RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000219473.11

USP10-201, Transcript of ubiquitin specific peptidase 10, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene USP10, Length 3,009 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP10-201ENST00000219473 C5orf22Q49AR2 442 aa14.84□□□□□ -0.03
USP10-201ENST00000219473 DNAJB7Q7Z6W7 309 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
USP10-201ENST00000219473 CPNE9Q8IYJ1 553 aa14.84□□□□□ -0.03
USP10-201ENST00000219473 LILRA2Q8N149 483 aa14.84□□□□□ -0.03
USP10-201ENST00000219473 ADGRE3Q9BY15 652 aa14.84□□□□□ -0.03
USP10-201ENST00000219473 NRP2O60462 931 aa14.84□□□□□ -0.03
USP10-201ENST00000219473 HGFP14210 728 aa14.84□□□□□ -0.03
USP10-201ENST00000219473 VCLP18206 1134 aa14.84□□□□□ -0.03
USP10-201ENST00000219473 CDH18Q13634 790 aa14.84□□□□□ -0.03
USP10-201ENST00000219473 VEPH1Q14D04 833 aa14.84□□□□□ -0.03
USP10-201ENST00000219473 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
USP10-201ENST00000219473 OR52E8Q6IFG1 317 aa14.84□□□□□ -0.03
USP10-201ENST00000219473 UGT3A1Q6NUS8 523 aa14.84□□□□□ -0.03
USP10-201ENST00000219473 CAMK1DQ8IU85 385 aa14.84□□□□□ -0.03
USP10-201ENST00000219473 PEX13Q92968 403 aa14.84□□□□□ -0.03
USP10-201ENST00000219473 LINGO1Q96FE5 620 aa14.84□□□□□ -0.03
USP10-201ENST00000219473 TMEM169Q96HH4 297 aa14.84□□□□□ -0.03
USP10-201ENST00000219473 BIRC8Q96P09 236 aa14.84□□□□□ -0.03
USP10-201ENST00000219473 HBEGFQ99075 208 aa14.84□□□□□ -0.03
USP10-201ENST00000219473 PKP2Q99959 881 aa14.84□□□□□ -0.03
USP10-201ENST00000219473 GPR63Q9BZJ6 419 aa14.84□□□□□ -0.03
USP10-201ENST00000219473 TUBB1Q9H4B7 451 aa14.84□□□□□ -0.03
USP10-201ENST00000219473 INTS10Q9NVR2 710 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
USP10-201ENST00000219473 TRMT6Q9UJA5 497 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
USP10-201ENST00000219473 CHD5Q8TDI0 1954 aa14.84□□□□□ -0.03
USP10-201ENST00000219473 A0A0J9YYE9 177 aa14.84□□□□□ -0.03
USP10-201ENST00000219473 PRORSD1PA6NEY8 169 aa14.84□□□□□ -0.03
USP10-201ENST00000219473 ENO4A6NNW6 628 aa14.84□□□□□ -0.03
USP10-201ENST00000219473 TRIM38O00635 465 aa14.84□□□□□ -0.03
USP10-201ENST00000219473 SNUPNO95149 360 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
USP10-201ENST00000219473 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
USP10-201ENST00000219473 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
USP10-201ENST00000219473 UQCRBP14927 111 aa14.84□□□□□ -0.03
USP10-201ENST00000219473 SLC7A2P52569 658 aa14.84□□□□□ -0.03
USP10-201ENST00000219473 INHBCP55103 352 aa14.84□□□□□ -0.03
USP10-201ENST00000219473 ZXDBP98169 803 aa14.84□□□□□ -0.03
USP10-201ENST00000219473 LRP8Q14114 963 aa14.84□□□□□ -0.03
USP10-201ENST00000219473 MAPRE2Q15555 327 aa14.84□□□□□ -0.03
USP10-201ENST00000219473 RBBP7Q16576 425 aa14.84□□□□□ -0.03
USP10-201ENST00000219473 FUNDC1Q8IVP5 155 aa14.84□□□□□ -0.03
USP10-201ENST00000219473 KIAA1191Q96A73 305 aa14.84□□□□□ -0.03
USP10-201ENST00000219473 DCUN1D1Q96GG9 259 aa14.84□□□□□ -0.03
USP10-201ENST00000219473 CDK15Q96Q40 435 aa14.84□□□□□ -0.03
USP10-201ENST00000219473 ACOX2Q99424 681 aa14.84□□□□□ -0.03
USP10-201ENST00000219473 TFB2MQ9H5Q4 396 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
USP10-201ENST00000219473 ASB1Q9Y576 335 aa14.84□□□□□ -0.03
USP10-201ENST00000219473 KIF3CO14782 793 aa14.83□□□□□ -0.04
USP10-201ENST00000219473 KERAO60938 352 aa14.83□□□□□ -0.04
USP10-201ENST00000219473 VPS26AO75436 327 aa14.83□□□□□ -0.04
USP10-201ENST00000219473 F11P03951 625 aa14.83□□□□□ -0.04
