	□□□□□ -1.6
MLH1-223	ENST00000616768	TEKT5	Q96M29	485 aa		5.04	□□□□□ -1.6
MLH1-223	ENST00000616768	ERVMER34-1	Q9H9K5	563 aa		5.04	□□□□□ -1.6
MLH1-223	ENST00000616768	KCTD5	Q9NXV2	234 aa		5.04	□□□□□ -1.6
MLH1-223	ENST00000616768	UXT	Q9UBK9	157 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
MLH1-223	ENST00000616768	RPH3A	Q9Y2J0	694 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
MLH1-223	ENST00000616768	MTO1	Q9Y2Z2	717 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
MLH1-223	ENST00000616768	LOXL2	Q9Y4K0	774 aa		5.04	□□□□□ -1.6
MLH1-223	ENST00000616768	ERICH2	A1L162	156 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MLH1-223	ENST00000616768	SMCO2	A6NFE2	343 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MLH1-223	ENST00000616768		E7ENX8	843 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MLH1-223	ENST00000616768	KIAA0391	O15091	583 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
MLH1-223	ENST00000616768	LRRTM2	O43300	516 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MLH1-223	ENST00000616768	PRC1	O43663	620 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MLH1-223	ENST00000616768	JAK2	O60674	1132 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MLH1-223	ENST00000616768	TCEA3	O75764	348 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MLH1-223	ENST00000616768	PSMD10	O75832	226 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MLH1-223	ENST00000616768	NOL4	O94818	638 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MLH1-223	ENST00000616768	F9	P00740	461 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MLH1-223	ENST00000616768	ALPPL2	P10696	532 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MLH1-223	ENST00000616768	IRF1	P10914	325 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MLH1-223	ENST00000616768	ITGA3	P26006	1051 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MLH1-223	ENST00000616768	PCSK6	P29122	969 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MLH1-223	ENST00000616768	YWHAB	P31946	246 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
MLH1-223	ENST00000616768	CDH8	P55286	799 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MLH1-223	ENST00000616768	POU6F2	P78424	691 aa	Predicted RBP	5.03	□□□□□ -1.6
MLH1-223	ENST00000616768	TAP2	Q03519	686 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MLH1-223	ENST00000616768	SPAG1	Q07617	926 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MLH1-223	ENST00000616768	ITK	Q08881	620 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MLH1-223	ENST00000616768	KCNJ12	Q14500	433 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MLH1-223	ENST00000616768	DHX8	Q14562	1220 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
MLH1-223	ENST00000616768	ZNF234	Q14588	700 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MLH1-223	ENST00000616768	ACAP2	Q15057	778 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MLH1-223	ENST00000616768	CCDC142	Q17RM4	750 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MLH1-223	ENST00000616768	DCAF4L1	Q3SXM0	396 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MLH1-223	ENST00000616768	POM121L1P	Q3SYA9	428 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MLH1-223	ENST00000616768	NCEH1	Q6PIU2	408 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MLH1-223	ENST00000616768	ZNF517	Q6ZMY9	492 aa	Predicted RBP	5.03	□□□□□ -1.6
MLH1-223	ENST00000616768	TPGS1	Q6ZTW0	290 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MLH1-223	ENST00000616768	MAEA	Q7L5Y9	396 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MLH1-223	ENST00000616768	TTC7B	Q86TV6	843 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MLH1-223	ENST00000616768	PDSS2	Q86YH6	399 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MLH1-223	ENST00000616768	BBS7	Q8IWZ6	715 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MLH1-223	ENST00000616768	EXOC8	Q8IYI6	725 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MLH1-223	ENST00000616768	FSIP1	Q8NA03	581 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MLH1-223	ENST00000616768	NCOA7	Q8NI08	942 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MLH1-223	ENST00000616768	SPPL2B	Q8TCT7	592 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MLH1-223	ENST00000616768	GTF3C6	Q969F1	213 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MLH1-223	ENST00000616768	WBP2	Q969T9	261 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MLH1-223	ENST00000616768	PTCD3	Q96EY7	689 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
