RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000592825.1

TMUB2-215, Transcript of transmembrane and ubiquitin like domain containing 2, human

TSL 3 BASIC

Gene TMUB2, Length 2,151 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TMUB2-215	ENST00000592825	TRIM64B	A6NI03	449 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TMUB2-215	ENST00000592825	SYCE1L	A8MT33	242 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TMUB2-215	ENST00000592825		J3KR12	359 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TMUB2-215	ENST00000592825		M0QZQ0	153 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TMUB2-215	ENST00000592825	CCL22	O00626	93 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TMUB2-215	ENST00000592825	PPP6C	O00743	305 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TMUB2-215	ENST00000592825	TNFRSF10B	O14763	440 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TMUB2-215	ENST00000592825	B3GAT3	O94766	335 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TMUB2-215	ENST00000592825	VARS	P26640	1264 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
TMUB2-215	ENST00000592825	HLCS	P50747	726 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TMUB2-215	ENST00000592825	SCNN1B	P51168	640 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TMUB2-215	ENST00000592825	TIAL1	Q01085	375 aa	Known RBP eCLIP	13.6	□□□□□ -0.23	3e-7	■■□□□ 14.3
TMUB2-215	ENST00000592825	CTBS	Q01459	385 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TMUB2-215	ENST00000592825	PMS2P3	Q13401	168 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TMUB2-215	ENST00000592825	ZNF829	Q3KNS6	432 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
TMUB2-215	ENST00000592825	CCNYL2	Q5T2Q4	361 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TMUB2-215	ENST00000592825	ACBD5	Q5T8D3	534 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
TMUB2-215	ENST00000592825	ANKS6	Q68DC2	871 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TMUB2-215	ENST00000592825	OVOS1	Q6IE37	1185 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TMUB2-215	ENST00000592825	DUS1L	Q6P1R4	473 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
TMUB2-215	ENST00000592825	AGMO	Q6ZNB7	445 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TMUB2-215	ENST00000592825	ANKRD23	Q86SG2	305 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TMUB2-215	ENST00000592825	SPATA2L	Q8IUW3	424 aa	Predicted RBP	13.6	□□□□□ -0.23
TMUB2-215	ENST00000592825	OR10T2	Q8NGX3	314 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TMUB2-215	ENST00000592825	ARRDC2	Q8TBH0	407 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TMUB2-215	ENST00000592825	LPP	Q93052	612 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TMUB2-215	ENST00000592825	KLHL5	Q96PQ7	755 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TMUB2-215	ENST00000592825	PAAF1	Q9BRP4	392 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TMUB2-215	ENST00000592825	AARSD1	Q9BTE6	412 aa	Known RBP	13.6	□□□□□ -0.23
TMUB2-215	ENST00000592825	BDH2	Q9BUT1	245 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TMUB2-215	ENST00000592825	BRINP2	Q9C0B6	783 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TMUB2-215	ENST00000592825	DERL2	Q9GZP9	239 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TMUB2-215	ENST00000592825	MUC3B	Q9H195	1237 aa		13.6	□□□□□ -0.23
TMUB2-215	ENST00000592825	CCL15-CCL14	A0A0B4J2E2	113 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TMUB2-215	ENST00000592825	SUPT3H	B4E1H0	165 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TMUB2-215	ENST00000592825	SUPT3H	O75486	399 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TMUB2-215	ENST00000592825	CHRM3	P20309	590 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TMUB2-215	ENST00000592825	HTR1E	P28566	365 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TMUB2-215	ENST00000592825	EEF1D	P29692	281 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
TMUB2-215	ENST00000592825	GRIK1	P39086	918 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TMUB2-215	ENST00000592825	GRSF1	Q12849	480 aa	Known RBP eCLIP	13.59	□□□□□ -0.23
TMUB2-215	ENST00000592825	FXN	Q16595	210 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TMUB2-215	ENST00000592825	CCL15	Q16663	113 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TMUB2-215	ENST00000592825	FAM110C	Q1W6H9	321 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TMUB2-215	ENST00000592825	GPR107	Q5VW38	600 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TMUB2-215	ENST00000592825	ELMSAN1	Q6PJG2	1045 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TMUB2-215	ENST00000592825	PRR23B	Q6ZRT6	265 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TMUB2-215	ENST00000592825	LRRTM3	Q86VH5	581 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TMUB2-215	ENST00000592825	TMEM199	Q8N511	208 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TMUB2-215	ENST00000592825	KLHL23	Q8NBE8	558 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TMUB2-215	ENST00000592825	NSUN5	Q96P11	429 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
