RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000458961.1

SNORD109B-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 109B, humanhuman

BASIC

Gene SNORD109B, Length 67 nt, Biotype snoRNA, Subcellular localisation Nucleolus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD109B-201ENST00000458961 CDH6P55285 790 aa2.69□□□□□ -1.98
SNORD109B-201ENST00000458961 GFERP55789 205 aa2.69□□□□□ -1.98
SNORD109B-201ENST00000458961 SH3BP2P78314 561 aa2.69□□□□□ -1.98
SNORD109B-201ENST00000458961 MC2RQ01718 297 aa2.69□□□□□ -1.98
SNORD109B-201ENST00000458961 MC1RQ01726 317 aa2.69□□□□□ -1.98
SNORD109B-201ENST00000458961 MYL5Q02045 173 aa2.69□□□□□ -1.98
SNORD109B-201ENST00000458961 DSC2Q02487 901 aa2.69□□□□□ -1.98
SNORD109B-201ENST00000458961 PTSQ03393 145 aa2.69□□□□□ -1.98
SNORD109B-201ENST00000458961 DPTQ07507 201 aa2.69□□□□□ -1.98
SNORD109B-201ENST00000458961 ABHD18Q0P651 414 aa2.69□□□□□ -1.98
SNORD109B-201ENST00000458961 MMRN1Q13201 1228 aa2.69□□□□□ -1.98
SNORD109B-201ENST00000458961 SQSTM1Q13501 440 aa2.69□□□□□ -1.98
SNORD109B-201ENST00000458961 LRP8Q14114 963 aa2.69□□□□□ -1.98
SNORD109B-201ENST00000458961 SEPT6Q14141 434 aa2.69□□□□□ -1.98
SNORD109B-201ENST00000458961 ERV3-1Q14264 604 aa2.69□□□□□ -1.98
SNORD109B-201ENST00000458961 GALNT3Q14435 633 aa2.69□□□□□ -1.98
SNORD109B-201ENST00000458961 KRT81Q14533 505 aa2.69□□□□□ -1.98
SNORD109B-201ENST00000458961 IHHQ14623 411 aa2.69□□□□□ -1.98
SNORD109B-201ENST00000458961 SEPT7Q16181 437 aaKnown RBP2.69□□□□□ -1.98
SNORD109B-201ENST00000458961 DPYSL2Q16555 572 aa2.69□□□□□ -1.98
SNORD109B-201ENST00000458961 PLA2G4EQ3MJ16 856 aa2.69□□□□□ -1.98
SNORD109B-201ENST00000458961 C4orf17Q53FE4 359 aa2.69□□□□□ -1.98
SNORD109B-201ENST00000458961 PYCR3Q53H96 274 aa2.69□□□□□ -1.98
SNORD109B-201ENST00000458961 BOLA3Q53S33 107 aa2.69□□□□□ -1.98
SNORD109B-201ENST00000458961 CHCHD2P9Q5T1J5 151 aaPredicted RBP2.69□□□□□ -1.98
SNORD109B-201ENST00000458961 ALS2CLQ60I27 953 aa2.69□□□□□ -1.98
SNORD109B-201ENST00000458961 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP2.69□□□□□ -1.98
SNORD109B-201ENST00000458961 TXNRD3NBQ6F5E7 133 aa2.69□□□□□ -1.98
SNORD109B-201ENST00000458961 PPP1R2P3Q6NXS1 205 aa2.69□□□□□ -1.98
SNORD109B-201ENST00000458961 IYDQ6PHW0 289 aa2.69□□□□□ -1.98
SNORD109B-201ENST00000458961 WDR74Q6RFH5 385 aaPredicted RBP2.69□□□□□ -1.98
SNORD109B-201ENST00000458961 CRTC3Q6UUV7 619 aa2.69□□□□□ -1.98
