RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613894.3

CU633980.1-201, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene CU633980.1, Length 1,708 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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CU633980.1-201ENST00000613894 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
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