RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489344.5

RBM3-208, Transcript of RNA binding motif protein 3, human

TSL 2

Gene RBM3, Length 724 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM3-208	ENST00000489344	PDGFA	P04085	211 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RBM3-208	ENST00000489344	PTMA	P06454	111 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
RBM3-208	ENST00000489344	MYCLP1	P12525	358 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
RBM3-208	ENST00000489344	F8A1	P23610	371 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RBM3-208	ENST00000489344	TNFRSF8	P28908	595 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RBM3-208	ENST00000489344	ARHGAP25	P42331	645 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RBM3-208	ENST00000489344	VAV2	P52735	878 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RBM3-208	ENST00000489344	CCZ1B	P86790	482 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RBM3-208	ENST00000489344	CCZ1	P86791	482 aa	Predicted RBP	13.77	□□□□□ -0.21
RBM3-208	ENST00000489344	RALGDS	Q12967	914 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RBM3-208	ENST00000489344	ERV3-1	Q14264	604 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RBM3-208	ENST00000489344	ITPR3	Q14573	2671 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RBM3-208	ENST00000489344	GRM3	Q14832	879 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RBM3-208	ENST00000489344	CYTH1	Q15438	398 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RBM3-208	ENST00000489344	PNCK	Q6P2M8	343 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RBM3-208	ENST00000489344	LIPI	Q6XZB0	460 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RBM3-208	ENST00000489344	KIAA1328	Q86T90	577 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RBM3-208	ENST00000489344	CAMK1D	Q8IU85	385 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RBM3-208	ENST00000489344	CCDC185	Q8N715	623 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RBM3-208	ENST00000489344	NIPA2	Q8N8Q9	360 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RBM3-208	ENST00000489344	NTAN1	Q96AB6	310 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RBM3-208	ENST00000489344	ZPBP	Q9BS86	351 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RBM3-208	ENST00000489344	RETREG1	Q9H6L5	497 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RBM3-208	ENST00000489344	NOL6	Q9H6R4	1146 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
RBM3-208	ENST00000489344	PCSK1N	Q9UHG2	260 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RBM3-208	ENST00000489344	LCMT1	Q9UIC8	334 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RBM3-208	ENST00000489344	POLH	Q9Y253	713 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RBM3-208	ENST00000489344	ST14	Q9Y5Y6	855 aa		13.77	□□□□□ -0.21
RBM3-208	ENST00000489344		A0A0A6YYK5	440 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
RBM3-208	ENST00000489344	CFAP69	A5D8W1	941 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RBM3-208	ENST00000489344		A8MX80	341 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RBM3-208	ENST00000489344	PJA2	O43164	708 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RBM3-208	ENST00000489344	PRPSAP2	O60256	369 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RBM3-208	ENST00000489344	LRCH4	O75427	683 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RBM3-208	ENST00000489344	PROSC	O94903	275 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RBM3-208	ENST00000489344	DDAH2	O95865	285 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RBM3-208	ENST00000489344	DLGAP3	O95886	979 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RBM3-208	ENST00000489344	CEACAM5	P06731	702 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RBM3-208	ENST00000489344	FURIN	P09958	794 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RBM3-208	ENST00000489344	GM2A	P17900	193 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RBM3-208	ENST00000489344	POU3F2	P20265	443 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
RBM3-208	ENST00000489344	MIP	P30301	263 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RBM3-208	ENST00000489344	PCK1	P35558	622 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RBM3-208	ENST00000489344	AIF1	P55008	147 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RBM3-208	ENST00000489344	GPLD1	P80108	840 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RBM3-208	ENST00000489344	CTBS	Q01459	385 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RBM3-208	ENST00000489344	MESD	Q14696	234 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RBM3-208	ENST00000489344	ACOX1	Q15067	660 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RBM3-208	ENST00000489344	ERMARD	Q5T6L9	678 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RBM3-208	ENST00000489344	SRRM1	Q8IYB3	904 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
