RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439720.3

RABGEF1-203, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGEF1, Length 3,065 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-203ENST00000439720 AREL1O15033 823 aa8.37□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 FKBP9O95302 570 aa8.37□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 HMGCRP04035 888 aa8.37□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 PBLDP30039 288 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 FMO4P31512 558 aa8.37□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 SFNP31947 248 aa8.37□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 NPTX2P47972 431 aa8.37□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 GP2P55259 537 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 SOX10P56693 466 aa8.37□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 SELPLGQ14242 412 aa8.37□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 SEMA3AQ14563 771 aa8.37□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 MORN1Q5T089 497 aa8.37□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa8.37□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 GLRX5Q86SX6 157 aa8.37□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 FAM35AQ86V20 835 aa8.37□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 RIOX2Q8IUF8 465 aa8.37□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 MAP4K3Q8IVH8 894 aa8.37□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 CDAN1Q8IWY9 1227 aa8.37□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 OR6F1Q8NGZ6 308 aa8.37□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 RHOXF1Q8NHV9 184 aa8.37□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 SLC22A17Q8WUG5 538 aa8.37□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 SDCCAG3Q96C92 435 aa8.37□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 RMDN1Q96DB5 314 aa8.37□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 LRCH3Q96II8 777 aa8.37□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 BTN2A3PQ96KV6 586 aa8.37□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 SNX18Q96RF0 628 aa8.37□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 PEBP4Q96S96 227 aa8.37□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 TTYH2Q9BSA4 534 aa8.37□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 TRIM8Q9BZR9 551 aa8.37□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 LTB4R2Q9NPC1 389 aa8.37□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 LIMD1Q9UGP4 676 aa8.37□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 EVPLLA8MZ36 301 aa8.37□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 PTGES3LE9PB15 166 aa8.37□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 hCG_2039718K7EN88 272 aa8.37□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 SDHDO14521 159 aa8.37□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 ZW10O43264 779 aa8.37□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 RASGRP1O95267 797 aa8.37□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 GUCA1CO95843 209 aa8.37□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 PIGRP01833 764 aa8.37□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 C4BPAP04003 597 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 SAT1P21673 171 aa8.37□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 MGAT1P26572 445 aa8.37□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 GP5P40197 560 aa8.37□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 HADHAP40939 763 aa8.37□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 ETV3P41162 512 aa8.37□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 MAPK9P45984 424 aa8.37□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 JAK3P52333 1124 aa8.37□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 TPD52P55327 224 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 SNX17Q15036 470 aa8.37□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 PTPN20Q4JDL3 420 aa8.37□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 COLEC12Q5KU26 742 aa8.37□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 PLD5Q8N7P1 536 aa8.37□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 CCNYL1Q8N7R7 359 aa8.37□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 CHST13Q8NET6 341 aa8.37□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 ACER1Q8TDN7 264 aa8.37□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 RASSF5Q8WWW0 418 aa8.37□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 GPRASP2Q96D09 838 aa8.37□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 SLC45A3Q96JT2 553 aa8.37□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 DSN1Q9H410 356 aa8.37□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 NEUROD4Q9HD90 331 aa8.37□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 GPATCH2LQ9NWQ4 482 aa8.37□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 ZNF69Q9UC07 566 aa8.37□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 SRRDQ9UH36 339 aa8.37□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 SARDHQ9UL12 918 aa8.37□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 STYXL1Q9Y6J8 313 aa8.37□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 INPP4BO15327 924 aa8.36□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 NDUFS2O75306 463 aa8.36□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 CNMDO75829 334 aa8.36□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 TRUB2O95900 331 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 MT-CO1P00395 513 aa8.36□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 CD4P01730 458 aa8.36□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 ICAM3P32942 547 aa8.36□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 CYP2C18P33260 490 aa8.36□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 BCAR1P56945 870 aa8.36□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 NCS1P62166 190 aa8.36□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 C19orf57Q0VDD7 668 aa8.36□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 NAB1Q13506 487 aa8.36□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 TFDP2Q14188 446 aa8.36□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 CYP51A1Q16850 503 aa8.36□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 AGAP6Q5VW22 663 aa8.36□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 MOB2Q70IA6 237 aa8.36□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 SLC51BQ86UW2 128 aa8.36□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 CDR2LQ86X02 465 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 LACC1Q8IV20 430 aa8.36□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 ADGRG5Q8IZF4 528 aa8.36□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 LSMEM2Q8N112 164 aa8.36□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 PIK3C3Q8NEB9 887 aa8.36□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 OR13J1Q8NGT2 312 aa8.36□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 OR5H6Q8NGV6 325 aa8.36□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 TRIM63Q969Q1 353 aa8.36□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 MUL1Q969V5 352 aa8.36□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 AGAP4Q96P64 663 aa8.36□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 KCTD14Q9BQ13 255 aaPredicted RBP8.36□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 CEP41Q9BYV8 373 aa8.36□□□□□ -1.07
RABGEF1-203ENST00000439720 TASP1Q9H6P5 420 aa8.36□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.6 ms