RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489406.1

UFD1-209, Transcript of ubiquitin recognition factor in ER associated degradation 1, humanhuman

TSL 2

Gene UFD1, Length 994 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFD1-209ENST00000489406 FOXD4Q12950 439 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
UFD1-209ENST00000489406 CDC16Q13042 620 aa14.85□□□□□ -0.03
UFD1-209ENST00000489406 LRP8Q14114 963 aa14.85□□□□□ -0.03
UFD1-209ENST00000489406 KCNAB1Q14722 419 aa14.85□□□□□ -0.03
UFD1-209ENST00000489406 CYTH1Q15438 398 aa14.85□□□□□ -0.03
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UFD1-209ENST00000489406 HIF1AQ16665 826 aa14.85□□□□□ -0.03
UFD1-209ENST00000489406 RAET1GQ6H3X3 334 aa14.85□□□□□ -0.03
UFD1-209ENST00000489406 XKRXQ6PP77 449 aa14.85□□□□□ -0.03
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UFD1-209ENST00000489406 PRSS42Q7Z5A4 293 aa14.85□□□□□ -0.03
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UFD1-209ENST00000489406 FASTKD2Q9NYY8 710 aaKnown RBP eCLIP14.85□□□□□ -0.03
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UFD1-209ENST00000489406 RPH3AQ9Y2J0 694 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
UFD1-209ENST00000489406 SLC30A1Q9Y6M5 507 aa14.85□□□□□ -0.03
UFD1-209ENST00000489406 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
UFD1-209ENST00000489406 CUTAO60888 179 aa14.84□□□□□ -0.03
UFD1-209ENST00000489406 CPNE3O75131 537 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
UFD1-209ENST00000489406 RHOQP17081 205 aa14.84□□□□□ -0.03
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UFD1-209ENST00000489406 IST1P53990 364 aa14.84□□□□□ -0.03
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UFD1-209ENST00000489406 ZCWPW2Q504Y3 356 aa14.84□□□□□ -0.03
UFD1-209ENST00000489406 MTFR2Q6P444 385 aa14.84□□□□□ -0.03
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UFD1-209ENST00000489406 NLRP14Q86W24 1093 aa14.84□□□□□ -0.03
UFD1-209ENST00000489406 ARHGEF19Q8IW93 802 aa14.84□□□□□ -0.03
UFD1-209ENST00000489406 SIDT2Q8NBJ9 832 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
UFD1-209ENST00000489406 CLEC1AQ8NC01 280 aa14.84□□□□□ -0.03
UFD1-209ENST00000489406 PGAP3Q96FM1 320 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
UFD1-209ENST00000489406 PAGE5Q96GU1 130 aa14.84□□□□□ -0.03
UFD1-209ENST00000489406 SPOCK3Q9BQ16 436 aa14.84□□□□□ -0.03
UFD1-209ENST00000489406 DLL4Q9NR61 685 aa14.84□□□□□ -0.03
UFD1-209ENST00000489406 OLAHQ9NV23 265 aa14.84□□□□□ -0.03
UFD1-209ENST00000489406 TMEM248Q9NWD8 314 aa14.84□□□□□ -0.03
UFD1-209ENST00000489406 SH3BGRL2Q9UJC5 107 aa14.84□□□□□ -0.03
UFD1-209ENST00000489406 PRKAB1Q9Y478 270 aa14.84□□□□□ -0.03
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UFD1-209ENST00000489406 FAM131BQ86XD5 332 aa14.83□□□□□ -0.04
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UFD1-209ENST00000489406 DNAJB14Q8TBM8 379 aa14.83□□□□□ -0.04
UFD1-209ENST00000489406 NT5C3BQ969T7 300 aa14.83□□□□□ -0.04
UFD1-209ENST00000489406 NLNQ9BYT8 704 aa14.83□□□□□ -0.04
UFD1-209ENST00000489406 B4GALT6Q9UBX8 382 aa14.83□□□□□ -0.04
UFD1-209ENST00000489406 KCNK6Q9Y257 313 aa14.83□□□□□ -0.04
UFD1-209ENST00000489406 PCYT1BQ9Y5K3 369 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
UFD1-209ENST00000489406 KIR2DS5A0A0G2JLQ3 304 aa14.82□□□□□ -0.04
UFD1-209ENST00000489406 A0A0G2JNG1 304 aa14.82□□□□□ -0.04
UFD1-209ENST00000489406 A0A0U1RQS6 177 aa14.82□□□□□ -0.04
UFD1-209ENST00000489406 KIR2DS3K7RE56 304 aa14.82□□□□□ -0.04
UFD1-209ENST00000489406 MASP2O00187 686 aa14.82□□□□□ -0.04
UFD1-209ENST00000489406 EBLN1P0CF75 366 aa14.82□□□□□ -0.04
UFD1-209ENST00000489406 FOSL1P15407 271 aa14.82□□□□□ -0.04
UFD1-209ENST00000489406 SERPINA4P29622 427 aa14.82□□□□□ -0.04
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UFD1-209ENST00000489406 OTX2P32243 289 aa14.82□□□□□ -0.04
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UFD1-209ENST00000489406 KIR2DS5Q14953 304 aa14.82□□□□□ -0.04
UFD1-209ENST00000489406 CDSNQ15517 529 aa14.82□□□□□ -0.04
UFD1-209ENST00000489406 CNGA3Q16281 694 aa14.82□□□□□ -0.04
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UFD1-209ENST00000489406 RAB43Q86YS6 212 aa14.82□□□□□ -0.04
UFD1-209ENST00000489406 TMEM126BQ8IUX1 230 aa14.82□□□□□ -0.04
UFD1-209ENST00000489406 PASD1Q8IV76 773 aa14.82□□□□□ -0.04
UFD1-209ENST00000489406 LRRN4CLQ8ND94 238 aa14.82□□□□□ -0.04
UFD1-209ENST00000489406 RSC1A1Q92681 617 aa14.82□□□□□ -0.04
UFD1-209ENST00000489406 DTD2Q96FN9 168 aa14.82□□□□□ -0.04
UFD1-209ENST00000489406 HERPUD2Q9BSE4 406 aa14.82□□□□□ -0.04
UFD1-209ENST00000489406 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
UFD1-209ENST00000489406 CXXC4Q9H2H0 198 aa14.82□□□□□ -0.04
UFD1-209ENST00000489406 FANCGO15287 622 aa14.81□□□□□ -0.04
UFD1-209ENST00000489406 F3P13726 295 aa14.81□□□□□ -0.04
UFD1-209ENST00000489406 SLC2A4P14672 509 aa14.81□□□□□ -0.04
UFD1-209ENST00000489406 GNA15P30679 374 aa14.81□□□□□ -0.04
UFD1-209ENST00000489406 GPR1P46091 355 aa14.81□□□□□ -0.04
UFD1-209ENST00000489406 CSNK1G2P78368 415 aa14.81□□□□□ -0.04
UFD1-209ENST00000489406 ADORA2A-AS1P86434 159 aa14.81□□□□□ -0.04
UFD1-209ENST00000489406 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP14.81□□□□□ -0.04
UFD1-209ENST00000489406 GFRALQ6UXV0 394 aa14.81□□□□□ -0.04
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