RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541456.1

PRR4-209, Transcript of proline rich 4, human

TSL 3

Gene PRR4, Length 454 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PRR4-209	ENST00000541456	ROBO4	Q8WZ75	1007 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PRR4-209	ENST00000541456	AKAP1	Q92667	903 aa	Known RBP eCLIP	4.99	□□□□□ -1.61
PRR4-209	ENST00000541456	FYTTD1	Q96QD9	318 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
PRR4-209	ENST00000541456	BBS4	Q96RK4	519 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PRR4-209	ENST00000541456	TMEM47	Q9BQJ4	181 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PRR4-209	ENST00000541456	PIMREG	Q9BSJ6	248 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PRR4-209	ENST00000541456	ALG8	Q9BVK2	526 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PRR4-209	ENST00000541456	GLIS2	Q9BZE0	524 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
PRR4-209	ENST00000541456	TMEM248	Q9NWD8	314 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PRR4-209	ENST00000541456	FASTKD2	Q9NYY8	710 aa	Known RBP eCLIP	4.99	□□□□□ -1.61
PRR4-209	ENST00000541456	GRHL1	Q9NZI5	618 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PRR4-209	ENST00000541456	VSX1	Q9NZR4	365 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
PRR4-209	ENST00000541456	CGN	Q9P2M7	1197 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
PRR4-209	ENST00000541456	CNOT8	Q9UFF9	292 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
PRR4-209	ENST00000541456	LAMP5	Q9UJQ1	280 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PRR4-209	ENST00000541456	FBXW11	Q9UKB1	542 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PRR4-209	ENST00000541456	GABRQ	Q9UN88	632 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PRR4-209	ENST00000541456	EXOC7	Q9UPT5	735 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PRR4-209	ENST00000541456	DTX4	Q9Y2E6	619 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PRR4-209	ENST00000541456	TDRKH	Q9Y2W6	561 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
PRR4-209	ENST00000541456	FAM237A	A0A1B0GTK4	181 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PRR4-209	ENST00000541456		A0A1W2PR77	199 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PRR4-209	ENST00000541456	GAGE12B	A1L429	117 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PRR4-209	ENST00000541456	GAGE12H	A6NDE8	117 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PRR4-209	ENST00000541456	GPR89A	B7ZAQ6	455 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PRR4-209	ENST00000541456		H0YIN7	160 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PRR4-209	ENST00000541456	UBXN8	O00124	270 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PRR4-209	ENST00000541456	EIF3D	O15371	548 aa	Known RBP eCLIP	4.98	□□□□□ -1.61
PRR4-209	ENST00000541456	CA12	O43570	354 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PRR4-209	ENST00000541456	SSX5	O60225	188 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PRR4-209	ENST00000541456	TJP3	O95049	919 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PRR4-209	ENST00000541456	CBX6	O95503	412 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PRR4-209	ENST00000541456	FAM58BP	P0C7Q3	252 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PRR4-209	ENST00000541456	GPR89B	P0CG08	455 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PRR4-209	ENST00000541456	PEPD	P12955	493 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PRR4-209	ENST00000541456	PFKFB1	P16118	471 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PRR4-209	ENST00000541456	ITIH1	P19827	911 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PRR4-209	ENST00000541456	TYK2	P29597	1187 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PRR4-209	ENST00000541456	FRK	P42685	505 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
PRR4-209	ENST00000541456	PRCP	P42785	496 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PRR4-209	ENST00000541456	HNMT	P50135	292 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PRR4-209	ENST00000541456	ZNF75D	P51815	510 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PRR4-209	ENST00000541456	SP2	Q02086	613 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PRR4-209	ENST00000541456	RBPJ	Q06330	500 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PRR4-209	ENST00000541456	CNGA3	Q16281	694 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PRR4-209	ENST00000541456	TAZ	Q16635	292 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PRR4-209	ENST00000541456	TCTN1	Q2MV58	587 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PRR4-209	ENST00000541456	SPDYE7P	Q495Y7	208 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PRR4-209	ENST00000541456	CD300E	Q496F6	205 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
