RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000249330.2

VGF-201, Transcript of VGF nerve growth factor inducible, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene VGF, Length 2,575 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGF-201ENST00000249330 MFSD2AQ8NA29 543 aa20.11■□□□□ 0.81
VGF-201ENST00000249330 PPHLN1Q8NEY8 458 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
VGF-201ENST00000249330 SMOXQ9NWM0 555 aa20.11■□□□□ 0.81
VGF-201ENST00000249330 YIPF1Q9Y548 306 aa20.11■□□□□ 0.81
VGF-201ENST00000249330 ZNF840PA6NDX5 716 aa20.1■□□□□ 0.81
VGF-201ENST00000249330 ATP6V1B2P21281 511 aa20.1■□□□□ 0.81
VGF-201ENST00000249330 MYF6P23409 242 aa20.1■□□□□ 0.81
VGF-201ENST00000249330 SLC1A2P43004 574 aa20.1■□□□□ 0.81
VGF-201ENST00000249330 CD151P48509 253 aa20.1■□□□□ 0.81
VGF-201ENST00000249330 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
VGF-201ENST00000249330 CBR4Q8N4T8 237 aa20.1■□□□□ 0.81
VGF-201ENST00000249330 ATP6V0D2Q8N8Y2 350 aa20.1■□□□□ 0.81
VGF-201ENST00000249330 TBL1YQ9BQ87 522 aa20.1■□□□□ 0.81
VGF-201ENST00000249330 TRIM15Q9C019 465 aa20.1■□□□□ 0.81
VGF-201ENST00000249330 NACA2Q9H009 215 aa20.1■□□□□ 0.81
VGF-201ENST00000249330 IGLV3-27P01718 113 aa20.1■□□□□ 0.81
VGF-201ENST00000249330 HMOX2P30519 316 aa20.1■□□□□ 0.81
VGF-201ENST00000249330 CSHL1Q14406 222 aa20.1■□□□□ 0.81
VGF-201ENST00000249330 EML3Q32P44 896 aa20.1■□□□□ 0.81
VGF-201ENST00000249330 TBCELQ5QJ74 424 aa20.1■□□□□ 0.81
VGF-201ENST00000249330 INTS11Q5TA45 600 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
VGF-201ENST00000249330 NADSYN1Q6IA69 706 aa20.1■□□□□ 0.81
VGF-201ENST00000249330 C8orf82Q6P1X6 216 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
VGF-201ENST00000249330 BADQ92934 168 aa20.1■□□□□ 0.81
VGF-201ENST00000249330 IL23AQ9NPF7 189 aa20.1■□□□□ 0.81
VGF-201ENST00000249330 COMMD8Q9NX08 183 aa20.1■□□□□ 0.81
VGF-201ENST00000249330 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP20.1■□□□□ 0.81
VGF-201ENST00000249330 TEX28O15482 410 aa20.09■□□□□ 0.81
VGF-201ENST00000249330 ATP5C1P36542 298 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
VGF-201ENST00000249330 STX1BP61266 288 aa20.09■□□□□ 0.81
VGF-201ENST00000249330 TWF1Q12792 350 aa20.09■□□□□ 0.81
VGF-201ENST00000249330 PLD1Q13393 1074 aa20.09■□□□□ 0.81
VGF-201ENST00000249330 FAM83EQ2M2I3 478 aa20.09■□□□□ 0.81
VGF-201ENST00000249330 ESRP1Q6NXG1 681 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
VGF-201ENST00000249330 PCYOX1LQ8NBM8 494 aa20.09■□□□□ 0.81
VGF-201ENST00000249330 ROPN1LQ96C74 230 aa20.09■□□□□ 0.81
VGF-201ENST00000249330 SLC39A3Q9BRY0 314 aa20.09■□□□□ 0.81
VGF-201ENST00000249330 ADI1Q9BV57 179 aa20.09■□□□□ 0.81
VGF-201ENST00000249330 HERC2P3Q9BVR0 1158 aa20.09■□□□□ 0.81
VGF-201ENST00000249330 ZYG11BQ9C0D3 744 aa20.09■□□□□ 0.81
VGF-201ENST00000249330 TNFRSF12AQ9NP84 129 aa20.09■□□□□ 0.81
VGF-201ENST00000249330 GKN1Q9NS71 199 aa20.09■□□□□ 0.81
VGF-201ENST00000249330 IGSF5Q9NSI5 407 aa20.09■□□□□ 0.81
VGF-201ENST00000249330 TBC1D23Q9NUY8 699 aa20.09■□□□□ 0.81
VGF-201ENST00000249330 CDH7Q9ULB5 785 aa20.09■□□□□ 0.81
VGF-201ENST00000249330 AURKCQ9UQB9 309 aa20.09■□□□□ 0.81
VGF-201ENST00000249330 AAR2Q9Y312 384 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
VGF-201ENST00000249330 PRRG1O14668 218 aa20.09■□□□□ 0.81
VGF-201ENST00000249330 COCHO43405 550 aa20.09■□□□□ 0.81
