RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551968.5

CS-230, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 542 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-230ENST00000551968 KCNAB1Q14722 419 aa13.51□□□□□ -0.25
CS-230ENST00000551968 TESK1Q15569 626 aa13.51□□□□□ -0.25
CS-230ENST00000551968 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP13.51□□□□□ -0.25
CS-230ENST00000551968 ARCQ7LC44 396 aa13.51□□□□□ -0.25
CS-230ENST00000551968 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP13.51□□□□□ -0.25
CS-230ENST00000551968 TECPR1Q7Z6L1 1165 aa13.51□□□□□ -0.25
CS-230ENST00000551968 SYVN1Q86TM6 617 aa13.51□□□□□ -0.25
CS-230ENST00000551968 GALNT13Q8IUC8 556 aa13.51□□□□□ -0.25
CS-230ENST00000551968 RHOT1Q8IXI2 618 aa13.51□□□□□ -0.25
CS-230ENST00000551968 IQCKQ8N0W5 287 aa13.51□□□□□ -0.25
CS-230ENST00000551968 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP13.51□□□□□ -0.25
CS-230ENST00000551968 SCAMP4Q969E2 229 aa13.51□□□□□ -0.25
CS-230ENST00000551968 BARD1Q99728 777 aaKnown RBP13.51□□□□□ -0.25
CS-230ENST00000551968 SLC39A8Q9C0K1 460 aa13.51□□□□□ -0.25
CS-230ENST00000551968 ABCG8Q9H221 673 aa13.51□□□□□ -0.25
CS-230ENST00000551968 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP13.51□□□□□ -0.25
CS-230ENST00000551968 CPNE7Q9UBL6 633 aa13.51□□□□□ -0.25
CS-230ENST00000551968 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP13.51□□□□□ -0.25
CS-230ENST00000551968 DNAJC12Q9UKB3 198 aa13.51□□□□□ -0.25
CS-230ENST00000551968 CTNND2Q9UQB3 1225 aa13.51□□□□□ -0.25
CS-230ENST00000551968 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa13.51□□□□□ -0.25
CS-230ENST00000551968 NAV3Q8IVL0 2385 aa13.5□□□□□ -0.25
CS-230ENST00000551968 C2CD4BA6NLJ0 364 aa13.5□□□□□ -0.25
CS-230ENST00000551968 CREB3O43889 395 aa13.5□□□□□ -0.25
CS-230ENST00000551968 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP13.5□□□□□ -0.25
CS-230ENST00000551968 CYP11B1P15538 503 aa13.5□□□□□ -0.25
CS-230ENST00000551968 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP13.5□□□□□ -0.25
CS-230ENST00000551968 SCNN1BP51168 640 aa13.5□□□□□ -0.25
CS-230ENST00000551968 PPP1CAP62136 330 aa13.5□□□□□ -0.25
CS-230ENST00000551968 POLR2LP62875 67 aaKnown RBP13.5□□□□□ -0.25
CS-230ENST00000551968 UBE2IP63279 158 aaKnown RBP13.5□□□□□ -0.25
CS-230ENST00000551968 LCN10Q6JVE6 187 aa13.5□□□□□ -0.25
CS-230ENST00000551968 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa13.5□□□□□ -0.25
CS-230ENST00000551968 CERS6Q6ZMG9 384 aa13.5□□□□□ -0.25
CS-230ENST00000551968 SLC9B2Q86UD5 537 aa13.5□□□□□ -0.25
CS-230ENST00000551968 PPP1R3BQ86XI6 285 aa13.5□□□□□ -0.25
CS-230ENST00000551968 FAM71AQ8IYT1 594 aa13.5□□□□□ -0.25
CS-230ENST00000551968 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP13.5□□□□□ -0.25
CS-230ENST00000551968 FAM172AQ8WUF8 416 aa13.5□□□□□ -0.25
CS-230ENST00000551968 RSC1A1Q92681 617 aa13.5□□□□□ -0.25
CS-230ENST00000551968 SH3KBP1Q96B97 665 aa13.5□□□□□ -0.25
CS-230ENST00000551968 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP13.5□□□□□ -0.25
CS-230ENST00000551968 GPR87Q9BY21 358 aa13.5□□□□□ -0.25
CS-230ENST00000551968 PDCL3Q9H2J4 239 aa13.5□□□□□ -0.25
CS-230ENST00000551968 GDPD2Q9HCC8 539 aa13.5□□□□□ -0.25
CS-230ENST00000551968 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa13.5□□□□□ -0.25
CS-230ENST00000551968 MAN1B1Q9UKM7 699 aa13.5□□□□□ -0.25
