RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426683.5

HERC3-205, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 4

Gene HERC3, Length 559 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-205ENST00000426683 ARL5AQ9Y689 179 aa17.89■□□□□ 0.45
HERC3-205ENST00000426683 C2orf81A6NN90 581 aa17.88■□□□□ 0.45
HERC3-205ENST00000426683 STX7O15400 261 aaKnown RBP17.88■□□□□ 0.45
HERC3-205ENST00000426683 AP2A1O95782 977 aa17.88■□□□□ 0.45
HERC3-205ENST00000426683 CDK4P11802 303 aa17.88■□□□□ 0.45
HERC3-205ENST00000426683 FDFT1P37268 417 aa17.88■□□□□ 0.45
HERC3-205ENST00000426683 ADCY8P40145 1251 aa17.88■□□□□ 0.45
HERC3-205ENST00000426683 RPIAP49247 311 aa17.88■□□□□ 0.45
HERC3-205ENST00000426683 PTPRCAPQ14761 206 aa17.88■□□□□ 0.45
HERC3-205ENST00000426683 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP17.88■□□□□ 0.45
HERC3-205ENST00000426683 ZDHHC20Q5W0Z9 365 aa17.88■□□□□ 0.45
HERC3-205ENST00000426683 SLC35F3Q8IY50 421 aa17.88■□□□□ 0.45
HERC3-205ENST00000426683 ARL10Q8N8L6 244 aa17.88■□□□□ 0.45
HERC3-205ENST00000426683 GLIS1Q8NBF1 620 aa17.88■□□□□ 0.45
HERC3-205ENST00000426683 BRSK1Q8TDC3 778 aa17.88■□□□□ 0.45
HERC3-205ENST00000426683 GLYATL1Q969I3 302 aa17.88■□□□□ 0.45
HERC3-205ENST00000426683 MS4A14Q96JA4 679 aa17.88■□□□□ 0.45
HERC3-205ENST00000426683 OR2M4Q96R27 311 aa17.88■□□□□ 0.45
HERC3-205ENST00000426683 GSDMCQ9BYG8 508 aa17.88■□□□□ 0.45
HERC3-205ENST00000426683 ARFGAP3Q9NP61 516 aa17.88■□□□□ 0.45
HERC3-205ENST00000426683 IL26Q9NPH9 171 aa17.88■□□□□ 0.45
HERC3-205ENST00000426683 HOMER3Q9NSC5 361 aa17.88■□□□□ 0.45
HERC3-205ENST00000426683 VPS18Q9P253 973 aa17.88■□□□□ 0.45
HERC3-205ENST00000426683 GULP1Q9UBP9 304 aa17.88■□□□□ 0.45
HERC3-205ENST00000426683 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP17.88■□□□□ 0.45
HERC3-205ENST00000426683 LRP4O75096 1905 aa17.88■□□□□ 0.45
HERC3-205ENST00000426683 NCOR2Q9Y618 2525 aa17.87■□□□□ 0.45
HERC3-205ENST00000426683 CPED1A4D0V7 1026 aa17.87■□□□□ 0.45
HERC3-205ENST00000426683 SLC25A14O95258 325 aaPredicted RBP17.87■□□□□ 0.45
HERC3-205ENST00000426683 CRTAMO95727 393 aa17.87■□□□□ 0.45
HERC3-205ENST00000426683 ZSCAN5DPP0CG00 497 aa17.87■□□□□ 0.45
HERC3-205ENST00000426683 LPOP22079 712 aaPredicted RBP17.87■□□□□ 0.45
HERC3-205ENST00000426683 KCNJ1P48048 391 aa17.87■□□□□ 0.45
HERC3-205ENST00000426683 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP17.87■□□□□ 0.45
HERC3-205ENST00000426683 MSLNQ13421 630 aaPredicted RBP17.87■□□□□ 0.45
HERC3-205ENST00000426683 PYCR3Q53H96 274 aa17.87■□□□□ 0.45
HERC3-205ENST00000426683 ZNF648Q5T619 568 aaPredicted RBP17.87■□□□□ 0.45
HERC3-205ENST00000426683 GUSBP11Q6P575 273 aa17.87■□□□□ 0.45
HERC3-205ENST00000426683 FAM151BQ6UXP7 276 aa17.87■□□□□ 0.45
HERC3-205ENST00000426683 GSTA5Q7RTV2 222 aa17.87■□□□□ 0.45
HERC3-205ENST00000426683 GALNT13Q8IUC8 556 aa17.87■□□□□ 0.45
HERC3-205ENST00000426683 PHYKPLQ8IUZ5 450 aa17.87■□□□□ 0.45
HERC3-205ENST00000426683 PRELID2Q8N945 189 aa17.87■□□□□ 0.45
HERC3-205ENST00000426683 KYQ8NBH2 561 aa17.87■□□□□ 0.45
HERC3-205ENST00000426683 FAM46DQ8NEK8 389 aa17.87■□□□□ 0.45
HERC3-205ENST00000426683 IFI44Q8TCB0 444 aa17.87■□□□□ 0.45
HERC3-205ENST00000426683 GPBAR1Q8TDU6 330 aa17.87■□□□□ 0.45
HERC3-205ENST00000426683 OSBPL9Q96SU4 736 aa17.87■□□□□ 0.45
HERC3-205ENST00000426683 RAB6BQ9NRW1 208 aa17.87■□□□□ 0.45
