RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000582821.5

GGA3-215, Transcript of golgi associated, gamma adaptin ear containing, ARF binding protein 3, human

TSL 2

Gene GGA3, Length 1,018 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GGA3-215	ENST00000582821	DNAJC6	O75061	913 aa		13.86	□□□□□ -0.19
GGA3-215	ENST00000582821	PPFIA2	O75334	1257 aa		13.86	□□□□□ -0.19
GGA3-215	ENST00000582821	MT-CO3	P00414	261 aa		13.86	□□□□□ -0.19
GGA3-215	ENST00000582821	AGT	P01019	485 aa		13.86	□□□□□ -0.19
GGA3-215	ENST00000582821	BPI	P17213	487 aa		13.86	□□□□□ -0.19
GGA3-215	ENST00000582821	PSMB4	P28070	264 aa		13.86	□□□□□ -0.19
GGA3-215	ENST00000582821	STIP1	P31948	543 aa	Known RBP	13.86	□□□□□ -0.19
GGA3-215	ENST00000582821	ADCY8	P40145	1251 aa		13.86	□□□□□ -0.19
GGA3-215	ENST00000582821	CHRNA4	P43681	627 aa		13.86	□□□□□ -0.19
GGA3-215	ENST00000582821	GNPDA1	P46926	289 aa		13.86	□□□□□ -0.19
GGA3-215	ENST00000582821	CTBS	Q01459	385 aa		13.86	□□□□□ -0.19
GGA3-215	ENST00000582821	TARDBP	Q13148	414 aa	Known RBP eCLIP	13.86	□□□□□ -0.19
GGA3-215	ENST00000582821	LRP8	Q14114	963 aa		13.86	□□□□□ -0.19
GGA3-215	ENST00000582821	PARP6	Q2NL67	630 aa		13.86	□□□□□ -0.19
GGA3-215	ENST00000582821	SEL1L2	Q5TEA6	688 aa		13.86	□□□□□ -0.19
GGA3-215	ENST00000582821	C17orf82	Q86X59	251 aa	Predicted RBP	13.86	□□□□□ -0.19
GGA3-215	ENST00000582821	SLC13A5	Q86YT5	568 aa	Predicted RBP	13.86	□□□□□ -0.19
GGA3-215	ENST00000582821	SLC25A41	Q8N5S1	370 aa		13.86	□□□□□ -0.19
GGA3-215	ENST00000582821	TRIM58	Q8NG06	486 aa		13.86	□□□□□ -0.19
GGA3-215	ENST00000582821	CCDC110	Q8TBZ0	833 aa		13.86	□□□□□ -0.19
GGA3-215	ENST00000582821	RTP4	Q96DX8	246 aa		13.86	□□□□□ -0.19
GGA3-215	ENST00000582821	FSD1L	Q9BXM9	530 aa		13.86	□□□□□ -0.19
GGA3-215	ENST00000582821	ABCG4	Q9H172	646 aa		13.86	□□□□□ -0.19
GGA3-215	ENST00000582821	ARNT2	Q9HBZ2	717 aa		13.86	□□□□□ -0.19
GGA3-215	ENST00000582821	IL17C	Q9P0M4	197 aa		13.86	□□□□□ -0.19
GGA3-215	ENST00000582821	GULP1	Q9UBP9	304 aa		13.86	□□□□□ -0.19
GGA3-215	ENST00000582821	R3HDM2	Q9Y2K5	976 aa	Known RBP	13.86	□□□□□ -0.19
GGA3-215	ENST00000582821	ST14	Q9Y5Y6	855 aa		13.86	□□□□□ -0.19
GGA3-215	ENST00000582821	OAS3	Q9Y6K5	1087 aa	Known RBP	13.86	□□□□□ -0.19
GGA3-215	ENST00000582821	ZZEF1	O43149	2961 aa		13.85	□□□□□ -0.19
GGA3-215	ENST00000582821	GPR89A	B7ZAQ6	455 aa		13.85	□□□□□ -0.19
