RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460567.5

SUCLG2-202, Transcript of succinate-CoA ligase GDP-forming beta subunit, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SUCLG2, Length 1,596 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUCLG2-202ENST00000460567 PAQR3Q6TCH7 311 aa15.62■□□□□ 0.09
SUCLG2-202ENST00000460567 UGT2A3Q6UWM9 527 aa15.62■□□□□ 0.09
SUCLG2-202ENST00000460567 DHFR2Q86XF0 187 aa15.62■□□□□ 0.09
SUCLG2-202ENST00000460567 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP15.62■□□□□ 0.09
SUCLG2-202ENST00000460567 PACRGLQ8N7B6 248 aa15.62■□□□□ 0.09
SUCLG2-202ENST00000460567 EFCAB3Q8N7B9 438 aa15.62■□□□□ 0.09
SUCLG2-202ENST00000460567 ZNF461Q8TAF7 563 aa15.62■□□□□ 0.09
SUCLG2-202ENST00000460567 HMGCLL1Q8TB92 370 aa15.62■□□□□ 0.09
SUCLG2-202ENST00000460567 ZNF483Q8TF39 744 aaPredicted RBP15.62■□□□□ 0.09
SUCLG2-202ENST00000460567 DDI1Q8WTU0 396 aa15.62■□□□□ 0.09
SUCLG2-202ENST00000460567 GPATCH1Q9BRR8 931 aaKnown RBP15.62■□□□□ 0.09
SUCLG2-202ENST00000460567 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP15.62■□□□□ 0.09
SUCLG2-202ENST00000460567 TRIM54Q9BYV2 358 aa15.62■□□□□ 0.09
SUCLG2-202ENST00000460567 COPS7BQ9H9Q2 264 aaPredicted RBP15.62■□□□□ 0.09
SUCLG2-202ENST00000460567 ARMC1Q9NVT9 282 aa15.62■□□□□ 0.09
SUCLG2-202ENST00000460567 NUDT4Q9NZJ9 180 aa15.62■□□□□ 0.09
SUCLG2-202ENST00000460567 PKP3Q9Y446 797 aa15.62■□□□□ 0.09
SUCLG2-202ENST00000460567 C15orf38-AP3S2A0A0A6YYH1 394 aa15.61■□□□□ 0.09
SUCLG2-202ENST00000460567 TTC24A2A3L6 582 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
SUCLG2-202ENST00000460567 CCL22O00626 93 aa15.61■□□□□ 0.09
SUCLG2-202ENST00000460567 TXNDC9O14530 226 aa15.61■□□□□ 0.09
SUCLG2-202ENST00000460567 ABLIM3O94929 683 aa15.61■□□□□ 0.09
SUCLG2-202ENST00000460567 PRLP01236 227 aa15.61■□□□□ 0.09
SUCLG2-202ENST00000460567 CXCL10P02778 98 aa15.61■□□□□ 0.09
SUCLG2-202ENST00000460567 F11P03951 625 aa15.61■□□□□ 0.09
SUCLG2-202ENST00000460567 INHAP05111 366 aa15.61■□□□□ 0.09
SUCLG2-202ENST00000460567 PABPC4LP0CB38 370 aaKnown RBP15.61■□□□□ 0.09
SUCLG2-202ENST00000460567 EEF1DP29692 281 aaKnown RBP15.61■□□□□ 0.09
SUCLG2-202ENST00000460567 FMO4P31512 558 aa15.61■□□□□ 0.09
SUCLG2-202ENST00000460567 CACNG1Q06432 222 aa15.61■□□□□ 0.09
SUCLG2-202ENST00000460567 INPP5AQ14642 412 aa15.61■□□□□ 0.09
SUCLG2-202ENST00000460567 PTPRNQ16849 979 aa15.61■□□□□ 0.09
SUCLG2-202ENST00000460567 CLEC6AQ6EIG7 209 aa15.61■□□□□ 0.09
SUCLG2-202ENST00000460567 KIAA1841Q6NSI8 718 aa15.61■□□□□ 0.09
SUCLG2-202ENST00000460567 NCEH1Q6PIU2 408 aa15.61■□□□□ 0.09
SUCLG2-202ENST00000460567 PAOXQ6QHF9 649 aa15.61■□□□□ 0.09
SUCLG2-202ENST00000460567 ARPINQ7Z6K5 226 aa15.61■□□□□ 0.09
SUCLG2-202ENST00000460567 GALNT13Q8IUC8 556 aa15.61■□□□□ 0.09
SUCLG2-202ENST00000460567 PCDH20Q8N6Y1 951 aaKnown RBP15.61■□□□□ 0.09
SUCLG2-202ENST00000460567 TMEM102Q8N9M5 508 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
SUCLG2-202ENST00000460567 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
SUCLG2-202ENST00000460567 PRICKLE1Q96MT3 831 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
SUCLG2-202ENST00000460567 ZIC5Q96T25 663 aa15.61■□□□□ 0.09
SUCLG2-202ENST00000460567 MUC3BQ9H195 1237 aa15.61■□□□□ 0.09
SUCLG2-202ENST00000460567 MAGEE1Q9HCI5 957 aa15.61■□□□□ 0.09
SUCLG2-202ENST00000460567 SPO11Q9Y5K1 396 aa15.61■□□□□ 0.09
SUCLG2-202ENST00000460567 TTC3P53804 2025 aa15.61■□□□□ 0.09
SUCLG2-202ENST00000460567 GBF1Q92538 1859 aa15.6■□□□□ 0.09
SUCLG2-202ENST00000460567 LOC107983988A0A1B0GUW6 1196 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
