RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000622362.1

FAM200B-223, Transcript of family with sequence similarity 200 member B, human

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene FAM200B, Length 4,377 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM200B-223	ENST00000622362	UCKL1	Q9NWZ5	548 aa		11.69	□□□□□ -0.54
FAM200B-223	ENST00000622362	CCDC88A	Q3V6T2	1871 aa		11.69	□□□□□ -0.54
FAM200B-223	ENST00000622362		A0A1W2PPW3	197 aa		11.69	□□□□□ -0.54
FAM200B-223	ENST00000622362	UGT2B11	O75310	529 aa		11.69	□□□□□ -0.54
FAM200B-223	ENST00000622362	CAT	P04040	527 aa	Known RBP	11.69	□□□□□ -0.54
FAM200B-223	ENST00000622362	TCF4	P15884	667 aa		11.69	□□□□□ -0.54
FAM200B-223	ENST00000622362	THOP1	P52888	689 aa		11.69	□□□□□ -0.54
FAM200B-223	ENST00000622362	BACE1	P56817	501 aa		11.69	□□□□□ -0.54
FAM200B-223	ENST00000622362	ARMC6	Q6NXE6	501 aa		11.69	□□□□□ -0.54
FAM200B-223	ENST00000622362	ZNF613	Q6PF04	617 aa		11.69	□□□□□ -0.54
FAM200B-223	ENST00000622362	TRMT10B	Q6PF06	316 aa	Known RBP	11.69	□□□□□ -0.54
FAM200B-223	ENST00000622362	STK40	Q8N2I9	435 aa		11.69	□□□□□ -0.54
FAM200B-223	ENST00000622362	PNPT1	Q8TCS8	783 aa	Known RBP	11.69	□□□□□ -0.54
FAM200B-223	ENST00000622362	TNFRSF25	Q93038	417 aa		11.69	□□□□□ -0.54
FAM200B-223	ENST00000622362	COL26A1	Q96A83	441 aa		11.69	□□□□□ -0.54
FAM200B-223	ENST00000622362	SMARCD1	Q96GM5	515 aa		11.69	□□□□□ -0.54
FAM200B-223	ENST00000622362	DDX4	Q9NQI0	724 aa	Known RBP	11.69	□□□□□ -0.54
FAM200B-223	ENST00000622362	FAM25E	A8MYX2	175 aa		11.68	□□□□□ -0.54
FAM200B-223	ENST00000622362	AP3D1	O14617	1153 aa		11.68	□□□□□ -0.54
FAM200B-223	ENST00000622362	KPNA6	O60684	536 aa		11.68	□□□□□ -0.54
FAM200B-223	ENST00000622362	AMH	P03971	560 aa		11.68	□□□□□ -0.54
FAM200B-223	ENST00000622362	TNFSF9	P41273	254 aa		11.68	□□□□□ -0.54
FAM200B-223	ENST00000622362	CDKN2B	P42772	138 aa		11.68	□□□□□ -0.54
FAM200B-223	ENST00000622362	UGT2B15	P54855	530 aa		11.68	□□□□□ -0.54
FAM200B-223	ENST00000622362	HSF2	Q03933	536 aa		11.68	□□□□□ -0.54
FAM200B-223	ENST00000622362	BMT2	Q1RMZ1	405 aa		11.68	□□□□□ -0.54
FAM200B-223	ENST00000622362	SMU1	Q2TAY7	513 aa		11.68	□□□□□ -0.54
FAM200B-223	ENST00000622362	POTEH	Q6S545	545 aa		11.68	□□□□□ -0.54
FAM200B-223	ENST00000622362	PPP1R3F	Q6ZSY5	799 aa	Predicted RBP	11.68	□□□□□ -0.54
FAM200B-223	ENST00000622362	STX12	Q86Y82	276 aa		11.68	□□□□□ -0.54
FAM200B-223	ENST00000622362	LGI2	Q8N0V4	545 aa		11.68	□□□□□ -0.54
