RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589969.1

NFIC-209, Transcript of nuclear factor I C, humanhuman

TSL 3

Gene NFIC, Length 614 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIC-209ENST00000589969 PRAMEF10O60809 474 aa20.49■□□□□ 0.87
NFIC-209ENST00000589969 MFAP3LO75121 409 aa20.49■□□□□ 0.87
NFIC-209ENST00000589969 SLC1A1P43005 524 aa20.49■□□□□ 0.87
NFIC-209ENST00000589969 LIMK2P53671 638 aa20.49■□□□□ 0.87
NFIC-209ENST00000589969 MAPK10P53779 464 aa20.49■□□□□ 0.87
NFIC-209ENST00000589969 AP1B1Q10567 949 aa20.49■□□□□ 0.87
NFIC-209ENST00000589969 ZBTB17Q13105 803 aa20.49■□□□□ 0.87
NFIC-209ENST00000589969 C16orf72Q14CZ0 275 aa20.49■□□□□ 0.87
NFIC-209ENST00000589969 ZNF574Q6ZN55 896 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
NFIC-209ENST00000589969 ZNF605Q86T29 641 aa20.49■□□□□ 0.87
NFIC-209ENST00000589969 SFRP1Q8N474 314 aa20.49■□□□□ 0.87
NFIC-209ENST00000589969 CNTD1Q8N815 330 aa20.49■□□□□ 0.87
NFIC-209ENST00000589969 CCDC112Q8NEF3 446 aa20.49■□□□□ 0.87
NFIC-209ENST00000589969 RAD18Q9NS91 495 aa20.49■□□□□ 0.87
NFIC-209ENST00000589969 WDR70Q9NW82 654 aa20.49■□□□□ 0.87
NFIC-209ENST00000589969 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
NFIC-209ENST00000589969 INTUQ9ULD6 942 aa20.49■□□□□ 0.87
NFIC-209ENST00000589969 CNOT6Q9ULM6 557 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
NFIC-209ENST00000589969 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa20.49■□□□□ 0.87
NFIC-209ENST00000589969 IGHV1OR21-1A0A087WYE8 117 aa20.48■□□□□ 0.87
NFIC-209ENST00000589969 DNAJC6O75061 913 aa20.48■□□□□ 0.87
NFIC-209ENST00000589969 ETV5P41161 510 aa20.48■□□□□ 0.87
NFIC-209ENST00000589969 SLC14A2Q15849 920 aa20.48■□□□□ 0.87
NFIC-209ENST00000589969 BZW1Q7L1Q6 419 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
NFIC-209ENST00000589969 NT5DC3Q86UY8 548 aa20.48■□□□□ 0.87
NFIC-209ENST00000589969 CNGA4Q8IV77 575 aa20.48■□□□□ 0.87
NFIC-209ENST00000589969 RHOT1Q8IXI2 618 aa20.48■□□□□ 0.87
NFIC-209ENST00000589969 AGBL5Q8NDL9 886 aa20.48■□□□□ 0.87
NFIC-209ENST00000589969 IMP4Q96G21 291 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
NFIC-209ENST00000589969 CCDC74BQ96LY2 380 aa20.48■□□□□ 0.87
NFIC-209ENST00000589969 OLFM3Q96PB7 478 aa20.48■□□□□ 0.87
NFIC-209ENST00000589969 WDR24Q96S15 920 aa20.48■□□□□ 0.87
NFIC-209ENST00000589969 SLC38A3Q99624 504 aa20.48■□□□□ 0.87
NFIC-209ENST00000589969 CHP1Q99653 195 aa20.48■□□□□ 0.87
NFIC-209ENST00000589969 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP20.48■□□□□ 0.87
NFIC-209ENST00000589969 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa20.48■□□□□ 0.87
NFIC-209ENST00000589969 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
NFIC-209ENST00000589969 GPR89AB7ZAQ6 455 aa20.47■□□□□ 0.87
NFIC-209ENST00000589969 C9orf172C9J069 976 aa20.47■□□□□ 0.87
NFIC-209ENST00000589969 IQCJ-SCHIP1C9J366 451 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
NFIC-209ENST00000589969 EFSO43281 561 aa20.47■□□□□ 0.87
NFIC-209ENST00000589969 KRT1P04264 644 aa20.47■□□□□ 0.87
NFIC-209ENST00000589969 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
NFIC-209ENST00000589969 GPR89BP0CG08 455 aa20.47■□□□□ 0.87
NFIC-209ENST00000589969 SLC2A4P14672 509 aa20.47■□□□□ 0.87
NFIC-209ENST00000589969 TCEAL1Q15170 157 aa20.47■□□□□ 0.87
NFIC-209ENST00000589969 TGIF1Q15583 401 aa20.47■□□□□ 0.87
NFIC-209ENST00000589969 MANEAQ5SRI9 462 aa20.47■□□□□ 0.87
