RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552985.5

TPCN1-223, Transcript of two pore segment channel 1, human

TSL 3

Gene TPCN1, Length 762 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TPCN1-223	ENST00000552985	ARHGEF18	Q6ZSZ5	1173 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TPCN1-223	ENST00000552985	PRUNE1	Q86TP1	453 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TPCN1-223	ENST00000552985	KLHDC8B	Q8IXV7	354 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TPCN1-223	ENST00000552985	GALNT15	Q8N3T1	639 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TPCN1-223	ENST00000552985	SDR16C5	Q8N3Y7	309 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TPCN1-223	ENST00000552985	ARL10	Q8N8L6	244 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TPCN1-223	ENST00000552985	FAM46D	Q8NEK8	389 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TPCN1-223	ENST00000552985	GPBAR1	Q8TDU6	330 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TPCN1-223	ENST00000552985	UBE2Q2	Q8WVN8	375 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TPCN1-223	ENST00000552985	RTP4	Q96DX8	246 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TPCN1-223	ENST00000552985	PDLIM2	Q96JY6	352 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TPCN1-223	ENST00000552985	OR2M4	Q96R27	311 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TPCN1-223	ENST00000552985	SPATS2L	Q9NUQ6	558 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
TPCN1-223	ENST00000552985	IL17C	Q9P0M4	197 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TPCN1-223	ENST00000552985	RABGEF1	Q9UJ41	708 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TPCN1-223	ENST00000552985	TMPRSS11E	Q9UL52	423 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TPCN1-223	ENST00000552985	PADI4	Q9UM07	663 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TPCN1-223	ENST00000552985	AAR2	Q9Y312	384 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
TPCN1-223	ENST00000552985	PRKAB1	Q9Y478	270 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TPCN1-223	ENST00000552985	KCTD3	Q9Y597	815 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TPCN1-223	ENST00000552985	ARL5A	Q9Y689	179 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TPCN1-223	ENST00000552985	ZNF106	Q9H2Y7	1883 aa	Known RBP	11.16	□□□□□ -0.62
TPCN1-223	ENST00000552985	USP24	Q9UPU5	2620 aa		11.16	□□□□□ -0.62
TPCN1-223	ENST00000552985		B4DGG1	531 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TPCN1-223	ENST00000552985	GPR39	O43194	453 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TPCN1-223	ENST00000552985	NOBOX	O60393	691 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TPCN1-223	ENST00000552985	DNAJC6	O75061	913 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TPCN1-223	ENST00000552985	ASMTL	O95671	621 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TPCN1-223	ENST00000552985	GP1BA	P07359	652 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TPCN1-223	ENST00000552985	CDK4	P11802	303 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TPCN1-223	ENST00000552985	ETS1	P14921	441 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TPCN1-223	ENST00000552985	HMGCL	P35914	325 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TPCN1-223	ENST00000552985	TNNT3	P45378	269 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
TPCN1-223	ENST00000552985	CAMK2B	Q13554	666 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TPCN1-223	ENST00000552985	PRPSAP1	Q14558	356 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TPCN1-223	ENST00000552985	PARP6	Q2NL67	630 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TPCN1-223	ENST00000552985	KHDC1	Q4VXA5	237 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
TPCN1-223	ENST00000552985	ZNF569	Q5MCW4	686 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TPCN1-223	ENST00000552985	KCTD11	Q693B1	232 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TPCN1-223	ENST00000552985	OGFOD3	Q6PK18	319 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TPCN1-223	ENST00000552985	SLC30A9	Q6PML9	568 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TPCN1-223	ENST00000552985	GLT6D1	Q7Z4J2	308 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TPCN1-223	ENST00000552985	TMPRSS12	Q86WS5	348 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TPCN1-223	ENST00000552985	TRAM1L1	Q8N609	369 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TPCN1-223	ENST00000552985	GLIS1	Q8NBF1	620 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TPCN1-223	ENST00000552985	GPR156	Q8NFN8	814 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TPCN1-223	ENST00000552985	SCG3	Q8WXD2	468 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
TPCN1-223	ENST00000552985	GLMN	Q92990	594 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TPCN1-223	ENST00000552985	GLYATL1	Q969I3	302 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TPCN1-223	ENST00000552985	SRPK1	Q96SB4	655 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