SNORD109B-201ENST00000458961 SASS6Q6UVJ0 657 aa2.69□□□□□ -1.98
SNORD109B-201ENST00000458961 FAM92BQ6ZTR7 304 aa2.69□□□□□ -1.98
SNORD109B-201ENST00000458961 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa2.69□□□□□ -1.98
SNORD109B-201ENST00000458961 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP2.69□□□□□ -1.98
SNORD109B-201ENST00000458961 ARHGAP22Q7Z5H3 698 aa2.69□□□□□ -1.98
SNORD109B-201ENST00000458961 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa2.69□□□□□ -1.98
SNORD109B-201ENST00000458961 POLNQ7Z5Q5 900 aa2.69□□□□□ -1.98
SNORD109B-201ENST00000458961 TMEM135Q86UB9 458 aa2.69□□□□□ -1.98
SNORD109B-201ENST00000458961 SLC9B2Q86UD5 537 aa2.69□□□□□ -1.98
SNORD109B-201ENST00000458961 ATCAYQ86WG3 371 aa2.69□□□□□ -1.98
SNORD109B-201ENST00000458961 PHYKPLQ8IUZ5 450 aa2.69□□□□□ -1.98
SNORD109B-201ENST00000458961 PSTKQ8IV42 348 aaKnown RBP2.69□□□□□ -1.98
SNORD109B-201ENST00000458961 RASGRP3Q8IV61 690 aa2.69□□□□□ -1.98
SNORD109B-201ENST00000458961 TRIM48Q8IWZ4 208 aa2.69□□□□□ -1.98
SNORD109B-201ENST00000458961 CBARPQ8N350 705 aaPredicted RBP2.69□□□□□ -1.98
SNORD109B-201ENST00000458961 SFRP1Q8N474 314 aa2.69□□□□□ -1.98
SNORD109B-201ENST00000458961 TTC30BQ8N4P2 665 aa2.69□□□□□ -1.98
SNORD109B-201ENST00000458961 FAM26EQ8N5C1 309 aa2.69□□□□□ -1.98
SNORD109B-201ENST00000458961 TEX26Q8N6G2 289 aa2.69□□□□□ -1.98
SNORD109B-201ENST00000458961 AOPEPQ8N6M6 819 aa2.69□□□□□ -1.98
SNORD109B-201ENST00000458961 TEX19Q8NA77 164 aa2.69□□□□□ -1.98
SNORD109B-201ENST00000458961 GALNT6Q8NCL4 622 aa2.69□□□□□ -1.98
SNORD109B-201ENST00000458961 LPCAT1Q8NF37 534 aa2.69□□□□□ -1.98
SNORD109B-201ENST00000458961 EXD1Q8NHP7 514 aa2.69□□□□□ -1.98
SNORD109B-201ENST00000458961 APOBEC4Q8WW27 367 aaKnown RBP2.69□□□□□ -1.98
SNORD109B-201ENST00000458961 PIH1D2Q8WWB5 315 aa2.69□□□□□ -1.98
SNORD109B-201ENST00000458961 STAMBPL1Q96FJ0 436 aa2.69□□□□□ -1.98
SNORD109B-201ENST00000458961 SCRN2Q96FV2 425 aa2.69□□□□□ -1.98
SNORD109B-201ENST00000458961 SCARF2Q96GP6 870 aaPredicted RBP2.69□□□□□ -1.98
SNORD109B-201ENST00000458961 COX14Q96I36 57 aa2.69□□□□□ -1.98
SNORD109B-201ENST00000458961 TGM7Q96PF1 710 aa2.69□□□□□ -1.98
SNORD109B-201ENST00000458961 CSPG4P5Q96PW8 444 aa2.69□□□□□ -1.98
SNORD109B-201ENST00000458961 TEFMQ96QE5 360 aaKnown RBP2.69□□□□□ -1.98
SNORD109B-201ENST00000458961 OR6C1Q96RD1 312 aa2.69□□□□□ -1.98