FAM200B-223	ENST00000622362	ART5	Q96L15	291 aa		11.68	□□□□□ -0.54
FAM200B-223	ENST00000622362	BPIFA1	Q9NP55	256 aa		11.68	□□□□□ -0.54
FAM200B-223	ENST00000622362	MTRR	Q9UBK8	725 aa		11.68	□□□□□ -0.54
FAM200B-223	ENST00000622362	PEX16	Q9Y5Y5	336 aa		11.68	□□□□□ -0.54
FAM200B-223	ENST00000622362	IRAK3	Q9Y616	596 aa		11.68	□□□□□ -0.54
FAM200B-223	ENST00000622362	KHDRBS3	O75525	346 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
FAM200B-223	ENST00000622362	ASL	P04424	464 aa		11.68	□□□□□ -0.54
FAM200B-223	ENST00000622362	BMP7	P18075	431 aa		11.68	□□□□□ -0.54
FAM200B-223	ENST00000622362	SLC6A2	P23975	617 aa		11.68	□□□□□ -0.54
FAM200B-223	ENST00000622362	HNF4A	P41235	474 aa		11.68	□□□□□ -0.54
FAM200B-223	ENST00000622362	BCAP31	P51572	246 aa		11.68	□□□□□ -0.54
FAM200B-223	ENST00000622362	WNT3A	P56704	352 aa		11.68	□□□□□ -0.54
FAM200B-223	ENST00000622362	EVX2	Q03828	476 aa		11.68	□□□□□ -0.54
FAM200B-223	ENST00000622362	HKDC1	Q2TB90	917 aa		11.68	□□□□□ -0.54
FAM200B-223	ENST00000622362	PLD5	Q8N7P1	536 aa		11.68	□□□□□ -0.54
FAM200B-223	ENST00000622362	SLC4A11	Q8NBS3	891 aa		11.68	□□□□□ -0.54
FAM200B-223	ENST00000622362	OR52J3	Q8NH60	311 aa		11.68	□□□□□ -0.54
FAM200B-223	ENST00000622362	EXOC2	Q96KP1	924 aa		11.68	□□□□□ -0.54
FAM200B-223	ENST00000622362	HSFY1	Q96LI6	401 aa		11.68	□□□□□ -0.54
FAM200B-223	ENST00000622362	DNAJB4	Q9UDY4	337 aa		11.68	□□□□□ -0.54
FAM200B-223	ENST00000622362	KLHL33	A6NCF5	533 aa		11.68	□□□□□ -0.54
FAM200B-223	ENST00000622362	PLK4	O00444	970 aa		11.68	□□□□□ -0.54
FAM200B-223	ENST00000622362	ZBTB7A	O95365	584 aa		11.68	□□□□□ -0.54
FAM200B-223	ENST00000622362	ITGA3	P26006	1051 aa		11.68	□□□□□ -0.54
FAM200B-223	ENST00000622362	MERTK	Q12866	999 aa		11.68	□□□□□ -0.54
FAM200B-223	ENST00000622362	GRM3	Q14832	879 aa		11.68	□□□□□ -0.54
FAM200B-223	ENST00000622362	ADAMTSL2	Q86TH1	951 aa		11.68	□□□□□ -0.54
FAM200B-223	ENST00000622362	POMGNT2	Q8NAT1	580 aa		11.68	□□□□□ -0.54
FAM200B-223	ENST00000622362	GPRC5A	Q8NFJ5	357 aa		11.68	□□□□□ -0.54
FAM200B-223	ENST00000622362	CANT1	Q8WVQ1	401 aa		11.68	□□□□□ -0.54
FAM200B-223	ENST00000622362	POF1B	Q8WVV4	589 aa		11.68	□□□□□ -0.54
FAM200B-223	ENST00000622362	MRPS31	Q92665	395 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
FAM200B-223	ENST00000622362	CD101	Q93033	1021 aa		11.68	□□□□□ -0.54
FAM200B-223	ENST00000622362	TRNT1	Q96Q11	434 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
FAM200B-223	ENST00000622362	TDRD1	Q9BXT4	1180 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
