RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428101.6

LMO1-202, Transcript of LIM domain only 1, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LMO1, Length 1,038 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO1-202ENST00000428101 LRP8Q14114 963 aa27.02■■□□□ 1.92
LMO1-202ENST00000428101 C16orf72Q14CZ0 275 aa27.02■■□□□ 1.92
LMO1-202ENST00000428101 CLPPQ16740 277 aaPredicted RBP27.02■■□□□ 1.92
LMO1-202ENST00000428101 INO80CQ6PI98 192 aaPredicted RBP27.02■■□□□ 1.92
LMO1-202ENST00000428101 MFSD7Q6UXD7 560 aa27.02■■□□□ 1.92
LMO1-202ENST00000428101 NT5DC3Q86UY8 548 aa27.02■■□□□ 1.92
LMO1-202ENST00000428101 CCHCR1Q8TD31 782 aa27.02■■□□□ 1.92
LMO1-202ENST00000428101 TADA1Q96BN2 335 aa27.02■■□□□ 1.92
LMO1-202ENST00000428101 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP27.02■■□□□ 1.92
LMO1-202ENST00000428101 PKD2L2Q9NZM6 624 aa27.02■■□□□ 1.92
LMO1-202ENST00000428101 VPS18Q9P253 973 aa27.02■■□□□ 1.92
LMO1-202ENST00000428101 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa27.02■■□□□ 1.92
LMO1-202ENST00000428101 PRKAB1Q9Y478 270 aa27.02■■□□□ 1.92
LMO1-202ENST00000428101 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP27.01■■□□□ 1.91
LMO1-202ENST00000428101 EML2O95834 649 aa27.01■■□□□ 1.91
LMO1-202ENST00000428101 TNNT1P13805 278 aa27.01■■□□□ 1.91
LMO1-202ENST00000428101 DYNLT1P63172 113 aa27.01■■□□□ 1.91
LMO1-202ENST00000428101 RHDQ02161 417 aa27.01■■□□□ 1.91
LMO1-202ENST00000428101 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa27.01■■□□□ 1.91
LMO1-202ENST00000428101 KDELC2Q7Z4H8 507 aa27.01■■□□□ 1.91
LMO1-202ENST00000428101 BRD8Q9H0E9 1235 aa27.01■■□□□ 1.91
LMO1-202ENST00000428101 SLC25A51Q9H1U9 297 aa27.01■■□□□ 1.91
LMO1-202ENST00000428101 EIF2AK3Q9NZJ5 1116 aaKnown RBP27.01■■□□□ 1.91
LMO1-202ENST00000428101 SEPT10Q9P0V9 454 aa27.01■■□□□ 1.91
LMO1-202ENST00000428101 ZW10O43264 779 aa27■■□□□ 1.91
LMO1-202ENST00000428101 EFSO43281 561 aa27■■□□□ 1.91
LMO1-202ENST00000428101 CDKN2BP42772 138 aa27■■□□□ 1.91
LMO1-202ENST00000428101 NOP2P46087 812 aaKnown RBP27■■□□□ 1.91
LMO1-202ENST00000428101 CFHR1Q03591 330 aa27■■□□□ 1.91
LMO1-202ENST00000428101 BIRC2Q13490 618 aa27■■□□□ 1.91
LMO1-202ENST00000428101 TGIF1Q15583 401 aa27■■□□□ 1.91
LMO1-202ENST00000428101 TAZQ16635 292 aa27■■□□□ 1.91
LMO1-202ENST00000428101 NKAIN2Q5VXU1 208 aa27■■□□□ 1.91
LMO1-202ENST00000428101 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa27■■□□□ 1.91
LMO1-202ENST00000428101 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa26.99■■□□□ 1.91
LMO1-202ENST00000428101 IGHV1OR21-1A0A087WYE8 117 aa26.99■■□□□ 1.91
LMO1-202ENST00000428101 PRAMEF33A0A0G2JMD5 474 aa26.99■■□□□ 1.91
LMO1-202ENST00000428101 IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 117 aa26.99■■□□□ 1.91
LMO1-202ENST00000428101 PRAMEF10O60809 474 aa26.99■■□□□ 1.91
LMO1-202ENST00000428101 SQSTM1Q13501 440 aa26.99■■□□□ 1.91
LMO1-202ENST00000428101 CCDC81Q6ZN84 652 aa26.99■■□□□ 1.91
LMO1-202ENST00000428101 SLC37A2Q8TED4 501 aa26.99■■□□□ 1.91
LMO1-202ENST00000428101 TTC9Q92623 222 aa26.99■■□□□ 1.91
LMO1-202ENST00000428101 USP7Q93009 1102 aa26.99■■□□□ 1.91
LMO1-202ENST00000428101 CCNL2Q96S94 520 aaPredicted RBP26.99■■□□□ 1.91
LMO1-202ENST00000428101 MAGEE1Q9HCI5 957 aa26.99■■□□□ 1.91
LMO1-202ENST00000428101 FOXJ2Q9P0K8 574 aa26.99■■□□□ 1.91
