RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000554534.5

PCNX4-208, Transcript of pecanex 4, humanhuman

TSL 3

Gene PCNX4, Length 357 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX4-208ENST00000554534 FBXO38Q6PIJ6 1188 aa6.64□□□□□ -1.35
PCNX4-208ENST00000554534 CRTC3Q6UUV7 619 aa6.64□□□□□ -1.35
PCNX4-208ENST00000554534 CEACAM20Q6UY09 585 aa6.64□□□□□ -1.35
PCNX4-208ENST00000554534 FAM92BQ6ZTR7 304 aa6.64□□□□□ -1.35
PCNX4-208ENST00000554534 GALNT13Q8IUC8 556 aa6.64□□□□□ -1.35
PCNX4-208ENST00000554534 CCDC112Q8NEF3 446 aa6.64□□□□□ -1.35
PCNX4-208ENST00000554534 NEK11Q8NG66 645 aa6.64□□□□□ -1.35
PCNX4-208ENST00000554534 OR10G6Q8NH81 332 aa6.64□□□□□ -1.35
PCNX4-208ENST00000554534 NAT14Q8WUY8 206 aa6.64□□□□□ -1.35
PCNX4-208ENST00000554534 PIH1D2Q8WWB5 315 aa6.64□□□□□ -1.35
PCNX4-208ENST00000554534 PSKH2Q96QS6 385 aa6.64□□□□□ -1.35
PCNX4-208ENST00000554534 OR6C1Q96RD1 312 aa6.64□□□□□ -1.35
PCNX4-208ENST00000554534 WDR24Q96S15 920 aa6.64□□□□□ -1.35
PCNX4-208ENST00000554534 ULBP3Q9BZM4 244 aa6.64□□□□□ -1.35
PCNX4-208ENST00000554534 TWSG1Q9GZX9 223 aa6.64□□□□□ -1.35
PCNX4-208ENST00000554534 RETREG1Q9H6L5 497 aa6.64□□□□□ -1.35
PCNX4-208ENST00000554534 CASS4Q9NQ75 786 aa6.64□□□□□ -1.35
PCNX4-208ENST00000554534 OGFRQ9NZT2 677 aa6.64□□□□□ -1.35
PCNX4-208ENST00000554534 SLC23A2Q9UGH3 650 aa6.64□□□□□ -1.35
PCNX4-208ENST00000554534 ANAPC2Q9UJX6 822 aa6.64□□□□□ -1.35
PCNX4-208ENST00000554534 CNOT6Q9ULM6 557 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
PCNX4-208ENST00000554534 PHTF1Q9UMS5 762 aa6.64□□□□□ -1.35
PCNX4-208ENST00000554534 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa6.64□□□□□ -1.35
PCNX4-208ENST00000554534 TTLL3Q9Y4R7 772 aa6.64□□□□□ -1.35
PCNX4-208ENST00000554534 MDC1Q14676 2089 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
PCNX4-208ENST00000554534 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
PCNX4-208ENST00000554534 A6NL46 340 aa6.63□□□□□ -1.35
PCNX4-208ENST00000554534 MASP2O00187 686 aa6.63□□□□□ -1.35
PCNX4-208ENST00000554534 KRT86O43790 486 aa6.63□□□□□ -1.35
PCNX4-208ENST00000554534 PRPSAP2O60256 369 aa6.63□□□□□ -1.35
PCNX4-208ENST00000554534 MAFKO60675 156 aa6.63□□□□□ -1.35
PCNX4-208ENST00000554534 DNAJC6O75061 913 aa6.63□□□□□ -1.35
PCNX4-208ENST00000554534 MTX2O75431 263 aa6.63□□□□□ -1.35
PCNX4-208ENST00000554534 PGLSO95336 258 aa6.63□□□□□ -1.35
PCNX4-208ENST00000554534 DLGAP3O95886 979 aa6.63□□□□□ -1.35
PCNX4-208ENST00000554534 CD48P09326 243 aa6.63□□□□□ -1.35
PCNX4-208ENST00000554534 CYP2A6P11509 494 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
PCNX4-208ENST00000554534 RPL10P27635 214 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
PCNX4-208ENST00000554534 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
PCNX4-208ENST00000554534 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
PCNX4-208ENST00000554534 GJC1P36383 396 aa6.63□□□□□ -1.35
PCNX4-208ENST00000554534 STAT5AP42229 794 aa6.63□□□□□ -1.35
PCNX4-208ENST00000554534 AP1S1P61966 158 aa6.63□□□□□ -1.35
PCNX4-208ENST00000554534 UBE2HP62256 183 aa6.63□□□□□ -1.35
PCNX4-208ENST00000554534 UBXN1Q04323 297 aa6.63□□□□□ -1.35
PCNX4-208ENST00000554534 RAPSNQ13702 412 aa6.63□□□□□ -1.35
PCNX4-208ENST00000554534 DPYSQ14117 519 aa6.63□□□□□ -1.35
PCNX4-208ENST00000554534 BECN1Q14457 450 aa6.63□□□□□ -1.35
PCNX4-208ENST00000554534 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa6.63□□□□□ -1.35
PCNX4-208ENST00000554534 ARMC12Q5T9G4 340 aa6.63□□□□□ -1.35
