RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258104.7

DYSF-201, Transcript of dysferlin, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene DYSF, Length 6,796 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DYSF-201ENST00000258104 SMARCB1Q12824 385 aa14.95□□□□□ -0.02
DYSF-201ENST00000258104 DPYSQ14117 519 aa14.95□□□□□ -0.02
DYSF-201ENST00000258104 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
DYSF-201ENST00000258104 ARMC10Q8N2F6 343 aa14.95□□□□□ -0.02
DYSF-201ENST00000258104 ADCY4Q8NFM4 1077 aa14.95□□□□□ -0.02
DYSF-201ENST00000258104 NAT14Q8WUY8 206 aa14.95□□□□□ -0.02
DYSF-201ENST00000258104 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa14.95□□□□□ -0.02
DYSF-201ENST00000258104 NCANO14594 1321 aa14.95□□□□□ -0.02
DYSF-201ENST00000258104 NOBOXO60393 691 aa14.95□□□□□ -0.02
DYSF-201ENST00000258104 FABP3P05413 133 aa14.95□□□□□ -0.02
DYSF-201ENST00000258104 GNALP38405 381 aa14.95□□□□□ -0.02
DYSF-201ENST00000258104 SF1Q15637 639 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
DYSF-201ENST00000258104 CA9Q16790 459 aa14.95□□□□□ -0.02
DYSF-201ENST00000258104 C1orf186Q6ZWK4 172 aa14.95□□□□□ -0.02
DYSF-201ENST00000258104 HJURPQ8NCD3 748 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
DYSF-201ENST00000258104 EXOSC8Q96B26 276 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
DYSF-201ENST00000258104 TBC1D17Q9HA65 648 aa14.95□□□□□ -0.02
DYSF-201ENST00000258104 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
DYSF-201ENST00000258104 ATXN1P54253 815 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
DYSF-201ENST00000258104 CCL23P55773 120 aa14.95□□□□□ -0.02
DYSF-201ENST00000258104 TYSND1Q2T9J0 566 aa14.95□□□□□ -0.02
DYSF-201ENST00000258104 CCNYL2Q5T2Q4 361 aa14.95□□□□□ -0.02
DYSF-201ENST00000258104 BICRALQ6AI39 1079 aa14.95□□□□□ -0.02
DYSF-201ENST00000258104 CCDC80Q76M96 950 aa14.95□□□□□ -0.02
DYSF-201ENST00000258104 ANKRD46Q86W74 232 aa14.95□□□□□ -0.02
DYSF-201ENST00000258104 SLC4A11Q8NBS3 891 aa14.95□□□□□ -0.02
DYSF-201ENST00000258104 NXNL1Q96CM4 212 aa14.95□□□□□ -0.02
DYSF-201ENST00000258104 C5orf34Q96MH7 638 aa14.95□□□□□ -0.02
DYSF-201ENST00000258104 OXCT2Q9BYC2 517 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
DYSF-201ENST00000258104 PRPF19Q9UMS4 504 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
DYSF-201ENST00000258104 TGFB3P10600 412 aa14.95□□□□□ -0.02
DYSF-201ENST00000258104 SSR2P43308 183 aa14.95□□□□□ -0.02
DYSF-201ENST00000258104 CDCA5Q96FF9 252 aa14.95□□□□□ -0.02
DYSF-201ENST00000258104 LRRC19Q9H756 370 aa14.95□□□□□ -0.02
DYSF-201ENST00000258104 PLK2Q9NYY3 685 aa14.95□□□□□ -0.02
DYSF-201ENST00000258104 WRBO00258 174 aa14.95□□□□□ -0.02
DYSF-201ENST00000258104 SMAD9O15198 467 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
DYSF-201ENST00000258104 NT5EP21589 574 aa14.95□□□□□ -0.02
DYSF-201ENST00000258104 CDKL1Q00532 357 aa14.95□□□□□ -0.02
DYSF-201ENST00000258104 FRMD7Q6ZUT3 714 aa14.95□□□□□ -0.02
DYSF-201ENST00000258104 ADAMTSL2Q86TH1 951 aa14.95□□□□□ -0.02
DYSF-201ENST00000258104 FAM110BQ8TC76 370 aa14.95□□□□□ -0.02
DYSF-201ENST00000258104 SPOCK2Q92563 424 aa14.95□□□□□ -0.02
DYSF-201ENST00000258104 HBEGFQ99075 208 aa14.95□□□□□ -0.02
DYSF-201ENST00000258104 B3GNT5Q9BYG0 378 aa14.95□□□□□ -0.02
DYSF-201ENST00000258104 MAGEL2Q9UJ55 1249 aa14.95□□□□□ -0.02
DYSF-201ENST00000258104 MADDQ8WXG6 1647 aa14.95□□□□□ -0.02
DYSF-201ENST00000258104 TNFRSF11BO00300 401 aa14.94□□□□□ -0.02
DYSF-201ENST00000258104 MDM4O15151 490 aa14.94□□□□□ -0.02