NFIC-209ENST00000589969 OR10G6Q8NH81 332 aa20.47■□□□□ 0.87
NFIC-209ENST00000589969 SLC37A2Q8TED4 501 aa20.47■□□□□ 0.87
NFIC-209ENST00000589969 SH3KBP1Q96B97 665 aa20.47■□□□□ 0.87
NFIC-209ENST00000589969 SGF29Q96ES7 293 aa20.47■□□□□ 0.87
NFIC-209ENST00000589969 AHCYL2Q96HN2 611 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
NFIC-209ENST00000589969 TAAR9Q96RI9 348 aa20.47■□□□□ 0.87
NFIC-209ENST00000589969 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
NFIC-209ENST00000589969 HERPUD2Q9BSE4 406 aa20.47■□□□□ 0.87
NFIC-209ENST00000589969 SLC25A51Q9H1U9 297 aa20.47■□□□□ 0.87
NFIC-209ENST00000589969 CARD9Q9H257 536 aa20.47■□□□□ 0.87
NFIC-209ENST00000589969 MAGEE1Q9HCI5 957 aa20.47■□□□□ 0.87
NFIC-209ENST00000589969 SPTLC3Q9NUV7 552 aa20.47■□□□□ 0.87
NFIC-209ENST00000589969 FOXJ2Q9P0K8 574 aa20.47■□□□□ 0.87
NFIC-209ENST00000589969 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa20.47■□□□□ 0.87
NFIC-209ENST00000589969 OAS3Q9Y6K5 1087 aaKnown RBP20.47■□□□□ 0.87
NFIC-209ENST00000589969 FADS2P1A8MWK0 482 aa20.46■□□□□ 0.87
NFIC-209ENST00000589969 AGRPO00253 132 aa20.46■□□□□ 0.87
NFIC-209ENST00000589969 CSTF2P33240 577 aaKnown RBP eCLIP20.46■□□□□ 0.87
NFIC-209ENST00000589969 NR2C2P49116 596 aa20.46■□□□□ 0.87
NFIC-209ENST00000589969 DCDC1P59894 354 aa20.46■□□□□ 0.87
NFIC-209ENST00000589969 GALNT3Q14435 633 aa20.46■□□□□ 0.87
NFIC-209ENST00000589969 NKAIN2Q5VXU1 208 aa20.46■□□□□ 0.87
NFIC-209ENST00000589969 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa20.46■□□□□ 0.87
NFIC-209ENST00000589969 PDPK2PQ6A1A2 396 aa20.46■□□□□ 0.87
NFIC-209ENST00000589969 CCDC70Q6NSX1 233 aa20.46■□□□□ 0.87
NFIC-209ENST00000589969 TMEM71Q6P5X7 295 aa20.46■□□□□ 0.87
NFIC-209ENST00000589969 XKR5Q6UX68 686 aa20.46■□□□□ 0.87
NFIC-209ENST00000589969 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
NFIC-209ENST00000589969 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa20.46■□□□□ 0.87
NFIC-209ENST00000589969 DTX1Q86Y01 620 aa20.46■□□□□ 0.87
NFIC-209ENST00000589969 RFX6Q8HWS3 928 aa20.46■□□□□ 0.87
NFIC-209ENST00000589969 ZSCAN1Q8NBB4 408 aa20.46■□□□□ 0.87
NFIC-209ENST00000589969 AVL9Q8NBF6 648 aa20.46■□□□□ 0.87
NFIC-209ENST00000589969 RCBTB1Q8NDN9 531 aa20.46■□□□□ 0.87
NFIC-209ENST00000589969 MED8Q96G25 268 aa20.46■□□□□ 0.87
NFIC-209ENST00000589969 AGAP3Q96P47 875 aa20.46■□□□□ 0.87
NFIC-209ENST00000589969 TRIB3Q96RU7 358 aa20.46■□□□□ 0.87
NFIC-209ENST00000589969 ZSCAN5AQ9BUG6 496 aa20.46■□□□□ 0.87
NFIC-209ENST00000589969 TSPY26PQ9H489 355 aa20.46■□□□□ 0.87
NFIC-209ENST00000589969 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
NFIC-209ENST00000589969 NFKBIL1Q9UBC1 381 aaPredicted RBP20.46■□□□□ 0.87
NFIC-209ENST00000589969 SCN8AQ9UQD0 1980 aa20.45■□□□□ 0.86
NFIC-209ENST00000589969 OR5K4A6NMS3 321 aa20.45■□□□□ 0.86
NFIC-209ENST00000589969 STMND1H3BQB6 276 aa20.45■□□□□ 0.86
NFIC-209ENST00000589969 DUX1O43812 170 aa20.45■□□□□ 0.86
NFIC-209ENST00000589969 NUAK1O60285 661 aa20.45■□□□□ 0.86
NFIC-209ENST00000589969 THRAP10827 490 aa20.45■□□□□ 0.86
NFIC-209ENST00000589969 CCL4P13236 92 aa20.45■□□□□ 0.86
NFIC-209ENST00000589969 HHEXQ03014 270 aa20.45■□□□□ 0.86
NFIC-209ENST00000589969 CDK18Q07002 472 aa20.45■□□□□ 0.86
NFIC-209ENST00000589969 TFDP2Q14188 446 aa20.45■□□□□ 0.86
NFIC-209ENST00000589969 ZNF569Q5MCW4 686 aa20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.9 ms