CS-230ENST00000551968 FARSAQ9Y285 508 aaKnown RBP13.5□□□□□ -0.25
CS-230ENST00000551968 ZDHHC9Q9Y397 364 aa13.5□□□□□ -0.25
CS-230ENST00000551968 LILRA5A6NI73 299 aa13.49□□□□□ -0.25
CS-230ENST00000551968 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP13.49□□□□□ -0.25
CS-230ENST00000551968 PALMO75781 387 aa13.49□□□□□ -0.25
CS-230ENST00000551968 RASSF9O75901 435 aa13.49□□□□□ -0.25
CS-230ENST00000551968 TMEM63AO94886 807 aa13.49□□□□□ -0.25
CS-230ENST00000551968 MT-ND3P03897 115 aa13.49□□□□□ -0.25
CS-230ENST00000551968 ACP5P13686 325 aa13.49□□□□□ -0.25
CS-230ENST00000551968 FOLR1P15328 257 aa13.49□□□□□ -0.25
CS-230ENST00000551968 LPOP22079 712 aaPredicted RBP13.49□□□□□ -0.25
CS-230ENST00000551968 SDC4P31431 198 aa13.49□□□□□ -0.25
CS-230ENST00000551968 NOMO3P69849 1222 aa13.49□□□□□ -0.25
CS-230ENST00000551968 DPTQ07507 201 aa13.49□□□□□ -0.25
CS-230ENST00000551968 LRP8Q14114 963 aa13.49□□□□□ -0.25
CS-230ENST00000551968 ELOAQ14241 798 aaKnown RBP13.49□□□□□ -0.25
CS-230ENST00000551968 NAA35Q5VZE5 725 aa13.49□□□□□ -0.25
CS-230ENST00000551968 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa13.49□□□□□ -0.25
CS-230ENST00000551968 FAM92BQ6ZTR7 304 aa13.49□□□□□ -0.25
CS-230ENST00000551968 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP13.49□□□□□ -0.25
CS-230ENST00000551968 KLHL6Q8WZ60 621 aa13.49□□□□□ -0.25
CS-230ENST00000551968 SMARCE1Q969G3 411 aa13.49□□□□□ -0.25
CS-230ENST00000551968 NTAN1Q96AB6 310 aa13.49□□□□□ -0.25
CS-230ENST00000551968 COX14Q96I36 57 aa13.49□□□□□ -0.25
CS-230ENST00000551968 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa13.49□□□□□ -0.25
CS-230ENST00000551968 CINPQ9BW66 212 aaPredicted RBP13.49□□□□□ -0.25
CS-230ENST00000551968 OSGIN2Q9Y236 505 aa13.49□□□□□ -0.25
CS-230ENST00000551968 SVILO95425 2214 aa13.48□□□□□ -0.25
CS-230ENST00000551968 PIKFYVEQ9Y2I7 2098 aa13.48□□□□□ -0.25
CS-230ENST00000551968 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP13.48□□□□□ -0.25
CS-230ENST00000551968 SSU72P8A0A1W2PR75 194 aa13.48□□□□□ -0.25
CS-230ENST00000551968 UBXN7O94888 489 aa13.48□□□□□ -0.25
CS-230ENST00000551968 CPP00450 1065 aa13.48□□□□□ -0.25
CS-230ENST00000551968 MMEP08473 750 aa13.48□□□□□ -0.25
CS-230ENST00000551968 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
CS-230ENST00000551968 F3P13726 295 aa13.48□□□□□ -0.25
CS-230ENST00000551968 CTPS1P17812 591 aa13.48□□□□□ -0.25
CS-230ENST00000551968 CA5AP35218 305 aa13.48□□□□□ -0.25
CS-230ENST00000551968 PTPN9P43378 593 aa13.48□□□□□ -0.25
CS-230ENST00000551968 RPS15P62841 145 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
CS-230ENST00000551968 KRT85P78386 507 aa13.48□□□□□ -0.25
CS-230ENST00000551968 TRAF2Q12933 501 aa13.48□□□□□ -0.25
CS-230ENST00000551968 CACHD1Q5VU97 1274 aa13.48□□□□□ -0.25
CS-230ENST00000551968 GBP6Q6ZN66 633 aa13.48□□□□□ -0.25
CS-230ENST00000551968 STRADAQ7RTN6 431 aa13.48□□□□□ -0.25
CS-230ENST00000551968 PRSS42Q7Z5A4 293 aa13.48□□□□□ -0.25
CS-230ENST00000551968 SLFN11Q7Z7L1 901 aa13.48□□□□□ -0.25
CS-230ENST00000551968 GLIS1Q8NBF1 620 aa13.48□□□□□ -0.25
CS-230ENST00000551968 SLC38A9Q8NBW4 561 aa13.48□□□□□ -0.25
CS-230ENST00000551968 SEC14L1Q92503 715 aa13.48□□□□□ -0.25
CS-230ENST00000551968 AP2M1Q96CW1 435 aa13.48□□□□□ -0.25
CS-230ENST00000551968 FAM81BQ96LP2 452 aa13.48□□□□□ -0.25
CS-230ENST00000551968 EPB41L1Q9H4G0 881 aa13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.4 ms