RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462363.6

PTPRC-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 926 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-210ENST00000462363 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP5.62□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 GLT6D1Q7Z4J2 308 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP5.62□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 ADIPOR2Q86V24 386 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF354CQ86Y25 554 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 TMEM25Q86YD3 366 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 TMPRSS6Q8IU80 811 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 RNF135Q8IUD6 432 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 PHYKPLQ8IUZ5 450 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 SLC22A9Q8IVM8 553 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 MFN1Q8IWA4 741 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 CMTM8Q8IZV2 173 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 TTC8Q8TAM2 541 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 CD200R1Q8TD46 325 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 ACTRT2Q8TDY3 377 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 PPP4R1Q8TF05 950 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 WDR60Q8WVS4 1066 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 KCNJ9Q92806 393 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 BADQ92934 168 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 MRGPRX3Q96LB0 322 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 TCF25Q9BQ70 676 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 ADGRE3Q9BY15 652 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 CPEB1Q9BZB8 566 aaKnown RBP5.62□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 CEP44Q9C0F1 390 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 POMKQ9H5K3 350 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 MEAF6Q9HAF1 191 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 RNPEPL1Q9HAU8 725 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 CD248Q9HCU0 757 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 TCF7L2Q9NQB0 619 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 ASAH2Q9NR71 780 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 LATS2Q9NRM7 1088 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP5.62□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 NFKBIL1Q9UBC1 381 aaPredicted RBP5.62□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 VPS28Q9UK41 221 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 LSM7Q9UK45 103 aaKnown RBP5.62□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 CRYL1Q9Y2S2 319 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 PCDHB9Q9Y5E1 797 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 COMMD10Q9Y6G5 202 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 ANKRD12Q6UB98 2062 aa5.62□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 A0A0U1RQS6 177 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 A0A1B0GTL3 188 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 C2orf81A6NN90 581 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 B2RBV5 119 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 F8W8V4 182 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 SPECC1L-ADORA2AF8WAN1 911 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 STX16-NPEPL1H3BU86 382 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 STX16O14662 325 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 GRM6O15303 877 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 CCL16O15467 120 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 OR1I1O60431 355 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 REV3LO60673 3130 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 DIAPH2O60879 1101 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 NIPSNAP2O75323 286 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 RFPL2O75678 378 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 CDK14O94921 469 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 ESR1P03372 595 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 RB1P06400 928 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 ENO1P06733 434 aaKnown RBP5.61□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 RHOP08100 348 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 ALPIP09923 528 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 CISD3P0C7P0 127 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 PRR35P0CG20 571 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 COX4I1P13073 169 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 PKMP14618 531 aaKnown RBP5.61□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 EPCAMP16422 314 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 ITGAXP20702 1163 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 SAT1P21673 171 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 LHCGRP22888 699 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 PIK3R1P27986 724 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 EPHA3P29320 983 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 MC4RP32245 332 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 HNF1BP35680 557 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 ABL2P42684 1182 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 PTGER3P43115 390 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 PSMD8P48556 350 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 TTPAP49638 278 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 STK19P49842 368 aaPredicted RBP5.61□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 ATP4BP51164 291 aa5.61□□□□□ -1.51
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PTPRC-210ENST00000462363 ATP6V0D1P61421 351 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 HERVK_113P63132 956 aa5.61□□□□□ -1.51
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PTPRC-210ENST00000462363 CDH18Q13634 790 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 KCNC3Q14003 757 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 DMC1Q14565 340 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 TEAD2Q15562 447 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 PPP1R3AQ16821 1122 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 PTPRNQ16849 979 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 DNAL1Q4LDG9 190 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 CMPK2Q5EBM0 449 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 ACSBG2Q5FVE4 666 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 ARMC12Q5T9G4 340 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 FAM219BQ5XKK7 198 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 KANK2Q63ZY3 851 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 SEL1L3Q68CR1 1132 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 TMEM215Q68D42 235 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRC-210ENST00000462363 C8orf82Q6P1X6 216 aaPredicted RBP5.61□□□□□ -1.51
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