HERC3-205ENST00000426683 IGF2BP1Q9NZI8 577 aaKnown RBP eCLIP17.87■□□□□ 0.45
HERC3-205ENST00000426683 PAK5Q9P286 719 aa17.87■□□□□ 0.45
HERC3-205ENST00000426683 PLEKHM1Q9Y4G2 1056 aa17.87■□□□□ 0.45
HERC3-205ENST00000426683 NEUROG3Q9Y4Z2 214 aa17.87■□□□□ 0.45
HERC3-205ENST00000426683 KCTD3Q9Y597 815 aa17.87■□□□□ 0.45
HERC3-205ENST00000426683 ARID1BQ8NFD5 2236 aaPredicted RBP17.86■□□□□ 0.45
HERC3-205ENST00000426683 GLYATL1P3A0A0U1RQE8 302 aa17.86■□□□□ 0.45
HERC3-205ENST00000426683 EME2A4GXA9 379 aaPredicted RBP17.86■□□□□ 0.45
HERC3-205ENST00000426683 E7EVH7 732 aa17.86■□□□□ 0.45
HERC3-205ENST00000426683 DNAJC6O75061 913 aa17.86■□□□□ 0.45
HERC3-205ENST00000426683 PPFIA2O75334 1257 aa17.86■□□□□ 0.45
HERC3-205ENST00000426683 TPH1P17752 444 aa17.86■□□□□ 0.45
HERC3-205ENST00000426683 AK4P27144 223 aaPredicted RBP17.86■□□□□ 0.45
HERC3-205ENST00000426683 RPL22P35268 128 aaKnown RBP17.86■□□□□ 0.45
HERC3-205ENST00000426683 LMAN1P49257 510 aa17.86■□□□□ 0.45
HERC3-205ENST00000426683 CTBSQ01459 385 aa17.86■□□□□ 0.45
HERC3-205ENST00000426683 SMAD1Q15797 465 aaKnown RBP17.86■□□□□ 0.45
HERC3-205ENST00000426683 CHRNA6Q15825 494 aa17.86■□□□□ 0.45
HERC3-205ENST00000426683 ATP13A5Q4VNC0 1218 aa17.86■□□□□ 0.45
HERC3-205ENST00000426683 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa17.86■□□□□ 0.45
HERC3-205ENST00000426683 EFL1Q7Z2Z2 1120 aaKnown RBP17.86■□□□□ 0.45
HERC3-205ENST00000426683 NRROSQ86YC3 692 aa17.86■□□□□ 0.45
HERC3-205ENST00000426683 DTX3LQ8TDB6 740 aa17.86■□□□□ 0.45
HERC3-205ENST00000426683 COG1Q8WTW3 980 aa17.86■□□□□ 0.45
HERC3-205ENST00000426683 VPS35Q96QK1 796 aa17.86■□□□□ 0.45
HERC3-205ENST00000426683 OR2AG1Q9H205 316 aa17.86■□□□□ 0.45
HERC3-205ENST00000426683 DPEP2Q9H4A9 486 aa17.86■□□□□ 0.45
HERC3-205ENST00000426683 RMI1Q9H9A7 625 aa17.86■□□□□ 0.45
HERC3-205ENST00000426683 TRIM39Q9HCM9 518 aa17.86■□□□□ 0.45
HERC3-205ENST00000426683 PIH1D1Q9NWS0 290 aaKnown RBP17.86■□□□□ 0.45
HERC3-205ENST00000426683 ATXN10Q9UBB4 475 aa17.86■□□□□ 0.45
HERC3-205ENST00000426683 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa17.86■□□□□ 0.45
HERC3-205ENST00000426683 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP17.86■□□□□ 0.45
HERC3-205ENST00000426683 PADI4Q9UM07 663 aa17.86■□□□□ 0.45
HERC3-205ENST00000426683 SNX12Q9UMY4 172 aa17.86■□□□□ 0.45
HERC3-205ENST00000426683 PRKAB1Q9Y478 270 aa17.86■□□□□ 0.45
HERC3-205ENST00000426683 PCYT1BQ9Y5K3 369 aaPredicted RBP17.86■□□□□ 0.45
HERC3-205ENST00000426683 ERI2A8K979 691 aaKnown RBP17.85■□□□□ 0.45
HERC3-205ENST00000426683 B4DGG1 531 aa17.85■□□□□ 0.45
HERC3-205ENST00000426683 GP1BAP07359 652 aa17.85■□□□□ 0.45
HERC3-205ENST00000426683 ZNF8P17098 575 aaPredicted RBP17.85■□□□□ 0.45
HERC3-205ENST00000426683 CLDN6P56747 220 aa17.85■□□□□ 0.45
HERC3-205ENST00000426683 GNG11P61952 73 aa17.85■□□□□ 0.45
HERC3-205ENST00000426683 PDE1BQ01064 536 aa17.85■□□□□ 0.45
HERC3-205ENST00000426683 E2F1Q01094 437 aa17.85■□□□□ 0.45
HERC3-205ENST00000426683 SEMA5AQ13591 1074 aa17.85■□□□□ 0.45
HERC3-205ENST00000426683 SLC30A9Q6PML9 568 aa17.85■□□□□ 0.45
HERC3-205ENST00000426683 ADGRG6Q86SQ4 1221 aa17.85■□□□□ 0.45
HERC3-205ENST00000426683 LINC00523Q86TU6 105 aa17.85■□□□□ 0.45
HERC3-205ENST00000426683 GALNT15Q8N3T1 639 aa17.85■□□□□ 0.45
HERC3-205ENST00000426683 OR4K2Q8NGD2 314 aa17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.2 ms