USP10-201ENST00000219473 PKMP14618 531 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
USP10-201ENST00000219473 CSKP41240 450 aa14.83□□□□□ -0.04
USP10-201ENST00000219473 FOLH1Q04609 750 aa14.83□□□□□ -0.04
USP10-201ENST00000219473 GALNT1Q10472 559 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
USP10-201ENST00000219473 IL23RQ5VWK5 629 aa14.83□□□□□ -0.04
USP10-201ENST00000219473 FUBP1Q96AE4 644 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
USP10-201ENST00000219473 SLC25A23Q9BV35 468 aa14.83□□□□□ -0.04
USP10-201ENST00000219473 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
USP10-201ENST00000219473 CWH43Q9H720 699 aa14.83□□□□□ -0.04
USP10-201ENST00000219473 CD274Q9NZQ7 290 aa14.83□□□□□ -0.04
USP10-201ENST00000219473 BCAS2O75934 225 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
USP10-201ENST00000219473 CASP2P42575 452 aa14.83□□□□□ -0.04
USP10-201ENST00000219473 SUOXP51687 545 aa14.83□□□□□ -0.04
USP10-201ENST00000219473 DIO3P55073 304 aa14.83□□□□□ -0.04
USP10-201ENST00000219473 NFKB2Q00653 900 aa14.83□□□□□ -0.04
USP10-201ENST00000219473 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
USP10-201ENST00000219473 CAPRIN1Q14444 709 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
USP10-201ENST00000219473 ANKS6Q68DC2 871 aa14.83□□□□□ -0.04
USP10-201ENST00000219473 FBXL19Q6PCT2 694 aa14.83□□□□□ -0.04
USP10-201ENST00000219473 FAM151BQ6UXP7 276 aa14.83□□□□□ -0.04
USP10-201ENST00000219473 TPGS1Q6ZTW0 290 aa14.83□□□□□ -0.04
USP10-201ENST00000219473 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa14.83□□□□□ -0.04
USP10-201ENST00000219473 SPAG4Q9NPE6 437 aa14.83□□□□□ -0.04
USP10-201ENST00000219473 CROTQ9UKG9 612 aa14.83□□□□□ -0.04
USP10-201ENST00000219473 TBC1D30Q9Y2I9 924 aa14.83□□□□□ -0.04
USP10-201ENST00000219473 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
USP10-201ENST00000219473 ACOT8O14734 319 aa14.82□□□□□ -0.04
USP10-201ENST00000219473 PYGLP06737 847 aa14.82□□□□□ -0.04
USP10-201ENST00000219473 C18orf21Q32NC0 220 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
USP10-201ENST00000219473 MAP7D1Q3KQU3 841 aa14.82□□□□□ -0.04
USP10-201ENST00000219473 CTSL3PQ5NE16 218 aa14.82□□□□□ -0.04
USP10-201ENST00000219473 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
USP10-201ENST00000219473 ARMC3Q5W041 872 aa14.82□□□□□ -0.04
USP10-201ENST00000219473 RETREG3Q86VR2 466 aa14.82□□□□□ -0.04
USP10-201ENST00000219473 RHEBL1Q8TAI7 183 aa14.82□□□□□ -0.04
USP10-201ENST00000219473 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
USP10-201ENST00000219473 FEM1AQ9BSK4 669 aa14.82□□□□□ -0.04
USP10-201ENST00000219473 C1orf50Q9BV19 199 aa14.82□□□□□ -0.04
USP10-201ENST00000219473 DERL2Q9GZP9 239 aa14.82□□□□□ -0.04
USP10-201ENST00000219473 PIDD1Q9HB75 910 aa14.82□□□□□ -0.04
USP10-201ENST00000219473 EPS15L1Q9UBC2 864 aa14.82□□□□□ -0.04
USP10-201ENST00000219473 POLG2Q9UHN1 485 aa14.82□□□□□ -0.04
USP10-201ENST00000219473 VPS51Q9UID3 782 aa14.82□□□□□ -0.04
USP10-201ENST00000219473 LCHNA4D1U4 455 aa14.82□□□□□ -0.04
USP10-201ENST00000219473 SMAD6O43541 496 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
USP10-201ENST00000219473 SNX2O60749 519 aa14.82□□□□□ -0.04
USP10-201ENST00000219473 RNASEH2AO75792 299 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
USP10-201ENST00000219473 GJA1P17302 382 aa14.82□□□□□ -0.04
USP10-201ENST00000219473 CYP4F8P98187 520 aa14.82□□□□□ -0.04
USP10-201ENST00000219473 TLE2Q04725 743 aa14.82□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.7 ms