RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487548.2

SENP6-210, Transcript of SUMO specific peptidase 6, humanhuman

TSL 2

Gene SENP6, Length 427 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Exosome, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SENP6-210ENST00000487548 TLX1P31314 330 aaPredicted RBP2.51□□□□□ -2.01
SENP6-210ENST00000487548 CEACAM8P31997 349 aaPredicted RBP2.51□□□□□ -2.01
SENP6-210ENST00000487548 AHRP35869 848 aa2.51□□□□□ -2.01
SENP6-210ENST00000487548 CCR10P46092 362 aa2.51□□□□□ -2.01
SENP6-210ENST00000487548 MCM2P49736 904 aa2.51□□□□□ -2.01
SENP6-210ENST00000487548 MBTD1Q05BQ5 628 aa2.51□□□□□ -2.01
SENP6-210ENST00000487548 RIGQ13278 110 aa2.51□□□□□ -2.01
SENP6-210ENST00000487548 TRIM14Q14142 442 aa2.51□□□□□ -2.01
SENP6-210ENST00000487548 BRD3Q15059 726 aa2.51□□□□□ -2.01
SENP6-210ENST00000487548 TCTN1Q2MV58 587 aa2.51□□□□□ -2.01
SENP6-210ENST00000487548 KIAA1644Q3SXP7 199 aa2.51□□□□□ -2.01
SENP6-210ENST00000487548 FAM83BQ5T0W9 1011 aa2.51□□□□□ -2.01
SENP6-210ENST00000487548 ZNF280DQ6N043 979 aa2.51□□□□□ -2.01
SENP6-210ENST00000487548 LINGO2Q7L985 606 aa2.51□□□□□ -2.01
SENP6-210ENST00000487548 PIWIL4Q7Z3Z4 852 aaKnown RBP2.51□□□□□ -2.01
SENP6-210ENST00000487548 ZNF584Q8IVC4 421 aa2.51□□□□□ -2.01
SENP6-210ENST00000487548 MAP7D3Q8IWC1 876 aa2.51□□□□□ -2.01
SENP6-210ENST00000487548 ZNF614Q8N883 585 aa2.51□□□□□ -2.01
SENP6-210ENST00000487548 GRAMD2BQ96HH9 432 aa2.51□□□□□ -2.01
SENP6-210ENST00000487548 GMPPAQ96IJ6 420 aaPredicted RBP2.51□□□□□ -2.01
SENP6-210ENST00000487548 PKP2Q99959 881 aa2.51□□□□□ -2.01
SENP6-210ENST00000487548 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP2.51□□□□□ -2.01
SENP6-210ENST00000487548 HINT3Q9NQE9 182 aaKnown RBP2.51□□□□□ -2.01
SENP6-210ENST00000487548 PLCXD1Q9NUJ7 323 aa2.51□□□□□ -2.01
SENP6-210ENST00000487548 ATAD3AQ9NVI7 634 aa2.51□□□□□ -2.01
SENP6-210ENST00000487548 ALKBH4Q9NXW9 302 aa2.51□□□□□ -2.01
SENP6-210ENST00000487548 PTTG2Q9NZH5 202 aa2.51□□□□□ -2.01
SENP6-210ENST00000487548 IL1RAPL1Q9NZN1 696 aa2.51□□□□□ -2.01
SENP6-210ENST00000487548 FAM96BQ9Y3D0 163 aa2.51□□□□□ -2.01
SENP6-210ENST00000487548 DISP3Q9P2K9 1392 aa2.5□□□□□ -2.01
SENP6-210ENST00000487548 SYNCRIPO60506 623 aaKnown RBP2.5□□□□□ -2.01
SENP6-210ENST00000487548 FAM155BO75949 473 aa2.5□□□□□ -2.01
SENP6-210ENST00000487548 HMBSP08397 361 aa2.5□□□□□ -2.01
SENP6-210ENST00000487548 MSH3P20585 1137 aa2.5□□□□□ -2.01
SENP6-210ENST00000487548 POU1F1P28069 291 aa2.5□□□□□ -2.01
SENP6-210ENST00000487548 ARCN1P48444 511 aaKnown RBP2.5□□□□□ -2.01
SENP6-210ENST00000487548 TAS2R38P59533 333 aa2.5□□□□□ -2.01
SENP6-210ENST00000487548 RPP30P78346 268 aaKnown RBP2.5□□□□□ -2.01
SENP6-210ENST00000487548 FOXM1Q08050 763 aa2.5□□□□□ -2.01
SENP6-210ENST00000487548 MORC3Q14149 939 aa2.5□□□□□ -2.01
SENP6-210ENST00000487548 PPP2R5BQ15173 497 aa2.5□□□□□ -2.01
SENP6-210ENST00000487548 TAF11Q15544 211 aa2.5□□□□□ -2.01
SENP6-210ENST00000487548 KRTCAP3Q53RY4 240 aa2.5□□□□□ -2.01
SENP6-210ENST00000487548 ZNF667Q5HYK9 610 aa2.5□□□□□ -2.01
SENP6-210ENST00000487548 GGNBP1Q5YKI7 109 aa2.5□□□□□ -2.01
SENP6-210ENST00000487548 METTL2BQ6P1Q9 378 aaKnown RBP2.5□□□□□ -2.01
SENP6-210ENST00000487548 ZNF613Q6PF04 617 aa2.5□□□□□ -2.01
SENP6-210ENST00000487548 CCDC174Q6PII3 467 aa2.5□□□□□ -2.01
SENP6-210ENST00000487548 MFSD6Q6ZSS7 791 aa2.5□□□□□ -2.01