RBM3-208	ENST00000489344	TXLNB	Q8N3L3	684 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RBM3-208	ENST00000489344	ESX1	Q8N693	406 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RBM3-208	ENST00000489344	PAF1	Q8N7H5	531 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RBM3-208	ENST00000489344	PTCD2	Q8WV60	388 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
RBM3-208	ENST00000489344	ZNF641	Q96N77	438 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
RBM3-208	ENST00000489344	PHF12	Q96QT6	1004 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RBM3-208	ENST00000489344	DESI2	Q9BSY9	194 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RBM3-208	ENST00000489344	FBXO8	Q9NRD0	319 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RBM3-208	ENST00000489344	PHPT1	Q9NRX4	125 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
RBM3-208	ENST00000489344	TRNAU1AP	Q9NX07	287 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
RBM3-208	ENST00000489344	PDP2	Q9P2J9	529 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RBM3-208	ENST00000489344	FZD10	Q9ULW2	581 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RBM3-208	ENST00000489344	SUFU	Q9UMX1	484 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RBM3-208	ENST00000489344	F8	P00451	2351 aa		13.76	□□□□□ -0.21
RBM3-208	ENST00000489344	TRBV23OR9-2	A0A075B6M9	112 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RBM3-208	ENST00000489344	CDC14C	A4D256	554 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RBM3-208	ENST00000489344	RASA4B	C9J798	803 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RBM3-208	ENST00000489344	RASA4	O43374	803 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RBM3-208	ENST00000489344	CLDN1	O95832	211 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RBM3-208	ENST00000489344	DLST	P36957	453 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RBM3-208	ENST00000489344	ACTR1B	P42025	376 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RBM3-208	ENST00000489344	HADHB	P55084	474 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
RBM3-208	ENST00000489344	RIPPLY3	P57055	190 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RBM3-208	ENST00000489344	ACTR1A	P61163	376 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RBM3-208	ENST00000489344	EIF2S3L	Q2VIR3	472 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
RBM3-208	ENST00000489344	ARHGAP22	Q7Z5H3	698 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RBM3-208	ENST00000489344	TMEM135	Q86UB9	458 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RBM3-208	ENST00000489344	TICAM1	Q8IUC6	712 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RBM3-208	ENST00000489344	OR10G6	Q8NH81	332 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RBM3-208	ENST00000489344	SLC38A3	Q99624	504 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RBM3-208	ENST00000489344	LACRT	Q9GZZ8	138 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RBM3-208	ENST00000489344	UBA2	Q9UBT2	640 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
RBM3-208	ENST00000489344	CROT	Q9UKG9	612 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RBM3-208	ENST00000489344	PLEKHM1	Q9Y4G2	1056 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RBM3-208	ENST00000489344	ADGRG1	Q9Y653	693 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RBM3-208	ENST00000489344	OAS3	Q9Y6K5	1087 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
RBM3-208	ENST00000489344	DUSP10	Q9Y6W6	482 aa		13.75	□□□□□ -0.21
RBM3-208	ENST00000489344	SETD2	Q9BYW2	2564 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
RBM3-208	ENST00000489344	BTNL10	A8MVZ5	291 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RBM3-208	ENST00000489344	POLR1C	O15160	346 aa	Predicted RBP	13.74	□□□□□ -0.21
RBM3-208	ENST00000489344	KATNA1	O75449	491 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RBM3-208	ENST00000489344	DNAJB5	O75953	348 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RBM3-208	ENST00000489344	ELAVL4	P26378	380 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
RBM3-208	ENST00000489344	SERPINA4	P29622	427 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RBM3-208	ENST00000489344	ADCY8	P40145	1251 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RBM3-208	ENST00000489344	SSR1	P43307	286 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
RBM3-208	ENST00000489344	POLD2	P49005	469 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RBM3-208	ENST00000489344	PMS2	P54278	862 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RBM3-208	ENST00000489344	KIF5A	Q12840	1032 aa		13.74	□□□□□ -0.21
RBM3-208	ENST00000489344	PEX6	Q13608	980 aa		13.74	□□□□□ -0.21

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