RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000282074.6

SPC25-201, Transcript of SPC25, NDC80 kinetochore complex component, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPC25, Length 1,354 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPC25-201ENST00000282074 CELSR2Q9HCU4 2923 aa11.9□□□□□ -0.51
SPC25-201ENST00000282074 POLQO75417 2590 aa11.89□□□□□ -0.51
SPC25-201ENST00000282074 TCP11X1B4DZS4 312 aa11.89□□□□□ -0.51
SPC25-201ENST00000282074 LRCH4O75427 683 aa11.89□□□□□ -0.51
SPC25-201ENST00000282074 MT-ND3P03897 115 aa11.89□□□□□ -0.51
SPC25-201ENST00000282074 RFC1P35251 1148 aaPredicted RBP11.89□□□□□ -0.51
SPC25-201ENST00000282074 GARSP41250 739 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
SPC25-201ENST00000282074 TPI1P60174 286 aa11.89□□□□□ -0.51
SPC25-201ENST00000282074 DPTQ07507 201 aa11.89□□□□□ -0.51
SPC25-201ENST00000282074 NADK2Q4G0N4 442 aa11.89□□□□□ -0.51
SPC25-201ENST00000282074 IYDQ6PHW0 289 aa11.89□□□□□ -0.51
SPC25-201ENST00000282074 Q6ZVL8 140 aa11.89□□□□□ -0.51
SPC25-201ENST00000282074 MARK2Q7KZI7 788 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
SPC25-201ENST00000282074 HSD11B1LQ7Z5J1 315 aa11.89□□□□□ -0.51
SPC25-201ENST00000282074 AVL9Q8NBF6 648 aa11.89□□□□□ -0.51
SPC25-201ENST00000282074 EPS8L1Q8TE68 723 aa11.89□□□□□ -0.51
SPC25-201ENST00000282074 PDCD6IPQ8WUM4 868 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
SPC25-201ENST00000282074 THAP4Q8WY91 577 aa11.89□□□□□ -0.51
SPC25-201ENST00000282074 CELF6Q96J87 481 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
SPC25-201ENST00000282074 C11orf70Q9BRQ4 267 aa11.89□□□□□ -0.51
SPC25-201ENST00000282074 SELENOOQ9BVL4 669 aa11.89□□□□□ -0.51
SPC25-201ENST00000282074 SLC39A8Q9C0K1 460 aa11.89□□□□□ -0.51
SPC25-201ENST00000282074 SP110Q9HB58 689 aa11.89□□□□□ -0.51
SPC25-201ENST00000282074 SIDT1Q9NXL6 827 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
SPC25-201ENST00000282074 CNOT8Q9UFF9 292 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
SPC25-201ENST00000282074 PHTF1Q9UMS5 762 aa11.89□□□□□ -0.51
SPC25-201ENST00000282074 PCDHGA9Q9Y5G4 932 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
SPC25-201ENST00000282074 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP11.89□□□□□ -0.51
SPC25-201ENST00000282074 ANKRD62A6NC57 917 aa11.88□□□□□ -0.51
SPC25-201ENST00000282074 A6NCN8 305 aa11.88□□□□□ -0.51
SPC25-201ENST00000282074 WIPF3A6NGB9 483 aa11.88□□□□□ -0.51
SPC25-201ENST00000282074 C21orf140B9A014 251 aa11.88□□□□□ -0.51
SPC25-201ENST00000282074 TOX3O15405 576 aaPredicted RBP11.88□□□□□ -0.51
SPC25-201ENST00000282074 HTRA2O43464 458 aaPredicted RBP11.88□□□□□ -0.51
SPC25-201ENST00000282074 SOCS5O75159 536 aa11.88□□□□□ -0.51
SPC25-201ENST00000282074 DNAJB5O75953 348 aa11.88□□□□□ -0.51
SPC25-201ENST00000282074 KIAA0754O94854 1291 aa11.88□□□□□ -0.51
SPC25-201ENST00000282074 SORBS2O94875 1100 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
SPC25-201ENST00000282074 NDUFA10O95299 355 aa11.88□□□□□ -0.51
SPC25-201ENST00000282074 CLDN1O95832 211 aa11.88□□□□□ -0.51
SPC25-201ENST00000282074 CYP1A1P04798 512 aaPredicted RBP11.88□□□□□ -0.51
SPC25-201ENST00000282074 PYGLP06737 847 aa11.88□□□□□ -0.51
SPC25-201ENST00000282074 PRKCSHP14314 528 aaPredicted RBP11.88□□□□□ -0.51
SPC25-201ENST00000282074 ZNF28P17035 718 aa11.88□□□□□ -0.51
SPC25-201ENST00000282074 DESP17661 470 aa11.88□□□□□ -0.51
SPC25-201ENST00000282074 DNASE1L3Q13609 305 aa11.88□□□□□ -0.51
SPC25-201ENST00000282074 MAN2A1Q16706 1144 aa11.88□□□□□ -0.51
SPC25-201ENST00000282074 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa11.88□□□□□ -0.51
