RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471880.5

SSR4-208, Transcript of signal sequence receptor subunit 4, human

TSL 5

Gene SSR4, Length 785 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SSR4-208	ENST00000471880	USP12	O75317	370 aa		14.7	□□□□□ -0.06
SSR4-208	ENST00000471880	ANXA9	O76027	345 aa		14.7	□□□□□ -0.06
SSR4-208	ENST00000471880	SLC25A14	O95258	325 aa	Predicted RBP	14.7	□□□□□ -0.06
SSR4-208	ENST00000471880	FUCA1	P04066	466 aa		14.7	□□□□□ -0.06
SSR4-208	ENST00000471880	IVL	P07476	585 aa		14.7	□□□□□ -0.06
SSR4-208	ENST00000471880	CCDC175	P0C221	793 aa		14.7	□□□□□ -0.06
SSR4-208	ENST00000471880	PSMB4	P28070	264 aa		14.7	□□□□□ -0.06
SSR4-208	ENST00000471880	CTBS	Q01459	385 aa		14.7	□□□□□ -0.06
SSR4-208	ENST00000471880	SLC14A2	Q15849	920 aa		14.7	□□□□□ -0.06
SSR4-208	ENST00000471880	C14orf28	Q4W4Y0	310 aa		14.7	□□□□□ -0.06
SSR4-208	ENST00000471880	ANKRD20A2	Q5SQ80	823 aa		14.7	□□□□□ -0.06
SSR4-208	ENST00000471880	ZNF648	Q5T619	568 aa	Predicted RBP	14.7	□□□□□ -0.06
SSR4-208	ENST00000471880	ANKRD20A1	Q5TYW2	823 aa		14.7	□□□□□ -0.06
SSR4-208	ENST00000471880	ANKRD20A3	Q5VUR7	823 aa		14.7	□□□□□ -0.06
SSR4-208	ENST00000471880	KDELC1	Q6UW63	502 aa		14.7	□□□□□ -0.06
SSR4-208	ENST00000471880	RBM44	Q6ZP01	1051 aa	Known RBP	14.7	□□□□□ -0.06
SSR4-208	ENST00000471880	ARHGEF18	Q6ZSZ5	1173 aa		14.7	□□□□□ -0.06
SSR4-208	ENST00000471880	GLT6D1	Q7Z4J2	308 aa		14.7	□□□□□ -0.06
SSR4-208	ENST00000471880	RNF10	Q8N5U6	811 aa	Known RBP	14.7	□□□□□ -0.06
SSR4-208	ENST00000471880	TTC13	Q8NBP0	860 aa		14.7	□□□□□ -0.06
SSR4-208	ENST00000471880	GPR26	Q8NDV2	337 aa		14.7	□□□□□ -0.06
SSR4-208	ENST00000471880	LRRC45	Q96CN5	670 aa		14.7	□□□□□ -0.06
SSR4-208	ENST00000471880	MRGPRX2	Q96LB1	330 aa		14.7	□□□□□ -0.06
SSR4-208	ENST00000471880	ALS2CR12	Q96Q35	445 aa		14.7	□□□□□ -0.06
SSR4-208	ENST00000471880	SRPK1	Q96SB4	655 aa	Known RBP	14.7	□□□□□ -0.06
SSR4-208	ENST00000471880	SPATS2L	Q9NUQ6	558 aa	Known RBP	14.7	□□□□□ -0.06
SSR4-208	ENST00000471880	TRNAU1AP	Q9NX07	287 aa	Known RBP	14.7	□□□□□ -0.06
SSR4-208	ENST00000471880	TAAR2	Q9P1P5	351 aa		14.7	□□□□□ -0.06
SSR4-208	ENST00000471880	SLC17A4	Q9Y2C5	497 aa		14.7	□□□□□ -0.06
SSR4-208	ENST00000471880	ADAMTS20	P59510	1910 aa		14.7	□□□□□ -0.06
SSR4-208	ENST00000471880	SCN8A	Q9UQD0	1980 aa		14.69	□□□□□ -0.06