TPCN1-223	ENST00000552985	TBL1Y	Q9BQ87	522 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TPCN1-223	ENST00000552985	GSDMC	Q9BYG8	508 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TPCN1-223	ENST00000552985	CDH19	Q9H159	772 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TPCN1-223	ENST00000552985	TRABD	Q9H4I3	376 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TPCN1-223	ENST00000552985	IL26	Q9NPH9	171 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TPCN1-223	ENST00000552985	RAD18	Q9NS91	495 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TPCN1-223	ENST00000552985	TRNAU1AP	Q9NX07	287 aa	Known RBP	11.15	□□□□□ -0.62
TPCN1-223	ENST00000552985	NCKIPSD	Q9NZQ3	722 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TPCN1-223	ENST00000552985	HACD3	Q9P035	362 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TPCN1-223	ENST00000552985	TAAR2	Q9P1P5	351 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TPCN1-223	ENST00000552985	ATXN10	Q9UBB4	475 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TPCN1-223	ENST00000552985	GPSM3	Q9Y4H4	160 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TPCN1-223	ENST00000552985	CACNA1B	Q00975	2339 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TPCN1-223	ENST00000552985	FREM2	Q5SZK8	3169 aa		11.15	□□□□□ -0.62
TPCN1-223	ENST00000552985	GAPDHS	O14556	408 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
TPCN1-223	ENST00000552985	CEP104	O60308	925 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TPCN1-223	ENST00000552985	MTX2	O75431	263 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TPCN1-223	ENST00000552985	ZNF189	O75820	626 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
TPCN1-223	ENST00000552985	SLC25A14	O95258	325 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
TPCN1-223	ENST00000552985	FGG	P02679	453 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TPCN1-223	ENST00000552985	JUP	P14923	745 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TPCN1-223	ENST00000552985	ZNF8	P17098	575 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
TPCN1-223	ENST00000552985	RPIA	P49247	311 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TPCN1-223	ENST00000552985	E2F1	Q01094	437 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TPCN1-223	ENST00000552985	ILF3	Q12906	894 aa	Known RBP eCLIP	11.14	□□□□□ -0.63
TPCN1-223	ENST00000552985	TARDBP	Q13148	414 aa	Known RBP eCLIP	11.14	□□□□□ -0.63	2e-6	■■■■□ 21.1
TPCN1-223	ENST00000552985	CHRNA6	Q15825	494 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TPCN1-223	ENST00000552985	KCTD19	Q17RG1	926 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
TPCN1-223	ENST00000552985	ATP13A5	Q4VNC0	1218 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TPCN1-223	ENST00000552985	CDCP2	Q5VXM1	449 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TPCN1-223	ENST00000552985	FAM151B	Q6UXP7	276 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TPCN1-223	ENST00000552985	MICALCL	Q6ZW33	695 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TPCN1-223	ENST00000552985	ADGRG6	Q86SQ4	1221 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TPCN1-223	ENST00000552985	GALNT13	Q8IUC8	556 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TPCN1-223	ENST00000552985	PDCD7	Q8N8D1	485 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
TPCN1-223	ENST00000552985	MAPK15	Q8TD08	544 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TPCN1-223	ENST00000552985	PATE1	Q8WXA2	126 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TPCN1-223	ENST00000552985	CCDC74A	Q96AQ1	378 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TPCN1-223	ENST00000552985	PLEKHG4B	Q96PX9	1271 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TPCN1-223	ENST00000552985	ZSCAN5A	Q9BUG6	496 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TPCN1-223	ENST00000552985	FRMD8P1	Q9BZ68	369 aa	Predicted RBP	11.14	□□□□□ -0.63
TPCN1-223	ENST00000552985	OR2AG1	Q9H205	316 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TPCN1-223	ENST00000552985	DPEP2	Q9H4A9	486 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TPCN1-223	ENST00000552985	ARNT2	Q9HBZ2	717 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TPCN1-223	ENST00000552985	EVA1B	Q9NVM1	165 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TPCN1-223	ENST00000552985	TRMT1	Q9NXH9	659 aa	Known RBP	11.14	□□□□□ -0.63
TPCN1-223	ENST00000552985	VPS18	Q9P253	973 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TPCN1-223	ENST00000552985	ZNHIT2	Q9UHR6	403 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TPCN1-223	ENST00000552985	ZNF148	Q9UQR1	794 aa		11.14	□□□□□ -0.63
TPCN1-223	ENST00000552985	DMXL2	Q8TDJ6	3036 aa		11.14	□□□□□ -0.63

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