LMO1-202ENST00000428101 SAE1Q9UBE0 346 aaPredicted RBP26.99■■□□□ 1.91
LMO1-202ENST00000428101 SHOC2Q9UQ13 582 aa26.99■■□□□ 1.91
LMO1-202ENST00000428101 C9orf172C9J069 976 aa26.98■■□□□ 1.91
LMO1-202ENST00000428101 SPOPO43791 374 aa26.98■■□□□ 1.91
LMO1-202ENST00000428101 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP26.98■■□□□ 1.91
LMO1-202ENST00000428101 PIRTP0C851 137 aa26.98■■□□□ 1.91
LMO1-202ENST00000428101 CSF2RBP32927 897 aa26.98■■□□□ 1.91
LMO1-202ENST00000428101 FASLGP48023 281 aa26.98■■□□□ 1.91
LMO1-202ENST00000428101 MAPK10P53779 464 aa26.98■■□□□ 1.91
LMO1-202ENST00000428101 C19orf57Q0VDD7 668 aa26.98■■□□□ 1.91
LMO1-202ENST00000428101 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP26.98■■□□□ 1.91
LMO1-202ENST00000428101 PCSK7Q16549 785 aa26.98■■□□□ 1.91
LMO1-202ENST00000428101 TEX44Q53QW1 395 aa26.98■■□□□ 1.91
LMO1-202ENST00000428101 ODF2Q5BJF6 829 aa26.98■■□□□ 1.91
LMO1-202ENST00000428101 CHST15Q7LFX5 561 aaPredicted RBP26.98■■□□□ 1.91
LMO1-202ENST00000428101 TMC3Q7Z5M5 1100 aa26.98■■□□□ 1.91
LMO1-202ENST00000428101 SFRP1Q8N474 314 aa26.98■■□□□ 1.91
LMO1-202ENST00000428101 TC2NQ8N9U0 490 aa26.98■■□□□ 1.91
LMO1-202ENST00000428101 RCBTB1Q8NDN9 531 aa26.98■■□□□ 1.91
LMO1-202ENST00000428101 SPATA22Q8NHS9 363 aa26.98■■□□□ 1.91
LMO1-202ENST00000428101 WBP1Q96G27 269 aa26.98■■□□□ 1.91
LMO1-202ENST00000428101 CCDC74BQ96LY2 380 aa26.98■■□□□ 1.91
LMO1-202ENST00000428101 RMI1Q9H9A7 625 aa26.98■■□□□ 1.91
LMO1-202ENST00000428101 GLOD4Q9HC38 313 aa26.98■■□□□ 1.91
LMO1-202ENST00000428101 CCL4P13236 92 aa26.97■■□□□ 1.91
LMO1-202ENST00000428101 PTPN3P26045 913 aa26.97■■□□□ 1.91
LMO1-202ENST00000428101 LIMK2P53671 638 aa26.97■■□□□ 1.91
LMO1-202ENST00000428101 HADHBP55084 474 aaKnown RBP26.97■■□□□ 1.91
LMO1-202ENST00000428101 CDK18Q07002 472 aa26.97■■□□□ 1.91
LMO1-202ENST00000428101 LLGL1Q15334 1064 aa26.97■■□□□ 1.91
LMO1-202ENST00000428101 SLC14A2Q15849 920 aa26.97■■□□□ 1.91
LMO1-202ENST00000428101 GPR26Q8NDV2 337 aa26.97■■□□□ 1.91
LMO1-202ENST00000428101 OR4D9Q8NGE8 314 aa26.97■■□□□ 1.91
LMO1-202ENST00000428101 KCNK4Q9NYG8 393 aa26.97■■□□□ 1.91
LMO1-202ENST00000428101 TBC1D29Q9UFV1 150 aa26.97■■□□□ 1.91
LMO1-202ENST00000428101 ALG6Q9Y672 507 aa26.97■■□□□ 1.91
LMO1-202ENST00000428101 HGSO14964 777 aaPredicted RBP26.96■■□□□ 1.91
LMO1-202ENST00000428101 NUAK1O60285 661 aa26.96■■□□□ 1.91
LMO1-202ENST00000428101 LIPCP11150 499 aa26.96■■□□□ 1.91
LMO1-202ENST00000428101 PECAM1P16284 738 aaPredicted RBP26.96■■□□□ 1.91
LMO1-202ENST00000428101 MAGEA1P43355 309 aa26.96■■□□□ 1.91
LMO1-202ENST00000428101 NR2C2P49116 596 aa26.96■■□□□ 1.91
LMO1-202ENST00000428101 ADCY2Q08462 1091 aa26.96■■□□□ 1.91
LMO1-202ENST00000428101 SRSF6Q13247 344 aaKnown RBP26.96■■□□□ 1.91
LMO1-202ENST00000428101 TAF1BQ53T94 588 aaPredicted RBP26.96■■□□□ 1.91
LMO1-202ENST00000428101 CHCHD2P9Q5T1J5 151 aaPredicted RBP26.96■■□□□ 1.91
LMO1-202ENST00000428101 KIAA1614Q5VZ46 1190 aa26.96■■□□□ 1.91
LMO1-202ENST00000428101 SARM1Q6SZW1 724 aa26.96■■□□□ 1.91
LMO1-202ENST00000428101 ZNF761Q86XN6 746 aaPredicted RBP26.96■■□□□ 1.91
LMO1-202ENST00000428101 ZNF843Q8N446 348 aa26.96■■□□□ 1.91
LMO1-202ENST00000428101 TEKT5Q96M29 485 aa26.96■■□□□ 1.91
LMO1-202ENST00000428101 SPATA16Q9BXB7 569 aa26.96■■□□□ 1.91
LMO1-202ENST00000428101 GOLPH3Q9H4A6 298 aa26.96■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.9 ms