RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616271.4

CADM1-222, Transcript of cell adhesion molecule 1, human

TSL 5 BASIC

Gene CADM1, Length 1,246 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CADM1-222	ENST00000616271	TRIP6	Q15654	476 aa	Known RBP	18.25	■□□□□ 0.51
CADM1-222	ENST00000616271	TPSAB1	Q15661	275 aa		18.25	■□□□□ 0.51
CADM1-222	ENST00000616271	DOK6	Q6PKX4	331 aa		18.25	■□□□□ 0.51
CADM1-222	ENST00000616271	SYT10	Q6XYQ8	523 aa		18.25	■□□□□ 0.51
CADM1-222	ENST00000616271	PHYKPL	Q8IUZ5	450 aa		18.25	■□□□□ 0.51
CADM1-222	ENST00000616271	OR4K2	Q8NGD2	314 aa		18.25	■□□□□ 0.51
CADM1-222	ENST00000616271	GLYATL1	Q969I3	302 aa		18.25	■□□□□ 0.51
CADM1-222	ENST00000616271	TRIM44	Q96DX7	344 aa	Predicted RBP	18.25	■□□□□ 0.51
CADM1-222	ENST00000616271	SCARF2	Q96GP6	870 aa	Predicted RBP	18.25	■□□□□ 0.51
CADM1-222	ENST00000616271	IL26	Q9NPH9	171 aa		18.25	■□□□□ 0.51
CADM1-222	ENST00000616271	CASS4	Q9NQ75	786 aa		18.25	■□□□□ 0.51
CADM1-222	ENST00000616271	MOSPD1	Q9UJG1	213 aa		18.25	■□□□□ 0.51
CADM1-222	ENST00000616271	NEU2	Q9Y3R4	380 aa		18.25	■□□□□ 0.51
CADM1-222	ENST00000616271	DNAH14	Q0VDD8	3507 aa		18.25	■□□□□ 0.51
CADM1-222	ENST00000616271	LMO7DN	F2Z398	122 aa		18.24	■□□□□ 0.51
CADM1-222	ENST00000616271	CCDC188	H7C350	402 aa		18.24	■□□□□ 0.51
CADM1-222	ENST00000616271	TPP1	O14773	563 aa		18.24	■□□□□ 0.51
CADM1-222	ENST00000616271	ECEL1	O95672	775 aa		18.24	■□□□□ 0.51
CADM1-222	ENST00000616271	TPH1	P17752	444 aa		18.24	■□□□□ 0.51
CADM1-222	ENST00000616271	KCNA4	P22459	653 aa		18.24	■□□□□ 0.51
CADM1-222	ENST00000616271	HADHA	P40939	763 aa		18.24	■□□□□ 0.51
CADM1-222	ENST00000616271	VPS41	P49754	854 aa		18.24	■□□□□ 0.51
CADM1-222	ENST00000616271	GPS1	Q13098	491 aa		18.24	■□□□□ 0.51
CADM1-222	ENST00000616271	C1orf61	Q13536	156 aa		18.24	■□□□□ 0.51
CADM1-222	ENST00000616271	ITGA9	Q13797	1035 aa		18.24	■□□□□ 0.51
CADM1-222	ENST00000616271	POU6F1	Q14863	301 aa		18.24	■□□□□ 0.51
CADM1-222	ENST00000616271	FAM151B	Q6UXP7	276 aa		18.24	■□□□□ 0.51
CADM1-222	ENST00000616271	SLCO2A1	Q92959	643 aa		18.24	■□□□□ 0.51
CADM1-222	ENST00000616271	CNDP2	Q96KP4	475 aa	Known RBP	18.24	■□□□□ 0.51
CADM1-222	ENST00000616271	RUNDC3B	Q96NL0	473 aa		18.24	■□□□□ 0.51
CADM1-222	ENST00000616271	CLPB	Q9H078	707 aa		18.24	■□□□□ 0.51
CADM1-222	ENST00000616271	DDX47	Q9H0S4	455 aa	Known RBP	18.24	■□□□□ 0.51
