RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000382998.8

CTIF-202, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CTIF, Length 4,407 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-202ENST00000382998 GFM1Q96RP9 751 aaKnown RBP13.67□□□□□ -0.22
CTIF-202ENST00000382998 GFOD1Q9NXC2 390 aa13.67□□□□□ -0.22
CTIF-202ENST00000382998 GNG8Q9UK08 70 aa13.67□□□□□ -0.22
CTIF-202ENST00000382998 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa13.67□□□□□ -0.22
CTIF-202ENST00000382998 CYP2C18P33260 490 aa13.67□□□□□ -0.22
CTIF-202ENST00000382998 SLC26A2P50443 739 aa13.67□□□□□ -0.22
CTIF-202ENST00000382998 DNAJC24Q6P3W2 148 aa13.67□□□□□ -0.22
CTIF-202ENST00000382998 PARP8Q8N3A8 854 aa13.67□□□□□ -0.22
CTIF-202ENST00000382998 FBXL13Q8NEE6 735 aa13.67□□□□□ -0.22
CTIF-202ENST00000382998 OR4D10Q8NGI6 311 aa13.67□□□□□ -0.22
CTIF-202ENST00000382998 TBRG4Q969Z0 631 aaKnown RBP eCLIP13.67□□□□□ -0.224e-7■■■■■ 107.2
CTIF-202ENST00000382998 COL26A1Q96A83 441 aa13.67□□□□□ -0.22
CTIF-202ENST00000382998 PNMA8BQ9ULN7 279 aaPredicted RBP13.67□□□□□ -0.22
CTIF-202ENST00000382998 PLOD3O60568 738 aa13.66□□□□□ -0.22
CTIF-202ENST00000382998 STAU1O95793 577 aaKnown RBP13.66□□□□□ -0.22
CTIF-202ENST00000382998 ME2P23368 584 aa13.66□□□□□ -0.22
CTIF-202ENST00000382998 ZNF235Q14590 738 aa13.66□□□□□ -0.22
CTIF-202ENST00000382998 AGAP7PQ5VUJ5 663 aa13.66□□□□□ -0.22
CTIF-202ENST00000382998 ARHGAP17Q68EM7 881 aa13.66□□□□□ -0.22
CTIF-202ENST00000382998 CADM3Q8N126 398 aa13.66□□□□□ -0.22
CTIF-202ENST00000382998 SVOPQ8N4V2 548 aa13.66□□□□□ -0.22
CTIF-202ENST00000382998 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP13.66□□□□□ -0.22
CTIF-202ENST00000382998 MCOLN3Q8TDD5 553 aa13.66□□□□□ -0.22
CTIF-202ENST00000382998 ADAMTS16Q8TE57 1224 aa13.66□□□□□ -0.22
CTIF-202ENST00000382998 FATE1Q969F0 183 aa13.66□□□□□ -0.22
CTIF-202ENST00000382998 HSPBP1Q9NZL4 362 aa13.66□□□□□ -0.22
CTIF-202ENST00000382998 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP13.66□□□□□ -0.22
CTIF-202ENST00000382998 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP13.66□□□□□ -0.22
CTIF-202ENST00000382998 C1orf196B1AJZ1 125 aa13.66□□□□□ -0.22
CTIF-202ENST00000382998 AP3D1O14617 1153 aa13.66□□□□□ -0.22
CTIF-202ENST00000382998 LGALS2P05162 132 aa13.66□□□□□ -0.22
CTIF-202ENST00000382998 LCP1P13796 627 aa13.66□□□□□ -0.22
CTIF-202ENST00000382998 LBPP18428 481 aa13.66□□□□□ -0.22
CTIF-202ENST00000382998 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP13.66□□□□□ -0.22
CTIF-202ENST00000382998 HPCAL1P37235 193 aa13.66□□□□□ -0.22
CTIF-202ENST00000382998 GIT2Q14161 759 aa13.66□□□□□ -0.22
CTIF-202ENST00000382998 SEC23BQ15437 767 aa13.66□□□□□ -0.22
CTIF-202ENST00000382998 PAPD4Q6PIY7 484 aaKnown RBP13.66□□□□□ -0.22
CTIF-202ENST00000382998 FOXR2Q6PJQ5 311 aa13.66□□□□□ -0.22
CTIF-202ENST00000382998 ZBTB44Q8NCP5 570 aa13.66□□□□□ -0.22
CTIF-202ENST00000382998 SRFBP1Q8NEF9 429 aaKnown RBP13.66□□□□□ -0.22
CTIF-202ENST00000382998 IL31RAQ8NI17 732 aa13.66□□□□□ -0.22
CTIF-202ENST00000382998 AAASQ9NRG9 546 aa13.66□□□□□ -0.22
CTIF-202ENST00000382998 NFKBIL1Q9UBC1 381 aaPredicted RBP13.66□□□□□ -0.22
CTIF-202ENST00000382998 EBF1Q9UH73 591 aa13.66□□□□□ -0.22
CTIF-202ENST00000382998 MAB21L2Q9Y586 359 aa13.66□□□□□ -0.22
CTIF-202ENST00000382998 OR6C74A6NCV1 312 aa13.66□□□□□ -0.22
CTIF-202ENST00000382998 CD2P06729 351 aa13.66□□□□□ -0.22
