RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000320031.12

ITGA3-202, Transcript of integrin subunit alpha 3, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene ITGA3, Length 4,888 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3-202ENST00000320031 LAMA4Q16363 1823 aa16.42■□□□□ 0.22
ITGA3-202ENST00000320031 TM7SF2O76062 418 aa16.42■□□□□ 0.22
ITGA3-202ENST00000320031 GJA5P36382 358 aa16.42■□□□□ 0.22
ITGA3-202ENST00000320031 SKP1P63208 163 aa16.42■□□□□ 0.22
ITGA3-202ENST00000320031 RBM15BQ8NDT2 890 aaKnown RBP16.42■□□□□ 0.22
ITGA3-202ENST00000320031 SLC28A3Q9HAS3 691 aa16.42■□□□□ 0.22
ITGA3-202ENST00000320031 CORO2BQ9UQ03 480 aa16.42■□□□□ 0.22
ITGA3-202ENST00000320031 A0A1B0GUL6 1792 aa16.42■□□□□ 0.22
ITGA3-202ENST00000320031 C2orf71A6NGG8 1288 aa16.42■□□□□ 0.22
ITGA3-202ENST00000320031 CLCQ05315 142 aa16.42■□□□□ 0.22
ITGA3-202ENST00000320031 SERPINA9Q86WD7 417 aa16.42■□□□□ 0.22
ITGA3-202ENST00000320031 LEMD2Q8NC56 503 aa16.42■□□□□ 0.22
ITGA3-202ENST00000320031 ZNF461Q8TAF7 563 aa16.42■□□□□ 0.22
ITGA3-202ENST00000320031 TWIST2Q8WVJ9 160 aa16.42■□□□□ 0.22
ITGA3-202ENST00000320031 TADA1Q96BN2 335 aa16.42■□□□□ 0.22
ITGA3-202ENST00000320031 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP16.42■□□□□ 0.22
ITGA3-202ENST00000320031 EBF2Q9HAK2 575 aa16.42■□□□□ 0.22
ITGA3-202ENST00000320031 A0A0J9YYE9 177 aa16.42■□□□□ 0.22
ITGA3-202ENST00000320031 FAM220BPB1ANY3 271 aa16.42■□□□□ 0.22
ITGA3-202ENST00000320031 CCR3P51677 355 aa16.42■□□□□ 0.22
ITGA3-202ENST00000320031 RPS6KA3P51812 740 aa16.42■□□□□ 0.22
ITGA3-202ENST00000320031 TNK2Q07912 1038 aa16.42■□□□□ 0.22
ITGA3-202ENST00000320031 DCTN2Q13561 401 aaKnown RBP16.42■□□□□ 0.22
ITGA3-202ENST00000320031 PRKD1Q15139 912 aaPredicted RBP16.42■□□□□ 0.22
ITGA3-202ENST00000320031 CAPN10Q9HC96 672 aa16.42■□□□□ 0.22
ITGA3-202ENST00000320031 ENTPD4Q9Y227 616 aa16.42■□□□□ 0.22
ITGA3-202ENST00000320031 CXorf49A8MYA2 514 aaPredicted RBP16.41■□□□□ 0.22
ITGA3-202ENST00000320031 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP16.41■□□□□ 0.22
ITGA3-202ENST00000320031 CYP4F8P98187 520 aa16.41■□□□□ 0.22
ITGA3-202ENST00000320031 DLG2Q15700 870 aa16.41■□□□□ 0.22
ITGA3-202ENST00000320031 PHKG1Q16816 387 aa16.41■□□□□ 0.22
ITGA3-202ENST00000320031 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP16.41■□□□□ 0.22
ITGA3-202ENST00000320031 ZNF781Q8N8C0 355 aa16.41■□□□□ 0.22
ITGA3-202ENST00000320031 NELL1Q92832 810 aa16.41■□□□□ 0.22
ITGA3-202ENST00000320031 TPD52L3Q96J77 140 aa16.41■□□□□ 0.22
ITGA3-202ENST00000320031 SEMA6AQ9H2E6 1030 aa16.41■□□□□ 0.22
ITGA3-202ENST00000320031 GKN1Q9NS71 199 aa16.41■□□□□ 0.22
ITGA3-202ENST00000320031 ZNF229Q9UJW7 825 aa16.41■□□□□ 0.22
ITGA3-202ENST00000320031 PSME2Q9UL46 239 aa16.41■□□□□ 0.22
ITGA3-202ENST00000320031 ASF1AQ9Y294 204 aa16.41■□□□□ 0.22
ITGA3-202ENST00000320031 MYRFQ9Y2G1 1151 aa16.41■□□□□ 0.22
ITGA3-202ENST00000320031 APODP05090 189 aa16.41■□□□□ 0.22
ITGA3-202ENST00000320031 POU1F1P28069 291 aa16.41■□□□□ 0.22
ITGA3-202ENST00000320031 IL5RAQ01344 420 aa16.41■□□□□ 0.22
ITGA3-202ENST00000320031 CAP1Q01518 475 aa16.41■□□□□ 0.22
ITGA3-202ENST00000320031 C6orf89Q6UWU4 347 aa16.41■□□□□ 0.22
ITGA3-202ENST00000320031 KIAA2013Q8IYS2 634 aa16.41■□□□□ 0.22
ITGA3-202ENST00000320031 SIGLEC10Q96LC7 697 aa16.41■□□□□ 0.22
