RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546160.5

PDE4D-226, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PDE4D, Length 7,690 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-226ENST00000546160 VPS35Q96QK1 796 aa6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 SH3GL2Q99962 352 aa6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 RTKNQ9BST9 563 aa6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 CDH19Q9H159 772 aa6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 IMP3Q9NV31 184 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 IRAK3Q9Y616 596 aa6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 ATRNL1Q5VV63 1379 aa6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 TRIM43BA6NCK2 446 aa6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 SLC38A8A6NNN8 435 aa6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 H0Y858 1186 aa6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 TRIM38O00635 465 aa6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 MPZL2O60487 215 aa6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 TNFP01375 233 aa6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 EPHX1P07099 455 aa6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 LILRA4P59901 499 aa6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 RPL38P63173 70 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 KLHL12Q53G59 568 aa6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 CCNYL2Q5T2Q4 361 aa6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 BROXQ5VW32 411 aa6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 SMYD5Q6GMV2 418 aa6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 MED27Q6P2C8 311 aa6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 KLHL17Q6TDP4 642 aa6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 CACUL1Q86Y37 369 aa6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 C7orf61Q8IZ16 206 aa6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 KIFC1Q9BW19 673 aa6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 NUAK2Q9H093 628 aa6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 ACSS3Q9H6R3 686 aa6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 DNAJC11Q9NVH1 559 aa6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 IL36AQ9UHA7 158 aa6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 SMIM28A0A1B0GU29 152 aa6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 KCNU1A8MYU2 1149 aa6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 WBP4O75554 376 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 ELNP15502 786 aa6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 NOMO1Q15155 1222 aa6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 EIPR1Q53HC9 387 aa6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 ZNF57Q68EA5 555 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 MON1BQ7L1V2 547 aa6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 BEND5Q7L4P6 421 aa6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 TAF8Q7Z7C8 310 aa6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 HDDC3Q8N4P3 179 aa6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 S100ZQ8WXG8 99 aa6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 TRIM63Q969Q1 353 aa6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 NDNQ99608 321 aa6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 HEPHQ9BQS7 1158 aa6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 OSBPL11Q9BXB4 747 aa6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 PNPLA8Q9NP80 782 aa6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 ZNF180Q9UJW8 692 aa6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 FBXW11Q9UKB1 542 aa6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 SSR3Q9UNL2 185 aa6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 COG5Q9UP83 839 aa6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 ARVCFO00192 962 aa6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 DPYSQ14117 519 aa6.37□□□□□ -1.39
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PDE4D-226ENST00000546160 ARMC8Q8IUR7 673 aa6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 OR5B17Q8NGF7 314 aa6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 BTBD9Q96Q07 612 aa6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 REXO4Q9GZR2 422 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 CCDC177Q9NQR7 707 aaPredicted RBP6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 TRAF6Q9Y4K3 522 aa6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 GMPPBQ9Y5P6 360 aa6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 TAF1P21675 1872 aa6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 UGT2B11O75310 529 aa6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 KHDRBS3O75525 346 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 CST1P01037 141 aa6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 PDX1P52945 283 aa6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 HSDL1Q3SXM5 330 aa6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 FBXO42Q6P3S6 717 aa6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 KLHL24Q6TFL4 600 aa6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 ABHD13Q7L211 337 aa6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 MCEMP1Q8IX19 187 aa6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 ZNF527Q8NB42 609 aa6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 BAP1Q92560 729 aa6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 ACDQ96AP0 544 aa6.37□□□□□ -1.39
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PDE4D-226ENST00000546160 ZNF599Q96NL3 588 aa6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 BCL2L14Q9BZR8 327 aa6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 LRTM1Q9HBL6 345 aa6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 THUMPD1Q9NXG2 353 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 COMMD9Q9P000 198 aa6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 FZD1Q9UP38 647 aa6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 LRP6O75581 1613 aa6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 LTBP3Q9NS15 1303 aa6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 ATP9AO75110 1047 aa6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 COL6A1P12109 1028 aa6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 COX4I1P13073 169 aa6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 PKMP14618 531 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 IL12BP29460 328 aa6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 SCNN1AP37088 669 aa6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 CASRP41180 1078 aa6.37□□□□□ -1.39
PDE4D-226ENST00000546160 RPL7AP62424 266 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
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