RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000616768.4

MLH1-223, Transcript of mutL homolog 1, human

TSL 2

Gene MLH1, Length 721 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MLH1-223	ENST00000616768	IMMT	Q16891	758 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
MLH1-223	ENST00000616768	ADCK5	Q3MIX3	580 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MLH1-223	ENST00000616768	ATP1A1-AS1	Q5TC04	95 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MLH1-223	ENST00000616768	KIAA0895L	Q68EN5	471 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MLH1-223	ENST00000616768	TGIF2LY	Q8IUE0	185 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MLH1-223	ENST00000616768	SRBD1	Q8N5C6	995 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
MLH1-223	ENST00000616768	FAM98A	Q8NCA5	519 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
MLH1-223	ENST00000616768	GRAMD1A	Q96CP6	724 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MLH1-223	ENST00000616768	MARS2	Q96GW9	593 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
MLH1-223	ENST00000616768	ZNF764	Q96H86	408 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
MLH1-223	ENST00000616768		Q96MF0	132 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MLH1-223	ENST00000616768	CATSPER2	Q96P56	530 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MLH1-223	ENST00000616768	ADPGK	Q9BRR6	497 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MLH1-223	ENST00000616768	RIC8A	Q9NPQ8	531 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MLH1-223	ENST00000616768	JKAMP	Q9P055	326 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MLH1-223	ENST00000616768	WRAP73	Q9P2S5	460 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
MLH1-223	ENST00000616768	HSFX1	Q9UBD0	423 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MLH1-223	ENST00000616768	TUBGCP4	Q9UGJ1	667 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MLH1-223	ENST00000616768	TRHDE	Q9UKU6	1024 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MLH1-223	ENST00000616768	DMTF1	Q9Y222	760 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MLH1-223	ENST00000616768	CPQ	Q9Y646	472 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MLH1-223	ENST00000616768	PRRC2C	Q9Y520	2896 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
MLH1-223	ENST00000616768	ZNF559-ZNF177	A0A0A6YYI6	481 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
MLH1-223	ENST00000616768	TCRBV7S2A1N4T	A0A589	114 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MLH1-223	ENST00000616768	CDHR4	A6H8M9	788 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MLH1-223	ENST00000616768	RNF212B	A8MTL3	300 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MLH1-223	ENST00000616768		M0QZQ0	153 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MLH1-223	ENST00000616768	TLR4	O00206	839 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MLH1-223	ENST00000616768	SLC9A3R1	O14745	358 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
MLH1-223	ENST00000616768	IFIT3	O14879	490 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
MLH1-223	ENST00000616768	HOXC11	O43248	304 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
MLH1-223	ENST00000616768	PROM1	O43490	865 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MLH1-223	ENST00000616768	KRT86	O43790	486 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MLH1-223	ENST00000616768	SLC43A1	O75387	559 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MLH1-223	ENST00000616768	NEBL	O76041	1014 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MLH1-223	ENST00000616768	CSH1	P0DML2	217 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MLH1-223	ENST00000616768	CSH2	P0DML3	217 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MLH1-223	ENST00000616768	COX6B1	P14854	86 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MLH1-223	ENST00000616768	GLRA2	P23416	452 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MLH1-223	ENST00000616768	DGKA	P23743	735 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MLH1-223	ENST00000616768	PRKCH	P24723	683 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MLH1-223	ENST00000616768	OAS2	P29728	719 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
MLH1-223	ENST00000616768	RARRES1	P49788	294 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MLH1-223	ENST00000616768	MAPK10	P53779	464 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MLH1-223	ENST00000616768	NOMO3	P69849	1222 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MLH1-223	ENST00000616768	CDC20	Q12834	499 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MLH1-223	ENST00000616768	FOXD4	Q12950	439 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