SPC25-201ENST00000282074 CYB5D1Q6P9G0 228 aa11.88□□□□□ -0.51
SPC25-201ENST00000282074 WDR59Q6PJI9 974 aa11.88□□□□□ -0.51
SPC25-201ENST00000282074 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa11.88□□□□□ -0.51
SPC25-201ENST00000282074 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP11.88□□□□□ -0.51
SPC25-201ENST00000282074 SLC30A5Q8TAD4 765 aa11.88□□□□□ -0.51
SPC25-201ENST00000282074 MOCOSQ96EN8 888 aa11.88□□□□□ -0.51
SPC25-201ENST00000282074 PSKH2Q96QS6 385 aa11.88□□□□□ -0.51
SPC25-201ENST00000282074 OR6C1Q96RD1 312 aa11.88□□□□□ -0.51
SPC25-201ENST00000282074 HERPUD2Q9BSE4 406 aa11.88□□□□□ -0.51
SPC25-201ENST00000282074 STK33Q9BYT3 514 aa11.88□□□□□ -0.51
SPC25-201ENST00000282074 NDST4Q9H3R1 872 aa11.88□□□□□ -0.51
SPC25-201ENST00000282074 SLAMF7Q9NQ25 335 aa11.88□□□□□ -0.51
SPC25-201ENST00000282074 MAP10Q9P2G4 905 aa11.88□□□□□ -0.51
SPC25-201ENST00000282074 ZNHIT2Q9UHR6 403 aa11.88□□□□□ -0.51
SPC25-201ENST00000282074 PYCARDQ9ULZ3 195 aa11.88□□□□□ -0.51
SPC25-201ENST00000282074 FHOD1Q9Y613 1164 aa11.88□□□□□ -0.51
SPC25-201ENST00000282074 SHANK1Q9Y566 2161 aa11.88□□□□□ -0.51
SPC25-201ENST00000282074 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa11.87□□□□□ -0.51
SPC25-201ENST00000282074 KIR2DS5A0A0G2JLQ3 304 aa11.87□□□□□ -0.51
SPC25-201ENST00000282074 A0A0G2JNG1 304 aa11.87□□□□□ -0.51
SPC25-201ENST00000282074 OR5K4A6NMS3 321 aa11.87□□□□□ -0.51
SPC25-201ENST00000282074 KIR2DS3K7RE56 304 aa11.87□□□□□ -0.51
SPC25-201ENST00000282074 DAPK3O43293 454 aa11.87□□□□□ -0.51
SPC25-201ENST00000282074 ASMTLO95671 621 aa11.87□□□□□ -0.51
SPC25-201ENST00000282074 CPP00450 1065 aa11.87□□□□□ -0.51
SPC25-201ENST00000282074 CDR2Q01850 454 aa11.87□□□□□ -0.51
SPC25-201ENST00000282074 IL10RBQ08334 325 aa11.87□□□□□ -0.51
SPC25-201ENST00000282074 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
SPC25-201ENST00000282074 KIR2DS5Q14953 304 aa11.87□□□□□ -0.51
SPC25-201ENST00000282074 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP11.87□□□□□ -0.51
SPC25-201ENST00000282074 USP45Q70EL2 814 aa11.87□□□□□ -0.51
SPC25-201ENST00000282074 SLC34A3Q8N130 599 aa11.87□□□□□ -0.51
SPC25-201ENST00000282074 NDUFAF2Q8N183 169 aa11.87□□□□□ -0.51
SPC25-201ENST00000282074 ANKRD7Q92527 254 aa11.87□□□□□ -0.51
SPC25-201ENST00000282074 AP2M1Q96CW1 435 aa11.87□□□□□ -0.51
SPC25-201ENST00000282074 SCRN2Q96FV2 425 aa11.87□□□□□ -0.51
SPC25-201ENST00000282074 C9orf72Q96LT7 481 aa11.87□□□□□ -0.51
SPC25-201ENST00000282074 TRIM55Q9BYV6 548 aa11.87□□□□□ -0.51
SPC25-201ENST00000282074 MLXIPLQ9NP71 852 aa11.87□□□□□ -0.51
SPC25-201ENST00000282074 ACSS2Q9NR19 701 aa11.87□□□□□ -0.51
SPC25-201ENST00000282074 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa11.87□□□□□ -0.51
SPC25-201ENST00000282074 ADAM22Q9P0K1 906 aa11.87□□□□□ -0.51
SPC25-201ENST00000282074 RCOR3Q9P2K3 495 aaPredicted RBP11.87□□□□□ -0.51
SPC25-201ENST00000282074 LNPEPQ9UIQ6 1025 aa11.87□□□□□ -0.51
SPC25-201ENST00000282074 G3BP2Q9UN86 482 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
SPC25-201ENST00000282074 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa11.87□□□□□ -0.51
SPC25-201ENST00000282074 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa11.87□□□□□ -0.51
SPC25-201ENST00000282074 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa11.87□□□□□ -0.51
SPC25-201ENST00000282074 MN1Q10571 1320 aaPredicted RBP11.87□□□□□ -0.51
SPC25-201ENST00000282074 LILRA5A6NI73 299 aa11.86□□□□□ -0.51
SPC25-201ENST00000282074 SIGLEC16A6NMB1 481 aa11.86□□□□□ -0.51
SPC25-201ENST00000282074 DFFAO00273 331 aa11.86□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.9 ms