DYSF-201ENST00000258104 HCN1O60741 890 aa14.94□□□□□ -0.02
DYSF-201ENST00000258104 ELFN1P0C7U0 828 aa14.94□□□□□ -0.02
DYSF-201ENST00000258104 ALAS2P22557 587 aa14.94□□□□□ -0.02
DYSF-201ENST00000258104 RPL3P39023 403 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
DYSF-201ENST00000258104 DNASE1L1P49184 302 aa14.94□□□□□ -0.02
DYSF-201ENST00000258104 NAA20P61599 178 aa14.94□□□□□ -0.02
DYSF-201ENST00000258104 TXNL4AP83876 142 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
DYSF-201ENST00000258104 C2orf80Q0P641 193 aa14.94□□□□□ -0.02
DYSF-201ENST00000258104 IL17AQ16552 155 aa14.94□□□□□ -0.02
DYSF-201ENST00000258104 CRELD2Q6UXH1 353 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
DYSF-201ENST00000258104 TMPRSS11AQ6ZMR5 421 aa14.94□□□□□ -0.02
DYSF-201ENST00000258104 YTHDF3Q7Z739 585 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
DYSF-201ENST00000258104 MAB21L3Q8N8X9 362 aa14.94□□□□□ -0.02
DYSF-201ENST00000258104 OR5B17Q8NGF7 314 aa14.94□□□□□ -0.02
DYSF-201ENST00000258104 TNFAIP8L1Q8WVP5 186 aa14.94□□□□□ -0.02
DYSF-201ENST00000258104 PTPN18Q99952 460 aa14.94□□□□□ -0.02
DYSF-201ENST00000258104 NECTIN3Q9NQS3 549 aa14.94□□□□□ -0.02
DYSF-201ENST00000258104 SAMD4AQ9UPU9 718 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
DYSF-201ENST00000258104 BAIAP2Q9UQB8 552 aa14.94□□□□□ -0.02
DYSF-201ENST00000258104 A0A1W2PQ67 120 aa14.94□□□□□ -0.02
DYSF-201ENST00000258104 ZSCAN5BA6NJL1 495 aa14.94□□□□□ -0.02
DYSF-201ENST00000258104 CSN2P05814 226 aa14.94□□□□□ -0.02
DYSF-201ENST00000258104 CCR10P46092 362 aa14.94□□□□□ -0.02
DYSF-201ENST00000258104 AP1S2P56377 157 aa14.94□□□□□ -0.02
DYSF-201ENST00000258104 HECTD2Q5U5R9 776 aa14.94□□□□□ -0.02
DYSF-201ENST00000258104 LCN1P1Q5VSP4 162 aa14.94□□□□□ -0.02
DYSF-201ENST00000258104 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
DYSF-201ENST00000258104 NKX2-3Q8TAU0 364 aa14.94□□□□□ -0.02
DYSF-201ENST00000258104 TWIST2Q8WVJ9 160 aa14.94□□□□□ -0.02
DYSF-201ENST00000258104 DGCR14Q96DF8 476 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
DYSF-201ENST00000258104 DPPA5A6NC42 116 aa14.94□□□□□ -0.02
DYSF-201ENST00000258104 B4GALT5O43286 388 aa14.94□□□□□ -0.02
DYSF-201ENST00000258104 CHP2O43745 196 aa14.94□□□□□ -0.02
DYSF-201ENST00000258104 ABHD2P08910 425 aa14.94□□□□□ -0.02
DYSF-201ENST00000258104 COL6A1P12109 1028 aa14.94□□□□□ -0.02
DYSF-201ENST00000258104 ZNF155Q12901 538 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
DYSF-201ENST00000258104 CRY2Q49AN0 593 aa14.94□□□□□ -0.02
DYSF-201ENST00000258104 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa14.94□□□□□ -0.02
DYSF-201ENST00000258104 GPR158Q5T848 1215 aa14.94□□□□□ -0.02
DYSF-201ENST00000258104 CXCL17Q6UXB2 119 aa14.94□□□□□ -0.02
DYSF-201ENST00000258104 HOMEZQ8IX15 550 aa14.94□□□□□ -0.02
DYSF-201ENST00000258104 CCDC36Q8IYA8 594 aa14.94□□□□□ -0.02
DYSF-201ENST00000258104 RDH11Q8TC12 318 aa14.94□□□□□ -0.02
DYSF-201ENST00000258104 VWA7Q9Y334 891 aa14.94□□□□□ -0.02
DYSF-201ENST00000258104 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
DYSF-201ENST00000258104 C1QTNF3-AMACRE9PGA6 284 aa14.94□□□□□ -0.02
DYSF-201ENST00000258104 XKRYO14609 159 aa14.94□□□□□ -0.02
DYSF-201ENST00000258104 BPGMP07738 259 aa14.94□□□□□ -0.02
DYSF-201ENST00000258104 AKR1A1P14550 325 aa14.94□□□□□ -0.02
DYSF-201ENST00000258104 SLC20A2Q08357 652 aa14.94□□□□□ -0.02
DYSF-201ENST00000258104 RTL4Q6ZR62 310 aa14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.4 ms