SNORD109B-201ENST00000458961 ERGIC2Q96RQ1 377 aa2.69□□□□□ -1.98
SNORD109B-201ENST00000458961 MCCC1Q96RQ3 725 aaPredicted RBP2.69□□□□□ -1.98
SNORD109B-201ENST00000458961 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP2.69□□□□□ -1.98
SNORD109B-201ENST00000458961 HERPUD2Q9BSE4 406 aa2.69□□□□□ -1.98
SNORD109B-201ENST00000458961 SYT11Q9BT88 431 aa2.69□□□□□ -1.98
SNORD109B-201ENST00000458961 EFHD1Q9BUP0 239 aa2.69□□□□□ -1.98
SNORD109B-201ENST00000458961 SPRY4Q9C004 299 aa2.69□□□□□ -1.98
SNORD109B-201ENST00000458961 OR2AG1Q9H205 316 aa2.69□□□□□ -1.98
SNORD109B-201ENST00000458961 OSGEPL1Q9H4B0 414 aa2.69□□□□□ -1.98
SNORD109B-201ENST00000458961 STN1Q9H668 368 aaKnown RBP2.69□□□□□ -1.98
SNORD109B-201ENST00000458961 HAUS4Q9H6D7 363 aa2.69□□□□□ -1.98
SNORD109B-201ENST00000458961 PCDH18Q9HCL0 1135 aa2.69□□□□□ -1.98
SNORD109B-201ENST00000458961 SARS2Q9NP81 518 aaKnown RBP2.69□□□□□ -1.98
SNORD109B-201ENST00000458961 PRDM8Q9NQV8 689 aa2.69□□□□□ -1.98
SNORD109B-201ENST00000458961 FBXO8Q9NRD0 319 aa2.69□□□□□ -1.98
SNORD109B-201ENST00000458961 STAU2Q9NUL3 570 aaKnown RBP eCLIP2.69□□□□□ -1.98
SNORD109B-201ENST00000458961 LMBRD1Q9NUN5 540 aa2.69□□□□□ -1.98
SNORD109B-201ENST00000458961 ANO10Q9NW15 660 aa2.69□□□□□ -1.98
SNORD109B-201ENST00000458961 RBM22Q9NW64 420 aaKnown RBP eCLIP2.69□□□□□ -1.98
SNORD109B-201ENST00000458961 KCTD5Q9NXV2 234 aa2.69□□□□□ -1.98
SNORD109B-201ENST00000458961 CHMP5Q9NZZ3 219 aa2.69□□□□□ -1.98
SNORD109B-201ENST00000458961 PDP2Q9P2J9 529 aa2.69□□□□□ -1.98
SNORD109B-201ENST00000458961 CPNE7Q9UBL6 633 aa2.69□□□□□ -1.98
SNORD109B-201ENST00000458961 TRIM10Q9UDY6 481 aa2.69□□□□□ -1.98
SNORD109B-201ENST00000458961 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa2.69□□□□□ -1.98
SNORD109B-201ENST00000458961 TUBD1Q9UJT1 453 aa2.69□□□□□ -1.98
SNORD109B-201ENST00000458961 ANAPC2Q9UJX6 822 aa2.69□□□□□ -1.98
SNORD109B-201ENST00000458961 CROTQ9UKG9 612 aa2.69□□□□□ -1.98
SNORD109B-201ENST00000458961 CNOT6Q9ULM6 557 aaKnown RBP2.69□□□□□ -1.98
SNORD109B-201ENST00000458961 TP53TG5Q9Y2B4 290 aa2.69□□□□□ -1.98
SNORD109B-201ENST00000458961 MAN2B2Q9Y2E5 1009 aa2.69□□□□□ -1.98
SNORD109B-201ENST00000458961 DNAJC16Q9Y2G8 782 aa2.69□□□□□ -1.98
SNORD109B-201ENST00000458961 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa2.69□□□□□ -1.98
SNORD109B-201ENST00000458961 RPS6KL1Q9Y6S9 549 aa2.69□□□□□ -1.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.1 ms