RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589298.2

APLP1-206, Transcript of amyloid beta precursor like protein 1, human

TSL 5

Gene APLP1, Length 547 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
APLP1-206	ENST00000589298	NSMCE3	Q96MG7	304 aa		13.58	□□□□□ -0.24
APLP1-206	ENST00000589298	ZNF778	Q96MU6	729 aa		13.58	□□□□□ -0.24
APLP1-206	ENST00000589298	SMC6	Q96SB8	1091 aa		13.58	□□□□□ -0.24
APLP1-206	ENST00000589298	DHRS4	Q9BTZ2	278 aa		13.58	□□□□□ -0.24
APLP1-206	ENST00000589298	TSSK1B	Q9BXA7	367 aa		13.58	□□□□□ -0.24
APLP1-206	ENST00000589298	RHOJ	Q9H4E5	214 aa		13.58	□□□□□ -0.24
APLP1-206	ENST00000589298	FAM83D	Q9H4H8	585 aa		13.58	□□□□□ -0.24
APLP1-206	ENST00000589298	PREB	Q9HCU5	417 aa		13.58	□□□□□ -0.24
APLP1-206	ENST00000589298	NFKBIL1	Q9UBC1	381 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
APLP1-206	ENST00000589298	TBK1	Q9UHD2	729 aa		13.58	□□□□□ -0.24
APLP1-206	ENST00000589298	CRLS1	Q9UJA2	301 aa		13.58	□□□□□ -0.24
APLP1-206	ENST00000589298	CKAP5	Q14008	2032 aa		13.57	□□□□□ -0.24
APLP1-206	ENST00000589298	CCDC162P	A2VCL2	907 aa		13.57	□□□□□ -0.24
APLP1-206	ENST00000589298	LRRC72	A6NJI9	287 aa		13.57	□□□□□ -0.24
APLP1-206	ENST00000589298		H3BMM5	538 aa		13.57	□□□□□ -0.24
APLP1-206	ENST00000589298	MID1	O15344	667 aa		13.57	□□□□□ -0.24
APLP1-206	ENST00000589298	ZNF217	O75362	1048 aa		13.57	□□□□□ -0.24
APLP1-206	ENST00000589298	SRP72	O76094	671 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
APLP1-206	ENST00000589298	PCDH8	O95206	1070 aa		13.57	□□□□□ -0.24
APLP1-206	ENST00000589298	PRAMEF1	O95521	474 aa		13.57	□□□□□ -0.24
APLP1-206	ENST00000589298	PRKCG	P05129	697 aa		13.57	□□□□□ -0.24
APLP1-206	ENST00000589298	ZNF7	P17097	686 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
APLP1-206	ENST00000589298	OXTR	P30559	389 aa		13.57	□□□□□ -0.24
APLP1-206	ENST00000589298	CNR2	P34972	360 aa		13.57	□□□□□ -0.24
APLP1-206	ENST00000589298	P2RY2	P41231	377 aa		13.57	□□□□□ -0.24
APLP1-206	ENST00000589298	PTGER3	P43115	390 aa		13.57	□□□□□ -0.24
APLP1-206	ENST00000589298	LEPR	P48357	1165 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
APLP1-206	ENST00000589298	RPS21	P63220	83 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
APLP1-206	ENST00000589298	PTS	Q03393	145 aa		13.57	□□□□□ -0.24
APLP1-206	ENST00000589298	SGCG	Q13326	291 aa		13.57	□□□□□ -0.24
APLP1-206	ENST00000589298	COL9A2	Q14055	689 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
APLP1-206	ENST00000589298	POM121L1P	Q3SYA9	428 aa		13.57	□□□□□ -0.24
APLP1-206	ENST00000589298	SETMAR	Q53H47	684 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
APLP1-206	ENST00000589298	N4BP2L1	Q5TBK1	243 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
APLP1-206	ENST00000589298	UGT3A1	Q6NUS8	523 aa		13.57	□□□□□ -0.24
APLP1-206	ENST00000589298	KIAA1324	Q6UXG2	1013 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
APLP1-206	ENST00000589298	PACS1	Q6VY07	963 aa		13.57	□□□□□ -0.24
APLP1-206	ENST00000589298	RAB11FIP1	Q6WKZ4	1283 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
APLP1-206	ENST00000589298	ZNF765	Q7L2R6	523 aa		13.57	□□□□□ -0.24
APLP1-206	ENST00000589298	NLRP8	Q86W28	1048 aa		13.57	□□□□□ -0.24
APLP1-206	ENST00000589298	ZSWIM9	Q86XI8	627 aa		13.57	□□□□□ -0.24
APLP1-206	ENST00000589298	CILP2	Q8IUL8	1156 aa		13.57	□□□□□ -0.24
APLP1-206	ENST00000589298	KRT222	Q8N1A0	295 aa		13.57	□□□□□ -0.24
APLP1-206	ENST00000589298	C2CD4A	Q8NCU7	369 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
APLP1-206	ENST00000589298	TSTD1	Q8NFU3	115 aa		13.57	□□□□□ -0.24
APLP1-206	ENST00000589298	ZNF398	Q8TD17	642 aa		13.57	□□□□□ -0.24
APLP1-206	ENST00000589298	ACMSD	Q8TDX5	336 aa		13.57	□□□□□ -0.24
APLP1-206	ENST00000589298	EZH1	Q92800	747 aa	Predicted RBP	13.57	□□□□□ -0.24
APLP1-206	ENST00000589298	ARRDC3	Q96B67	414 aa		13.57	□□□□□ -0.24