CADM1-222	ENST00000616271	CARS2	Q9HA77	564 aa	Known RBP	18.24	■□□□□ 0.51
CADM1-222	ENST00000616271	PIH1D1	Q9NWS0	290 aa	Known RBP	18.24	■□□□□ 0.51
CADM1-222	ENST00000616271	PCYOX1	Q9UHG3	505 aa		18.24	■□□□□ 0.51
CADM1-222	ENST00000616271	APPL1	Q9UKG1	709 aa		18.24	■□□□□ 0.51
CADM1-222	ENST00000616271	SUFU	Q9UMX1	484 aa		18.24	■□□□□ 0.51
CADM1-222	ENST00000616271	KCTD3	Q9Y597	815 aa		18.24	■□□□□ 0.51
CADM1-222	ENST00000616271	OAS3	Q9Y6K5	1087 aa	Known RBP	18.24	■□□□□ 0.51
CADM1-222	ENST00000616271	AP3B1	O00203	1094 aa		18.23	■□□□□ 0.51
CADM1-222	ENST00000616271	TRIM38	O00635	465 aa		18.23	■□□□□ 0.51
CADM1-222	ENST00000616271	GAPDHS	O14556	408 aa	Predicted RBP	18.23	■□□□□ 0.51
CADM1-222	ENST00000616271	TNFSF14	O43557	240 aa		18.23	■□□□□ 0.51
CADM1-222	ENST00000616271	SIGLEC6	O43699	453 aa		18.23	■□□□□ 0.51
CADM1-222	ENST00000616271	SLC25A14	O95258	325 aa	Predicted RBP	18.23	■□□□□ 0.51
CADM1-222	ENST00000616271	ASMTL	O95671	621 aa		18.23	■□□□□ 0.51
CADM1-222	ENST00000616271	LDOC1	O95751	146 aa	Predicted RBP	18.23	■□□□□ 0.51
CADM1-222	ENST00000616271	ANXA6	P08133	673 aa		18.23	■□□□□ 0.51
CADM1-222	ENST00000616271	GRIA1	P42261	906 aa		18.23	■□□□□ 0.51
CADM1-222	ENST00000616271	MAGEA6	P43360	314 aa		18.23	■□□□□ 0.51
CADM1-222	ENST00000616271	POLD2	P49005	469 aa		18.23	■□□□□ 0.51
CADM1-222	ENST00000616271	LAMB3	Q13751	1172 aa		18.23	■□□□□ 0.51
CADM1-222	ENST00000616271	SEPT6	Q14141	434 aa		18.23	■□□□□ 0.51
CADM1-222	ENST00000616271	PTPRCAP	Q14761	206 aa		18.23	■□□□□ 0.51
CADM1-222	ENST00000616271	CHRNA6	Q15825	494 aa		18.23	■□□□□ 0.51
CADM1-222	ENST00000616271	ATP13A5	Q4VNC0	1218 aa		18.23	■□□□□ 0.51
CADM1-222	ENST00000616271	LVRN	Q6Q4G3	990 aa		18.23	■□□□□ 0.51
CADM1-222	ENST00000616271	ERMP1	Q7Z2K6	904 aa		18.23	■□□□□ 0.51
CADM1-222	ENST00000616271	GKN2	Q86XP6	184 aa		18.23	■□□□□ 0.51
CADM1-222	ENST00000616271	OR13C4	Q8NGS5	318 aa		18.23	■□□□□ 0.51
CADM1-222	ENST00000616271	STYX	Q8WUJ0	223 aa		18.23	■□□□□ 0.51
CADM1-222	ENST00000616271	C16orf45	Q96MC5	204 aa	Predicted RBP	18.23	■□□□□ 0.51
CADM1-222	ENST00000616271	RANBP9	Q96S59	729 aa		18.23	■□□□□ 0.51
CADM1-222	ENST00000616271	RMI1	Q9H9A7	625 aa		18.23	■□□□□ 0.51
CADM1-222	ENST00000616271	SMOX	Q9NWM0	555 aa		18.23	■□□□□ 0.51
CADM1-222	ENST00000616271	TRNAU1AP	Q9NX07	287 aa	Known RBP	18.23	■□□□□ 0.51
