RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000411094.1

RN7SKP247-201, Transcript of RNA, 7SK small nuclear pseudogene 247, humanhuman

BASIC

Gene RN7SKP247, Length 308 nt, Biotype misc RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RN7SKP247-201ENST00000411094 ABCB4P21439 1286 aa4.89□□□□□ -1.63
RN7SKP247-201ENST00000411094 WARSP23381 471 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
RN7SKP247-201ENST00000411094 CHRNA5P30532 468 aa4.89□□□□□ -1.63
RN7SKP247-201ENST00000411094 SLC5A2P31639 672 aa4.89□□□□□ -1.63
RN7SKP247-201ENST00000411094 IL13P35225 146 aa4.89□□□□□ -1.63
RN7SKP247-201ENST00000411094 THPOP40225 353 aa4.89□□□□□ -1.63
RN7SKP247-201ENST00000411094 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
RN7SKP247-201ENST00000411094 EIF2S3P41091 472 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
RN7SKP247-201ENST00000411094 LIG4P49917 911 aa4.89□□□□□ -1.63
RN7SKP247-201ENST00000411094 P2RY4P51582 365 aa4.89□□□□□ -1.63
RN7SKP247-201ENST00000411094 CAPZA1P52907 286 aa4.89□□□□□ -1.63
RN7SKP247-201ENST00000411094 SKP1P63208 163 aa4.89□□□□□ -1.63
RN7SKP247-201ENST00000411094 ALDH6A1Q02252 535 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
RN7SKP247-201ENST00000411094 GHRHRQ02643 423 aa4.89□□□□□ -1.63
RN7SKP247-201ENST00000411094 ABRQ12979 859 aa4.89□□□□□ -1.63
RN7SKP247-201ENST00000411094 BAMBIQ13145 260 aa4.89□□□□□ -1.63
RN7SKP247-201ENST00000411094 SNTA1Q13424 505 aa4.89□□□□□ -1.63
RN7SKP247-201ENST00000411094 TGFBIQ15582 683 aa4.89□□□□□ -1.63
RN7SKP247-201ENST00000411094 TXNRD1Q16881 649 aa4.89□□□□□ -1.63
RN7SKP247-201ENST00000411094 CCDC142Q17RM4 750 aa4.89□□□□□ -1.63
RN7SKP247-201ENST00000411094 TIGD6Q17RP2 521 aa4.89□□□□□ -1.63
RN7SKP247-201ENST00000411094 EDRF1Q3B7T1 1238 aa4.89□□□□□ -1.63
RN7SKP247-201ENST00000411094 GTDC1Q4AE62 458 aa4.89□□□□□ -1.63
RN7SKP247-201ENST00000411094 EPC2Q52LR7 807 aa4.89□□□□□ -1.63
RN7SKP247-201ENST00000411094 KLHL12Q53G59 568 aa4.89□□□□□ -1.63
RN7SKP247-201ENST00000411094 TNFAIP8L3Q5GJ75 292 aa4.89□□□□□ -1.63
RN7SKP247-201ENST00000411094 RIPPLY2Q5TAB7 128 aa4.89□□□□□ -1.63
RN7SKP247-201ENST00000411094 KRT79Q5XKE5 535 aa4.89□□□□□ -1.63
RN7SKP247-201ENST00000411094 PLA2G4FQ68DD2 849 aa4.89□□□□□ -1.63
RN7SKP247-201ENST00000411094 HMBOX1Q6NT76 420 aa4.89□□□□□ -1.63
RN7SKP247-201ENST00000411094 TAF2Q6P1X5 1199 aa4.89□□□□□ -1.63
RN7SKP247-201ENST00000411094 METAP1DQ6UB28 335 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
RN7SKP247-201ENST00000411094 C5orf46Q6UWT4 87 aa4.89□□□□□ -1.63
RN7SKP247-201ENST00000411094 MIGA2Q7L4E1 593 aa4.89□□□□□ -1.63
RN7SKP247-201ENST00000411094 COPS6Q7L5N1 327 aa4.89□□□□□ -1.63
RN7SKP247-201ENST00000411094 LHFPL3Q86UP9 236 aa4.89□□□□□ -1.63
RN7SKP247-201ENST00000411094 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
RN7SKP247-201ENST00000411094 NLRX1Q86UT6 975 aa4.89□□□□□ -1.63
RN7SKP247-201ENST00000411094 HPS6Q86YV9 775 aa4.89□□□□□ -1.63
RN7SKP247-201ENST00000411094 HIPK1Q86Z02 1210 aa4.89□□□□□ -1.63
RN7SKP247-201ENST00000411094 NUDCD3Q8IVD9 361 aa4.89□□□□□ -1.63
RN7SKP247-201ENST00000411094 ARID3BQ8IVW6 561 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
RN7SKP247-201ENST00000411094 GPR65Q8IYL9 337 aa4.89□□□□□ -1.63
RN7SKP247-201ENST00000411094 ADGRF2Q8IZF7 708 aa4.89□□□□□ -1.63
RN7SKP247-201ENST00000411094 NAGSQ8N159 534 aa4.89□□□□□ -1.63
RN7SKP247-201ENST00000411094 PDIK1LQ8N165 341 aa4.89□□□□□ -1.63
RN7SKP247-201ENST00000411094 CYP4Z2PQ8N1L4 340 aa4.89□□□□□ -1.63
RN7SKP247-201ENST00000411094 Q8N1Y9 231 aa4.89□□□□□ -1.63
RN7SKP247-201ENST00000411094 ZNF781Q8N8C0 355 aa4.89□□□□□ -1.63
RN7SKP247-201ENST00000411094 SIMC1Q8NDZ2 872 aa4.89□□□□□ -1.63