ITGA3-202ENST00000320031 ARMC7Q9H6L4 198 aa16.41■□□□□ 0.22
ITGA3-202ENST00000320031 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP16.41■□□□□ 0.22
ITGA3-202ENST00000320031 DNAJC11Q9NVH1 559 aa16.41■□□□□ 0.22
ITGA3-202ENST00000320031 DUS2Q9NX74 493 aaKnown RBP16.41■□□□□ 0.22
ITGA3-202ENST00000320031 PACSIN3Q9UKS6 424 aa16.41■□□□□ 0.22
ITGA3-202ENST00000320031 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP16.41■□□□□ 0.22
ITGA3-202ENST00000320031 CDK14O94921 469 aa16.41■□□□□ 0.22
ITGA3-202ENST00000320031 HTR1BP28222 390 aa16.41■□□□□ 0.22
ITGA3-202ENST00000320031 SLC7A2P52569 658 aa16.41■□□□□ 0.22
ITGA3-202ENST00000320031 ALDH6A1Q02252 535 aaKnown RBP16.41■□□□□ 0.22
ITGA3-202ENST00000320031 SKA1Q96BD8 255 aa16.41■□□□□ 0.22
ITGA3-202ENST00000320031 C1orf74Q96LT6 269 aa16.41■□□□□ 0.22
ITGA3-202ENST00000320031 EPS8L2Q9H6S3 715 aa16.41■□□□□ 0.22
ITGA3-202ENST00000320031 TMEM248Q9NWD8 314 aa16.41■□□□□ 0.22
ITGA3-202ENST00000320031 RPS6KA6Q9UK32 745 aa16.41■□□□□ 0.22
ITGA3-202ENST00000320031 INSL6Q9Y581 213 aa16.41■□□□□ 0.22
ITGA3-202ENST00000320031 C9IYK1 514 aa16.41■□□□□ 0.22
ITGA3-202ENST00000320031 ENPP3O14638 875 aa16.41■□□□□ 0.22
ITGA3-202ENST00000320031 ACRP10323 421 aa16.41■□□□□ 0.22
ITGA3-202ENST00000320031 CYBAP13498 195 aa16.41■□□□□ 0.22
ITGA3-202ENST00000320031 NTSP30990 170 aa16.41■□□□□ 0.22
ITGA3-202ENST00000320031 GNPDA1P46926 289 aa16.41■□□□□ 0.22
ITGA3-202ENST00000320031 GAD2Q05329 585 aa16.41■□□□□ 0.22
ITGA3-202ENST00000320031 MS4A13Q5J8X5 152 aa16.41■□□□□ 0.22
ITGA3-202ENST00000320031 B3GNT6Q6ZMB0 384 aa16.41■□□□□ 0.22
ITGA3-202ENST00000320031 OVCA2Q8WZ82 227 aa16.41■□□□□ 0.22
ITGA3-202ENST00000320031 ERLEC1Q96DZ1 483 aa16.41■□□□□ 0.22
ITGA3-202ENST00000320031 SYT11Q9BT88 431 aa16.41■□□□□ 0.22
ITGA3-202ENST00000320031 ATXN10Q9UBB4 475 aa16.41■□□□□ 0.22
ITGA3-202ENST00000320031 CCDC162PA2VCL2 907 aa16.4■□□□□ 0.22
ITGA3-202ENST00000320031 PCSK2P16519 638 aa16.4■□□□□ 0.22
ITGA3-202ENST00000320031 KRT20P35900 424 aa16.4■□□□□ 0.22
ITGA3-202ENST00000320031 CSKP41240 450 aa16.4■□□□□ 0.22
ITGA3-202ENST00000320031 DAB2P98082 770 aa16.4■□□□□ 0.22
ITGA3-202ENST00000320031 TIGD2Q4W5G0 525 aa16.4■□□□□ 0.22
ITGA3-202ENST00000320031 ZCCHC8Q6NZY4 707 aaKnown RBP16.4■□□□□ 0.22
ITGA3-202ENST00000320031 KIAA1324Q6UXG2 1013 aaKnown RBP16.4■□□□□ 0.22
ITGA3-202ENST00000320031 R3HCC1LQ7Z5L2 792 aaKnown RBP16.4■□□□□ 0.22
ITGA3-202ENST00000320031 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP16.4■□□□□ 0.22
ITGA3-202ENST00000320031 WDR60Q8WVS4 1066 aa16.4■□□□□ 0.22
ITGA3-202ENST00000320031 APOL4Q9BPW4 351 aa16.4■□□□□ 0.22
ITGA3-202ENST00000320031 FAIM2Q9BWQ8 316 aa16.4■□□□□ 0.22
ITGA3-202ENST00000320031 CREBZFQ9NS37 354 aa16.4■□□□□ 0.22
ITGA3-202ENST00000320031 SMIM31A0A1B0GVY4 71 aa16.4■□□□□ 0.22
ITGA3-202ENST00000320031 KCNQ1P51787 676 aa16.4■□□□□ 0.22
ITGA3-202ENST00000320031 SLC18A2Q05940 514 aa16.4■□□□□ 0.22
ITGA3-202ENST00000320031 CAPN13Q6MZZ7 669 aaPredicted RBP16.4■□□□□ 0.22
ITGA3-202ENST00000320031 AP2M1Q96CW1 435 aa16.4■□□□□ 0.22
ITGA3-202ENST00000320031 ITCHQ96J02 903 aa16.4■□□□□ 0.22
ITGA3-202ENST00000320031 MS4A4AQ96JQ5 239 aa16.4■□□□□ 0.22
ITGA3-202ENST00000320031 CDV3Q9UKY7 258 aaKnown RBP16.4■□□□□ 0.22
ITGA3-202ENST00000320031 PALM2-AKAP2B1ALY0 433 aaPredicted RBP16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.4 ms