RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000243103.3

HOXC12-201, Transcript of homeobox C12, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXC12, Length 3,335 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC12-201ENST00000243103 GRB7Q14451 532 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXC12-201ENST00000243103 SPDYE7PQ495Y7 208 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXC12-201ENST00000243103 THAP5Q7Z6K1 395 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXC12-201ENST00000243103 ANKRD13AQ8IZ07 590 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXC12-201ENST00000243103 OR6P1Q8NGX9 317 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXC12-201ENST00000243103 SNAPC3Q92966 411 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXC12-201ENST00000243103 P2RY11Q96G91 374 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXC12-201ENST00000243103 MRPL45Q9BRJ2 306 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
HOXC12-201ENST00000243103 NUAK2Q9H093 628 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXC12-201ENST00000243103 SIK2Q9H0K1 926 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXC12-201ENST00000243103 TMEM39AQ9NV64 488 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXC12-201ENST00000243103 NDUFAF1Q9Y375 327 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXC12-201ENST00000243103 ABCA3Q99758 1704 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXC12-201ENST00000243103 MSH3P20585 1137 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXC12-201ENST00000243103 ARL4AP40617 200 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXC12-201ENST00000243103 MTHFRP42898 656 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXC12-201ENST00000243103 HLCSP50747 726 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXC12-201ENST00000243103 USP41Q3LFD5 358 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXC12-201ENST00000243103 RAB11FIP1Q6WKZ4 1283 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
HOXC12-201ENST00000243103 CUZD1Q86UP6 607 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXC12-201ENST00000243103 P2RY8Q86VZ1 359 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXC12-201ENST00000243103 CEP97Q8IW35 865 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXC12-201ENST00000243103 KCTD17Q8N5Z5 321 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXC12-201ENST00000243103 CCDC185Q8N715 623 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXC12-201ENST00000243103 ELOVL4Q9GZR5 314 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXC12-201ENST00000243103 RANGRFQ9HD47 186 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
HOXC12-201ENST00000243103 STMN3Q9NZ72 180 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXC12-201ENST00000243103 MOCS1Q9NZB8 636 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXC12-201ENST00000243103 TSPAN16Q9UKR8 245 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXC12-201ENST00000243103 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
HOXC12-201ENST00000243103 CDH7Q9ULB5 785 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXC12-201ENST00000243103 EIF3LQ9Y262 564 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
HOXC12-201ENST00000243103 TCRBV5S1A1TA0A578 114 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXC12-201ENST00000243103 OR6C70A6NIJ9 312 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXC12-201ENST00000243103 MFSD11O43934 449 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXC12-201ENST00000243103 NUDT6P53370 316 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXC12-201ENST00000243103 PPP2R2BQ00005 443 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXC12-201ENST00000243103 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXC12-201ENST00000243103 ARMC4Q5T2S8 1044 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXC12-201ENST00000243103 B3GNT9Q6UX72 402 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXC12-201ENST00000243103 OTOP2Q7RTS6 562 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXC12-201ENST00000243103 GALNT10Q86SR1 603 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXC12-201ENST00000243103 GALNT13Q8IUC8 556 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXC12-201ENST00000243103 PIK3R3Q92569 461 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXC12-201ENST00000243103 SIPA1Q96FS4 1042 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXC12-201ENST00000243103 THUMPD3Q9BV44 507 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