CTIF-202ENST00000382998 FMO5P49326 533 aa13.66□□□□□ -0.22
CTIF-202ENST00000382998 BHLHE22Q8NFJ8 381 aaPredicted RBP13.66□□□□□ -0.22
CTIF-202ENST00000382998 OR5T3Q8NGG3 340 aa13.66□□□□□ -0.22
CTIF-202ENST00000382998 VCPIP1Q96JH7 1222 aa13.66□□□□□ -0.22
CTIF-202ENST00000382998 CCDC115Q96NT0 180 aa13.66□□□□□ -0.22
CTIF-202ENST00000382998 CDRT15Q96T59 188 aa13.66□□□□□ -0.22
CTIF-202ENST00000382998 GMLQ99445 158 aa13.66□□□□□ -0.22
CTIF-202ENST00000382998 LIN7BQ9HAP6 207 aa13.66□□□□□ -0.22
CTIF-202ENST00000382998 CAPN10Q9HC96 672 aa13.66□□□□□ -0.22
CTIF-202ENST00000382998 HEMK1Q9Y5R4 338 aaPredicted RBP13.66□□□□□ -0.22
CTIF-202ENST00000382998 EDF1O60869 148 aaKnown RBP13.65□□□□□ -0.22
CTIF-202ENST00000382998 IL6P05231 212 aa13.65□□□□□ -0.22
CTIF-202ENST00000382998 HADHBP55084 474 aaKnown RBP13.65□□□□□ -0.22
CTIF-202ENST00000382998 MAB21L1Q13394 359 aa13.65□□□□□ -0.22
CTIF-202ENST00000382998 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP13.65□□□□□ -0.22
CTIF-202ENST00000382998 INTS6LQ5JSJ4 861 aaKnown RBP13.65□□□□□ -0.22
CTIF-202ENST00000382998 HASPINQ8TF76 798 aa13.65□□□□□ -0.22
CTIF-202ENST00000382998 KLHL6Q8WZ60 621 aa13.65□□□□□ -0.22
CTIF-202ENST00000382998 FAM111AQ96PZ2 611 aa13.65□□□□□ -0.22
CTIF-202ENST00000382998 RAB20Q9NX57 234 aa13.65□□□□□ -0.22
CTIF-202ENST00000382998 PACSIN3Q9UKS6 424 aa13.65□□□□□ -0.22
CTIF-202ENST00000382998 SLC9A8Q9Y2E8 581 aa13.65□□□□□ -0.22
CTIF-202ENST00000382998 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa13.65□□□□□ -0.22
CTIF-202ENST00000382998 RETP07949 1114 aa13.65□□□□□ -0.22
CTIF-202ENST00000382998 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP13.65□□□□□ -0.22
CTIF-202ENST00000382998 GRB14Q14449 540 aa13.65□□□□□ -0.22
CTIF-202ENST00000382998 FIGNQ5HY92 759 aa13.65□□□□□ -0.22
CTIF-202ENST00000382998 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa13.65□□□□□ -0.22
CTIF-202ENST00000382998 ZNF227Q86WZ6 799 aa13.65□□□□□ -0.22
CTIF-202ENST00000382998 LACC1Q8IV20 430 aa13.65□□□□□ -0.22
CTIF-202ENST00000382998 ZC3H7AQ8IWR0 971 aaKnown RBP13.65□□□□□ -0.22
CTIF-202ENST00000382998 EFCAB3Q8N7B9 438 aa13.65□□□□□ -0.22
CTIF-202ENST00000382998 OR4C6Q8NH72 309 aa13.65□□□□□ -0.22
CTIF-202ENST00000382998 INTS12Q96CB8 462 aaKnown RBP13.65□□□□□ -0.22
CTIF-202ENST00000382998 POM121Q96HA1 1249 aa13.65□□□□□ -0.22
CTIF-202ENST00000382998 CPB2Q96IY4 423 aa13.65□□□□□ -0.22
CTIF-202ENST00000382998 FOPNLQ96NB1 174 aa13.65□□□□□ -0.22
CTIF-202ENST00000382998 MED15Q96RN5 788 aa13.65□□□□□ -0.22
CTIF-202ENST00000382998 CMTM6Q9NX76 183 aa13.65□□□□□ -0.22
CTIF-202ENST00000382998 MAP10Q9P2G4 905 aa13.65□□□□□ -0.22
CTIF-202ENST00000382998 UBQLN2Q9UHD9 624 aa13.65□□□□□ -0.22
CTIF-202ENST00000382998 RNF112Q9ULX5 631 aa13.65□□□□□ -0.22
CTIF-202ENST00000382998 KDM3BQ7LBC6 1761 aa13.65□□□□□ -0.22
CTIF-202ENST00000382998 DHFRP00374 187 aa13.65□□□□□ -0.22
CTIF-202ENST00000382998 FASP25445 335 aa13.65□□□□□ -0.22
CTIF-202ENST00000382998 GSTM5P46439 218 aa13.65□□□□□ -0.22
CTIF-202ENST00000382998 HK3P52790 923 aa13.65□□□□□ -0.22
CTIF-202ENST00000382998 RPA4Q13156 261 aa13.65□□□□□ -0.22
CTIF-202ENST00000382998 BIKQ13323 160 aa13.65□□□□□ -0.22
CTIF-202ENST00000382998 MTM1Q13496 603 aa13.65□□□□□ -0.22
CTIF-202ENST00000382998 NPY5RQ15761 445 aa13.65□□□□□ -0.22
CTIF-202ENST00000382998 UNC5AQ6ZN44 842 aa13.65□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.5 ms