MLH1-223	ENST00000616768	ZNF177	Q13360	481 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
MLH1-223	ENST00000616768	MXD4	Q14582	209 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
MLH1-223	ENST00000616768	ZRSR2	Q15696	482 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
MLH1-223	ENST00000616768	ZRANB3	Q5FWF4	1079 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MLH1-223	ENST00000616768	DSTYK	Q6XUX3	929 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MLH1-223	ENST00000616768	TMEM25	Q86YD3	366 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MLH1-223	ENST00000616768	RAB11FIP4	Q86YS3	637 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MLH1-223	ENST00000616768	CCDC13	Q8IYE1	715 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MLH1-223	ENST00000616768	PPM1N	Q8N819	430 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MLH1-223	ENST00000616768	APOBEC4	Q8WW27	367 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
MLH1-223	ENST00000616768	RUFY2	Q8WXA3	655 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MLH1-223	ENST00000616768	RNF31	Q96EP0	1072 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MLH1-223	ENST00000616768	PDLIM2	Q96JY6	352 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MLH1-223	ENST00000616768	TCEANC2	Q96MN5	208 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MLH1-223	ENST00000616768	DMRTA2	Q96SC8	542 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MLH1-223	ENST00000616768	LRRC2	Q9BYS8	371 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MLH1-223	ENST00000616768	KRT23	Q9C075	422 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MLH1-223	ENST00000616768	PRDM13	Q9H4Q3	707 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MLH1-223	ENST00000616768	SLC38A7	Q9NVC3	462 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MLH1-223	ENST00000616768	PRMT7	Q9NVM4	692 aa	Predicted RBP	5.05	□□□□□ -1.6
MLH1-223	ENST00000616768	SIDT1	Q9NXL6	827 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
MLH1-223	ENST00000616768	TES	Q9UGI8	421 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
MLH1-223	ENST00000616768	USP25	Q9UHP3	1055 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MLH1-223	ENST00000616768	LIMCH1	Q9UPQ0	1083 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MLH1-223	ENST00000616768	RUVBL1	Q9Y265	456 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
MLH1-223	ENST00000616768	CFAP20	Q9Y6A4	193 aa	Known RBP	5.05	□□□□□ -1.6
MLH1-223	ENST00000616768	PKD1L1	Q8TDX9	2849 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MLH1-223	ENST00000616768	CIT	O14578	2027 aa		5.04	□□□□□ -1.6
MLH1-223	ENST00000616768	PTPRJ	Q12913	1337 aa		5.04	□□□□□ -1.6
MLH1-223	ENST00000616768	NEDD8-MDP1	E9PL57	170 aa		5.04	□□□□□ -1.6
MLH1-223	ENST00000616768	MKRN2OS	H3BPM6	223 aa		5.04	□□□□□ -1.6
MLH1-223	ENST00000616768	SH2B2	O14492	632 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
MLH1-223	ENST00000616768	NVL	O15381	856 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
MLH1-223	ENST00000616768	SORBS2	O94875	1100 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
MLH1-223	ENST00000616768	CYP3A4	P08684	503 aa		5.04	□□□□□ -1.6
MLH1-223	ENST00000616768	CPA1	P15085	419 aa		5.04	□□□□□ -1.6
MLH1-223	ENST00000616768	CXCR5	P32302	372 aa		5.04	□□□□□ -1.6
MLH1-223	ENST00000616768	RPL9	P32969	192 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
MLH1-223	ENST00000616768	CDKN1C	P49918	316 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
MLH1-223	ENST00000616768	ELL	P55199	621 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
MLH1-223	ENST00000616768	PSMC5	P62195	406 aa		5.04	□□□□□ -1.6
MLH1-223	ENST00000616768	EXOSC10	Q01780	885 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
MLH1-223	ENST00000616768	PRPF4B	Q13523	1007 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
MLH1-223	ENST00000616768	FGL2	Q14314	439 aa		5.04	□□□□□ -1.6
MLH1-223	ENST00000616768	SAFB	Q15424	915 aa	Known RBP eCLIP	5.04	□□□□□ -1.6
MLH1-223	ENST00000616768	XKR9	Q5GH70	373 aa		5.04	□□□□□ -1.6
MLH1-223	ENST00000616768	HIST2H2BD	Q6DRA6	164 aa		5.04	□□□□□ -1.6
MLH1-223	ENST00000616768	DSG4	Q86SJ6	1040 aa		5.04	□□□□□ -1.6
MLH1-223	ENST00000616768	ADGRF2	Q8IZF7	708 aa		5.04	□□□□□ -1.6
MLH1-223	ENST00000616768	ZNF366	Q8N895	744 aa		5.04	□□□□□ -1.6
MLH1-223	ENST00000616768	CTCFL	Q8NI51	663 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6
MLH1-223	ENST00000616768	TBC1D15	Q8TC07	691 aa		5.04	□□□□□ -1.6
MLH1-223	ENST00000616768	NTN5	Q8WTR8	489 aa	Predicted RBP	5.04	□□□□□ -1.6

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