SSR4-208	ENST00000471880	FAM208B	Q5VWN6	2430 aa		14.69	□□□□□ -0.06
SSR4-208	ENST00000471880	TRBV23OR9-2	A0A075B6M9	112 aa		14.69	□□□□□ -0.06
SSR4-208	ENST00000471880	RGSL1	A5PLK6	1076 aa		14.69	□□□□□ -0.06
SSR4-208	ENST00000471880	RHPN2P1	A8MT19	583 aa		14.69	□□□□□ -0.06
SSR4-208	ENST00000471880	AGT	P01019	485 aa		14.69	□□□□□ -0.06
SSR4-208	ENST00000471880	RPLP0	P05388	317 aa	Known RBP	14.69	□□□□□ -0.06
SSR4-208	ENST00000471880	HLA-DPA1	P20036	260 aa		14.69	□□□□□ -0.06
SSR4-208	ENST00000471880	MAZ	P56270	477 aa	Known RBP	14.69	□□□□□ -0.06
SSR4-208	ENST00000471880	SLC1A5	Q15758	541 aa		14.69	□□□□□ -0.06
SSR4-208	ENST00000471880	C3orf38	Q5JPI3	329 aa		14.69	□□□□□ -0.06
SSR4-208	ENST00000471880	HENMT1	Q5T8I9	393 aa	Known RBP	14.69	□□□□□ -0.06
SSR4-208	ENST00000471880	TMC3	Q7Z5M5	1100 aa		14.69	□□□□□ -0.06
SSR4-208	ENST00000471880	NLRP8	Q86W28	1048 aa		14.69	□□□□□ -0.06
SSR4-208	ENST00000471880	PROSER1	Q86XN7	944 aa		14.69	□□□□□ -0.06
SSR4-208	ENST00000471880	DCBLD1	Q8N8Z6	715 aa		14.69	□□□□□ -0.06
SSR4-208	ENST00000471880	FAM71D	Q8N9W8	422 aa		14.69	□□□□□ -0.06
SSR4-208	ENST00000471880	OR6C4	Q8NGE1	309 aa		14.69	□□□□□ -0.06
SSR4-208	ENST00000471880	TADA1	Q96BN2	335 aa		14.69	□□□□□ -0.06
SSR4-208	ENST00000471880	GFM1	Q96RP9	751 aa	Known RBP	14.69	□□□□□ -0.06
SSR4-208	ENST00000471880	WDR24	Q96S15	920 aa		14.69	□□□□□ -0.06
SSR4-208	ENST00000471880	ZSCAN5A	Q9BUG6	496 aa		14.69	□□□□□ -0.06
SSR4-208	ENST00000471880	OR2AG1	Q9H205	316 aa		14.69	□□□□□ -0.06
SSR4-208	ENST00000471880	WDR70	Q9NW82	654 aa		14.69	□□□□□ -0.06
SSR4-208	ENST00000471880	LRIT1	Q9P2V4	623 aa		14.69	□□□□□ -0.06
SSR4-208	ENST00000471880	RAX	Q9Y2V3	346 aa		14.69	□□□□□ -0.06
SSR4-208	ENST00000471880	OAS3	Q9Y6K5	1087 aa	Known RBP	14.69	□□□□□ -0.06
SSR4-208	ENST00000471880	SRRM3	A6NNA2	597 aa	Predicted RBP	14.68	□□□□□ -0.06
SSR4-208	ENST00000471880	SNX2	O60749	519 aa		14.68	□□□□□ -0.06
SSR4-208	ENST00000471880	MPO	P05164	745 aa		14.68	□□□□□ -0.06
SSR4-208	ENST00000471880	FGF1	P05230	155 aa		14.68	□□□□□ -0.06
SSR4-208	ENST00000471880	ACP5	P13686	325 aa		14.68	□□□□□ -0.06
SSR4-208	ENST00000471880	BPI	P17213	487 aa		14.68	□□□□□ -0.06
SSR4-208	ENST00000471880	ALDH4A1	P30038	563 aa		14.68	□□□□□ -0.06
SSR4-208	ENST00000471880	GABRE	P78334	506 aa		14.68	□□□□□ -0.06
SSR4-208	ENST00000471880	CCL7	P80098	99 aa		14.68	□□□□□ -0.06
