RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429017.2

HOXD8-202, Transcript of homeobox D8, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXD8, Length 1,608 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD8-202ENST00000429017 FGF1P05230 155 aa6.55□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 FGF3P11487 239 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 DRD2P14416 443 aa6.55□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 PNLIPP16233 465 aa6.55□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 XPAP23025 273 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 SOX5P35711 763 aa6.55□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 PAPOLAP51003 745 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 SUOXP51687 545 aa6.55□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 POLR2FP61218 127 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
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HOXD8-202ENST00000429017 CLEC16AQ2KHT3 1053 aa6.55□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 PARP15Q460N3 678 aa6.55□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 TCP11X2Q5H9J9 407 aa6.55□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 PHF19Q5T6S3 580 aa6.55□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 SCYL2Q6P3W7 929 aa6.55□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 ATG14Q6ZNE5 492 aa6.55□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 MON1BQ7L1V2 547 aa6.55□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 VN1R5Q7Z5H4 357 aa6.55□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 SRLQ86TD4 932 aa6.55□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 PHF13Q86YI8 300 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 FAM114A1Q8IWE2 563 aa6.55□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 ARHGAP12Q8IWW6 846 aa6.55□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 ARFGAP1Q8N6T3 406 aa6.55□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 RCBTB1Q8NDN9 531 aa6.55□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 OR6C4Q8NGE1 309 aa6.55□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 PATE1Q8WXA2 126 aa6.55□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 ZNF641Q96N77 438 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 SEMA3CQ99985 751 aa6.55□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 NCAPGQ9BPX3 1015 aa6.55□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 VPS16Q9H269 839 aa6.55□□□□□ -1.36
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HOXD8-202ENST00000429017 CYP4F12Q9HCS2 524 aa6.55□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 ADAM22Q9P0K1 906 aa6.55□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 SIK3Q9Y2K2 1263 aa6.55□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 ZFC3H1O60293 1989 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 NAV2Q8IVL1 2488 aa6.55□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa6.55□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 117 aa6.54□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 A0A0U1RQS6 177 aa6.54□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 A0A1W2PQC6 194 aa6.54□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 PRSS38A1L453 326 aa6.54□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 CFAP69A5D8W1 941 aa6.54□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa6.54□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 IQCJ-SCHIP1C9J366 451 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
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HOXD8-202ENST00000429017 NUDT21O43809 227 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 CEACAM5P06731 702 aa6.54□□□□□ -1.36
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HOXD8-202ENST00000429017 AK4P27144 223 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 CD1CP29017 333 aa6.54□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 CSNK1DP48730 415 aa6.54□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
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HOXD8-202ENST00000429017 BRAT1Q6PJG6 821 aa6.54□□□□□ -1.36
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HOXD8-202ENST00000429017 DPPA4Q7L190 304 aa6.54□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 ZNF438Q7Z4V0 828 aa6.54□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 PTRH1Q86Y79 214 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
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HOXD8-202ENST00000429017 C3orf20Q8ND61 904 aa6.54□□□□□ -1.36
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HOXD8-202ENST00000429017 NKD1Q969G9 470 aa6.54□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 CCDC74BQ96LY2 380 aa6.54□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 COQ10AQ96MF6 247 aa6.54□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 MCEEQ96PE7 176 aa6.54□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa6.54□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 PEBP4Q96S96 227 aa6.54□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 CMKLR1Q99788 373 aa6.54□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 SELENOOQ9BVL4 669 aa6.54□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 SUDS3Q9H7L9 328 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
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HOXD8-202ENST00000429017 PLEKHM1Q9Y4G2 1056 aa6.54□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 PPM1DO15297 605 aa6.54□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 TEX33O43247 280 aa6.54□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 ECEL1O95672 775 aa6.54□□□□□ -1.36
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HOXD8-202ENST00000429017 CCNB1P14635 433 aa6.54□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 MPSTP25325 297 aa6.54□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 CSF2RBP32927 897 aa6.54□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 NSFP46459 744 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 POLD2P49005 469 aa6.54□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 TLE1Q04724 770 aa6.54□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 ARHGEF7Q14155 803 aa6.54□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 KRT31Q15323 416 aa6.54□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 CNGA3Q16281 694 aa6.54□□□□□ -1.36
HOXD8-202ENST00000429017 SKIDA1Q1XH10 827 aa6.54□□□□□ -1.36
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