CADM1-222	ENST00000616271	EIF2AK3	Q9NZJ5	1116 aa	Known RBP	18.23	■□□□□ 0.51
CADM1-222	ENST00000616271	FKBPL	Q9UIM3	349 aa		18.23	■□□□□ 0.51
CADM1-222	ENST00000616271	TMEM98	Q9Y2Y6	226 aa		18.23	■□□□□ 0.51
CADM1-222	ENST00000616271	SPAAR	A0A1B0GVQ0	90 aa		18.22	■□□□□ 0.51
CADM1-222	ENST00000616271	HEATR9	A2RTY3	570 aa		18.22	■□□□□ 0.51
CADM1-222	ENST00000616271	GPR89A	B7ZAQ6	455 aa		18.22	■□□□□ 0.51
CADM1-222	ENST00000616271	PRAMEF1	O95521	474 aa		18.22	■□□□□ 0.51
CADM1-222	ENST00000616271	FUCA1	P04066	466 aa		18.22	■□□□□ 0.51
CADM1-222	ENST00000616271	CELA2B	P08218	269 aa	Predicted RBP	18.22	■□□□□ 0.51
CADM1-222	ENST00000616271	GPR89B	P0CG08	455 aa		18.22	■□□□□ 0.51
CADM1-222	ENST00000616271	GNPDA1	P46926	289 aa		18.22	■□□□□ 0.51
CADM1-222	ENST00000616271	SIM1	P81133	766 aa	Predicted RBP	18.22	■□□□□ 0.51
CADM1-222	ENST00000616271	KCNJ11	Q14654	390 aa		18.22	■□□□□ 0.51
CADM1-222	ENST00000616271	DEFB133	Q30KQ1	61 aa		18.22	■□□□□ 0.51
CADM1-222	ENST00000616271	PROX2	Q3B8N5	592 aa		18.22	■□□□□ 0.51
CADM1-222	ENST00000616271	ZCCHC8	Q6NZY4	707 aa	Known RBP	18.22	■□□□□ 0.51
CADM1-222	ENST00000616271	FAM181A	Q8N9Y4	354 aa		18.22	■□□□□ 0.51
CADM1-222	ENST00000616271	PTCD2	Q8WV60	388 aa	Known RBP	18.22	■□□□□ 0.51
CADM1-222	ENST00000616271	DNAJC1	Q96KC8	554 aa	Known RBP	18.22	■□□□□ 0.51
CADM1-222	ENST00000616271	OR2M4	Q96R27	311 aa		18.22	■□□□□ 0.51
CADM1-222	ENST00000616271	TMEM168	Q9H0V1	697 aa		18.22	■□□□□ 0.51
CADM1-222	ENST00000616271	TRIM39	Q9HCM9	518 aa		18.22	■□□□□ 0.51
CADM1-222	ENST00000616271	NLE1	Q9NVX2	485 aa	Predicted RBP	18.22	■□□□□ 0.51
CADM1-222	ENST00000616271	TMPRSS11E	Q9UL52	423 aa		18.22	■□□□□ 0.51
CADM1-222	ENST00000616271	DOLK	Q9UPQ8	538 aa		18.22	■□□□□ 0.51
CADM1-222	ENST00000616271	PIKFYVE	Q9Y2I7	2098 aa		18.21	■□□□□ 0.51
CADM1-222	ENST00000616271	PTPRB	P23467	1997 aa		18.21	■□□□□ 0.51
CADM1-222	ENST00000616271	MROH6	A6NGR9	719 aa		18.21	■□□□□ 0.51
CADM1-222	ENST00000616271		H7C0S8	307 aa		18.21	■□□□□ 0.51
CADM1-222	ENST00000616271	YY2	O15391	372 aa		18.21	■□□□□ 0.51
CADM1-222	ENST00000616271	VEGFD	O43915	354 aa		18.21	■□□□□ 0.51
CADM1-222	ENST00000616271	DNAJC6	O75061	913 aa		18.21	■□□□□ 0.51
CADM1-222	ENST00000616271	SRP72	O76094	671 aa	Known RBP	18.21	■□□□□ 0.51
CADM1-222	ENST00000616271	PSMA3	P25788	255 aa		18.21	■□□□□ 0.51

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