RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511185.5

SH3BP2-218, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 1,071 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-218ENST00000511185 BUD23O43709 281 aaKnown RBP18.56■□□□□ 0.56
SH3BP2-218ENST00000511185 DNAJC6O75061 913 aa18.56■□□□□ 0.56
SH3BP2-218ENST00000511185 CSO75390 466 aaKnown RBP18.56■□□□□ 0.56
SH3BP2-218ENST00000511185 DCDC1P59894 354 aa18.56■□□□□ 0.56
SH3BP2-218ENST00000511185 MPP3Q13368 585 aa18.56■□□□□ 0.56
SH3BP2-218ENST00000511185 PYCR3Q53H96 274 aa18.56■□□□□ 0.56
SH3BP2-218ENST00000511185 NLRP8Q86W28 1048 aa18.56■□□□□ 0.56
SH3BP2-218ENST00000511185 RAVER1Q8IY67 606 aaKnown RBP18.56■□□□□ 0.56
SH3BP2-218ENST00000511185 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa18.56■□□□□ 0.56
SH3BP2-218ENST00000511185 RNF10Q8N5U6 811 aaKnown RBP18.56■□□□□ 0.56
SH3BP2-218ENST00000511185 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP18.56■□□□□ 0.56
SH3BP2-218ENST00000511185 GLMNQ92990 594 aa18.56■□□□□ 0.56
SH3BP2-218ENST00000511185 NAT6Q93015 286 aa18.56■□□□□ 0.56
SH3BP2-218ENST00000511185 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP18.56■□□□□ 0.56
SH3BP2-218ENST00000511185 SPATA13Q96N96 652 aa18.56■□□□□ 0.56
SH3BP2-218ENST00000511185 SPATA16Q9BXB7 569 aa18.56■□□□□ 0.56
SH3BP2-218ENST00000511185 TAAR2Q9P1P5 351 aa18.56■□□□□ 0.56
SH3BP2-218ENST00000511185 NFKBIL1Q9UBC1 381 aaPredicted RBP18.56■□□□□ 0.56
SH3BP2-218ENST00000511185 TRHDEQ9UKU6 1024 aa18.56■□□□□ 0.56
SH3BP2-218ENST00000511185 GPSM3Q9Y4H4 160 aa18.56■□□□□ 0.56
SH3BP2-218ENST00000511185 RNF215Q9Y6U7 377 aa18.56■□□□□ 0.56
SH3BP2-218ENST00000511185 A0A1W2PNU3 283 aaPredicted RBP18.55■□□□□ 0.56
SH3BP2-218ENST00000511185 SRRM3A6NNA2 597 aaPredicted RBP18.55■□□□□ 0.56
SH3BP2-218ENST00000511185 KRT86O43790 486 aa18.55■□□□□ 0.56
SH3BP2-218ENST00000511185 MTX2O75431 263 aa18.55■□□□□ 0.56
SH3BP2-218ENST00000511185 ASMTLO95671 621 aa18.55■□□□□ 0.56
SH3BP2-218ENST00000511185 AGTP01019 485 aa18.55■□□□□ 0.56
SH3BP2-218ENST00000511185 PYGLP06737 847 aa18.55■□□□□ 0.56
SH3BP2-218ENST00000511185 CA5AP35218 305 aa18.55■□□□□ 0.56
SH3BP2-218ENST00000511185 RPIAP49247 311 aa18.55■□□□□ 0.56
SH3BP2-218ENST00000511185 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP18.55■□□□□ 0.56
SH3BP2-218ENST00000511185 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP18.55■□□□□ 0.561e-7■□□□□ 9.5
SH3BP2-218ENST00000511185 KHDC1Q4VXA5 237 aaKnown RBP18.55■□□□□ 0.56
SH3BP2-218ENST00000511185 C14orf28Q4W4Y0 310 aa18.55■□□□□ 0.56
SH3BP2-218ENST00000511185 ZNF569Q5MCW4 686 aa18.55■□□□□ 0.56
SH3BP2-218ENST00000511185 CERCAMQ5T4B2 595 aa18.55■□□□□ 0.56
SH3BP2-218ENST00000511185 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa18.55■□□□□ 0.56
SH3BP2-218ENST00000511185 MICALCLQ6ZW33 695 aa18.55■□□□□ 0.56
SH3BP2-218ENST00000511185 PDCD7Q8N8D1 485 aaKnown RBP18.55■□□□□ 0.56
SH3BP2-218ENST00000511185 BLOC1S5Q8TDH9 187 aa18.55■□□□□ 0.56
SH3BP2-218ENST00000511185 NXPE2Q96DL1 559 aa18.55■□□□□ 0.56
SH3BP2-218ENST00000511185 FSD1LQ9BXM9 530 aa18.55■□□□□ 0.56
SH3BP2-218ENST00000511185 GSDMCQ9BYG8 508 aa18.55■□□□□ 0.56
SH3BP2-218ENST00000511185 CDH19Q9H159 772 aa18.55■□□□□ 0.56
SH3BP2-218ENST00000511185 DPEP2Q9H4A9 486 aa18.55■□□□□ 0.56
SH3BP2-218ENST00000511185 GRPEL1Q9HAV7 217 aa18.55■□□□□ 0.56
SH3BP2-218ENST00000511185 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP18.55■□□□□ 0.56
SH3BP2-218ENST00000511185 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa18.55■□□□□ 0.56
