RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483092.1

CCSAP-204, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CCSAP, Length 3,492 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-204ENST00000483092 OTUD1Q5VV17 481 aaPredicted RBP16.15■□□□□ 0.18
CCSAP-204ENST00000483092 STEAP4Q687X5 459 aa16.15■□□□□ 0.18
CCSAP-204ENST00000483092 UGT3A1Q6NUS8 523 aa16.15■□□□□ 0.18
CCSAP-204ENST00000483092 ALKAL1Q6UXT8 129 aa16.15■□□□□ 0.18
CCSAP-204ENST00000483092 HEXDCQ8WVB3 486 aa16.15■□□□□ 0.18
CCSAP-204ENST00000483092 HSFY1Q96LI6 401 aa16.15■□□□□ 0.18
CCSAP-204ENST00000483092 PARK7Q99497 189 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
CCSAP-204ENST00000483092 HGH1Q9BTY7 390 aa16.15■□□□□ 0.18
CCSAP-204ENST00000483092 CHID1Q9BWS9 393 aa16.15■□□□□ 0.18
CCSAP-204ENST00000483092 TKTL2Q9H0I9 626 aa16.15■□□□□ 0.18
CCSAP-204ENST00000483092 DKK3Q9UBP4 350 aa16.15■□□□□ 0.18
CCSAP-204ENST00000483092 ADAM28Q9UKQ2 775 aa16.15■□□□□ 0.18
CCSAP-204ENST00000483092 BOLA1Q9Y3E2 137 aa16.15■□□□□ 0.18
CCSAP-204ENST00000483092 F8W810 466 aa16.15■□□□□ 0.18
CCSAP-204ENST00000483092 IL5RAQ01344 420 aa16.15■□□□□ 0.18
CCSAP-204ENST00000483092 OTOP3Q7RTS5 596 aa16.15■□□□□ 0.18
CCSAP-204ENST00000483092 RETREG3Q86VR2 466 aa16.15■□□□□ 0.18
CCSAP-204ENST00000483092 OR13F1Q8NGS4 319 aa16.15■□□□□ 0.18
CCSAP-204ENST00000483092 CENPIQ92674 756 aaPredicted RBP16.15■□□□□ 0.18
CCSAP-204ENST00000483092 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP16.15■□□□□ 0.18
CCSAP-204ENST00000483092 CITED4Q96RK1 184 aa16.15■□□□□ 0.18
CCSAP-204ENST00000483092 ATP13A3Q9H7F0 1226 aa16.15■□□□□ 0.18
CCSAP-204ENST00000483092 SMURF2Q9HAU4 748 aa16.15■□□□□ 0.18
CCSAP-204ENST00000483092 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa16.15■□□□□ 0.18
CCSAP-204ENST00000483092 EML4Q9HC35 981 aaKnown RBP16.15■□□□□ 0.18
CCSAP-204ENST00000483092 MRGBPQ9NV56 204 aa16.15■□□□□ 0.18
CCSAP-204ENST00000483092 SPO11Q9Y5K1 396 aa16.15■□□□□ 0.18
CCSAP-204ENST00000483092 TRIM24O15164 1050 aa16.14■□□□□ 0.17
CCSAP-204ENST00000483092 MLNP12872 115 aa16.14■□□□□ 0.17
CCSAP-204ENST00000483092 SHMT2P34897 504 aa16.14■□□□□ 0.17
CCSAP-204ENST00000483092 CLK1P49759 484 aaKnown RBP16.14■□□□□ 0.17
CCSAP-204ENST00000483092 RPS3AP61247 264 aaKnown RBP16.14■□□□□ 0.17
CCSAP-204ENST00000483092 AQP6Q13520 282 aa16.14■□□□□ 0.17
CCSAP-204ENST00000483092 CYBRD1Q53TN4 286 aa16.14■□□□□ 0.17
CCSAP-204ENST00000483092 TBPL2Q6SJ96 375 aa16.14■□□□□ 0.17
CCSAP-204ENST00000483092 STRADAQ7RTN6 431 aa16.14■□□□□ 0.17
CCSAP-204ENST00000483092 ITIH5Q86UX2 942 aa16.14■□□□□ 0.17
CCSAP-204ENST00000483092 ZNF555Q8NEP9 628 aa16.14■□□□□ 0.17
CCSAP-204ENST00000483092 TRPV3Q8NET8 790 aa16.14■□□□□ 0.17
CCSAP-204ENST00000483092 SPATA22Q8NHS9 363 aa16.14■□□□□ 0.17
CCSAP-204ENST00000483092 BDH2Q9BUT1 245 aa16.14■□□□□ 0.17
CCSAP-204ENST00000483092 PRM3Q9NNZ6 103 aa16.14■□□□□ 0.17
CCSAP-204ENST00000483092 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP16.14■□□□□ 0.17
CCSAP-204ENST00000483092 LAMA3Q16787 3333 aa16.14■□□□□ 0.17
CCSAP-204ENST00000483092 DLGAP1O14490 977 aa16.14■□□□□ 0.17
CCSAP-204ENST00000483092 UGT2B4P06133 528 aa16.14■□□□□ 0.17
CCSAP-204ENST00000483092 NFKB1P19838 968 aa16.14■□□□□ 0.17
CCSAP-204ENST00000483092 ADRA1BP35368 520 aa16.14■□□□□ 0.17
CCSAP-204ENST00000483092 TAS2R39P59534 338 aa16.14■□□□□ 0.17
