RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362869.1

RNU6-552P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 552, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-552P, Length 119 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-552P-201ENST00000362869 PPM1MQ96MI6 270 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZNF583Q96ND8 569 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 MAP7D2Q96T17 732 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 PCYT2Q99447 389 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 FKRPQ9H9S5 495 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 LTB4R2Q9NPC1 389 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 ACSL5Q9ULC5 683 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 DLGAP4Q9Y2H0 992 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 KLHL20Q9Y2M5 609 aa3.02□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 A0A1W2PQF6 199 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 C1orf226A1L170 272 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 M0QZ24 198 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 DVL1O14640 695 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 HS3ST1O14792 307 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 CCNDBP1O95273 360 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 CLEC3BP05452 202 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 TCEA1P23193 301 aaKnown RBP3.01□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 ANOS1P23352 680 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 UBA7P41226 1012 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 AMPHP49418 695 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 DVL1P1P54792 670 aaPredicted RBP3.01□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP3.01□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 EEF1A1P68104 462 aaKnown RBP3.01□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP3.01□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 GRIK2Q13002 908 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP3.01□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 GTF2H2Q13888 395 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 MYLK3Q32MK0 819 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 TMEM35AQ53FP2 167 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 PDSS1Q5T2R2 415 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 STXBP5Q5T5C0 1151 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 EEF1A1P5Q5VTE0 462 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 GTF2H2CQ6P1K8 395 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 GSG1LQ6UXU4 331 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 KCTD8Q6ZWB6 473 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 NFE4Q86UQ8 179 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 CIARTQ8N365 385 aaPredicted RBP3.01□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 FRMD1Q8N878 549 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 DMBX1Q8NFW5 382 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 KCNG4Q8TDN1 519 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 LRRC8CQ8TDW0 803 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 DNAAF4Q8WXU2 420 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 PERPQ96FX8 193 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 LRRC1Q9BTT6 524 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZNF334Q9HCZ1 680 aaPredicted RBP3.01□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP3.01□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 STK39Q9UEW8 545 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP3.01□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 OR14J1Q9UGF5 321 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 LIMA1Q9UHB6 759 aaKnown RBP3.01□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 ADAM18Q9Y3Q7 739 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 KCNE2Q9Y6J6 123 aa3.01□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 TNFSF12-TNFSF13A0A0A6YY99 330 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 PRR23AA6NEV1 266 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 ATP2A1O14983 1001 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZNHIT1O43257 154 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 SOCS5O75159 536 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 NDUFS3O75489 264 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 JRKO75564 520 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 SLC25A12O75746 678 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 SLC22A3O75751 556 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 TMEM63AO94886 807 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 MLYCDO95822 493 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 FAM106CPP0CH98 169 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 CD53P19397 219 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 APOBEC1P41238 236 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 HOXA1P49639 335 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 TERF1P54274 439 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 CLDN20P56880 219 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 RPS3AP61247 264 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZBED6P86452 979 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 PLIN5Q00G26 463 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 PDE1CQ14123 709 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 PNLIPRP3Q17RR3 467 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 SIRPB2Q5JXA9 342 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 C18orf63Q68DL7 685 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 C19orf48Q6RUI8 117 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 CYP20A1Q6UW02 462 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZNF704Q6ZNC4 412 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 MARK2Q7KZI7 788 aaKnown RBP3□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 SLC26A9Q7LBE3 791 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 CPLX4Q7Z7G2 160 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 TMPRSS12Q86WS5 348 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 SLC24A4Q8NFF2 622 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 OR1J2Q8NGS2 313 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 NEURL2Q9BR09 285 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 UNC45AQ9H3U1 944 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 RANGRFQ9HD47 186 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 IRAK4Q9NWZ3 460 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 FAF1Q9UNN5 650 aaPredicted RBP3□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 CLIC4Q9Y696 253 aa3□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 FAM237BA0A1B0GVD1 139 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 KANSL1LA0AUZ9 987 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 EIF4E1BA6NMX2 242 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 FAM90A26D6RGX4 464 aa2.99□□□□□ -1.93
RNU6-552P-201ENST00000362869 FAM72CH0Y354 149 aa2.99□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.5 ms