PRR4-209	ENST00000541456	LCE1E	Q5T753	118 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PRR4-209	ENST00000541456	TMEM268	Q5VZI3	342 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PRR4-209	ENST00000541456	PSRC1	Q6PGN9	363 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
PRR4-209	ENST00000541456	DET1	Q7L5Y6	550 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PRR4-209	ENST00000541456	RD3	Q7Z3Z2	195 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PRR4-209	ENST00000541456	GDF7	Q7Z4P5	450 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PRR4-209	ENST00000541456	MAPKAPK5	Q8IW41	473 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PRR4-209	ENST00000541456	ADGRF3	Q8IZF5	1079 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PRR4-209	ENST00000541456	C12orf76	Q8N812	135 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
PRR4-209	ENST00000541456	B3GALNT2	Q8NCR0	500 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PRR4-209	ENST00000541456	RP9	Q8TA86	221 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
PRR4-209	ENST00000541456	WIPF2	Q8TF74	440 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
PRR4-209	ENST00000541456	GDPD5	Q8WTR4	605 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PRR4-209	ENST00000541456	LINC00476	Q8WZB0	136 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PRR4-209	ENST00000541456	BCL2L2	Q92843	193 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
PRR4-209	ENST00000541456	EXT2	Q93063	718 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PRR4-209	ENST00000541456	TMEM125	Q96AQ2	219 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PRR4-209	ENST00000541456	ALG14	Q96F25	216 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PRR4-209	ENST00000541456	C5orf30	Q96GV9	206 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PRR4-209	ENST00000541456	BOD1	Q96IK1	185 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PRR4-209	ENST00000541456	LINC00615	Q96LM1	132 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
PRR4-209	ENST00000541456	COQ10A	Q96MF6	247 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PRR4-209	ENST00000541456	ZNF558	Q96NG5	402 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PRR4-209	ENST00000541456	SNX18	Q96RF0	628 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PRR4-209	ENST00000541456	CDRT15	Q96T59	188 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PRR4-209	ENST00000541456	NAP1L3	Q99457	506 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
PRR4-209	ENST00000541456	PKP2	Q99959	881 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PRR4-209	ENST00000541456	CACNG6	Q9BXT2	260 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PRR4-209	ENST00000541456	SLCO5A1	Q9H2Y9	848 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PRR4-209	ENST00000541456	NCOR1P1	Q9H4R4	102 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PRR4-209	ENST00000541456	VPS37B	Q9H9H4	285 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PRR4-209	ENST00000541456	USP29	Q9HBJ7	922 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PRR4-209	ENST00000541456	DDX4	Q9NQI0	724 aa	Known RBP	4.98	□□□□□ -1.61
PRR4-209	ENST00000541456	ARL8B	Q9NVJ2	186 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PRR4-209	ENST00000541456	ANKFY1	Q9P2R3	1169 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PRR4-209	ENST00000541456	HEY2	Q9UBP5	337 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PRR4-209	ENST00000541456	DNAJB4	Q9UDY4	337 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PRR4-209	ENST00000541456	NAP1L2	Q9ULW6	460 aa	Predicted RBP	4.98	□□□□□ -1.61
PRR4-209	ENST00000541456	PCDHGA5	Q9Y5G8	931 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PRR4-209	ENST00000541456	PCDHGA1	Q9Y5H4	931 aa		4.98	□□□□□ -1.61
PRR4-209	ENST00000541456	PPAN-P2RY11	A0A0B4J1V8	794 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PRR4-209	ENST00000541456	AKR1B15	C9JRZ8	316 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PRR4-209	ENST00000541456	NPIPB11	E5RHQ5	1161 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PRR4-209	ENST00000541456	SNAP23	O00161	211 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PRR4-209	ENST00000541456	EBAG9	O00559	213 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PRR4-209	ENST00000541456	RNASET2	O00584	256 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
PRR4-209	ENST00000541456	PPM1D	O15297	605 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PRR4-209	ENST00000541456	SLC25A17	O43808	307 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PRR4-209	ENST00000541456	VEGFD	O43915	354 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PRR4-209	ENST00000541456	NCR1	O76036	304 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PRR4-209	ENST00000541456	CNTN5	O94779	1100 aa		4.97	□□□□□ -1.61

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.4 ms