APLP1-206	ENST00000589298	RBBP8	Q99708	897 aa		13.57	□□□□□ -0.24
APLP1-206	ENST00000589298	ZCCHC2	Q9C0B9	1178 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
APLP1-206	ENST00000589298	IQCG	Q9H095	443 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
APLP1-206	ENST00000589298	ASB8	Q9H765	288 aa		13.57	□□□□□ -0.24
APLP1-206	ENST00000589298	SLC2A6	Q9UGQ3	507 aa		13.57	□□□□□ -0.24
APLP1-206	ENST00000589298	FKBPL	Q9UIM3	349 aa		13.57	□□□□□ -0.24
APLP1-206	ENST00000589298	SARDH	Q9UL12	918 aa		13.57	□□□□□ -0.24
APLP1-206	ENST00000589298	PCDHB1	Q9Y5F3	818 aa		13.57	□□□□□ -0.24
APLP1-206	ENST00000589298	ATRX	P46100	2492 aa		13.56	□□□□□ -0.24
APLP1-206	ENST00000589298		A0A1W2PP55	124 aa		13.56	□□□□□ -0.24
APLP1-206	ENST00000589298		A0A1W2PQF6	199 aa		13.56	□□□□□ -0.24
APLP1-206	ENST00000589298	TCRBV21S2A2	A0A5A6	115 aa		13.56	□□□□□ -0.24
APLP1-206	ENST00000589298		A6NNZ2	444 aa		13.56	□□□□□ -0.24
APLP1-206	ENST00000589298	AGPS	O00116	658 aa		13.56	□□□□□ -0.24
APLP1-206	ENST00000589298	AURKA	O14965	403 aa		13.56	□□□□□ -0.24
APLP1-206	ENST00000589298	AREL1	O15033	823 aa		13.56	□□□□□ -0.24
APLP1-206	ENST00000589298	BUD23	O43709	281 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
APLP1-206	ENST00000589298	ADAM23	O75077	832 aa		13.56	□□□□□ -0.24
APLP1-206	ENST00000589298	TM7SF2	O76062	418 aa		13.56	□□□□□ -0.24
APLP1-206	ENST00000589298	C7	P10643	843 aa		13.56	□□□□□ -0.24
APLP1-206	ENST00000589298	CHRM1	P11229	460 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
APLP1-206	ENST00000589298	LIG3	P49916	1009 aa		13.56	□□□□□ -0.24
APLP1-206	ENST00000589298	KPNA2	P52292	529 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
APLP1-206	ENST00000589298	COPA	P53621	1224 aa		13.56	□□□□□ -0.24
APLP1-206	ENST00000589298	LIMK2	P53671	638 aa		13.56	□□□□□ -0.24
APLP1-206	ENST00000589298	SHC2	P98077	582 aa		13.56	□□□□□ -0.24
APLP1-206	ENST00000589298	CNTN1	Q12860	1018 aa		13.56	□□□□□ -0.24
APLP1-206	ENST00000589298	GAS6	Q14393	721 aa		13.56	□□□□□ -0.24
APLP1-206	ENST00000589298	ITIH4	Q14624	930 aa		13.56	□□□□□ -0.24
APLP1-206	ENST00000589298	CDKN3	Q16667	212 aa		13.56	□□□□□ -0.24
APLP1-206	ENST00000589298	TUBB8	Q3ZCM7	444 aa		13.56	□□□□□ -0.24
APLP1-206	ENST00000589298	AASDH	Q4L235	1098 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
APLP1-206	ENST00000589298	TAF1B	Q53T94	588 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
APLP1-206	ENST00000589298	LIPI	Q6XZB0	460 aa		13.56	□□□□□ -0.24
APLP1-206	ENST00000589298	LCA5	Q86VQ0	697 aa		13.56	□□□□□ -0.24
APLP1-206	ENST00000589298	LONP2	Q86WA8	852 aa		13.56	□□□□□ -0.24
APLP1-206	ENST00000589298	RBFA	Q8N0V3	343 aa		13.56	□□□□□ -0.24
APLP1-206	ENST00000589298	SPEM1	Q8N4L4	309 aa		13.56	□□□□□ -0.24
APLP1-206	ENST00000589298	CAMKK1	Q8N5S9	505 aa		13.56	□□□□□ -0.24
APLP1-206	ENST00000589298	TRAM1L1	Q8N609	369 aa		13.56	□□□□□ -0.24
APLP1-206	ENST00000589298	FAM160A2	Q8N612	972 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
APLP1-206	ENST00000589298	DCAKD	Q8WVC6	231 aa		13.56	□□□□□ -0.24
APLP1-206	ENST00000589298	DCUN1D1	Q96GG9	259 aa		13.56	□□□□□ -0.24
APLP1-206	ENST00000589298	SPATA16	Q9BXB7	569 aa		13.56	□□□□□ -0.24
APLP1-206	ENST00000589298	CNOT10	Q9H9A5	744 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
APLP1-206	ENST00000589298	SGK2	Q9HBY8	427 aa		13.56	□□□□□ -0.24
APLP1-206	ENST00000589298	BPIFA1	Q9NP55	256 aa		13.56	□□□□□ -0.24
APLP1-206	ENST00000589298	TLK1	Q9UKI8	766 aa		13.56	□□□□□ -0.24
APLP1-206	ENST00000589298	HCN2	Q9UL51	889 aa		13.56	□□□□□ -0.24
APLP1-206	ENST00000589298	NOVA2	Q9UNW9	492 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
APLP1-206	ENST00000589298	FNDC3A	Q9Y2H6	1198 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24

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