RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000273261.7

LRIG1-201, Transcript of leucine rich repeats and immunoglobulin like domains 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LRIG1, Length 5,273 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG1-201ENST00000273261 OR7D4Q8NG98 312 aa20.28■□□□□ 0.84
LRIG1-201ENST00000273261 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa20.28■□□□□ 0.84
LRIG1-201ENST00000273261 ZNF490Q9ULM2 529 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
LRIG1-201ENST00000273261 GRIN2DO15399 1336 aa20.28■□□□□ 0.84
LRIG1-201ENST00000273261 PTGER3P43115 390 aa20.28■□□□□ 0.84
LRIG1-201ENST00000273261 ARL13AQ5H913 290 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
LRIG1-201ENST00000273261 CPTPQ5TA50 214 aa20.28■□□□□ 0.84
LRIG1-201ENST00000273261 COL26A1Q96A83 441 aa20.28■□□□□ 0.84
LRIG1-201ENST00000273261 ZNF599Q96NL3 588 aa20.28■□□□□ 0.84
LRIG1-201ENST00000273261 OLFM1Q99784 485 aa20.28■□□□□ 0.84
LRIG1-201ENST00000273261 OSBPL2Q9H1P3 480 aa20.28■□□□□ 0.84
LRIG1-201ENST00000273261 FAM83DQ9H4H8 585 aa20.28■□□□□ 0.84
LRIG1-201ENST00000273261 MIOSQ9NXC5 875 aa20.28■□□□□ 0.84
LRIG1-201ENST00000273261 PLK2Q9NYY3 685 aa20.28■□□□□ 0.84
LRIG1-201ENST00000273261 SUV39H1O43463 412 aa20.28■□□□□ 0.84
LRIG1-201ENST00000273261 NDUFB5O43674 189 aa20.28■□□□□ 0.84
LRIG1-201ENST00000273261 SIN3BO75182 1162 aa20.28■□□□□ 0.84
LRIG1-201ENST00000273261 OR6A2O95222 327 aa20.28■□□□□ 0.84
LRIG1-201ENST00000273261 PRAMEF1O95521 474 aa20.28■□□□□ 0.84
LRIG1-201ENST00000273261 TAF1AQ15573 450 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
LRIG1-201ENST00000273261 MACC1Q6ZN28 852 aa20.28■□□□□ 0.84
LRIG1-201ENST00000273261 PGAM4Q8N0Y7 254 aa20.28■□□□□ 0.84
LRIG1-201ENST00000273261 VPS35Q96QK1 796 aa20.28■□□□□ 0.84
LRIG1-201ENST00000273261 SOHLH2Q9NX45 425 aa20.28■□□□□ 0.84
LRIG1-201ENST00000273261 PACSIN3Q9UKS6 424 aa20.28■□□□□ 0.84
LRIG1-201ENST00000273261 IKZF3Q9UKT9 509 aa20.28■□□□□ 0.84
LRIG1-201ENST00000273261 CCDC189A1A4V9 331 aa20.27■□□□□ 0.84
LRIG1-201ENST00000273261 PPM1JQ5JR12 505 aa20.27■□□□□ 0.84
LRIG1-201ENST00000273261 FBXO22Q8NEZ5 403 aa20.27■□□□□ 0.84
LRIG1-201ENST00000273261 FEM1CQ96JP0 617 aa20.27■□□□□ 0.84
LRIG1-201ENST00000273261 NPAS2Q99743 824 aa20.27■□□□□ 0.84
LRIG1-201ENST00000273261 SGK2Q9HBY8 427 aa20.27■□□□□ 0.84
LRIG1-201ENST00000273261 ASB3Q9Y575 518 aa20.27■□□□□ 0.84
LRIG1-201ENST00000273261 UROSP10746 265 aa20.27■□□□□ 0.84
LRIG1-201ENST00000273261 IGFBP4P22692 258 aa20.27■□□□□ 0.84
LRIG1-201ENST00000273261 SLC6A2P23975 617 aa20.27■□□□□ 0.84
LRIG1-201ENST00000273261 NMBRP28336 390 aa20.27■□□□□ 0.84
LRIG1-201ENST00000273261 RGL4Q8IZJ4 473 aa20.27■□□□□ 0.84
LRIG1-201ENST00000273261 SAMHD1Q9Y3Z3 626 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
LRIG1-201ENST00000273261 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
LRIG1-201ENST00000273261 AGPSO00116 658 aa20.27■□□□□ 0.84
LRIG1-201ENST00000273261 CDK14O94921 469 aa20.27■□□□□ 0.84
LRIG1-201ENST00000273261 CLDN9O95484 217 aa20.27■□□□□ 0.84
LRIG1-201ENST00000273261 POLR2JP52435 117 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
LRIG1-201ENST00000273261 UGT2B15P54855 530 aa20.27■□□□□ 0.84
LRIG1-201ENST00000273261 GDF10P55107 478 aa20.27■□□□□ 0.84
LRIG1-201ENST00000273261 GPAT3Q53EU6 434 aa20.27■□□□□ 0.84
LRIG1-201ENST00000273261 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
LRIG1-201ENST00000273261 KLHL35Q6PF15 583 aa20.27■□□□□ 0.84