SUCLG2-202ENST00000460567 CAPN8A6NHC0 703 aa15.6■□□□□ 0.09
SUCLG2-202ENST00000460567 KIF3CO14782 793 aa15.6■□□□□ 0.09
SUCLG2-202ENST00000460567 PIP5K1BO14986 540 aa15.6■□□□□ 0.09
SUCLG2-202ENST00000460567 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
SUCLG2-202ENST00000460567 DNAJA2O60884 412 aa15.6■□□□□ 0.09
SUCLG2-202ENST00000460567 ECI2O75521 394 aa15.6■□□□□ 0.09
SUCLG2-202ENST00000460567 PRR35P0CG20 571 aa15.6■□□□□ 0.09
SUCLG2-202ENST00000460567 ZCCHC18P0CG32 403 aa15.6■□□□□ 0.09
SUCLG2-202ENST00000460567 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
SUCLG2-202ENST00000460567 MC4RP32245 332 aa15.6■□□□□ 0.09
SUCLG2-202ENST00000460567 OR1D2P34982 312 aa15.6■□□□□ 0.09
SUCLG2-202ENST00000460567 CREB5Q02930 508 aa15.6■□□□□ 0.09
SUCLG2-202ENST00000460567 PPP1R3AQ16821 1122 aa15.6■□□□□ 0.09
SUCLG2-202ENST00000460567 PDCD4Q53EL6 469 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
SUCLG2-202ENST00000460567 RNF219Q5W0B1 726 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
SUCLG2-202ENST00000460567 SLC30A9Q6PML9 568 aa15.6■□□□□ 0.09
SUCLG2-202ENST00000460567 CYHR1Q6ZMK1 362 aa15.6■□□□□ 0.09
SUCLG2-202ENST00000460567 PHYKPLQ8IUZ5 450 aa15.6■□□□□ 0.09
SUCLG2-202ENST00000460567 DDIASQ8IXT1 998 aa15.6■□□□□ 0.09
SUCLG2-202ENST00000460567 LPCAT1Q8NF37 534 aa15.6■□□□□ 0.09
SUCLG2-202ENST00000460567 MDGA1Q8NFP4 955 aa15.6■□□□□ 0.09
SUCLG2-202ENST00000460567 OR2T34Q8NGX1 318 aa15.6■□□□□ 0.09
SUCLG2-202ENST00000460567 OR2T3Q8NH03 318 aa15.6■□□□□ 0.09
SUCLG2-202ENST00000460567 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
SUCLG2-202ENST00000460567 TUBGCP3Q96CW5 907 aa15.6■□□□□ 0.09
SUCLG2-202ENST00000460567 MYEOVQ96EZ4 313 aa15.6■□□□□ 0.09
SUCLG2-202ENST00000460567 B3GALT6Q96L58 329 aa15.6■□□□□ 0.09
SUCLG2-202ENST00000460567 OSBPL11Q9BXB4 747 aa15.6■□□□□ 0.09
SUCLG2-202ENST00000460567 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
SUCLG2-202ENST00000460567 ZNF696Q9H7X3 374 aa15.6■□□□□ 0.09
SUCLG2-202ENST00000460567 TNFRSF12AQ9NP84 129 aa15.6■□□□□ 0.09
SUCLG2-202ENST00000460567 ZNF510Q9Y2H8 683 aa15.6■□□□□ 0.09
SUCLG2-202ENST00000460567 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
SUCLG2-202ENST00000460567 E5RI56 91 aa15.59■□□□□ 0.09
SUCLG2-202ENST00000460567 CBX4O00257 560 aa15.59■□□□□ 0.09
SUCLG2-202ENST00000460567 S100BP04271 92 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
SUCLG2-202ENST00000460567 FCGR1AP12314 374 aa15.59■□□□□ 0.09
SUCLG2-202ENST00000460567 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP15.59■□□□□ 0.09
SUCLG2-202ENST00000460567 CSNK1DP48730 415 aa15.59■□□□□ 0.09
SUCLG2-202ENST00000460567 PTPN5P54829 565 aa15.59■□□□□ 0.09
SUCLG2-202ENST00000460567 RPS24P62847 133 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
SUCLG2-202ENST00000460567 SMU1Q2TAY7 513 aa15.59■□□□□ 0.09
SUCLG2-202ENST00000460567 AASDHQ4L235 1098 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
SUCLG2-202ENST00000460567 RNF220Q5VTB9 566 aa15.59■□□□□ 0.09
SUCLG2-202ENST00000460567 PRSS55Q6UWB4 352 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
SUCLG2-202ENST00000460567 ADAMTSL2Q86TH1 951 aa15.59■□□□□ 0.09
SUCLG2-202ENST00000460567 GPSM1Q86YR5 675 aa15.59■□□□□ 0.09
SUCLG2-202ENST00000460567 GPR65Q8IYL9 337 aa15.59■□□□□ 0.09
SUCLG2-202ENST00000460567 GALNT15Q8N3T1 639 aa15.59■□□□□ 0.09
SUCLG2-202ENST00000460567 TTC30BQ8N4P2 665 aa15.59■□□□□ 0.09
SUCLG2-202ENST00000460567 TRPC4APQ8TEL6 797 aa15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.3 ms