RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356128.4

TRAPPC3L-201, Transcript of trafficking protein particle complex 3 like, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TRAPPC3L, Length 2,421 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PTPN9P43378 593 aa6.46□□□□□ -1.38
TRAPPC3L-201ENST00000356128 KCNJ1P48048 391 aa6.46□□□□□ -1.38
TRAPPC3L-201ENST00000356128 KCNC1P48547 511 aa6.46□□□□□ -1.38
TRAPPC3L-201ENST00000356128 NRIP1P48552 1158 aa6.46□□□□□ -1.38
TRAPPC3L-201ENST00000356128 RPL34P49207 117 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
TRAPPC3L-201ENST00000356128 VAMP2P63027 116 aa6.46□□□□□ -1.38
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SLC25A11Q02978 314 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
TRAPPC3L-201ENST00000356128 EGR3Q06889 387 aa6.46□□□□□ -1.38
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CD69Q07108 199 aa6.46□□□□□ -1.38
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ACAP1Q15027 740 aa6.46□□□□□ -1.38
TRAPPC3L-201ENST00000356128 BOLA3Q53S33 107 aa6.46□□□□□ -1.38
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ZNF449Q6P9G9 518 aa6.46□□□□□ -1.38
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CRTC1Q6UUV9 634 aa6.46□□□□□ -1.38
TRAPPC3L-201ENST00000356128 H1FNTQ75WM6 255 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
TRAPPC3L-201ENST00000356128 GSTA5Q7RTV2 222 aa6.46□□□□□ -1.38
TRAPPC3L-201ENST00000356128 KATNAL2Q8IYT4 538 aa6.46□□□□□ -1.38
TRAPPC3L-201ENST00000356128 TDHQ8IZJ6 230 aa6.46□□□□□ -1.38
TRAPPC3L-201ENST00000356128 C12orf76Q8N812 135 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
TRAPPC3L-201ENST00000356128 NIPA2Q8N8Q9 360 aa6.46□□□□□ -1.38
TRAPPC3L-201ENST00000356128 EXD1Q8NHP7 514 aa6.46□□□□□ -1.38
TRAPPC3L-201ENST00000356128 MGARPQ8TDB4 240 aa6.46□□□□□ -1.38
TRAPPC3L-201ENST00000356128 IRGQQ8WZA9 623 aa6.46□□□□□ -1.38
TRAPPC3L-201ENST00000356128 AGAP3Q96P47 875 aa6.46□□□□□ -1.38
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CYP2S1Q96SQ9 504 aa6.46□□□□□ -1.38
TRAPPC3L-201ENST00000356128 GPATCH1Q9BRR8 931 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ITPAQ9BY32 194 aa6.46□□□□□ -1.38
TRAPPC3L-201ENST00000356128 STK39Q9UEW8 545 aa6.46□□□□□ -1.38
TRAPPC3L-201ENST00000356128 MID2Q9UJV3 735 aa6.46□□□□□ -1.38
TRAPPC3L-201ENST00000356128 WASF3Q9UPY6 502 aa6.46□□□□□ -1.38
TRAPPC3L-201ENST00000356128 MTO1Q9Y2Z2 717 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
TRAPPC3L-201ENST00000356128 NR2E1Q9Y466 385 aa6.46□□□□□ -1.38
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PTPRSQ13332 1948 aa6.46□□□□□ -1.38
TRAPPC3L-201ENST00000356128 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa6.45□□□□□ -1.38
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PCDH17O14917 1159 aa6.45□□□□□ -1.38
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CST8O60676 142 aa6.45□□□□□ -1.38
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ERAL1O75616 437 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
TRAPPC3L-201ENST00000356128 F9P00740 461 aa6.45□□□□□ -1.38
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ESR1P03372 595 aa6.45□□□□□ -1.38
TRAPPC3L-201ENST00000356128 RB1P06400 928 aa6.45□□□□□ -1.38
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SBK3P0C264 359 aa6.45□□□□□ -1.38
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ARL4AP40617 200 aa6.45□□□□□ -1.38
TRAPPC3L-201ENST00000356128 VPS41P49754 854 aa6.45□□□□□ -1.38
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CYP4F8P98187 520 aa6.45□□□□□ -1.38
TRAPPC3L-201ENST00000356128 RASA2Q15283 850 aa6.45□□□□□ -1.38
TRAPPC3L-201ENST00000356128 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
TRAPPC3L-201ENST00000356128 TBCCQ15814 346 aa6.45□□□□□ -1.38
TRAPPC3L-201ENST00000356128 MST1LQ2TV78 715 aa6.45□□□□□ -1.38
TRAPPC3L-201ENST00000356128 HSP90B2PQ58FF3 399 aa6.45□□□□□ -1.38