LRIG1-201ENST00000273261 PHYKPLQ8IUZ5 450 aa20.27■□□□□ 0.84
LRIG1-201ENST00000273261 NAT16Q8N8M0 369 aa20.27■□□□□ 0.84
LRIG1-201ENST00000273261 TEFMQ96QE5 360 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
LRIG1-201ENST00000273261 PIPSLA2A3N6 862 aa20.27■□□□□ 0.83
LRIG1-201ENST00000273261 CLCQ05315 142 aa20.27■□□□□ 0.83
LRIG1-201ENST00000273261 STX4Q12846 297 aa20.27■□□□□ 0.83
LRIG1-201ENST00000273261 TRIM71Q2Q1W2 868 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.83
LRIG1-201ENST00000273261 CRTC3Q6UUV7 619 aa20.27■□□□□ 0.83
LRIG1-201ENST00000273261 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.83
LRIG1-201ENST00000273261 NEK10Q6ZWH5 1172 aa20.27■□□□□ 0.83
LRIG1-201ENST00000273261 FAM20CQ8IXL6 584 aa20.27■□□□□ 0.83
LRIG1-201ENST00000273261 FAM13CQ8NE31 585 aa20.27■□□□□ 0.83
LRIG1-201ENST00000273261 AARSD1Q9BTE6 412 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.83
LRIG1-201ENST00000273261 PRDM8Q9NQV8 689 aa20.27■□□□□ 0.83
LRIG1-201ENST00000273261 COL6A1P12109 1028 aa20.26■□□□□ 0.83
LRIG1-201ENST00000273261 PTPN2P17706 415 aa20.26■□□□□ 0.83
LRIG1-201ENST00000273261 LAPTM5Q13571 262 aa20.26■□□□□ 0.83
LRIG1-201ENST00000273261 ZDHHC24Q6UX98 284 aa20.26■□□□□ 0.83
LRIG1-201ENST00000273261 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
LRIG1-201ENST00000273261 NUSAP1Q9BXS6 441 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
LRIG1-201ENST00000273261 TDRD1Q9BXT4 1180 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
LRIG1-201ENST00000273261 ZDHHC18Q9NUE0 388 aa20.26■□□□□ 0.83
LRIG1-201ENST00000273261 OR10H2O60403 315 aa20.26■□□□□ 0.83
LRIG1-201ENST00000273261 GOT2P00505 430 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
LRIG1-201ENST00000273261 INHAP05111 366 aa20.26■□□□□ 0.83
LRIG1-201ENST00000273261 KCNE1P15382 129 aa20.26■□□□□ 0.83
LRIG1-201ENST00000273261 SP2Q02086 613 aa20.26■□□□□ 0.83
LRIG1-201ENST00000273261 PRKCZQ05513 592 aa20.26■□□□□ 0.83
LRIG1-201ENST00000273261 CA9Q16790 459 aa20.26■□□□□ 0.83
LRIG1-201ENST00000273261 CCDC157Q569K6 752 aa20.26■□□□□ 0.83
LRIG1-201ENST00000273261 GK5Q6ZS86 529 aa20.26■□□□□ 0.83
LRIG1-201ENST00000273261 ZC3H3Q8IXZ2 948 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
LRIG1-201ENST00000273261 GSTCDQ8NEC7 633 aa20.26■□□□□ 0.83
LRIG1-201ENST00000273261 DAPK2Q9UIK4 370 aa20.26■□□□□ 0.83
LRIG1-201ENST00000273261 CNTN6Q9UQ52 1028 aa20.26■□□□□ 0.83
LRIG1-201ENST00000273261 ZNF780BQ9Y6R6 833 aa20.26■□□□□ 0.83
LRIG1-201ENST00000273261 TOPAZ1Q8N9V7 1692 aa20.26■□□□□ 0.83
LRIG1-201ENST00000273261 CCR4P51679 360 aa20.26■□□□□ 0.83
LRIG1-201ENST00000273261 AGMOQ6ZNB7 445 aa20.26■□□□□ 0.83
LRIG1-201ENST00000273261 CROCCP3Q8IVE0 287 aa20.26■□□□□ 0.83
LRIG1-201ENST00000273261 PSMG2Q969U7 264 aa20.26■□□□□ 0.83
LRIG1-201ENST00000273261 SLC47A1Q96FL8 570 aa20.26■□□□□ 0.83
LRIG1-201ENST00000273261 SUSD3Q96L08 255 aa20.26■□□□□ 0.83
LRIG1-201ENST00000273261 C3orf14Q9HBI5 128 aa20.26■□□□□ 0.83
LRIG1-201ENST00000273261 CCL16O15467 120 aa20.26■□□□□ 0.83
LRIG1-201ENST00000273261 KIR3DL1P43629 444 aa20.26■□□□□ 0.83
LRIG1-201ENST00000273261 C21orf59P57076 290 aa20.26■□□□□ 0.83
LRIG1-201ENST00000273261 C16orf72Q14CZ0 275 aa20.26■□□□□ 0.83
LRIG1-201ENST00000273261 IFNL1Q8IU54 200 aa20.26■□□□□ 0.83
LRIG1-201ENST00000273261 CAMKK1Q8N5S9 505 aa20.26■□□□□ 0.83
LRIG1-201ENST00000273261 BPIFB6Q8NFQ5 453 aa20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18 ms