GGA3-215	ENST00000582821	INPP4B	O15327	924 aa		13.85	□□□□□ -0.19
GGA3-215	ENST00000582821	GPR89B	P0CG08	455 aa		13.85	□□□□□ -0.19
GGA3-215	ENST00000582821	PNLIP	P16233	465 aa		13.85	□□□□□ -0.19
GGA3-215	ENST00000582821	CLDN6	P56747	220 aa		13.85	□□□□□ -0.19
GGA3-215	ENST00000582821	MSLN	Q13421	630 aa	Predicted RBP	13.85	□□□□□ -0.19
GGA3-215	ENST00000582821	PERM1	Q5SV97	790 aa		13.85	□□□□□ -0.19
GGA3-215	ENST00000582821	DOK6	Q6PKX4	331 aa		13.85	□□□□□ -0.19
GGA3-215	ENST00000582821	TRIM74	Q86UV6	250 aa		13.85	□□□□□ -0.19
GGA3-215	ENST00000582821	MARCH9	Q86YJ5	346 aa		13.85	□□□□□ -0.19
GGA3-215	ENST00000582821	FAM71D	Q8N9W8	422 aa		13.85	□□□□□ -0.19
GGA3-215	ENST00000582821	KY	Q8NBH2	561 aa		13.85	□□□□□ -0.19
GGA3-215	ENST00000582821	MAPK15	Q8TD08	544 aa		13.85	□□□□□ -0.19
GGA3-215	ENST00000582821	GRAMD1A	Q96CP6	724 aa		13.85	□□□□□ -0.19
GGA3-215	ENST00000582821	VPS35	Q96QK1	796 aa		13.85	□□□□□ -0.19
GGA3-215	ENST00000582821	OR2M4	Q96R27	311 aa		13.85	□□□□□ -0.19
GGA3-215	ENST00000582821	C19orf43	Q9BQ61	176 aa		13.85	□□□□□ -0.19
GGA3-215	ENST00000582821	SPATA16	Q9BXB7	569 aa		13.85	□□□□□ -0.19
GGA3-215	ENST00000582821	NRSN2	Q9GZP1	204 aa		13.85	□□□□□ -0.19
GGA3-215	ENST00000582821	TRIM39	Q9HCM9	518 aa		13.85	□□□□□ -0.19
GGA3-215	ENST00000582821	SPATS2L	Q9NUQ6	558 aa	Known RBP	13.85	□□□□□ -0.19
GGA3-215	ENST00000582821	TAAR2	Q9P1P5	351 aa		13.85	□□□□□ -0.19
GGA3-215	ENST00000582821	APPL1	Q9UKG1	709 aa		13.85	□□□□□ -0.19
GGA3-215	ENST00000582821	COL27A1	Q8IZC6	1860 aa	Predicted RBP	13.84	□□□□□ -0.19
GGA3-215	ENST00000582821	KIF26B	Q2KJY2	2108 aa		13.84	□□□□□ -0.19
GGA3-215	ENST00000582821		F5H423	210 aa	Predicted RBP	13.84	□□□□□ -0.19
GGA3-215	ENST00000582821	NTN3	O00634	580 aa	Predicted RBP	13.84	□□□□□ -0.19
GGA3-215	ENST00000582821	NUDT21	O43809	227 aa	Known RBP	13.84	□□□□□ -0.19
GGA3-215	ENST00000582821	NUAK1	O60285	661 aa		13.84	□□□□□ -0.19
GGA3-215	ENST00000582821	TCEA3	O75764	348 aa		13.84	□□□□□ -0.19
GGA3-215	ENST00000582821	ASMTL	O95671	621 aa		13.84	□□□□□ -0.19
GGA3-215	ENST00000582821	ATP1A1	P05023	1023 aa	Known RBP	13.84	□□□□□ -0.19
GGA3-215	ENST00000582821	GLB1	P16278	677 aa		13.84	□□□□□ -0.19
GGA3-215	ENST00000582821	AK4	P27144	223 aa	Predicted RBP	13.84	□□□□□ -0.19
GGA3-215	ENST00000582821	HLTF	Q14527	1009 aa	Known RBP eCLIP	13.84	□□□□□ -0.19
GGA3-215	ENST00000582821	RTP5	Q14D33	572 aa		13.84	□□□□□ -0.19