SENP6-210ENST00000487548 GPR180Q86V85 440 aa2.5□□□□□ -2.01
SENP6-210ENST00000487548 DHX40Q8IX18 779 aaKnown RBP2.5□□□□□ -2.01
SENP6-210ENST00000487548 SLC34A3Q8N130 599 aa2.5□□□□□ -2.01
SENP6-210ENST00000487548 SAMD3Q8N6K7 520 aa2.5□□□□□ -2.01
SENP6-210ENST00000487548 RBM15BQ8NDT2 890 aaKnown RBP2.5□□□□□ -2.01
SENP6-210ENST00000487548 HUS1BQ8NHY5 278 aa2.5□□□□□ -2.01
SENP6-210ENST00000487548 STAMQ92783 540 aa2.5□□□□□ -2.01
SENP6-210ENST00000487548 METTL2AQ96IZ6 378 aaKnown RBP2.5□□□□□ -2.01
SENP6-210ENST00000487548 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP2.5□□□□□ -2.01
SENP6-210ENST00000487548 TWSG1Q9GZX9 223 aa2.5□□□□□ -2.01
SENP6-210ENST00000487548 PLEKHA4Q9H4M7 779 aa2.5□□□□□ -2.01
SENP6-210ENST00000487548 C2orf42Q9NWW7 574 aa2.5□□□□□ -2.01
SENP6-210ENST00000487548 TMEM181Q9P2C4 612 aa2.5□□□□□ -2.01
SENP6-210ENST00000487548 ASIC3Q9UHC3 531 aa2.5□□□□□ -2.01
SENP6-210ENST00000487548 ACAD8Q9UKU7 415 aa2.5□□□□□ -2.01
SENP6-210ENST00000487548 PADI3Q9ULW8 664 aa2.5□□□□□ -2.01
SENP6-210ENST00000487548 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP2.5□□□□□ -2.01
SENP6-210ENST00000487548 GDAQ9Y2T3 454 aa2.5□□□□□ -2.01
SENP6-210ENST00000487548 DERAQ9Y315 318 aa2.5□□□□□ -2.01
SENP6-210ENST00000487548 MOB4Q9Y3A3 225 aa2.5□□□□□ -2.01
SENP6-210ENST00000487548 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa2.49□□□□□ -2.01
SENP6-210ENST00000487548 IGLV3-10A0A075B6K4 115 aa2.49□□□□□ -2.01
SENP6-210ENST00000487548 TCEA3O75764 348 aa2.49□□□□□ -2.01
SENP6-210ENST00000487548 EDN1P05305 212 aa2.49□□□□□ -2.01
SENP6-210ENST00000487548 CSF2RAP15509 400 aa2.49□□□□□ -2.01
SENP6-210ENST00000487548 CAPN2P17655 700 aa2.49□□□□□ -2.01
SENP6-210ENST00000487548 CHKAP35790 457 aa2.49□□□□□ -2.01
SENP6-210ENST00000487548 CSNK2A1P68400 391 aaPredicted RBP2.49□□□□□ -2.01
SENP6-210ENST00000487548 GTDC1Q4AE62 458 aa2.49□□□□□ -2.01
SENP6-210ENST00000487548 CTXN3Q4LDR2 81 aa2.49□□□□□ -2.01
SENP6-210ENST00000487548 ARHGEF16Q5VV41 709 aa2.49□□□□□ -2.01
SENP6-210ENST00000487548 ERC1Q8IUD2 1116 aa2.49□□□□□ -2.01
SENP6-210ENST00000487548 CSNK2A3Q8NEV1 391 aa2.49□□□□□ -2.01
SENP6-210ENST00000487548 AFG1LQ8WV93 481 aa2.49□□□□□ -2.01
SENP6-210ENST00000487548 RILPL2Q969X0 211 aa2.49□□□□□ -2.01
SENP6-210ENST00000487548 SH3KBP1Q96B97 665 aa2.49□□□□□ -2.01
SENP6-210ENST00000487548 RHBDF1Q96CC6 855 aa2.49□□□□□ -2.01
SENP6-210ENST00000487548 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP2.49□□□□□ -2.01
SENP6-210ENST00000487548 PRAC1Q96KF2 57 aa2.49□□□□□ -2.01
SENP6-210ENST00000487548 FOXN4Q96NZ1 517 aa2.49□□□□□ -2.01
SENP6-210ENST00000487548 SH3GL2Q99962 352 aa2.49□□□□□ -2.01
SENP6-210ENST00000487548 PIGQQ9BRB3 760 aa2.49□□□□□ -2.01
SENP6-210ENST00000487548 LRMDAQ9H2I8 198 aa2.49□□□□□ -2.01
SENP6-210ENST00000487548 SEBOXQ9HB31 216 aaPredicted RBP2.49□□□□□ -2.01
SENP6-210ENST00000487548 TRPC7Q9HCX4 862 aa2.49□□□□□ -2.01
SENP6-210ENST00000487548 SAYSD1Q9NPB0 183 aa2.49□□□□□ -2.01
SENP6-210ENST00000487548 SIX2Q9NPC8 291 aa2.49□□□□□ -2.01
SENP6-210ENST00000487548 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa2.49□□□□□ -2.01
SENP6-210ENST00000487548 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP2.49□□□□□ -2.01
SENP6-210ENST00000487548 TMEM178BH3BS89 294 aa2.48□□□□□ -2.01
SENP6-210ENST00000487548 TRMUO75648 421 aaKnown RBP2.48□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.4 ms