RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409189.7

CCL20-202, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCL20, Length 839 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20-202ENST00000409189 TRADDQ15628 312 aa6.66□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 GPR19Q15760 415 aa6.66□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 P3H1Q32P28 736 aa6.66□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 DCAF6Q58WW2 860 aa6.66□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 ANKRD20A8PQ5CZ79 823 aa6.66□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 AGBL4Q5VU57 503 aa6.66□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 SCYL2Q6P3W7 929 aa6.66□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 FUT10Q6P4F1 479 aa6.66□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 PPP1R21Q6ZMI0 780 aa6.66□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 MTSS1LQ765P7 747 aa6.66□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 BHLHA9Q7RTU4 235 aa6.66□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 GPRIN1Q7Z2K8 1008 aa6.66□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 NLGN4XQ8N0W4 816 aa6.66□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 ZNF843Q8N446 348 aa6.66□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 CCDC185Q8N715 623 aa6.66□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 PQLC3Q8N755 202 aa6.66□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 PLD5Q8N7P1 536 aa6.66□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 MDM1Q8TC05 714 aa6.66□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 SPPL2BQ8TCT7 592 aa6.66□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 TTC25Q96NG3 672 aa6.66□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 OLFM3Q96PB7 478 aa6.66□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 QKIQ96PU8 341 aaKnown RBP eCLIP6.66□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 CSPG4P5Q96PW8 444 aa6.66□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 ADOQ96SZ5 270 aa6.66□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 FERMT1Q9BQL6 677 aa6.66□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 DHRS4Q9BTZ2 278 aa6.66□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 FRMD8Q9BZ67 464 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 FBXO44Q9H4M3 255 aa6.66□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 DHX35Q9H5Z1 703 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 PPCSQ9HAB8 311 aa6.66□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 MSL2Q9HCI7 577 aa6.66□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 VPS45Q9NRW7 570 aa6.66□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 TMEM30AQ9NV96 361 aa6.66□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 COMMD8Q9NX08 183 aa6.66□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa6.66□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 PAK5Q9P286 719 aa6.66□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 FZD10Q9ULW2 581 aa6.66□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 PLAAQ9Y263 795 aa6.66□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 MRPS17Q9Y2R5 130 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 TRAF6Q9Y4K3 522 aa6.66□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa6.66□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 ZFP37Q9Y6Q3 630 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 MYO16Q9Y6X6 1858 aa6.66□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 FAM92AA1XBS5 289 aa6.65□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 BCLAF3A2AJT9 711 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 YJEFN3A6XGL0 299 aa6.65□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 HACD1B0YJ81 288 aa6.65□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 E7ENQ6 273 aa6.65□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 J3QKU1 62 aa6.65□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 M0QYT0 321 aa6.65□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 MATN2O00339 956 aa6.65□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 MAN2B1O00754 1011 aa6.65□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 AQP7O14520 342 aa6.65□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 NRP1O14786 923 aa6.65□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 PPP1R12AO14974 1030 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 CHADO15335 359 aa6.65□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 TP73O15350 636 aa6.65□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 IRAK2O43187 625 aa6.65□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 RIPK2O43353 540 aa6.65□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 TADA2AO75478 443 aa6.65□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 AMY2AP04746 511 aa6.65□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 TSHRP16473 764 aa6.65□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 AMY2BP19961 511 aa6.65□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 BDNFP23560 247 aa6.65□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 GJA4P35212 333 aa6.65□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 SERPINB6P35237 376 aa6.65□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 ACTN2P35609 894 aa6.65□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 HCAR3P49019 387 aa6.65□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 CBX1P83916 185 aa6.65□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 IFFO1Q0D2I5 559 aa6.65□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 SEMA3BQ13214 749 aa6.65□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 MTA1Q13330 715 aa6.65□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 DPYSQ14117 519 aa6.65□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 LLGL1Q15334 1064 aa6.65□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 CA9Q16790 459 aa6.65□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 CTXN3Q4LDR2 81 aa6.65□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 SLC39A12Q504Y0 691 aa6.65□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 SLC45A4Q5BKX6 768 aa6.65□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 ZMAT1Q5H9K5 638 aa6.65□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 PPP6R3Q5H9R7 873 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 BRMS1LQ5PSV4 323 aa6.65□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 CEP85LQ5SZL2 805 aa6.65□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 RNASEH2BQ5TBB1 312 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 AGBL2Q5U5Z8 902 aa6.65□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 BTBD8Q5XKL5 378 aa6.65□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa6.65□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 TANGO2Q6ICL3 276 aa6.65□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 MSANTD2Q6P1R3 559 aa6.65□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 TAC4Q86UU9 113 aa6.65□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 FAM131BQ86XD5 332 aa6.65□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 SCUBE1Q8IWY4 988 aa6.65□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 SPEM1Q8N4L4 309 aa6.65□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 PCDH19Q8TAB3 1148 aa6.65□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 FAM76AQ8TAV0 307 aa6.65□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 SLC7A14Q8TBB6 771 aa6.65□□□□□ -1.34
CCL20-202ENST00000409189 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.9 ms