FAM200B-223	ENST00000622362	RHOBTB2	Q9BYZ6	727 aa		11.68	□□□□□ -0.54
FAM200B-223	ENST00000622362	PORCN	Q9H237	461 aa		11.68	□□□□□ -0.54
FAM200B-223	ENST00000622362	ZNF395	Q9H8N7	513 aa	Predicted RBP	11.68	□□□□□ -0.54
FAM200B-223	ENST00000622362	EXD2	Q9NVH0	621 aa		11.68	□□□□□ -0.54
FAM200B-223	ENST00000622362	SAMD4A	Q9UPU9	718 aa	Known RBP	11.68	□□□□□ -0.54
FAM200B-223	ENST00000622362	POLR1D	Q9Y2S0	133 aa		11.68	□□□□□ -0.54
FAM200B-223	ENST00000622362	PCDHB12	Q9Y5F1	795 aa		11.68	□□□□□ -0.54
FAM200B-223	ENST00000622362	SNCAIP	Q9Y6H5	919 aa		11.68	□□□□□ -0.54
FAM200B-223	ENST00000622362	KAT6A	Q92794	2004 aa		11.68	□□□□□ -0.54
FAM200B-223	ENST00000622362	NR2F1	P10589	423 aa		11.67	□□□□□ -0.54
FAM200B-223	ENST00000622362	ALDH7A1	P49419	539 aa	Known RBP	11.67	□□□□□ -0.54
FAM200B-223	ENST00000622362	OR2B6	P58173	313 aa		11.67	□□□□□ -0.54
FAM200B-223	ENST00000622362	TNFAIP8L3	Q5GJ75	292 aa		11.67	□□□□□ -0.54
FAM200B-223	ENST00000622362	SLC27A1	Q6PCB7	646 aa		11.67	□□□□□ -0.54
FAM200B-223	ENST00000622362	PAOX	Q6QHF9	649 aa		11.67	□□□□□ -0.54
FAM200B-223	ENST00000622362	RIOX2	Q8IUF8	465 aa		11.67	□□□□□ -0.54
FAM200B-223	ENST00000622362	YAF2	Q8IY57	180 aa		11.67	□□□□□ -0.54
FAM200B-223	ENST00000622362	OR8H3	Q8N146	312 aa		11.67	□□□□□ -0.54
FAM200B-223	ENST00000622362	NAT16	Q8N8M0	369 aa		11.67	□□□□□ -0.54
FAM200B-223	ENST00000622362	SMG8	Q8ND04	991 aa	Known RBP	11.67	□□□□□ -0.54
FAM200B-223	ENST00000622362	CPXM1	Q96SM3	734 aa		11.67	□□□□□ -0.54
FAM200B-223	ENST00000622362	MLPH	Q9BV36	600 aa	Predicted RBP	11.67	□□□□□ -0.54
FAM200B-223	ENST00000622362	WDR18	Q9BV38	432 aa		11.67	□□□□□ -0.54
FAM200B-223	ENST00000622362	B3GNT5	Q9BYG0	378 aa		11.67	□□□□□ -0.54
FAM200B-223	ENST00000622362	RNF38	Q9H0F5	515 aa		11.67	□□□□□ -0.54
FAM200B-223	ENST00000622362	SYNDIG1	Q9H7V2	258 aa		11.67	□□□□□ -0.54
FAM200B-223	ENST00000622362	SSU72	Q9NP77	194 aa	Known RBP	11.67	□□□□□ -0.54
FAM200B-223	ENST00000622362	MYOZ2	Q9NPC6	264 aa		11.67	□□□□□ -0.54
FAM200B-223	ENST00000622362	HES2	Q9Y543	173 aa		11.67	□□□□□ -0.54
FAM200B-223	ENST00000622362	TNRC6C	Q9HCJ0	1690 aa	Known RBP	11.67	□□□□□ -0.54
FAM200B-223	ENST00000622362	TAF1L	Q8IZX4	1826 aa		11.67	□□□□□ -0.54
FAM200B-223	ENST00000622362	ELOVL7	A1L3X0	281 aa		11.67	□□□□□ -0.54
FAM200B-223	ENST00000622362	TCEA3	O75764	348 aa		11.67	□□□□□ -0.54
FAM200B-223	ENST00000622362	METTL18	O95568	372 aa		11.67	□□□□□ -0.54

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