HOXC12-201ENST00000243103 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXC12-201ENST00000243103 CRYL1Q9Y2S2 319 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXC12-201ENST00000243103 NINQ8N4C6 2090 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXC12-201ENST00000243103 KNL1Q8NG31 2342 aa14.94□□□□□ -0.02
HOXC12-201ENST00000243103 THRBP10828 461 aa14.94□□□□□ -0.02
HOXC12-201ENST00000243103 HGFP14210 728 aa14.94□□□□□ -0.02
HOXC12-201ENST00000243103 PGAM1P18669 254 aa14.94□□□□□ -0.02
HOXC12-201ENST00000243103 CD47Q08722 323 aa14.94□□□□□ -0.02
HOXC12-201ENST00000243103 GOLGA7BQ2TAP0 167 aa14.94□□□□□ -0.02
HOXC12-201ENST00000243103 PAMR1Q6UXH9 720 aa14.94□□□□□ -0.02
HOXC12-201ENST00000243103 ABHD15Q6UXT9 468 aa14.94□□□□□ -0.02
HOXC12-201ENST00000243103 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa14.94□□□□□ -0.02
HOXC12-201ENST00000243103 GALNT6Q8NCL4 622 aa14.94□□□□□ -0.02
HOXC12-201ENST00000243103 RDM1Q8NG50 284 aa14.94□□□□□ -0.02
HOXC12-201ENST00000243103 SPATA22Q8NHS9 363 aa14.94□□□□□ -0.02
HOXC12-201ENST00000243103 SLC22A17Q8WUG5 538 aa14.94□□□□□ -0.02
HOXC12-201ENST00000243103 Q96MT0 163 aa14.94□□□□□ -0.02
HOXC12-201ENST00000243103 RBBP8Q99708 897 aa14.94□□□□□ -0.02
HOXC12-201ENST00000243103 MRPL9Q9BYD2 267 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
HOXC12-201ENST00000243103 SMOC2Q9H3U7 446 aa14.94□□□□□ -0.02
HOXC12-201ENST00000243103 HPS4Q9NQG7 708 aa14.94□□□□□ -0.02
HOXC12-201ENST00000243103 ANKEF1Q9NU02 776 aa14.94□□□□□ -0.02
HOXC12-201ENST00000243103 CAMSAP3Q9P1Y5 1249 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
HOXC12-201ENST00000243103 BTBD3Q9Y2F9 522 aa14.94□□□□□ -0.02
HOXC12-201ENST00000243103 MYO10Q9HD67 2058 aa14.94□□□□□ -0.02
HOXC12-201ENST00000243103 C16orf96A6NNT2 1141 aa14.94□□□□□ -0.02
HOXC12-201ENST00000243103 DDNO94850 711 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
HOXC12-201ENST00000243103 MXD1Q05195 221 aa14.94□□□□□ -0.02
HOXC12-201ENST00000243103 AAK1Q2M2I8 961 aa14.94□□□□□ -0.02
HOXC12-201ENST00000243103 LINC00523Q86TU6 105 aa14.94□□□□□ -0.02
HOXC12-201ENST00000243103 LSMEM2Q8N112 164 aa14.94□□□□□ -0.02
HOXC12-201ENST00000243103 TCAIMQ8N3R3 496 aa14.94□□□□□ -0.02
HOXC12-201ENST00000243103 SLC25A23Q9BV35 468 aa14.94□□□□□ -0.02
HOXC12-201ENST00000243103 DSN1Q9H410 356 aa14.94□□□□□ -0.02
HOXC12-201ENST00000243103 CDHR5Q9HBB8 845 aa14.94□□□□□ -0.02
HOXC12-201ENST00000243103 MID1IP1Q9NPA3 183 aa14.94□□□□□ -0.02
HOXC12-201ENST00000243103 SEMA4BQ9NPR2 832 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
HOXC12-201ENST00000243103 TIGARQ9NQ88 270 aa14.94□□□□□ -0.02
HOXC12-201ENST00000243103 NRBP2Q9NSY0 501 aa14.94□□□□□ -0.02
HOXC12-201ENST00000243103 INTS7Q9NVH2 962 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
HOXC12-201ENST00000243103 ARHGAP28Q9P2N2 729 aa14.94□□□□□ -0.02
HOXC12-201ENST00000243103 SUCOQ9UBS9 1254 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
HOXC12-201ENST00000243103 CPA4Q9UI42 421 aa14.94□□□□□ -0.02
HOXC12-201ENST00000243103 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
HOXC12-201ENST00000243103 SLX4Q8IY92 1834 aa14.94□□□□□ -0.02
HOXC12-201ENST00000243103 DNAH14Q0VDD8 3507 aa14.94□□□□□ -0.02
HOXC12-201ENST00000243103 ABCB7O75027 752 aa14.94□□□□□ -0.02
HOXC12-201ENST00000243103 PRKD3O94806 890 aa14.94□□□□□ -0.02
HOXC12-201ENST00000243103 STAG3L1P0CL83 205 aa14.94□□□□□ -0.02
HOXC12-201ENST00000243103 GLULP15104 373 aa14.94□□□□□ -0.02
HOXC12-201ENST00000243103 NKX3-2P78367 333 aa14.94□□□□□ -0.02
HOXC12-201ENST00000243103 ITKQ08881 620 aa14.94□□□□□ -0.02
HOXC12-201ENST00000243103 ILF2Q12905 390 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
HOXC12-201ENST00000243103 KCNAB2Q13303 367 aa14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.1 ms