RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000025354.3

Pggt1b-201, Transcript of Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pggt1b, Length 2,736 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tmem207P86045 143 aa12.62□□□□□ -0.39
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Htr4P97288 388 aa12.62□□□□□ -0.39
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cdh6P97326 790 aa12.62□□□□□ -0.39
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 HdxQ14B70 692 aa12.62□□□□□ -0.39
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Treml2Q2LA85 329 aa12.62□□□□□ -0.39
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tmem199Q5SYH2 208 aa12.62□□□□□ -0.39
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Arhgap30Q640N3 1101 aa12.62□□□□□ -0.39
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ppp1r26Q6A025 1163 aa12.62□□□□□ -0.39
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fam120bQ6RI63 786 aa12.62□□□□□ -0.39
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rnf38Q8BI21 518 aa12.62□□□□□ -0.39
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tmtc3Q8BRH0 920 aa12.62□□□□□ -0.39
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Arhgap12Q8C0D4 838 aa12.62□□□□□ -0.39
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Sit1Q8C503 180 aa12.62□□□□□ -0.39
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 HscbQ8K3A0 234 aa12.62□□□□□ -0.39
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Dhrs7bQ99J47 323 aa12.62□□□□□ -0.39
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Prpf19Q99KP6 504 aaKnown RBP12.62□□□□□ -0.39
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Upk1aQ9D132 257 aa12.62□□□□□ -0.39
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mrpl17Q9D8P4 176 aa12.62□□□□□ -0.39
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Nmnat1Q9EPA7 285 aa12.62□□□□□ -0.39
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Akr1a1Q9JII6 325 aa12.62□□□□□ -0.39
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Smad9Q9JIW5 430 aa12.62□□□□□ -0.39
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Itgb1bp2Q9R000 350 aa12.62□□□□□ -0.39
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rps6ka2Q9WUT3 733 aa12.62□□□□□ -0.39
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cib1Q9Z0F4 191 aa12.62□□□□□ -0.39
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ddx39bQ9Z1N5 428 aaKnown RBP12.62□□□□□ -0.39
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Wdr49A0A0N4SUK7 710 aa12.62□□□□□ -0.39
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Herc6F2Z461 1003 aa12.62□□□□□ -0.39
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Vmn2r86G5E8Y4 848 aa12.62□□□□□ -0.39
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 PrnpP04925 254 aa12.62□□□□□ -0.39
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 DesP31001 469 aaKnown RBP12.62□□□□□ -0.39
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ndst2P52850 883 aa12.62□□□□□ -0.39
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ldb1P70662 411 aa12.62□□□□□ -0.39
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gjb5Q02739 271 aa12.62□□□□□ -0.39
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 IdsQ08890 552 aa12.62□□□□□ -0.39
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Trappc9Q3U0M1 1148 aa12.62□□□□□ -0.39
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fam117bQ3U3E2 584 aa12.62□□□□□ -0.39
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Armcx5Q3UZB0 606 aa12.62□□□□□ -0.39
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pcbp2Q61990 362 aaKnown RBP12.62□□□□□ -0.39
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ggnbp1Q6K1E7 370 aa12.62□□□□□ -0.39
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fam72aQ8BFZ8 149 aa12.62□□□□□ -0.39
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mpp7Q8BVD5 576 aa12.62□□□□□ -0.39
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 GcshQ91WK5 170 aa12.62□□□□□ -0.39
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Psip1Q99JF8 528 aaKnown RBP12.62□□□□□ -0.39
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mrps18aQ99N85 196 aa12.62□□□□□ -0.39
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Exoc2Q9D4H1 924 aa12.62□□□□□ -0.39
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tmem114Q9D563 222 aa12.62□□□□□ -0.39
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Dus2Q9D7B1 493 aa12.62□□□□□ -0.39
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cdh22Q9WTP5 813 aa12.62□□□□□ -0.39
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm28168A0A087WNP1 180 aa12.61□□□□□ -0.39