MLH1-223	ENST00000616768	PPP1R13B	Q96KQ4	1090 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MLH1-223	ENST00000616768	RIT2	Q99578	217 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MLH1-223	ENST00000616768	NFKBIZ	Q9BYH8	718 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MLH1-223	ENST00000616768	BRINP2	Q9C0B6	783 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MLH1-223	ENST00000616768	ZCWPW1	Q9H0M4	648 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MLH1-223	ENST00000616768	POLR3F	Q9H1D9	316 aa	Predicted RBP	5.03	□□□□□ -1.6
MLH1-223	ENST00000616768	SPHK2	Q9NRA0	654 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MLH1-223	ENST00000616768	GJB4	Q9NTQ9	266 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MLH1-223	ENST00000616768	TMLHE	Q9NVH6	421 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MLH1-223	ENST00000616768	RLIM	Q9NVW2	624 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MLH1-223	ENST00000616768	PTGFRN	Q9P2B2	879 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MLH1-223	ENST00000616768	ADAM21	Q9UKJ8	722 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MLH1-223	ENST00000616768	PCDHA13	Q9Y5I0	950 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MLH1-223	ENST00000616768	SNX14	Q9Y5W7	946 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MLH1-223	ENST00000616768	RYR3	Q15413	4870 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MLH1-223	ENST00000616768	MAP1A	P78559	2803 aa	Predicted RBP	5.02	□□□□□ -1.61
MLH1-223	ENST00000616768	ABCA4	P78363	2273 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MLH1-223	ENST00000616768	ANKUB1	A6NFN9	424 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MLH1-223	ENST00000616768	CCDC154	A6NI56	674 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MLH1-223	ENST00000616768	PPEF2	O14830	753 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MLH1-223	ENST00000616768	PRPF3	O43395	683 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
MLH1-223	ENST00000616768	ZFPL1	O95159	310 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MLH1-223	ENST00000616768	CBX6	O95503	412 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MLH1-223	ENST00000616768	MT-CO1	P00395	513 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MLH1-223	ENST00000616768	DNTT	P04053	509 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MLH1-223	ENST00000616768	MYBL2	P10244	700 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MLH1-223	ENST00000616768	MBL2	P11226	248 aa	Predicted RBP	5.02	□□□□□ -1.61
MLH1-223	ENST00000616768	HARS	P12081	509 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
MLH1-223	ENST00000616768	TYR	P14679	529 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MLH1-223	ENST00000616768	CAPN3	P20807	821 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MLH1-223	ENST00000616768	ARL2	P36404	184 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MLH1-223	ENST00000616768	FOLR3	P41439	243 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MLH1-223	ENST00000616768	NT5C2	P49902	561 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MLH1-223	ENST00000616768	CACNA2D1	P54289	1103 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MLH1-223	ENST00000616768	GALC	P54803	685 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MLH1-223	ENST00000616768	SLC7A9	P82251	487 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MLH1-223	ENST00000616768	POU5F1B	Q06416	359 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MLH1-223	ENST00000616768	EIF3I	Q13347	325 aa	Known RBP	5.02	□□□□□ -1.61
MLH1-223	ENST00000616768	SLC45A4	Q5BKX6	768 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MLH1-223	ENST00000616768	XKR4	Q5GH76	650 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MLH1-223	ENST00000616768	ALKAL1	Q6UXT8	129 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MLH1-223	ENST00000616768	CLNK	Q7Z7G1	428 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MLH1-223	ENST00000616768	ZBTB8OS	Q8IWT0	167 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MLH1-223	ENST00000616768	RDM1	Q8NG50	284 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MLH1-223	ENST00000616768	OR2T3	Q8NH03	318 aa		5.02	□□□□□ -1.61
MLH1-223	ENST00000616768	GANC	Q8TET4	914 aa		5.02	□□□□□ -1.61

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