RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478473.1

C9orf3-215, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 3

Gene C9orf3, Length 895 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-215ENST00000478473 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
C9orf3-215ENST00000478473 ARL14Q8N4G2 192 aa23.24■■□□□ 1.31
C9orf3-215ENST00000478473 GPR26Q8NDV2 337 aa23.24■■□□□ 1.31
C9orf3-215ENST00000478473 ACRBPQ8NEB7 543 aa23.24■■□□□ 1.31
C9orf3-215ENST00000478473 WDR36Q8NI36 951 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
C9orf3-215ENST00000478473 ZSCAN5AQ9BUG6 496 aa23.24■■□□□ 1.31
C9orf3-215ENST00000478473 OSBPL8Q9BZF1 889 aa23.24■■□□□ 1.31
C9orf3-215ENST00000478473 TRABDQ9H4I3 376 aa23.24■■□□□ 1.31
C9orf3-215ENST00000478473 SATB2Q9UPW6 733 aa23.24■■□□□ 1.31
C9orf3-215ENST00000478473 ADGRG1Q9Y653 693 aa23.24■■□□□ 1.31
C9orf3-215ENST00000478473 CCDC187A0A096LP49 1063 aa23.23■■□□□ 1.31
C9orf3-215ENST00000478473 GRID2IPA4D2P6 1211 aa23.23■■□□□ 1.31
C9orf3-215ENST00000478473 CDRT15L2A8MXV6 281 aa23.23■■□□□ 1.31
C9orf3-215ENST00000478473 HMGCLP35914 325 aa23.23■■□□□ 1.31
C9orf3-215ENST00000478473 GPR3P46089 330 aa23.23■■□□□ 1.31
C9orf3-215ENST00000478473 WNT3AP56704 352 aa23.23■■□□□ 1.31
C9orf3-215ENST00000478473 RWDD2BP57060 319 aa23.23■■□□□ 1.31
C9orf3-215ENST00000478473 SQSTM1Q13501 440 aa23.23■■□□□ 1.31
C9orf3-215ENST00000478473 PCSK7Q16549 785 aa23.23■■□□□ 1.31
C9orf3-215ENST00000478473 CCDC70Q6NSX1 233 aa23.23■■□□□ 1.31
C9orf3-215ENST00000478473 DOK6Q6PKX4 331 aa23.23■■□□□ 1.31
C9orf3-215ENST00000478473 C19orf48Q6RUI8 117 aa23.23■■□□□ 1.31
C9orf3-215ENST00000478473 GALNT13Q8IUC8 556 aa23.23■■□□□ 1.31
C9orf3-215ENST00000478473 TRAM1L1Q8N609 369 aa23.23■■□□□ 1.31
C9orf3-215ENST00000478473 OXNAD1Q96HP4 312 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
C9orf3-215ENST00000478473 MRGPRX2Q96LB1 330 aa23.23■■□□□ 1.31
C9orf3-215ENST00000478473 TMEM74Q96NL1 305 aa23.23■■□□□ 1.31
C9orf3-215ENST00000478473 HEMGNQ9BXL5 484 aa23.23■■□□□ 1.31
C9orf3-215ENST00000478473 CARD9Q9H257 536 aa23.23■■□□□ 1.31
C9orf3-215ENST00000478473 SSUH2Q9Y2M2 353 aa23.23■■□□□ 1.31
C9orf3-215ENST00000478473 UNC13CQ8NB66 2214 aa23.23■■□□□ 1.31
C9orf3-215ENST00000478473 INPP4BO15327 924 aa23.22■■□□□ 1.31
C9orf3-215ENST00000478473 RRP8O43159 456 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
C9orf3-215ENST00000478473 B4GAT1O43505 415 aa23.22■■□□□ 1.31
C9orf3-215ENST00000478473 PMPCBO75439 489 aa23.22■■□□□ 1.31
C9orf3-215ENST00000478473 ECEL1O95672 775 aa23.22■■□□□ 1.31
C9orf3-215ENST00000478473 CLCNKAP51800 687 aa23.22■■□□□ 1.31
C9orf3-215ENST00000478473 MPP3Q13368 585 aa23.22■■□□□ 1.31
C9orf3-215ENST00000478473 SLC30A9Q6PML9 568 aa23.22■■□□□ 1.31
C9orf3-215ENST00000478473 PID1Q7Z2X4 250 aa23.22■■□□□ 1.31
C9orf3-215ENST00000478473 KDELC2Q7Z4H8 507 aa23.22■■□□□ 1.31
C9orf3-215ENST00000478473 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa23.22■■□□□ 1.31
C9orf3-215ENST00000478473 CLEC14AQ86T13 490 aa23.22■■□□□ 1.31
C9orf3-215ENST00000478473 HNRNPLLQ8WVV9 542 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
C9orf3-215ENST00000478473 ALG3Q92685 438 aa23.22■■□□□ 1.31
C9orf3-215ENST00000478473 PLEKHG4BQ96PX9 1271 aa23.22■■□□□ 1.31
C9orf3-215ENST00000478473 THSD1Q9NS62 852 aa23.22■■□□□ 1.31
C9orf3-215ENST00000478473 KLHL8Q9P2G9 620 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
C9orf3-215ENST00000478473 SHOC2Q9UQ13 582 aa23.22■■□□□ 1.31