VGF-201ENST00000249330 GNAO1P09471 354 aa20.09■□□□□ 0.81
VGF-201ENST00000249330 POU4F1Q01851 419 aa20.09■□□□□ 0.81
VGF-201ENST00000249330 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
VGF-201ENST00000249330 INPP5AQ14642 412 aa20.09■□□□□ 0.81
VGF-201ENST00000249330 TAF12Q16514 161 aa20.09■□□□□ 0.81
VGF-201ENST00000249330 TECRLQ5HYJ1 363 aa20.09■□□□□ 0.81
VGF-201ENST00000249330 PITRM1Q5JRX3 1037 aa20.09■□□□□ 0.81
VGF-201ENST00000249330 OR9I1Q8NGQ6 314 aa20.09■□□□□ 0.81
VGF-201ENST00000249330 SPATA22Q8NHS9 363 aa20.09■□□□□ 0.81
VGF-201ENST00000249330 ADAMTS16Q8TE57 1224 aa20.09■□□□□ 0.81
VGF-201ENST00000249330 RPRD1AQ96P16 312 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
VGF-201ENST00000249330 RNF38Q9H0F5 515 aa20.09■□□□□ 0.81
VGF-201ENST00000249330 MRM3Q9HC36 420 aaKnown RBP20.09■□□□□ 0.81
VGF-201ENST00000249330 CCM2LQ9NUG4 571 aaPredicted RBP20.09■□□□□ 0.81
VGF-201ENST00000249330 ZNF711Q9Y462 761 aa20.09■□□□□ 0.81
VGF-201ENST00000249330 C2orf78A6NCI8 922 aa20.08■□□□□ 0.81
VGF-201ENST00000249330 A8MT66 165 aa20.08■□□□□ 0.81
VGF-201ENST00000249330 GIPC1O14908 333 aa20.08■□□□□ 0.81
VGF-201ENST00000249330 FGF18O76093 207 aa20.08■□□□□ 0.81
VGF-201ENST00000249330 IPO13O94829 963 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
VGF-201ENST00000249330 CCNCP24863 283 aa20.08■□□□□ 0.81
VGF-201ENST00000249330 ARCN1P48444 511 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
VGF-201ENST00000249330 PFKPQ01813 784 aa20.08■□□□□ 0.81
VGF-201ENST00000249330 TPGS2Q68CL5 300 aa20.08■□□□□ 0.81
VGF-201ENST00000249330 ZNF470Q6ECI4 717 aa20.08■□□□□ 0.81
VGF-201ENST00000249330 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa20.08■□□□□ 0.81
VGF-201ENST00000249330 RNF135Q8IUD6 432 aa20.08■□□□□ 0.81
VGF-201ENST00000249330 CFAP52Q8N1V2 620 aa20.08■□□□□ 0.81
VGF-201ENST00000249330 GIPC3Q8TF64 312 aa20.08■□□□□ 0.81
VGF-201ENST00000249330 ZUFSPQ96AP4 578 aa20.08■□□□□ 0.81
VGF-201ENST00000249330 THAP11Q96EK4 314 aa20.08■□□□□ 0.81
VGF-201ENST00000249330 MRPL17Q9NRX2 175 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
VGF-201ENST00000249330 DNMT3LQ9UJW3 386 aa20.08■□□□□ 0.81
VGF-201ENST00000249330 CDC14AQ9UNH5 594 aa20.08■□□□□ 0.81
VGF-201ENST00000249330 EFCAB14O75071 495 aa20.08■□□□□ 0.8
VGF-201ENST00000249330 CBFA2T3O75081 653 aa20.08■□□□□ 0.8
VGF-201ENST00000249330 HTR7P34969 479 aa20.08■□□□□ 0.8
VGF-201ENST00000249330 MERTKQ12866 999 aa20.08■□□□□ 0.8
VGF-201ENST00000249330 RAB33AQ14088 237 aa20.08■□□□□ 0.8
VGF-201ENST00000249330 IPMKQ8NFU5 416 aa20.08■□□□□ 0.8
VGF-201ENST00000249330 FAM110BQ8TC76 370 aa20.08■□□□□ 0.8
VGF-201ENST00000249330 GMPR2Q9P2T1 348 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.8
VGF-201ENST00000249330 PTPRSQ13332 1948 aa20.07■□□□□ 0.8
VGF-201ENST00000249330 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
VGF-201ENST00000249330 MT-CYBP00156 380 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
VGF-201ENST00000249330 LINC00271P0C7V0 271 aa20.07■□□□□ 0.8
VGF-201ENST00000249330 PAMP19021 973 aa20.07■□□□□ 0.8
VGF-201ENST00000249330 KCNA5P22460 613 aa20.07■□□□□ 0.8
VGF-201ENST00000249330 ARNTP27540 789 aa20.07■□□□□ 0.8
VGF-201ENST00000249330 ATP4BP51164 291 aa20.07■□□□□ 0.8
VGF-201ENST00000249330 CTBSQ01459 385 aa20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.5 ms