TRAPPC3L-201ENST00000356128 TFDP3Q5H9I0 405 aa6.45□□□□□ -1.38
TRAPPC3L-201ENST00000356128 FYB2Q5VWT5 728 aa6.45□□□□□ -1.38
TRAPPC3L-201ENST00000356128 TXNDC8Q6A555 127 aa6.45□□□□□ -1.38
TRAPPC3L-201ENST00000356128 C8orf74Q6P047 294 aa6.45□□□□□ -1.38
TRAPPC3L-201ENST00000356128 LYPD4Q6UWN0 246 aa6.45□□□□□ -1.38
TRAPPC3L-201ENST00000356128 TMC5Q6UXY8 1006 aa6.45□□□□□ -1.38
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ZNF783Q6ZMS7 281 aa6.45□□□□□ -1.38
TRAPPC3L-201ENST00000356128 Q6ZS46 218 aa6.45□□□□□ -1.38
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ADGRD2Q7Z7M1 963 aa6.45□□□□□ -1.38
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ITIH5Q86UX2 942 aa6.45□□□□□ -1.38
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SLC13A5Q86YT5 568 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
TRAPPC3L-201ENST00000356128 NPAS3Q8IXF0 933 aa6.45□□□□□ -1.38
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ARHGAP18Q8N392 663 aa6.45□□□□□ -1.38
TRAPPC3L-201ENST00000356128 MPP5Q8N3R9 675 aa6.45□□□□□ -1.38
TRAPPC3L-201ENST00000356128 MAB21L3Q8N8X9 362 aa6.45□□□□□ -1.38
TRAPPC3L-201ENST00000356128 NAT8LQ8N9F0 302 aa6.45□□□□□ -1.38
TRAPPC3L-201ENST00000356128 LSM14AQ8ND56 463 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SPATA17Q96L03 361 aa6.45□□□□□ -1.38
TRAPPC3L-201ENST00000356128 GCNAQ96QF7 691 aa6.45□□□□□ -1.38
TRAPPC3L-201ENST00000356128 NPY6RQ99463 290 aa6.45□□□□□ -1.38
TRAPPC3L-201ENST00000356128 TRIM62Q9BVG3 475 aa6.45□□□□□ -1.38
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PCDHAC1Q9H158 963 aa6.45□□□□□ -1.38
TRAPPC3L-201ENST00000356128 HCFC1R1Q9NWW0 138 aa6.45□□□□□ -1.38
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ETAA1Q9NY74 926 aa6.45□□□□□ -1.38
TRAPPC3L-201ENST00000356128 AMACRQ9UHK6 382 aa6.45□□□□□ -1.38
TRAPPC3L-201ENST00000356128 BRWD1Q9NSI6 2320 aa6.45□□□□□ -1.38
TRAPPC3L-201ENST00000356128 DMDP11532 3685 aa6.45□□□□□ -1.38
TRAPPC3L-201ENST00000356128 C2orf78A6NCI8 922 aa6.45□□□□□ -1.38
TRAPPC3L-201ENST00000356128 TRDMT1O14717 391 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
TRAPPC3L-201ENST00000356128 KRT38O76015 456 aa6.45□□□□□ -1.38
TRAPPC3L-201ENST00000356128 TJP3O95049 919 aa6.45□□□□□ -1.38
TRAPPC3L-201ENST00000356128 FSBPO95073 299 aa6.45□□□□□ -1.38
TRAPPC3L-201ENST00000356128 IFNB1P01574 187 aa6.45□□□□□ -1.38
TRAPPC3L-201ENST00000356128 MBL2P11226 248 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
TRAPPC3L-201ENST00000356128 GOT1P17174 413 aa6.45□□□□□ -1.38
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CCR1P32246 355 aa6.45□□□□□ -1.38
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ADRA1BP35368 520 aa6.45□□□□□ -1.38
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
TRAPPC3L-201ENST00000356128 AP2B1P63010 937 aa6.45□□□□□ -1.38
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CCDC15Q0P6D6 951 aa6.45□□□□□ -1.38
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CAMK1Q14012 370 aa6.45□□□□□ -1.38
TRAPPC3L-201ENST00000356128 TBCEQ15813 527 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
TRAPPC3L-201ENST00000356128 BTBD16Q32M84 506 aa6.45□□□□□ -1.38
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ATG16L1Q676U5 607 aa6.45□□□□□ -1.38
TRAPPC3L-201ENST00000356128 STRADAQ7RTN6 431 aa6.45□□□□□ -1.38
TRAPPC3L-201ENST00000356128 BHLHA9Q7RTU4 235 aa6.45□□□□□ -1.38
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ANKS1BQ7Z6G8 1248 aa6.45□□□□□ -1.38
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ZC3H18Q86VM9 953 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
TRAPPC3L-201ENST00000356128 GATAD2AQ86YP4 633 aa6.45□□□□□ -1.38
TRAPPC3L-201ENST00000356128 GLB1L2Q8IW92 636 aa6.45□□□□□ -1.38
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SLC44A2Q8IWA5 706 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24 ms