C9orf3-215ENST00000478473 PLEKHM1Q9Y4G2 1056 aa23.22■■□□□ 1.31
C9orf3-215ENST00000478473 SPO11Q9Y5K1 396 aa23.22■■□□□ 1.31
C9orf3-215ENST00000478473 PCYT1BQ9Y5K3 369 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
C9orf3-215ENST00000478473 PTPRQQ9UMZ3 2332 aa23.21■■□□□ 1.31
C9orf3-215ENST00000478473 NUAK1O60285 661 aa23.21■■□□□ 1.31
C9orf3-215ENST00000478473 ATP1A1P05023 1023 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
C9orf3-215ENST00000478473 PIRTP0C851 137 aa23.21■■□□□ 1.31
C9orf3-215ENST00000478473 BPIP17213 487 aa23.21■■□□□ 1.31
C9orf3-215ENST00000478473 ACTR1BP42025 376 aa23.21■■□□□ 1.31
C9orf3-215ENST00000478473 ABCG1P45844 678 aa23.21■■□□□ 1.31
C9orf3-215ENST00000478473 FASLGP48023 281 aa23.21■■□□□ 1.31
C9orf3-215ENST00000478473 MAZP56270 477 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
C9orf3-215ENST00000478473 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
C9orf3-215ENST00000478473 ACTR1AP61163 376 aa23.21■■□□□ 1.31
C9orf3-215ENST00000478473 C3orf38Q5JPI3 329 aa23.21■■□□□ 1.31
C9orf3-215ENST00000478473 SLITRK4Q8IW52 837 aa23.21■■□□□ 1.31
C9orf3-215ENST00000478473 TXLNBQ8N3L3 684 aa23.21■■□□□ 1.31
C9orf3-215ENST00000478473 ZNF248Q8NDW4 579 aa23.21■■□□□ 1.31
C9orf3-215ENST00000478473 ACTL9Q8TC94 416 aa23.21■■□□□ 1.31
C9orf3-215ENST00000478473 HAUS1Q96CS2 278 aa23.21■■□□□ 1.31
C9orf3-215ENST00000478473 GPR63Q9BZJ6 419 aa23.21■■□□□ 1.31
C9orf3-215ENST00000478473 TRIM39Q9HCM9 518 aa23.21■■□□□ 1.31
C9orf3-215ENST00000478473 UBP1Q9NZI7 540 aa23.21■■□□□ 1.31
C9orf3-215ENST00000478473 HACD3Q9P035 362 aa23.21■■□□□ 1.31
C9orf3-215ENST00000478473 A6NCN8 305 aa23.2■■□□□ 1.3
C9orf3-215ENST00000478473 CHUKO15111 745 aa23.2■■□□□ 1.3
C9orf3-215ENST00000478473 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP23.2■■□□□ 1.3
C9orf3-215ENST00000478473 HLA-DPA1P20036 260 aa23.2■■□□□ 1.3
C9orf3-215ENST00000478473 RBL1P28749 1068 aa23.2■■□□□ 1.3
C9orf3-215ENST00000478473 INHBCP55103 352 aa23.2■■□□□ 1.3
C9orf3-215ENST00000478473 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa23.2■■□□□ 1.3
C9orf3-215ENST00000478473 PDZD3Q86UT5 571 aa23.2■■□□□ 1.3
C9orf3-215ENST00000478473 KLHDC8BQ8IXV7 354 aa23.2■■□□□ 1.3
C9orf3-215ENST00000478473 TTC30BQ8N4P2 665 aa23.2■■□□□ 1.3
C9orf3-215ENST00000478473 UBE2Q2Q8WVN8 375 aa23.2■■□□□ 1.3
C9orf3-215ENST00000478473 GLYATL1Q969I3 302 aa23.2■■□□□ 1.3
C9orf3-215ENST00000478473 TMEM159Q96B96 161 aa23.2■■□□□ 1.3
C9orf3-215ENST00000478473 DCBLD2Q96PD2 775 aa23.2■■□□□ 1.3
C9orf3-215ENST00000478473 VPS35Q96QK1 796 aa23.2■■□□□ 1.3
C9orf3-215ENST00000478473 GBA3Q9H227 469 aa23.2■■□□□ 1.3
C9orf3-215ENST00000478473 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP23.2■■□□□ 1.3
C9orf3-215ENST00000478473 KIF26BQ2KJY2 2108 aa23.2■■□□□ 1.3
C9orf3-215ENST00000478473 AURKAO14965 403 aa23.19■■□□□ 1.3
C9orf3-215ENST00000478473 ZW10O43264 779 aa23.19■■□□□ 1.3
C9orf3-215ENST00000478473 ASMTLO95671 621 aa23.19■■□□□ 1.3
C9orf3-215ENST00000478473 ITGA2BP08514 1039 aa23.19■■□□□ 1.3
C9orf3-215ENST00000478473 PYGMP11217 842 aa23.19■■□□□ 1.3
C9orf3-215ENST00000478473 ITPKBP27987 946 aa23.19■■□□□ 1.3
C9orf3-215ENST00000478473 RBMS1P29558 406 aaKnown RBP23.19■■□□□ 1.3
C9orf3-215ENST00000478473 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP23.19■■□□□ 1.3
C9orf3-215ENST00000478473 OTUD4Q01804 1114 aaKnown RBP23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.6 ms