RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460160.5

HOXB3-202, Transcript of homeobox B3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene HOXB3, Length 1,525 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-202ENST00000460160 H7C0C1 242 aa23.49■■□□□ 1.35
HOXB3-202ENST00000460160 NUDT21O43809 227 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
HOXB3-202ENST00000460160 DNAJC6O75061 913 aa23.49■■□□□ 1.35
HOXB3-202ENST00000460160 RPLP0P05388 317 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
HOXB3-202ENST00000460160 PYGMP11217 842 aa23.49■■□□□ 1.35
HOXB3-202ENST00000460160 PNLIPP16233 465 aa23.49■■□□□ 1.35
HOXB3-202ENST00000460160 RBL1P28749 1068 aa23.49■■□□□ 1.35
HOXB3-202ENST00000460160 ATP5OP48047 213 aa23.49■■□□□ 1.35
HOXB3-202ENST00000460160 LSSP48449 732 aa23.49■■□□□ 1.35
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HOXB3-202ENST00000460160 DCDC1P59894 354 aa23.49■■□□□ 1.35
HOXB3-202ENST00000460160 KIF5AQ12840 1032 aa23.49■■□□□ 1.35
HOXB3-202ENST00000460160 CCDC70Q6NSX1 233 aa23.49■■□□□ 1.35
HOXB3-202ENST00000460160 C19orf48Q6RUI8 117 aa23.49■■□□□ 1.35
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HOXB3-202ENST00000460160 CCNJLQ8IV13 435 aa23.49■■□□□ 1.35
HOXB3-202ENST00000460160 GPR26Q8NDV2 337 aa23.49■■□□□ 1.35
HOXB3-202ENST00000460160 MRGPRX2Q96LB1 330 aa23.49■■□□□ 1.35
HOXB3-202ENST00000460160 GPR63Q9BZJ6 419 aa23.49■■□□□ 1.35
HOXB3-202ENST00000460160 POLR1BQ9H9Y6 1135 aa23.49■■□□□ 1.35
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HOXB3-202ENST00000460160 NFKBIL1Q9UBC1 381 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
HOXB3-202ENST00000460160 TRHDEQ9UKU6 1024 aa23.49■■□□□ 1.35
HOXB3-202ENST00000460160 D6RAR5 112 aa23.49■■□□□ 1.35
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HOXB3-202ENST00000460160 ASMTLO95671 621 aa23.49■■□□□ 1.35
HOXB3-202ENST00000460160 TBC1D25Q3MII6 688 aa23.49■■□□□ 1.35
HOXB3-202ENST00000460160 ALS2CLQ60I27 953 aa23.49■■□□□ 1.35
HOXB3-202ENST00000460160 SPRED1Q7Z699 444 aa23.49■■□□□ 1.35
HOXB3-202ENST00000460160 Q8N9G6 341 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
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HOXB3-202ENST00000460160 LRRN3Q9H3W5 708 aa23.49■■□□□ 1.35
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HOXB3-202ENST00000460160 SATB2Q9UPW6 733 aa23.49■■□□□ 1.35
HOXB3-202ENST00000460160 DXOO77932 396 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
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HOXB3-202ENST00000460160 ACTR1BP42025 376 aa23.48■■□□□ 1.35
HOXB3-202ENST00000460160 ACTR1AP61163 376 aa23.48■■□□□ 1.35
HOXB3-202ENST00000460160 C3orf38Q5JPI3 329 aa23.48■■□□□ 1.35
HOXB3-202ENST00000460160 SIRPB2Q5JXA9 342 aa23.48■■□□□ 1.35
HOXB3-202ENST00000460160 PEX26Q7Z412 305 aa23.48■■□□□ 1.35
HOXB3-202ENST00000460160 B3GNT8Q7Z7M8 397 aa23.48■■□□□ 1.35
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HOXB3-202ENST00000460160 TXLNBQ8N3L3 684 aa23.48■■□□□ 1.35
HOXB3-202ENST00000460160 PATE1Q8WXA2 126 aa23.48■■□□□ 1.35
HOXB3-202ENST00000460160 DCBLD2Q96PD2 775 aa23.48■■□□□ 1.35
HOXB3-202ENST00000460160 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
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HOXB3-202ENST00000460160 RSPH14Q9UHP6 348 aa23.48■■□□□ 1.35
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HOXB3-202ENST00000460160 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa23.47■■□□□ 1.35
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HOXB3-202ENST00000460160 PMS2P1A4D2B8 440 aa23.46■■□□□ 1.35
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HOXB3-202ENST00000460160 FTCDO95954 541 aa23.46■■□□□ 1.35
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HOXB3-202ENST00000460160 PEX6Q13608 980 aa23.46■■□□□ 1.35
HOXB3-202ENST00000460160 COL28A1Q2UY09 1125 aa23.46■■□□□ 1.35
HOXB3-202ENST00000460160 ZNF569Q5MCW4 686 aa23.46■■□□□ 1.35
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HOXB3-202ENST00000460160 LSMEM2Q8N112 164 aa23.46■■□□□ 1.35
HOXB3-202ENST00000460160 ARL14Q8N4G2 192 aa23.46■■□□□ 1.35
HOXB3-202ENST00000460160 SLC25A41Q8N5S1 370 aa23.46■■□□□ 1.35
HOXB3-202ENST00000460160 TRAM1L1Q8N609 369 aa23.46■■□□□ 1.35
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HOXB3-202ENST00000460160 ARFGAP3Q9NP61 516 aa23.46■■□□□ 1.35
HOXB3-202ENST00000460160 ASCL3Q9NQ33 180 aa23.46■■□□□ 1.35
HOXB3-202ENST00000460160 LHX6Q9UPM6 363 aa23.46■■□□□ 1.35
HOXB3-202ENST00000460160 RBP3P10745 1247 aa23.45■■□□□ 1.34
HOXB3-202ENST00000460160 B4GALNT1Q00973 533 aa23.45■■□□□ 1.34
HOXB3-202ENST00000460160 SLC1A5Q15758 541 aa23.45■■□□□ 1.34
HOXB3-202ENST00000460160 IGF2-ASQ6U949 168 aa23.45■■□□□ 1.34
HOXB3-202ENST00000460160 TTC30BQ8N4P2 665 aa23.45■■□□□ 1.34
HOXB3-202ENST00000460160 UBL4BQ8N7F7 174 aa23.45■■□□□ 1.34
HOXB3-202ENST00000460160 PRR11Q96HE9 360 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
HOXB3-202ENST00000460160 ZNF578Q96N58 590 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
HOXB3-202ENST00000460160 FOXP3Q9BZS1 431 aa23.45■■□□□ 1.34
HOXB3-202ENST00000460160 TRABDQ9H4I3 376 aa23.45■■□□□ 1.34
HOXB3-202ENST00000460160 RMI1Q9H9A7 625 aa23.45■■□□□ 1.34
HOXB3-202ENST00000460160 ATXN10Q9UBB4 475 aa23.45■■□□□ 1.34
HOXB3-202ENST00000460160 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa23.45■■□□□ 1.34
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