SSR4-208	ENST00000471880	OLIG2	Q13516	323 aa		14.68	□□□□□ -0.06
SSR4-208	ENST00000471880	PEX6	Q13608	980 aa		14.68	□□□□□ -0.06
SSR4-208	ENST00000471880	RPS6KA1	Q15418	735 aa		14.68	□□□□□ -0.06
SSR4-208	ENST00000471880	PLA2G4E	Q3MJ16	856 aa		14.68	□□□□□ -0.06
SSR4-208	ENST00000471880	AMZ1	Q400G9	498 aa		14.68	□□□□□ -0.06
SSR4-208	ENST00000471880	CRTC3	Q6UUV7	619 aa		14.68	□□□□□ -0.06
SSR4-208	ENST00000471880	NRROS	Q86YC3	692 aa		14.68	□□□□□ -0.06
SSR4-208	ENST00000471880	PHYKPL	Q8IUZ5	450 aa		14.68	□□□□□ -0.06
SSR4-208	ENST00000471880	CCNJL	Q8IV13	435 aa		14.68	□□□□□ -0.06
SSR4-208	ENST00000471880	LRRC8A	Q8IWT6	810 aa		14.68	□□□□□ -0.06
SSR4-208	ENST00000471880	TRAM1L1	Q8N609	369 aa		14.68	□□□□□ -0.06
SSR4-208	ENST00000471880	GPBAR1	Q8TDU6	330 aa		14.68	□□□□□ -0.06
SSR4-208	ENST00000471880	PATE1	Q8WXA2	126 aa		14.68	□□□□□ -0.06
SSR4-208	ENST00000471880	EID2B	Q96D98	161 aa		14.68	□□□□□ -0.06
SSR4-208	ENST00000471880	HES6	Q96HZ4	224 aa		14.68	□□□□□ -0.06
SSR4-208	ENST00000471880	COX14	Q96I36	57 aa		14.68	□□□□□ -0.06
SSR4-208	ENST00000471880	SPATA13	Q96N96	652 aa		14.68	□□□□□ -0.06
SSR4-208	ENST00000471880	OSGEPL1	Q9H4B0	414 aa		14.68	□□□□□ -0.06
SSR4-208	ENST00000471880	EPB41L5	Q9HCM4	733 aa		14.68	□□□□□ -0.06
SSR4-208	ENST00000471880	HACD3	Q9P035	362 aa		14.68	□□□□□ -0.06
SSR4-208	ENST00000471880	RABGEF1	Q9UJ41	708 aa		14.68	□□□□□ -0.06
SSR4-208	ENST00000471880	KCNK6	Q9Y257	313 aa		14.68	□□□□□ -0.06
SSR4-208	ENST00000471880	R3HDM2	Q9Y2K5	976 aa	Known RBP	14.68	□□□□□ -0.06
SSR4-208	ENST00000471880	AAR2	Q9Y312	384 aa	Known RBP	14.68	□□□□□ -0.06
SSR4-208	ENST00000471880	PKP3	Q9Y446	797 aa		14.68	□□□□□ -0.06
SSR4-208	ENST00000471880	RNF215	Q9Y6U7	377 aa		14.68	□□□□□ -0.06
SSR4-208	ENST00000471880	LOC285095	A0A1B0GVY8	99 aa		14.67	□□□□□ -0.06
SSR4-208	ENST00000471880	TCRBV7S2A1N4T	A0A589	114 aa		14.67	□□□□□ -0.06
SSR4-208	ENST00000471880	GOLGA6L3	A6NEY3	463 aa		14.67	□□□□□ -0.06
SSR4-208	ENST00000471880	STX7	O15400	261 aa	Known RBP	14.67	□□□□□ -0.06
SSR4-208	ENST00000471880	NOBOX	O60393	691 aa		14.67	□□□□□ -0.06
SSR4-208	ENST00000471880	MTX2	O75431	263 aa		14.67	□□□□□ -0.06
SSR4-208	ENST00000471880	ECEL1	O95672	775 aa		14.67	□□□□□ -0.06
SSR4-208	ENST00000471880	EPO	P01588	193 aa		14.67	□□□□□ -0.06

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