RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583289.5

PTPRM-215, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, human

TSL 5

Gene PTPRM, Length 792 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRM-215	ENST00000583289	YWHAZ	P63104	245 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	DYNLT1	P63172	113 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	ELF3	P78545	371 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	ZNF33A	Q06730	810 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	MPP3	Q13368	585 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	FRG1	Q14331	258 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	GRB14	Q14449	540 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	KCNJ11	Q14654	390 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	KRT72	Q14CN4	511 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	ADRM1	Q16186	407 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	PKN2	Q16513	984 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	INSC	Q1MX18	579 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	GOLGA7B	Q2TAP0	167 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	ANO4	Q32M45	955 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	SLC25A52	Q3SY17	297 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	KCNT1	Q5JUK3	1230 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	WASHC2D	Q5SRD0	308 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	WLS	Q5T9L3	541 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	ANKRD20A3	Q5VUR7	823 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	C9orf57	Q5W0N0	161 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	LVRN	Q6Q4G3	990 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	KYAT3	Q6YP21	454 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	TIFAB	Q6ZNK6	161 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	FAM183BP	Q6ZVS7	135 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	ASRGL1	Q7L266	308 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	RD3	Q7Z3Z2	195 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	UNC45B	Q8IWX7	931 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	ARFGAP1	Q8N6T3	406 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	OR56A1	Q8NGH5	318 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	GDAP1	Q8TB36	358 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	UBA3	Q8TBC4	463 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	FAM172A	Q8WUF8	416 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	TFB1M	Q8WVM0	346 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	TRAPPC12	Q8WVT3	735 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	ASB10	Q8WXI3	467 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	FATE1	Q969F0	183 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	RSRC1	Q96IZ7	334 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	CLMN	Q96JQ2	1002 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	SNX27	Q96L92	541 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	UHRF1	Q96T88	793 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	PAFAH2	Q99487	392 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	HNRNPAB	Q99729	332 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	EBNA1BP2	Q99848	306 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	DUSP16	Q9BY84	665 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	SDCBP2	Q9H190	292 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	STN1	Q9H668	368 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	SMYD3	Q9H7B4	428 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	YY1AP1	Q9H869	796 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	ECT2	Q9H8V3	914 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	USP29	Q9HBJ7	922 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	BATF3	Q9NR55	127 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	PDGFC	Q9NRA1	345 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	ETNK2	Q9NVF9	386 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	KLHL11	Q9NVR0	708 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	TRHDE	Q9UKU6	1024 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	NOX1	Q9Y5S8	564 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	TNFRSF18	Q9Y5U5	241 aa		4.61	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	ZSWIM8	A7E2V4	1837 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	SCN4A	P35499	1836 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	PLXNA1	Q9UIW2	1896 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	CCL15-CCL14	A0A0B4J2E2	113 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	SMIM28	A0A1B0GU29	152 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	TCRBV9S1A1T	A0A576	114 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	BRINP1	O60477	761 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	GPR32	O75388	356 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	LUC7L3	O95232	432 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	ATP6V1G2	O95670	118 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	APOE	P02649	317 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	VTN	P04004	478 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	APOA4	P06727	396 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	POLB	P06746	335 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	APRT	P07741	180 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	DHRS4L1	P0CG22	281 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	ETS1	P14921	441 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	IL4R	P24394	825 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	CYP2F1	P24903	491 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	GCA	P28676	217 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	PTPN4	P29074	926 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	PCSK1	P29120	753 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	ADSL	P30566	484 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	SSTR1	P30872	391 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	HOXA11	P31270	313 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	FOXN2	P32314	431 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	SERPINB6	P35237	376 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	ID4	P47928	161 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	POLD2	P49005	469 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	NPY2R	P49146	381 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	GLUD2	P49448	558 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	CDK7	P50613	346 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	CCNG1	P51959	295 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	ARFIP2	P53365	341 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	PRKAA2	P54646	552 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	C21orf58	P58505	322 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	GPX6	P59796	221 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	RAP2B	P61225	183 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	COG7	P83436	770 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	ZBTB16	Q05516	673 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	FAP	Q12884	760 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	FOXI1	Q12951	378 aa		4.6	□□□□□ -1.67
PTPRM-215	ENST00000583289	MTA1	Q13330	715 aa		4.6	□□□□□ -1.67

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