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Zbed5B2RPU8 756 aa12.61□□□□□ -0.39
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cntnap3E9PY62 1287 aa12.61□□□□□ -0.39
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 JhyE9Q793 770 aa12.61□□□□□ -0.39
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gna12P27600 379 aa12.61□□□□□ -0.39
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pld2P97813 933 aa12.61□□□□□ -0.39
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Dennd1bQ3U1T9 766 aa12.61□□□□□ -0.39
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gpr174Q3U507 335 aa12.61□□□□□ -0.39
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr463Q5SW49 311 aa12.61□□□□□ -0.39
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Olfr462Q5SW50 311 aa12.61□□□□□ -0.39
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Itih1Q61702 907 aa12.61□□□□□ -0.39
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm5414Q6IFZ8 552 aa12.61□□□□□ -0.39
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 DseQ8BLI4 958 aa12.61□□□□□ -0.39
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gspt1Q8R050 636 aaKnown RBP12.61□□□□□ -0.39
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ppp2r2dQ925E7 453 aa12.61□□□□□ -0.39
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 LiasQ99M04 373 aa12.61□□□□□ -0.39
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tmem135Q9CYV5 458 aa12.61□□□□□ -0.39
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ddx59Q9DBN9 619 aa12.61□□□□□ -0.39
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm7173A0A0G2JEB6 3132 aa12.61□□□□□ -0.39
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm6408J3QNG1 320 aa12.61□□□□□ -0.39
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm3402K7N5P2 326 aa12.61□□□□□ -0.39
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Limk2O54785 638 aa12.61□□□□□ -0.39
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Smpd2O70572 419 aa12.61□□□□□ -0.39
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm1604bQ3TRG0 118 aa12.61□□□□□ -0.39
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 RhocQ62159 193 aa12.61□□□□□ -0.39
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cyp2d40Q6P8N9 338 aa12.61□□□□□ -0.39
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cdc14bQ6PFY9 485 aa12.61□□□□□ -0.39
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 DdnQ80TS7 710 aa12.61□□□□□ -0.39
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ppp1r15bQ8BFW3 697 aa12.61□□□□□ -0.39
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ano4Q8C5H1 955 aa12.61□□□□□ -0.39
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 RtknQ8C6B2 564 aa12.61□□□□□ -0.39
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Lancl3Q8CD19 420 aa12.61□□□□□ -0.39
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Aqp12Q8CHJ2 290 aa12.61□□□□□ -0.39
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 RhoqQ8R527 205 aa12.61□□□□□ -0.39
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Dlg2Q91XM9 852 aa12.61□□□□□ -0.39
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 CinpQ9D0V8 212 aa12.61□□□□□ -0.39
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Bcas2Q9D287 225 aa12.61□□□□□ -0.39
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 DtnaQ9D2N4 746 aa12.61□□□□□ -0.39
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Slc22a17Q9D9E0 401 aa12.61□□□□□ -0.39
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Adamts5Q9R001 930 aa12.61□□□□□ -0.39
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Vmn2r24D3YUI0 854 aa12.61□□□□□ -0.39
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gm5145F8VQ88 278 aa12.61□□□□□ -0.39
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 ZfrO88532 1074 aaKnown RBP12.61□□□□□ -0.39
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 LdhcP00342 332 aa12.61□□□□□ -0.39
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 RxrgP28705 463 aa12.61□□□□□ -0.39
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 HpcaP84075 193 aa12.61□□□□□ -0.39
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fads2p1Q0VAX3 487 aa12.61□□□□□ -0.39
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 March9Q3TZ87 348 aa12.61□□□□□ -0.39
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Lmf1Q3U3R4 574 aa12.61□□□□□ -0.39
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Trim75Q3UWZ0 467 aa12.61□□□□□ -0.39
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Hepacam2Q4VAH7 463 aa12.61□□□□□ -0.39
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Afap1l2Q5DTU0 825 aa12.61□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 36.2 ms