SH3BP2-218ENST00000511185 ITPR1Q14643 2758 aa18.55■□□□□ 0.56
SH3BP2-218ENST00000511185 A0A1W2PQM1 296 aa18.54■□□□□ 0.56
SH3BP2-218ENST00000511185 USP12O75317 370 aa18.54■□□□□ 0.56
SH3BP2-218ENST00000511185 EML2O95834 649 aa18.54■□□□□ 0.56
SH3BP2-218ENST00000511185 FGF1P05230 155 aa18.54■□□□□ 0.56
SH3BP2-218ENST00000511185 PTMAP06454 111 aaKnown RBP18.54■□□□□ 0.56
SH3BP2-218ENST00000511185 CCDC175P0C221 793 aa18.54■□□□□ 0.56
SH3BP2-218ENST00000511185 ADRA1AP35348 466 aa18.54■□□□□ 0.56
SH3BP2-218ENST00000511185 CETN2P41208 172 aa18.54■□□□□ 0.56
SH3BP2-218ENST00000511185 ACTR1BP42025 376 aa18.54■□□□□ 0.56
SH3BP2-218ENST00000511185 ACTR1AP61163 376 aa18.54■□□□□ 0.56
SH3BP2-218ENST00000511185 SPARCL1Q14515 664 aa18.54■□□□□ 0.56
SH3BP2-218ENST00000511185 PTPRCAPQ14761 206 aa18.54■□□□□ 0.56
SH3BP2-218ENST00000511185 OGFOD3Q6PK18 319 aa18.54■□□□□ 0.56
SH3BP2-218ENST00000511185 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa18.54■□□□□ 0.56
SH3BP2-218ENST00000511185 GALNT13Q8IUC8 556 aa18.54■□□□□ 0.56
SH3BP2-218ENST00000511185 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP18.54■□□□□ 0.56
SH3BP2-218ENST00000511185 TRAM1L1Q8N609 369 aa18.54■□□□□ 0.56
SH3BP2-218ENST00000511185 FAM71DQ8N9W8 422 aa18.54■□□□□ 0.56
SH3BP2-218ENST00000511185 SLC35B2Q8TB61 432 aa18.54■□□□□ 0.56
SH3BP2-218ENST00000511185 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa18.54■□□□□ 0.56
SH3BP2-218ENST00000511185 DEPDC7Q96QD5 511 aa18.54■□□□□ 0.56
SH3BP2-218ENST00000511185 ABCG4Q9H172 646 aa18.54■□□□□ 0.56
SH3BP2-218ENST00000511185 ATXN10Q9UBB4 475 aa18.54■□□□□ 0.56
SH3BP2-218ENST00000511185 RAXQ9Y2V3 346 aa18.54■□□□□ 0.56
SH3BP2-218ENST00000511185 PIKFYVEQ9Y2I7 2098 aa18.54■□□□□ 0.56
SH3BP2-218ENST00000511185 RGSL1A5PLK6 1076 aa18.53■□□□□ 0.56
SH3BP2-218ENST00000511185 GAPDHSO14556 408 aaPredicted RBP18.53■□□□□ 0.56
SH3BP2-218ENST00000511185 RPLP0P05388 317 aaKnown RBP18.53■□□□□ 0.56
SH3BP2-218ENST00000511185 HLA-DPA1P20036 260 aa18.53■□□□□ 0.56
SH3BP2-218ENST00000511185 GEMP55040 296 aa18.53■□□□□ 0.56
SH3BP2-218ENST00000511185 CCL7P80098 99 aa18.53■□□□□ 0.56
SH3BP2-218ENST00000511185 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa18.53■□□□□ 0.56
SH3BP2-218ENST00000511185 MEI1Q5TIA1 1274 aa18.53■□□□□ 0.56
SH3BP2-218ENST00000511185 CCDC70Q6NSX1 233 aa18.53■□□□□ 0.56
SH3BP2-218ENST00000511185 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa18.53■□□□□ 0.56
SH3BP2-218ENST00000511185 NAGSQ8N159 534 aa18.53■□□□□ 0.56
SH3BP2-218ENST00000511185 ATXN7L3BQ96GX2 97 aa18.53■□□□□ 0.56
SH3BP2-218ENST00000511185 TMEM121Q9BTD3 319 aa18.53■□□□□ 0.56
SH3BP2-218ENST00000511185 ZSCAN5AQ9BUG6 496 aa18.53■□□□□ 0.56
SH3BP2-218ENST00000511185 OR2AG1Q9H205 316 aa18.53■□□□□ 0.56
SH3BP2-218ENST00000511185 VPS18Q9P253 973 aa18.53■□□□□ 0.56
SH3BP2-218ENST00000511185 KCNK6Q9Y257 313 aa18.53■□□□□ 0.56
SH3BP2-218ENST00000511185 ENTPD2Q9Y5L3 495 aa18.53■□□□□ 0.56
SH3BP2-218ENST00000511185 ARL5AQ9Y689 179 aa18.53■□□□□ 0.56
SH3BP2-218ENST00000511185 NBEAQ8NFP9 2946 aa18.52■□□□□ 0.56
SH3BP2-218ENST00000511185 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa18.52■□□□□ 0.56
SH3BP2-218ENST00000511185 D6RAR5 112 aa18.52■□□□□ 0.56
SH3BP2-218ENST00000511185 NTN3O00634 580 aaPredicted RBP18.52■□□□□ 0.56
SH3BP2-218ENST00000511185 BRINP1O60477 761 aa18.52■□□□□ 0.56
SH3BP2-218ENST00000511185 ECEL1O95672 775 aa18.52■□□□□ 0.56
SH3BP2-218ENST00000511185 EPOP01588 193 aa18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 128.5 ms