CCSAP-204ENST00000483092 DAB2P98082 770 aa16.14■□□□□ 0.17
CCSAP-204ENST00000483092 IFITM3Q01628 133 aa16.14■□□□□ 0.17
CCSAP-204ENST00000483092 ZNF470Q6ECI4 717 aa16.14■□□□□ 0.17
CCSAP-204ENST00000483092 CEP97Q8IW35 865 aa16.14■□□□□ 0.17
CCSAP-204ENST00000483092 FEM1CQ96JP0 617 aa16.14■□□□□ 0.17
CCSAP-204ENST00000483092 SMOQ99835 787 aa16.14■□□□□ 0.17
CCSAP-204ENST00000483092 WDCPQ9H6R7 721 aa16.14■□□□□ 0.17
CCSAP-204ENST00000483092 TNFRSF12AQ9NP84 129 aa16.14■□□□□ 0.17
CCSAP-204ENST00000483092 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa16.14■□□□□ 0.17
CCSAP-204ENST00000483092 XPNPEP2O43895 674 aa16.14■□□□□ 0.17
CCSAP-204ENST00000483092 AHSGP02765 367 aa16.14■□□□□ 0.17
CCSAP-204ENST00000483092 GSNP06396 782 aa16.14■□□□□ 0.17
CCSAP-204ENST00000483092 AGXTP21549 392 aa16.14■□□□□ 0.17
CCSAP-204ENST00000483092 APLP1P51693 650 aa16.14■□□□□ 0.17
CCSAP-204ENST00000483092 NAB1Q13506 487 aa16.14■□□□□ 0.17
CCSAP-204ENST00000483092 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP16.14■□□□□ 0.17
CCSAP-204ENST00000483092 BCL2A1Q16548 175 aa16.14■□□□□ 0.17
CCSAP-204ENST00000483092 NDUFA5Q16718 116 aa16.14■□□□□ 0.17
CCSAP-204ENST00000483092 DGUOKQ16854 277 aa16.14■□□□□ 0.17
CCSAP-204ENST00000483092 PIWIL4Q7Z3Z4 852 aaKnown RBP16.14■□□□□ 0.17
CCSAP-204ENST00000483092 SCAMP5Q8TAC9 235 aa16.14■□□□□ 0.17
CCSAP-204ENST00000483092 FBXO30Q8TB52 745 aa16.14■□□□□ 0.17
CCSAP-204ENST00000483092 NDNFQ8TB73 568 aa16.14■□□□□ 0.17
CCSAP-204ENST00000483092 RORBQ92753 470 aa16.14■□□□□ 0.17
CCSAP-204ENST00000483092 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP16.14■□□□□ 0.17
CCSAP-204ENST00000483092 CD320Q9NPF0 282 aa16.14■□□□□ 0.17
CCSAP-204ENST00000483092 DERAQ9Y315 318 aa16.14■□□□□ 0.17
CCSAP-204ENST00000483092 TTC3P53804 2025 aa16.14■□□□□ 0.17
CCSAP-204ENST00000483092 A0A0G2JMZ2 1700 aa16.14■□□□□ 0.17
CCSAP-204ENST00000483092 LRRC37A2A6NM11 1700 aa16.14■□□□□ 0.17
CCSAP-204ENST00000483092 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP16.13■□□□□ 0.17
CCSAP-204ENST00000483092 YBX1P67809 324 aaKnown RBP16.13■□□□□ 0.17
CCSAP-204ENST00000483092 LAPTM5Q13571 262 aa16.13■□□□□ 0.17
CCSAP-204ENST00000483092 COLEC12Q5KU26 742 aa16.13■□□□□ 0.17
CCSAP-204ENST00000483092 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP16.13■□□□□ 0.17
CCSAP-204ENST00000483092 NEPROQ6NW34 567 aa16.13■□□□□ 0.17
CCSAP-204ENST00000483092 PLEKHG7Q6ZR37 379 aa16.13■□□□□ 0.17
CCSAP-204ENST00000483092 ARHGAP36Q6ZRI8 547 aa16.13■□□□□ 0.17
CCSAP-204ENST00000483092 ABI1Q8IZP0 508 aa16.13■□□□□ 0.17
CCSAP-204ENST00000483092 ITCHQ96J02 903 aa16.13■□□□□ 0.17
CCSAP-204ENST00000483092 NEK6Q9HC98 313 aa16.13■□□□□ 0.17
CCSAP-204ENST00000483092 OR12D3Q9UGF7 316 aa16.13■□□□□ 0.17
CCSAP-204ENST00000483092 USP3Q9Y6I4 520 aa16.13■□□□□ 0.17
CCSAP-204ENST00000483092 M0QZ92 97 aa16.13■□□□□ 0.17
CCSAP-204ENST00000483092 MSI1O43347 362 aaKnown RBP16.13■□□□□ 0.17
CCSAP-204ENST00000483092 HS6ST1O60243 411 aa16.13■□□□□ 0.17
CCSAP-204ENST00000483092 FYNP06241 537 aa16.13■□□□□ 0.17
CCSAP-204ENST00000483092 SLC35E2BP0CK96 405 aa16.13■□□□□ 0.17
CCSAP-204ENST00000483092 CDH1P12830 882 aa16.13■□□□□ 0.17
CCSAP-204ENST00000483092 KCNA5P22460 613 aa16.13■□□□□ 0.17
CCSAP-204ENST00000483092 HTR1BP28222 390 aa16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.9 ms