RN7SKP247-201ENST00000411094 CHST13Q8NET6 341 aa4.89□□□□□ -1.63
RN7SKP247-201ENST00000411094 Q8NFD4 153 aa4.89□□□□□ -1.63
RN7SKP247-201ENST00000411094 NUP43Q8NFH3 380 aa4.89□□□□□ -1.63
RN7SKP247-201ENST00000411094 NLGN2Q8NFZ4 835 aa4.89□□□□□ -1.63
RN7SKP247-201ENST00000411094 OR6Q1Q8NGQ2 317 aa4.89□□□□□ -1.63
RN7SKP247-201ENST00000411094 LRRC20Q8TCA0 184 aa4.89□□□□□ -1.63
RN7SKP247-201ENST00000411094 CPA5Q8WXQ8 436 aa4.89□□□□□ -1.63
RN7SKP247-201ENST00000411094 PRCCQ92733 491 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
RN7SKP247-201ENST00000411094 DPF1Q92782 380 aa4.89□□□□□ -1.63
RN7SKP247-201ENST00000411094 PROX1Q92786 737 aa4.89□□□□□ -1.63
RN7SKP247-201ENST00000411094 BORCS5Q969J3 196 aa4.89□□□□□ -1.63
RN7SKP247-201ENST00000411094 SHISA4Q96DD7 197 aa4.89□□□□□ -1.63
RN7SKP247-201ENST00000411094 HSPBAP1Q96EW2 488 aa4.89□□□□□ -1.63
RN7SKP247-201ENST00000411094 FAM89AQ96GI7 184 aa4.89□□□□□ -1.63
RN7SKP247-201ENST00000411094 AHCYL2Q96HN2 611 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
RN7SKP247-201ENST00000411094 LURAP1Q96LR2 239 aa4.89□□□□□ -1.63
RN7SKP247-201ENST00000411094 MAGEB10Q96LZ2 347 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
RN7SKP247-201ENST00000411094 RIPOR3Q96MK2 946 aa4.89□□□□□ -1.63
RN7SKP247-201ENST00000411094 ZNF558Q96NG5 402 aa4.89□□□□□ -1.63
RN7SKP247-201ENST00000411094 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
RN7SKP247-201ENST00000411094 C12orf57Q99622 126 aa4.89□□□□□ -1.63
RN7SKP247-201ENST00000411094 FERMT1Q9BQL6 677 aa4.89□□□□□ -1.63
RN7SKP247-201ENST00000411094 THUMPD3Q9BV44 507 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
RN7SKP247-201ENST00000411094 TARS2Q9BW92 718 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
RN7SKP247-201ENST00000411094 C1QTNF7Q9BXJ2 289 aa4.89□□□□□ -1.63
RN7SKP247-201ENST00000411094 ZYG11BQ9C0D3 744 aa4.89□□□□□ -1.63
RN7SKP247-201ENST00000411094 TINAGL1Q9GZM7 467 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
RN7SKP247-201ENST00000411094 TWSG1Q9GZX9 223 aa4.89□□□□□ -1.63
RN7SKP247-201ENST00000411094 HSD3B7Q9H2F3 369 aa4.89□□□□□ -1.63
RN7SKP247-201ENST00000411094 SETD4Q9NVD3 440 aa4.89□□□□□ -1.63
RN7SKP247-201ENST00000411094 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
RN7SKP247-201ENST00000411094 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
RN7SKP247-201ENST00000411094 THUMPD1Q9NXG2 353 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
RN7SKP247-201ENST00000411094 TAS2R10Q9NYW0 307 aa4.89□□□□□ -1.63
RN7SKP247-201ENST00000411094 GULP1Q9UBP9 304 aa4.89□□□□□ -1.63
RN7SKP247-201ENST00000411094 POLLQ9UGP5 575 aa4.89□□□□□ -1.63
RN7SKP247-201ENST00000411094 NARFQ9UHQ1 456 aa4.89□□□□□ -1.63
RN7SKP247-201ENST00000411094 ACSL6Q9UKU0 697 aa4.89□□□□□ -1.63
RN7SKP247-201ENST00000411094 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
RN7SKP247-201ENST00000411094 KLHL20Q9Y2M5 609 aa4.89□□□□□ -1.63
RN7SKP247-201ENST00000411094 RBMX2Q9Y388 322 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
RN7SKP247-201ENST00000411094 NR2E1Q9Y466 385 aa4.89□□□□□ -1.63
RN7SKP247-201ENST00000411094 SNX13Q9Y5W8 968 aa4.89□□□□□ -1.63
RN7SKP247-201ENST00000411094 GPR45Q9Y5Y3 372 aa4.89□□□□□ -1.63
RN7SKP247-201ENST00000411094 RAD54BQ9Y620 910 aa4.89□□□□□ -1.63
RN7SKP247-201ENST00000411094 FYCO1Q9BQS8 1478 aa4.88□□□□□ -1.63
RN7SKP247-201ENST00000411094 WDR97A6NE52 1622 aa4.88□□□□□ -1.63
RN7SKP247-201ENST00000411094 IQCF5A8MTL0 148 aa4.88□□□□□ -1.63
RN7SKP247-201ENST00000411094 FAM25AB3EWG3 89 aa4.88□□□□□ -1.63
RN7SKP247-201ENST00000411094 FAM25CB3EWG5 89 aa4.88□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.6 ms