TMUB2-215	ENST00000592825	KCNA7	Q96RP8	456 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TMUB2-215	ENST00000592825	SGIP1	Q9BQI5	828 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TMUB2-215	ENST00000592825	AP5M1	Q9H0R1	490 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TMUB2-215	ENST00000592825	CATSPERZ	Q9NTU4	200 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TMUB2-215	ENST00000592825	SUN2	Q9UH99	717 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TMUB2-215	ENST00000592825	RNF112	Q9ULX5	631 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TMUB2-215	ENST00000592825	BTRC	Q9Y297	605 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TMUB2-215	ENST00000592825	GBF1	Q92538	1859 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TMUB2-215	ENST00000592825	CCDC154	A6NI56	674 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TMUB2-215	ENST00000592825	STX16	O14662	325 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TMUB2-215	ENST00000592825	ZSCAN9	O15535	394 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
TMUB2-215	ENST00000592825	ATE1	O95260	518 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TMUB2-215	ENST00000592825	EPO	P01588	193 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TMUB2-215	ENST00000592825	RPS17	P08708	135 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
TMUB2-215	ENST00000592825	MTHFD1	P11586	935 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
TMUB2-215	ENST00000592825	STC1	P52823	247 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TMUB2-215	ENST00000592825	ADARB1	P78563	741 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
TMUB2-215	ENST00000592825	IL10RB	Q08334	325 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TMUB2-215	ENST00000592825	TYSND1	Q2T9J0	566 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TMUB2-215	ENST00000592825	PDCD4	Q53EL6	469 aa	Known RBP	13.59	□□□□□ -0.23
TMUB2-215	ENST00000592825	PRAMEF19	Q5SWL8	479 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TMUB2-215	ENST00000592825	TXNDC11	Q6PKC3	985 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TMUB2-215	ENST00000592825	KCTD8	Q6ZWB6	473 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TMUB2-215	ENST00000592825	USP50	Q70EL3	339 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
TMUB2-215	ENST00000592825	TFAP2D	Q7Z6R9	452 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TMUB2-215	ENST00000592825	ZNF683	Q8IZ20	524 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TMUB2-215	ENST00000592825	PNPLA1	Q8N8W4	532 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TMUB2-215	ENST00000592825	NLGN2	Q8NFZ4	835 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TMUB2-215	ENST00000592825	DNAJB14	Q8TBM8	379 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TMUB2-215	ENST00000592825	MAGEE2	Q8TD90	523 aa	Predicted RBP	13.59	□□□□□ -0.23
TMUB2-215	ENST00000592825	SH3RF2	Q8TEC5	729 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TMUB2-215	ENST00000592825	SLC39A13	Q96H72	371 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TMUB2-215	ENST00000592825	ZNF599	Q96NL3	588 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TMUB2-215	ENST00000592825	C1QTNF3	Q9BXJ4	246 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TMUB2-215	ENST00000592825	ZIM2	Q9NZV7	527 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TMUB2-215	ENST00000592825	KCTD3	Q9Y597	815 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TMUB2-215	ENST00000592825		A0A1W2PQH9	124 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TMUB2-215	ENST00000592825	CCDC162P	A2VCL2	907 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TMUB2-215	ENST00000592825	LRRC14B	A6NHZ5	514 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TMUB2-215	ENST00000592825		C9JVG2	144 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TMUB2-215	ENST00000592825		H3BMM5	538 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TMUB2-215	ENST00000592825	MAGEB3	O15480	346 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TMUB2-215	ENST00000592825	SNX2	O60749	519 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TMUB2-215	ENST00000592825	SLC22A3	O75751	556 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TMUB2-215	ENST00000592825	BAIAP3	O94812	1187 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TMUB2-215	ENST00000592825	CPNE6	O95741	557 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TMUB2-215	ENST00000592825	MLYCD	O95822	493 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TMUB2-215	ENST00000592825	ALB	P02768	609 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TMUB2-215	ENST00000592825	ENO2	P09104	434 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31 ms