GGA3-215	ENST00000582821	TCEA2	Q15560	299 aa		13.84	□□□□□ -0.19
GGA3-215	ENST00000582821	OASL	Q15646	514 aa	Known RBP	13.84	□□□□□ -0.19
GGA3-215	ENST00000582821	ST3GAL2	Q16842	350 aa		13.84	□□□□□ -0.19
GGA3-215	ENST00000582821	C14orf28	Q4W4Y0	310 aa		13.84	□□□□□ -0.19
GGA3-215	ENST00000582821	ZNF569	Q5MCW4	686 aa		13.84	□□□□□ -0.19
GGA3-215	ENST00000582821	KCTD11	Q693B1	232 aa		13.84	□□□□□ -0.19
GGA3-215	ENST00000582821	DENND5A	Q6IQ26	1287 aa		13.84	□□□□□ -0.19
GGA3-215	ENST00000582821	GLT6D1	Q7Z4J2	308 aa		13.84	□□□□□ -0.19
GGA3-215	ENST00000582821	GALNT13	Q8IUC8	556 aa		13.84	□□□□□ -0.19
GGA3-215	ENST00000582821	BLOC1S5	Q8TDH9	187 aa		13.84	□□□□□ -0.19
GGA3-215	ENST00000582821	GLYATL1	Q969I3	302 aa		13.84	□□□□□ -0.19
GGA3-215	ENST00000582821	TMEM121	Q9BTD3	319 aa		13.84	□□□□□ -0.19
GGA3-215	ENST00000582821	FICD	Q9BVA6	458 aa		13.84	□□□□□ -0.19
GGA3-215	ENST00000582821	TLR10	Q9BXR5	811 aa		13.84	□□□□□ -0.19
GGA3-215	ENST00000582821	DPEP2	Q9H4A9	486 aa		13.84	□□□□□ -0.19
GGA3-215	ENST00000582821	CCDC86	Q9H6F5	360 aa	Known RBP	13.84	□□□□□ -0.19
GGA3-215	ENST00000582821	IL26	Q9NPH9	171 aa		13.84	□□□□□ -0.19
GGA3-215	ENST00000582821	SIRPG	Q9P1W8	387 aa		13.84	□□□□□ -0.19
GGA3-215	ENST00000582821	FEZ2	Q9UHY8	353 aa	Predicted RBP	13.84	□□□□□ -0.19
GGA3-215	ENST00000582821	GPSM3	Q9Y4H4	160 aa		13.84	□□□□□ -0.19
GGA3-215	ENST00000582821	CHUK	O15111	745 aa		13.83	□□□□□ -0.2
GGA3-215	ENST00000582821	PSMD3	O43242	534 aa		13.83	□□□□□ -0.2
GGA3-215	ENST00000582821	LIAS	O43766	372 aa		13.83	□□□□□ -0.2
GGA3-215	ENST00000582821	SLC25A14	O95258	325 aa	Predicted RBP	13.83	□□□□□ -0.2
GGA3-215	ENST00000582821	CLCNKA	P51800	687 aa		13.83	□□□□□ -0.2
GGA3-215	ENST00000582821	GDF10	P55107	478 aa		13.83	□□□□□ -0.2
GGA3-215	ENST00000582821	TAF1A	Q15573	450 aa	Predicted RBP	13.83	□□□□□ -0.2
GGA3-215	ENST00000582821	P3H1	Q32P28	736 aa		13.83	□□□□□ -0.2
GGA3-215	ENST00000582821	CERCAM	Q5T4B2	595 aa		13.83	□□□□□ -0.2
GGA3-215	ENST00000582821	ALS2CL	Q60I27	953 aa		13.83	□□□□□ -0.2
GGA3-215	ENST00000582821	DRICH1	Q6PGQ1	229 aa	Predicted RBP	13.83	□□□□□ -0.2
GGA3-215	ENST00000582821	ARHGEF18	Q6ZSZ5	1173 aa		13.83	□□□□□ -0.2
GGA3-215	ENST00000582821	BRSK1	Q8TDC3	778 aa		13.83	□□□□□ -0.2
GGA3-215	ENST00000582821	ZDHHC1	Q8WTX9	485 aa		13.83	□□□□□ -0.2

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.4 ms