RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511362.5

ATXN3-211, Transcript of ataxin 3, humanhuman

TSL 3

Gene ATXN3, Length 591 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN3-211ENST00000511362 PRSS44E7EML9 344 aa3.1□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 TSC22D2O75157 780 aa3.1□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 PALMO75781 387 aa3.1□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 DDHD2O94830 711 aa3.1□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 DDX58O95786 925 aaKnown RBP3.1□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 DNTTP04053 509 aa3.1□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 FGF2P09038 288 aa3.1□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 RHOXF2BP0C7M4 288 aa3.1□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 PCNAP12004 261 aa3.1□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 CYBAP13498 195 aa3.1□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 EEF2P13639 858 aaKnown RBP3.1□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 RHCEP18577 417 aa3.1□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 TNFRSF1BP20333 461 aa3.1□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP3.1□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 PRKAR2BP31323 418 aa3.1□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 IDUAP35475 653 aa3.1□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 SOX6P35712 828 aa3.1□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 STAT1P42224 750 aa3.1□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 MAPK9P45984 424 aa3.1□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 ATP5OP48047 213 aa3.1□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 MCM2P49736 904 aa3.1□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 ARFIP1P53367 373 aa3.1□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 NANOS2P60321 138 aaKnown RBP3.1□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP3.1□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 CBX1P83916 185 aa3.1□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 IL1RL1Q01638 556 aa3.1□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 RHDQ02161 417 aa3.1□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 ACY1Q03154 408 aa3.1□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 RUNX1T1Q06455 604 aa3.1□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 DMPKQ09013 629 aa3.1□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 KIF5AQ12840 1032 aa3.1□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 SGCGQ13326 291 aa3.1□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 GAB1Q13480 694 aa3.1□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 SCARB2Q14108 478 aa3.1□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP3.1□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 GBX1Q14549 363 aa3.1□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 PSMD6Q15008 389 aa3.1□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 PPA1Q15181 289 aa3.1□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 STK11Q15831 433 aa3.1□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 CCNG2Q16589 344 aa3.1□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 SLC45A4Q5BKX6 768 aa3.1□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa3.1□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 CORO6Q6QEF8 472 aa3.1□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 ZNF793Q6ZN11 406 aa3.1□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 C4orf50Q6ZRC1 276 aa3.1□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 PLEKHM3Q6ZWE6 761 aa3.1□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 IKBIPQ70UQ0 350 aa3.1□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 B4GALNT4Q76KP1 1039 aa3.1□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa3.1□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 PIM3Q86V86 326 aa3.1□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 CCDC83Q8IWF9 413 aa3.1□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 SCYL3Q8IZE3 742 aa3.1□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 MMP21Q8N119 569 aa3.1□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 TMEM57Q8N5G2 664 aa3.1□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 DDX51Q8N8A6 666 aaKnown RBP eCLIP3.1□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa3.1□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 MBD3L2Q8NHZ7 208 aaPredicted RBP3.1□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 PARD3BQ8TEW8 1205 aa3.1□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 POF1BQ8WVV4 589 aa3.1□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 TCP11Q8WWU5 503 aa3.1□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 PIBF1Q8WXW3 757 aa3.1□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 PIGKQ92643 395 aa3.1□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 EXOC4Q96A65 974 aa3.1□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 RADILQ96JH8 1075 aa3.1□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 FCRL5Q96RD9 977 aa3.1□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 BARD1Q99728 777 aaKnown RBP3.1□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 RHOXF2Q9BQY4 288 aa3.1□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 TRMOQ9BU70 441 aa3.1□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP3.1□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 GLT8D2Q9H1C3 349 aa3.1□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 EHD1Q9H4M9 534 aa3.1□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 MROH8Q9H579 483 aa3.1□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 DNAJC18Q9H819 358 aa3.1□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP3.1□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 PARVGQ9HBI0 331 aa3.1□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa3.1□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 TMEM45AQ9NWC5 275 aa3.1□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 MORF4L1Q9UBU8 362 aa3.1□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 CORO2BQ9UQ03 480 aa3.1□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 TIMM22Q9Y584 194 aa3.1□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 SNX13Q9Y5W8 968 aa3.1□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 MROH7Q68CQ1 1323 aa3.1□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa3.1□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 MYH3P11055 1940 aa3.09□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 CFAP46Q8IYW2 2715 aa3.09□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 TEX15Q9BXT5 2789 aa3.09□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa3.09□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 UQCRHLA0A096LP55 91 aa3.09□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa3.09□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 B4DGG1 531 aa3.09□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 KIF28PB7ZC32 967 aa3.09□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 F5H423 210 aaPredicted RBP3.09□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 H7C0S8 307 aa3.09□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 UBXN8O00124 270 aa3.09□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 CAPN9O14815 690 aa3.09□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 CETN3O15182 167 aa3.09□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 SEPT4O43236 478 aa3.09□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 CBFA2T3O75081 653 aa3.09□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 ATP6V1G1O75348 118 aa3.09□□□□□ -1.91
ATXN3-211ENST00000511362 TULP3O75386 442 aa3.09□□□□□ -1.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.7 ms