RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551525.5

PTPRB-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,291 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF720Q7Z2F6 126 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 SLFN11Q7Z7L1 901 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 PHACTR4Q8IZ21 702 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 TRIM51Q9BSJ1 452 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 PRDM6Q9NQX0 595 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 TLR9Q9NR96 1032 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
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PTPRB-210ENST00000551525 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa6.29□□□□□ -1.4
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PTPRB-210ENST00000551525 WDPCPO95876 746 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 FGRP09769 529 aa6.29□□□□□ -1.4
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PTPRB-210ENST00000551525 TNFRSF8P28908 595 aa6.29□□□□□ -1.4
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PTPRB-210ENST00000551525 DUSP3P51452 185 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 ELP6Q0PNE2 266 aa6.29□□□□□ -1.4
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PTPRB-210ENST00000551525 TCEA2Q15560 299 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 SPANXN2Q5MJ10 180 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 LYPLAL1Q5VWZ2 237 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 KLHDC10Q6PID8 442 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 PAOXQ6QHF9 649 aa6.29□□□□□ -1.4
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PTPRB-210ENST00000551525 TPD52L3Q96J77 140 aa6.29□□□□□ -1.4
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PTPRB-210ENST00000551525 SFXN1Q9H9B4 322 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 ERVMER34-1Q9H9K5 563 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 HAO1Q9UJM8 370 aa6.29□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 A8MX80 341 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 TOR1BO14657 336 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 PRPF4O43172 522 aaKnown RBP eCLIP6.28□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 MTX2O75431 263 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 GLI1P08151 1106 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 BMPR2Q13873 1038 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 HAGHLQ6PII5 290 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 RRM2BQ7LG56 351 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 TREML1Q86YW5 311 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 GPR156Q8NFN8 814 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 TTLQ8NG68 377 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 FIG4Q92562 907 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 DPF1Q92782 380 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 KIAA1143Q96AT1 154 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 VCPIP1Q96JH7 1222 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 ASB2Q96Q27 587 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 LRMDAQ9H2I8 198 aa6.28□□□□□ -1.4
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PTPRB-210ENST00000551525 MARCH2Q9P0N8 246 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 UBA6A0AVT1 1052 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 FAM221BA6H8Z2 402 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 ARGFXA6NJG6 315 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 KIAA0355O15063 1070 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 NDUFA10O95299 355 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 AP2A1O95782 977 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 CLEC3BP05452 202 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 MYBP10242 640 aa6.28□□□□□ -1.4
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PTPRB-210ENST00000551525 TNNI3P19429 210 aa6.28□□□□□ -1.4
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PTPRB-210ENST00000551525 BPIFB3P59826 476 aa6.28□□□□□ -1.4
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PTPRB-210ENST00000551525 GPR158Q5T848 1215 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 PPP1R26Q5T8A7 1209 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 MZT2BQ6NZ67 158 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 KCTD20Q7Z5Y7 419 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 ADCK2Q7Z695 626 aa6.28□□□□□ -1.4
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PTPRB-210ENST00000551525 TAGAPQ8N103 731 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 CYP4Z2PQ8N1L4 340 aa6.28□□□□□ -1.4
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PTPRB-210ENST00000551525 ZNF248Q8NDW4 579 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 OR8K5Q8NH50 307 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 FEZF2Q8TBJ5 459 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 TCEAL4Q96EI5 215 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF845Q96IR2 970 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 VPS25Q9BRG1 176 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 BTBD10Q9BSF8 475 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 WWP1Q9H0M0 922 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 KCTD10Q9H3F6 313 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 LRRC19Q9H756 370 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 IL17RBQ9NRM6 502 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 A0A0A6YYH2 397 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRB-210ENST00000551525 A0A1W2PQJ5 194 aa6.28□□□□□ -1.4
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