PCNX4-208ENST00000554534 IYDQ6PHW0 289 aa6.63□□□□□ -1.35
PCNX4-208ENST00000554534 C6orf15Q6UXA7 325 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
PCNX4-208ENST00000554534 TRIM72Q6ZMU5 477 aa6.63□□□□□ -1.35
PCNX4-208ENST00000554534 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa6.63□□□□□ -1.35
PCNX4-208ENST00000554534 RASGRP3Q8IV61 690 aa6.63□□□□□ -1.35
PCNX4-208ENST00000554534 SFRP1Q8N474 314 aa6.63□□□□□ -1.35
PCNX4-208ENST00000554534 CT55Q8WUE5 264 aa6.63□□□□□ -1.35
PCNX4-208ENST00000554534 C19orf60Q96EN9 201 aa6.63□□□□□ -1.35
PCNX4-208ENST00000554534 SCRN2Q96FV2 425 aa6.63□□□□□ -1.35
PCNX4-208ENST00000554534 CATSPER2Q96P56 530 aa6.63□□□□□ -1.35
PCNX4-208ENST00000554534 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa6.63□□□□□ -1.35
PCNX4-208ENST00000554534 NUDCD1Q96RS6 583 aa6.63□□□□□ -1.35
PCNX4-208ENST00000554534 CEP41Q9BYV8 373 aa6.63□□□□□ -1.35
PCNX4-208ENST00000554534 OR2AG1Q9H205 316 aa6.63□□□□□ -1.35
PCNX4-208ENST00000554534 OSGEPL1Q9H4B0 414 aa6.63□□□□□ -1.35
PCNX4-208ENST00000554534 FBXO8Q9NRD0 319 aa6.63□□□□□ -1.35
PCNX4-208ENST00000554534 KLC4Q9NSK0 619 aa6.63□□□□□ -1.35
PCNX4-208ENST00000554534 CCDC88CQ9P219 2028 aa6.63□□□□□ -1.35
PCNX4-208ENST00000554534 PDP2Q9P2J9 529 aa6.63□□□□□ -1.35
PCNX4-208ENST00000554534 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
PCNX4-208ENST00000554534 ATXN10Q9UBB4 475 aa6.63□□□□□ -1.35
PCNX4-208ENST00000554534 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
PCNX4-208ENST00000554534 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa6.63□□□□□ -1.35
PCNX4-208ENST00000554534 SHANK1Q9Y566 2161 aa6.63□□□□□ -1.35
PCNX4-208ENST00000554534 SPTBP11277 2137 aa6.62□□□□□ -1.35
PCNX4-208ENST00000554534 ESPL1Q14674 2120 aa6.62□□□□□ -1.35
PCNX4-208ENST00000554534 TMEM191CA6NGB0 347 aa6.62□□□□□ -1.35
PCNX4-208ENST00000554534 ARGFXA6NJG6 315 aa6.62□□□□□ -1.35
PCNX4-208ENST00000554534 OR52A4PA6NMU1 304 aa6.62□□□□□ -1.35
PCNX4-208ENST00000554534 VPS4BO75351 444 aa6.62□□□□□ -1.35
PCNX4-208ENST00000554534 LRCH4O75427 683 aa6.62□□□□□ -1.35
PCNX4-208ENST00000554534 SPAG6O75602 509 aa6.62□□□□□ -1.35
PCNX4-208ENST00000554534 RASSF9O75901 435 aa6.62□□□□□ -1.35
PCNX4-208ENST00000554534 NDUFA10O95299 355 aa6.62□□□□□ -1.35
PCNX4-208ENST00000554534 PRLP01236 227 aa6.62□□□□□ -1.35
PCNX4-208ENST00000554534 FTLP02792 175 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
PCNX4-208ENST00000554534 RARAP10276 462 aa6.62□□□□□ -1.35
PCNX4-208ENST00000554534 ZNF8P17098 575 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
PCNX4-208ENST00000554534 AMD1P17707 334 aa6.62□□□□□ -1.35
PCNX4-208ENST00000554534 IL4RP24394 825 aa6.62□□□□□ -1.35
PCNX4-208ENST00000554534 EEF1GP26641 437 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
PCNX4-208ENST00000554534 SLC19A1P41440 591 aa6.62□□□□□ -1.35
PCNX4-208ENST00000554534 SSR1P43307 286 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
PCNX4-208ENST00000554534 MMP13P45452 471 aa6.62□□□□□ -1.35
PCNX4-208ENST00000554534 ARCN1P48444 511 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
PCNX4-208ENST00000554534 RENBPP51606 427 aa6.62□□□□□ -1.35
PCNX4-208ENST00000554534 EPHB1P54762 984 aa6.62□□□□□ -1.35
PCNX4-208ENST00000554534 DRG2P55039 364 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
PCNX4-208ENST00000554534 RAB15P59190 212 aa6.62□□□□□ -1.35
PCNX4-208ENST00000554534 NIPAL4Q0D2K0 466 aa6.62□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.3 ms