RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511467.1

PTPN13-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, non-receptor type 13, human

APPRIS P4 TSL 2 BASIC

Gene PTPN13, Length 8,076 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPN13-209	ENST00000511467	FOXJ1	Q92949	421 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPN13-209	ENST00000511467	SLC35C1	Q96A29	364 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPN13-209	ENST00000511467	ISG20	Q96AZ6	181 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PTPN13-209	ENST00000511467	RNF25	Q96BH1	459 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PTPN13-209	ENST00000511467	SUSD3	Q96L08	255 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPN13-209	ENST00000511467	DPY30	Q9C005	99 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPN13-209	ENST00000511467	GDE1	Q9NZC3	331 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPN13-209	ENST00000511467	TMEM9	Q9P0T7	183 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPN13-209	ENST00000511467	AFF4	Q9UHB7	1163 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
PTPN13-209	ENST00000511467	PCDHB11	Q9Y5F2	797 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PTPN13-209	ENST00000511467	NYNRIN	Q9P2P1	1898 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PTPN13-209	ENST00000511467	MAGEB3	O15480	346 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPN13-209	ENST00000511467	SERPINI2	O75830	405 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPN13-209	ENST00000511467	AKAP3	O75969	853 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPN13-209	ENST00000511467	SNRPB2	P08579	225 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PTPN13-209	ENST00000511467	CMPK1	P30085	196 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPN13-209	ENST00000511467	S100A3	P33764	101 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPN13-209	ENST00000511467	SLC1A6	P48664	564 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPN13-209	ENST00000511467	ABAT	P80404	500 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPN13-209	ENST00000511467	RPA4	Q13156	261 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPN13-209	ENST00000511467	ARHGAP19	Q14CB8	494 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPN13-209	ENST00000511467	KLHL22	Q53GT1	634 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPN13-209	ENST00000511467	TEX44	Q53QW1	395 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPN13-209	ENST00000511467	ADGRF1	Q5T601	910 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPN13-209	ENST00000511467	ABRAXAS1	Q6UWZ7	409 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPN13-209	ENST00000511467	OAF	Q86UD1	273 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPN13-209	ENST00000511467	ZC3H3	Q8IXZ2	948 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PTPN13-209	ENST00000511467	TMEM156	Q8N614	296 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPN13-209	ENST00000511467	CELF5	Q8N6W0	485 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PTPN13-209	ENST00000511467	TTC29	Q8NA56	475 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PTPN13-209	ENST00000511467	ZNF473	Q8WTR7	871 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PTPN13-209	ENST00000511467	COPS8	Q99627	209 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPN13-209	ENST00000511467	ZNF184	Q99676	751 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PTPN13-209	ENST00000511467	MYRF	Q9Y2G1	1151 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPN13-209	ENST00000511467	GNG14	A0A1W2PPG7	69 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPN13-209	ENST00000511467	TRIM49D1	C9J1S8	452 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPN13-209	ENST00000511467	ADAMTS3	O15072	1205 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPN13-209	ENST00000511467	ACSL4	O60488	711 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPN13-209	ENST00000511467	SRGAP2	O75044	1071 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPN13-209	ENST00000511467	MMP2	P08253	660 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPN13-209	ENST00000511467	TACSTD2	P09758	323 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPN13-209	ENST00000511467	ALPI	P09923	528 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPN13-209	ENST00000511467	MYB	P10242	640 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPN13-209	ENST00000511467	CTSE	P14091	401 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPN13-209	ENST00000511467	CHN1	P15882	459 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPN13-209	ENST00000511467	AKT2	P31751	481 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPN13-209	ENST00000511467	MLH1	P40692	756 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPN13-209	ENST00000511467	PITPNA	Q00169	270 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPN13-209	ENST00000511467	RBBP4	Q09028	425 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPN13-209	ENST00000511467	FAM171A1	Q5VUB5	890 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPN13-209	ENST00000511467	FBXO42	Q6P3S6	717 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPN13-209	ENST00000511467	C17orf64	Q86WR6	236 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPN13-209	ENST00000511467	AHI1	Q8N157	1196 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPN13-209	ENST00000511467	DDHD1	Q8NEL9	900 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPN13-209	ENST00000511467	SPPL2A	Q8TCT8	520 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPN13-209	ENST00000511467	IP6K3	Q96PC2	410 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPN13-209	ENST00000511467	EPYC	Q99645	322 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPN13-209	ENST00000511467	KCTD14	Q9BQ13	255 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PTPN13-209	ENST00000511467	BTBD10	Q9BSF8	475 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPN13-209	ENST00000511467	ZNF717	Q9BY31	904 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PTPN13-209	ENST00000511467	SLC13A1	Q9BZW2	595 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPN13-209	ENST00000511467	ERGIC3	Q9Y282	383 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPN13-209	ENST00000511467	STX16-NPEPL1	H3BU86	382 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPN13-209	ENST00000511467	AKAP10	O43572	662 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPN13-209	ENST00000511467	SPAM1	P38567	509 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPN13-209	ENST00000511467	TUBA1B	P68363	451 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPN13-209	ENST00000511467	CHI3L2	Q15782	390 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPN13-209	ENST00000511467	ARL9	Q6T311	187 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPN13-209	ENST00000511467	SLC36A4	Q6YBV0	504 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPN13-209	ENST00000511467	GPRIN3	Q6ZVF9	776 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPN13-209	ENST00000511467	TUBA1A	Q71U36	451 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPN13-209	ENST00000511467	PLPP6	Q8IY26	295 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPN13-209	ENST00000511467	COLGALT2	Q8IYK4	626 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPN13-209	ENST00000511467	DND1	Q8IYX4	353 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PTPN13-209	ENST00000511467	PGBD3	Q8N328	593 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPN13-209	ENST00000511467	FBXL18	Q96ME1	805 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPN13-209	ENST00000511467	PAFAH2	Q99487	392 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPN13-209	ENST00000511467	TUBA1C	Q9BQE3	449 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPN13-209	ENST00000511467	APOL2	Q9BQE5	337 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPN13-209	ENST00000511467	C1orf21	Q9H246	121 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPN13-209	ENST00000511467	TRIM39	Q9HCM9	518 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPN13-209	ENST00000511467	MRPS23	Q9Y3D9	190 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PTPN13-209	ENST00000511467	AKAP6	Q13023	2319 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPN13-209	ENST00000511467	DOCK10	Q96BY6	2186 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPN13-209	ENST00000511467	ZNF623	O75123	536 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPN13-209	ENST00000511467	CTDNEP1	O95476	244 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPN13-209	ENST00000511467	SMIM10L2A	P0DMW4	78 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPN13-209	ENST00000511467	SMIM10L2B	P0DMW5	78 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPN13-209	ENST00000511467	VAV1	P15498	845 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPN13-209	ENST00000511467	ERP29	P30040	261 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PTPN13-209	ENST00000511467	IGFALS	P35858	605 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPN13-209	ENST00000511467	NR6A1	Q15406	480 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPN13-209	ENST00000511467	C5orf46	Q6UWT4	87 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPN13-209	ENST00000511467	COLGALT1	Q8NBJ5	622 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPN13-209	ENST00000511467	AEN	Q8WTP8	325 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PTPN13-209	ENST00000511467	FUCA2	Q9BTY2	467 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPN13-209	ENST00000511467	SMOC2	Q9H3U7	446 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPN13-209	ENST00000511467	HPS4	Q9NQG7	708 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPN13-209	ENST00000511467	PNPLA3	Q9NST1	481 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PTPN13-209	ENST00000511467	TMPRSS11E	Q9UL52	423 aa		4.92	□□□□□ -1.62

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